MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 2938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021891	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021891	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021891	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021891	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527321567
5	NC_021891	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527321568
6	NC_021891	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527321568
7	NC_021891	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527321569
8	NC_021891	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527321569
9	NC_021891	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527321570
10	NC_021891	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527321570
11	NC_021891	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527321570
12	NC_021891	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527321570
13	NC_021891	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527321571
14	NC_021891	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527321571
15	NC_021891	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527321571
16	NC_021891	GGAG	2	8	6306	6313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021891	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527321572
18	NC_021891	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527321572
19	NC_021891	TATG	2	8	6955	6962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021891	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527321573
21	NC_021891	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527321573
22	NC_021891	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527321574
23	NC_021891	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527321575
24	NC_021891	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527321575
25	NC_021891	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527321575
26	NC_021891	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527321575
27	NC_021891	TATT	2	8	9311	9318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021891	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527321576
29	NC_021891	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527321576
30	NC_021891	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527321576
31	NC_021891	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527321577
32	NC_021891	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527321577
33	NC_021891	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527321577
34	NC_021891	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527321577
35	NC_021891	AGAA	2	8	11205	11212	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021891	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527321578
37	NC_021891	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527321579
38	NC_021891	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527321579
39	NC_021891	AAGG	2	8	13441	13448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021891	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527321580
41	NC_021891	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527321580
42	NC_021891	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527321580
43	NC_021891	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527321581
44	NC_021891	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527321581
45	NC_021891	CAAA	2	8	16075	16082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021891	CTAT	2	8	16262	16269	25 %	50 %	0 %	25 %	527321582
47	NC_021891	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527321582
48	NC_021891	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527321582
49	NC_021891	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527321582
50	NC_021891	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527321582
51	NC_021891	TGCG	2	8	18529	18536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021891	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527321584
53	NC_021891	GCCA	2	8	21023	21030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021891	CGCT	2	8	21271	21278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021891	TTAA	2	8	21292	21299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021891	GTTA	2	8	21329	21336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021891	GATC	2	8	21384	21391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021891	GATG	2	8	21647	21654	25 %	25 %	50 %	0 %	527321586
59	NC_021891	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527321586
60	NC_021891	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527321586
61	NC_021891	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527321586
62	NC_021891	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527321586
63	NC_021891	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527321586
64	NC_021891	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527321586
65	NC_021891	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527321586
66	NC_021891	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	527321587
67	NC_021891	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	527321587
68	NC_021891	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	527321587
