MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 352

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021891	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021891	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021891	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021891	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021891	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021891	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021891	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021891	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021891	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021891	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021891	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021891	AG	3	6	20519	20524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021891	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021891	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021891	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021891	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021891	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021891	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021891	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021891	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021891	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021891	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021891	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021891	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021891	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021891	AG	3	6	42646	42651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021891	TC	3	6	43738	43743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021891	AG	3	6	47974	47979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021891	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021891	GA	3	6	55593	55598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021891	CT	3	6	56488	56493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021891	GT	3	6	56538	56543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021891	TG	3	6	57167	57172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021891	GA	3	6	60790	60795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021891	AG	4	8	64809	64816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021891	TA	3	6	69128	69133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021891	CT	3	6	71864	71869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021891	TA	3	6	85226	85231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021891	TC	3	6	90447	90452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021891	GA	3	6	90579	90584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021891	CT	3	6	92929	92934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021891	GA	3	6	93457	93462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021891	TA	3	6	94074	94079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021891	TC	3	6	99956	99961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021891	AT	3	6	100007	100012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021891	GC	3	6	102113	102118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021891	TA	3	6	106683	106688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021891	TG	3	6	115937	115942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021891	CA	3	6	117855	117860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021891	AG	4	8	118523	118530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021891	GA	3	6	120345	120350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021891	TG	3	6	120604	120609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021891	CT	3	6	121229	121234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021891	AT	3	6	121932	121937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021891	TC	3	6	122142	122147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021891	GA	3	6	122472	122477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021891	GT	3	6	123528	123533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021891	CT	3	6	128065	128070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021891	TC	3	6	130387	130392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021891	TG	3	6	133296	133301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021891	TC	3	6	137037	137042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021891	CT	3	6	137066	137071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021891	CT	3	6	137248	137253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021891	AG	3	6	137412	137417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021891	AG	3	6	138150	138155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021891	GA	3	6	138213	138218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021891	AT	3	6	142445	142450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021891	GA	3	6	151682	151687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021891	AG	3	6	152797	152802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021891	AG	3	6	153224	153229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021891	AG	3	6	157249	157254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021891	TC	3	6	171721	171726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021891	AG	3	6	171853	171858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021891	CT	3	6	171871	171876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021891	TG	3	6	178362	178367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021891	TA	3	6	180092	180097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021891	AG	3	6	180452	180457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021891	CT	3	6	188687	188692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021891	CT	3	6	189632	189637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021891	CT	3	6	189718	189723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021891	AT	3	6	190486	190491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021891	TA	3	6	192142	192147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021891	TC	3	6	192161	192166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021891	TG	3	6	193039	193044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021891	TC	3	6	195084	195089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021891	AT	3	6	195431	195436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021891	AG	3	6	200207	200212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021891	TC	3	6	203199	203204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021891	AG	3	6	205031	205036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021891	CT	3	6	206957	206962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021891	GA	4	8	210018	210025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021891	CT	4	8	210066	210073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021891	TA	3	6	211647	211652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021891	AG	3	6	221338	221343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021891	TA	3	6	222892	222897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021891	CT	3	6	224535	224540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021891	TC	3	6	227536	227541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021891	AG	3	6	227567	227572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021891	TC	3	6	241766	241771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021891	AG	3	6	241792	241797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021891	AC	3	6	246715	246720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021891	GA	3	6	253801	253806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021891	TG	3	6	253911	253916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021891	AG	3	6	254711	254716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021891	GA	3	6	255590	255595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021891	AG	3	6	255715	255720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021891	TA	3	6	257536	257541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021891	AG	3	6	259827	259832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021891	TC	3	6	259853	259858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021891	TA	3	6	267694	267699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021891	AG	3	6	267774	267779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021891	CA	3	6	269501	269506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021891	TC	3	6	271400	271405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021891	TA	3	6	276951	276956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021891	AT	4	8	287511	287518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021891	CT	3	6	288363	288368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021891	TC	4	8	288454	288461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021891	TC	3	6	290145	290150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021891	TC	3	6	290202	290207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021891	CT	3	6	290675	290680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021891	AT	3	6	302689	302694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021891	CA	3	6	305018	305023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021891	GA	3	6	309749	309754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021891	AG	3	6	318967	318972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021891	CT	3	6	350918	350923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021891	CT	3	6	353989	353994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021891	TC	3	6	358215	358220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021891	CT	3	6	362131	362136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021891	AC	3	6	365464	365469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021891	GA	3	6	367376	367381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021891	TA	3	6	367656	367661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021891	GC	3	6	369185	369190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021891	TC	3	6	369489	369494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021891	TA	3	6	369559	369564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021891	AC	3	6	370271	370276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021891	CT	4	8	370443	370450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021891	CT	3	6	370676	370681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021891	CA	3	6	370685	370690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021891	CT	4	8	384767	384774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021891	CG	3	6	394606	394611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021891	CA	3	6	395656	395661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021891	TC	3	6	398203	398208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021891	CT	3	6	398693	398698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021891	GA	3	6	398947	398952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021891	CT	3	6	414040	414045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021891	CT	3	6	432775	432780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021891	CT	3	6	433798	433803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021891	AG	3	6	434144	434149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021891	GA	3	6	435839	435844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021891	AC	3	6	439837	439842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021891	CT	3	6	444108	444113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021891	AC	3	6	444146	444151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021891	CA	3	6	446615	446620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021891	CT	3	6	448019	448024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.