MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 12958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021891	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321567
2	NC_021891	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321567
3	NC_021891	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321567
4	NC_021891	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321567
5	NC_021891	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321567
6	NC_021891	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321567
7	NC_021891	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321567
8	NC_021891	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321567
9	NC_021891	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321567
10	NC_021891	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321567
11	NC_021891	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321568
12	NC_021891	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321568
13	NC_021891	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321568
14	NC_021891	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321568
15	NC_021891	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321568
16	NC_021891	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321568
17	NC_021891	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321568
18	NC_021891	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321569
19	NC_021891	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321569
20	NC_021891	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321569
21	NC_021891	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321569
22	NC_021891	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321569
23	NC_021891	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321569
24	NC_021891	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321569
25	NC_021891	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321569
26	NC_021891	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321569
27	NC_021891	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321569
28	NC_021891	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321569
29	NC_021891	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321569
30	NC_021891	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321569
31	NC_021891	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321569
32	NC_021891	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321569
33	NC_021891	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321569
34	NC_021891	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321569
35	NC_021891	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321569
36	NC_021891	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321569
37	NC_021891	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321569
38	NC_021891	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321569
39	NC_021891	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321569
40	NC_021891	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321570
41	NC_021891	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321570
42	NC_021891	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321570
43	NC_021891	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321570
44	NC_021891	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321570
45	NC_021891	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321570
46	NC_021891	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321570
47	NC_021891	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321570
48	NC_021891	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321570
49	NC_021891	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321570
50	NC_021891	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321570
51	NC_021891	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321570
52	NC_021891	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321570
53	NC_021891	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321570
54	NC_021891	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321570
55	NC_021891	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321570
56	NC_021891	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321571
57	NC_021891	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321571
58	NC_021891	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321571
59	NC_021891	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321571
60	NC_021891	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321571
61	NC_021891	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321571
62	NC_021891	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321571
63	NC_021891	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321571
64	NC_021891	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321571
65	NC_021891	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321571
66	NC_021891	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321571
67	NC_021891	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321571
68	NC_021891	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321571
69	NC_021891	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321571
70	NC_021891	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321571
71	NC_021891	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321571
72	NC_021891	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321571
73	NC_021891	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321572
74	NC_021891	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321572
75	NC_021891	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321572
76	NC_021891	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321572
77	NC_021891	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321572
78	NC_021891	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321573
79	NC_021891	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321573
80	NC_021891	TCG	2	6	7316	7321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321574
81	NC_021891	TCC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321574
82	NC_021891	GTT	2	6	7467	7472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321574
83	NC_021891	TTA	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321574
84	NC_021891	TTC	2	6	8160	8165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321574
85	NC_021891	GAA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321575
86	NC_021891	ACC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527321575
87	NC_021891	CTT	2	6	8485	8490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321575
88	NC_021891	GAG	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321575
89	NC_021891	ATA	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321575
90	NC_021891	AGG	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321575
91	NC_021891	GAA	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321575
92	NC_021891	CAG	2	6	8802	8807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321575
93	NC_021891	TGT	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321575
94	NC_021891	GAG	2	6	8888	8893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321575
95	NC_021891	TAC	2	6	8956	8961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321575
96	NC_021891	GTT	2	6	9060	9065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321575
97	NC_021891	AAG	2	6	9084	9089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321575
98	NC_021891	GAG	2	6	9110	9115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321575
99	NC_021891	TTA	2	6	9400	9405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321576
100	NC_021891	AGA	2	6	9435	9440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321576
101	NC_021891	TGC	2	6	9665	9670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321576
102	NC_021891	GAA	2	6	9692	9697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321576
103	NC_021891	TCG	2	6	9752	9757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321576
104	NC_021891	TGG	2	6	9775	9780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321576
105	NC_021891	GTA	2	6	9826	9831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321577
106	NC_021891	AGC	2	6	9986	9991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321577
107	NC_021891	CTT	2	6	10000	10005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321577
108	NC_021891	ATG	2	6	10161	10166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321577
109	NC_021891	CGT	2	6	10188	10193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321577
110	NC_021891	GAC	2	6	10358	10363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321577
111	NC_021891	GGT	2	6	10445	10450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321577
112	NC_021891	GAA	2	6	10491	10496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321577
113	NC_021891	CAA	2	6	10513	10518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321577
114	NC_021891	GGA	2	6	10575	10580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321577
115	NC_021891	CGA	2	6	10632	10637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321577
116	NC_021891	CTT	2	6	10738	10743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321577
117	NC_021891	TTG	2	6	10778	10783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321577
118	NC_021891	CTT	2	6	10792	10797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321577
119	NC_021891	ATC	2	6	10902	10907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321577
120	NC_021891	TGT	2	6	10908	10913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321577
121	NC_021891	AGA	2	6	11014	11019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321577
122	NC_021891	AGG	2	6	11053	11058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321577
123	NC_021891	GAT	2	6	11113	11118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321577
124	NC_021891	CGA	2	6	11119	11124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321577
125	NC_021891	AAT	2	6	11332	11337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321578
126	NC_021891	AGG	2	6	11575	11580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321578
127	NC_021891	ATA	3	9	11585	11593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321578
128	NC_021891	TAT	2	6	11604	11609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321578
129	NC_021891	ACA	2	6	11615	11620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321578
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