69	NC_021891	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	527321587
70	NC_021891	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	527321587
71	NC_021891	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	527321588
72	NC_021891	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	527321588
73	NC_021891	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	527321588
74	NC_021891	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	527321588
75	NC_021891	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	527321589
76	NC_021891	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	527321589
77	NC_021891	ATTG	2	8	27940	27947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021891	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	527321591
79	NC_021891	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	527321591
80	NC_021891	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	527321591
81	NC_021891	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	527321591
82	NC_021891	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	527321592
83	NC_021891	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	527321592
84	NC_021891	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	527321592
85	NC_021891	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	527321594
86	NC_021891	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	527321597
87	NC_021891	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	527321597
88	NC_021891	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	527321598
89	NC_021891	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	527321598
90	NC_021891	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	527321599
91	NC_021891	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	527321599
92	NC_021891	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	527321599
93	NC_021891	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	527321599
94	NC_021891	CTTT	2	8	36637	36644	0 %	75 %	0 %	25 %	527321600
95	NC_021891	ATGA	2	8	37127	37134	50 %	25 %	25 %	0 %	527321600
96	NC_021891	TAGG	2	8	37286	37293	25 %	25 %	50 %	0 %	527321600
97	NC_021891	CAAT	2	8	37470	37477	50 %	25 %	0 %	25 %	527321600
98	NC_021891	AATG	2	8	38257	38264	50 %	25 %	25 %	0 %	527321600
99	NC_021891	AGAA	2	8	39094	39101	75 %	0 %	25 %	0 %	527321601
100	NC_021891	AAGA	2	8	39146	39153	75 %	0 %	25 %	0 %	527321601
101	NC_021891	ATCC	2	8	39154	39161	25 %	25 %	0 %	50 %	527321601
102	NC_021891	TAAT	2	8	39365	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	527321601
103	NC_021891	GTGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	527321603
104	NC_021891	AGAA	2	8	41872	41879	75 %	0 %	25 %	0 %	527321603
105	NC_021891	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	527321603
106	NC_021891	AAAC	2	8	43163	43170	75 %	0 %	0 %	25 %	527321605
107	NC_021891	CAAT	2	8	43367	43374	50 %	25 %	0 %	25 %	527321605
108	NC_021891	TGTT	2	8	43747	43754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021891	AATA	2	8	43985	43992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021891	ATTT	2	8	44123	44130	25 %	75 %	0 %	0 %	527321607
111	NC_021891	GCTC	2	8	44431	44438	0 %	25 %	25 %	50 %	527321607
112	NC_021891	TTCT	2	8	44573	44580	0 %	75 %	0 %	25 %	527321607
113	NC_021891	TTGA	2	8	45173	45180	25 %	50 %	25 %	0 %	527321608
114	NC_021891	TGTT	2	8	45345	45352	0 %	75 %	25 %	0 %	527321608
115	NC_021891	CTAT	2	8	45375	45382	25 %	50 %	0 %	25 %	527321608
116	NC_021891	TGTT	2	8	45404	45411	0 %	75 %	25 %	0 %	527321608
117	NC_021891	CTAT	2	8	45700	45707	25 %	50 %	0 %	25 %	527321608
118	NC_021891	AAGA	2	8	46194	46201	75 %	0 %	25 %	0 %	527321609
119	NC_021891	AAGA	2	8	46251	46258	75 %	0 %	25 %	0 %	527321609
120	NC_021891	AAAG	2	8	46291	46298	75 %	0 %	25 %	0 %	527321609
121	NC_021891	AAGA	2	8	46406	46413	75 %	0 %	25 %	0 %	527321609
122	NC_021891	ACTT	2	8	46667	46674	25 %	50 %	0 %	25 %	527321609
123	NC_021891	ATGG	2	8	47293	47300	25 %	25 %	50 %	0 %	527321609
124	NC_021891	AGGA	2	8	47324	47331	50 %	0 %	50 %	0 %	527321609
125	NC_021891	GAAC	2	8	47871	47878	50 %	0 %	25 %	25 %	527321609
126	NC_021891	AAGT	2	8	47906	47913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021891	AACA	2	8	48118	48125	75 %	0 %	0 %	25 %	527321610
128	NC_021891	CTTT	2	8	48314	48321	0 %	75 %	0 %	25 %	527321610
129	NC_021891	CTTT	2	8	49199	49206	0 %	75 %	0 %	25 %	527321611
130	NC_021891	GTAG	2	8	49217	49224	25 %	25 %	50 %	0 %	527321611
131	NC_021891	GAAG	2	8	50647	50654	50 %	0 %	50 %	0 %	527321613
132	NC_021891	TTCA	2	8	51069	51076	25 %	50 %	0 %	25 %	527321613
133	NC_021891	TCTA	2	8	51286	51293	25 %	50 %	0 %	25 %	527321613
134	NC_021891	TATT	2	8	52172	52179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021891	GGAA	2	8	52403	52410	50 %	0 %	50 %	0 %	527321615
136	NC_021891	TTAA	2	8	53144	53151	50 %	50 %	0 %	0 %	527321615
137	NC_021891	CCTT	2	8	53351	53358	0 %	50 %	0 %	50 %	527321616
138	NC_021891	TTTA	2	8	53518	53525	25 %	75 %	0 %	0 %	527321616
139	NC_021891	AAAG	2	8	53742	53749	75 %	0 %	25 %	0 %	527321616
140	NC_021891	GATT	2	8	53879	53886	25 %	50 %	25 %	0 %	527321616
141	NC_021891	AATC	2	8	53934	53941	50 %	25 %	0 %	25 %	527321616
142	NC_021891	TATT	2	8	53995	54002	25 %	75 %	0 %	0 %	527321616
143	NC_021891	GTTT	2	8	54032	54039	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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