MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021890	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021890	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527320618
3	NC_021890	CAAAAA	2	12	6252	6263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021890	TAGCAA	2	12	10831	10842	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527320625
5	NC_021890	AAAGCT	2	12	10962	10973	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527320625
6	NC_021890	TAGTGA	2	12	12108	12119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320626
7	NC_021890	GTTCCT	2	12	19393	19404	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	527320632
8	NC_021890	CTTTTT	2	12	21547	21558	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527320634
9	NC_021890	GTGAGG	2	12	25478	25489	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	527320635
10	NC_021890	GGATTT	2	12	35954	35965	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527320647
11	NC_021890	AATTAG	2	12	37375	37386	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527320648
12	NC_021890	TTCCTG	2	12	37674	37685	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	527320648
13	NC_021890	TTTTGA	2	12	44982	44993	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	527320656
14	NC_021890	TGAACG	2	12	52440	52451	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	527320663
15	NC_021890	GTGATT	2	12	52459	52470	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527320663
16	NC_021890	GATCTG	2	12	55092	55103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527320665
17	NC_021890	GTGTAA	2	12	55140	55151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320665
18	NC_021890	GGTTCA	2	12	55229	55240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527320665
19	NC_021890	CCAAGA	2	12	57661	57672	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021890	AGTTGT	2	12	57767	57778	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021890	TCCTAA	2	12	59497	59508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320668
22	NC_021890	AAAAAT	2	12	60992	61003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021890	GTTCTT	2	12	63411	63422	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527320670
24	NC_021890	CTATTT	2	12	71733	71744	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527320677
25	NC_021890	ACTCTT	2	12	72862	72873	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	527320678
26	NC_021890	TTTCTG	2	12	73412	73423	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527320679
27	NC_021890	GATCAT	2	12	73542	73553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527320679
28	NC_021890	TAGTAC	2	12	76536	76547	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527320680
29	NC_021890	ATCTAG	2	12	76715	76726	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021890	GGTTTA	2	12	80186	80197	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527320684
31	NC_021890	TTTAGT	2	12	81959	81970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	527320686
32	NC_021890	GTCTGT	2	12	83230	83241	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	527320687
33	NC_021890	TTCTGA	2	12	88844	88855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527320691
34	NC_021890	AAAAGA	2	12	93907	93918	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	527320697
35	NC_021890	AGCTGT	2	12	96001	96012	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527320698
36	NC_021890	TCTTTT	2	12	96666	96677	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527320700
37	NC_021890	GGGGCT	2	12	97614	97625	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	527320700
38	NC_021890	TTTGAG	2	12	99819	99830	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527320702
39	NC_021890	TCAGAA	2	12	106459	106470	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527320706
40	NC_021890	CATAAC	2	12	109503	109514	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527320709
41	NC_021890	TGTTCT	2	12	112270	112281	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527320711
42	NC_021890	ACTTCG	2	12	115563	115574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527320713
43	NC_021890	TTTTAG	2	12	115998	116009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021890	TTGCCA	2	12	119102	119113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527320717
45	NC_021890	TAAAAA	2	12	120594	120605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021890	TTGGTA	2	12	120642	120653	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021890	AGGATC	2	12	121021	121032	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021890	AAGGGT	2	12	122787	122798	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	527320719
49	NC_021890	GGGTTT	2	12	123750	123761	0 %	50 %	50 %	0 %	527320720
50	NC_021890	TTGCAT	2	12	124032	124043	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527320720
51	NC_021890	AAGAGA	2	12	124401	124412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320720
52	NC_021890	TTAAAA	2	12	133338	133349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320727
53	NC_021890	AGGTTG	2	12	134580	134591	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	527320728
54	NC_021890	GAGTTA	2	12	139630	139641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320736
55	NC_021890	TGGAAT	2	12	143058	143069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320741
56	NC_021890	ATGGTT	2	12	143302	143313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527320741
57	NC_021890	TGCTCT	2	12	145493	145504	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	527320744
58	NC_021890	GAAAGG	2	12	149231	149242	50 %	0 %	50 %	0 %	527320746
59	NC_021890	GCTTTG	2	12	149474	149485	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	527320746
60	NC_021890	TGTGCG	2	12	153595	153606	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	527320749
61	NC_021890	CCTCAT	2	12	154893	154904	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527320750
62	NC_021890	TGGAGA	2	12	156351	156362	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	527320752
63	NC_021890	CTCCAT	2	12	157720	157731	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527320753
64	NC_021890	TCCTTG	2	12	158316	158327	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	527320754
65	NC_021890	AACAGC	2	12	160952	160963	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	527320757
66	NC_021890	AAAAAG	2	12	173542	173553	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	527320764
67	NC_021890	AGAAAA	2	12	182612	182623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021890	ACTTCT	2	12	187739	187750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	527320773
69	NC_021890	GGATAT	2	12	192082	192093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021890	GAATGC	2	12	193610	193621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021890	ATTTGC	2	12	195100	195111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527320774
72	NC_021890	AAACAT	2	12	196194	196205	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527320777
73	NC_021890	AGCAAC	2	12	196529	196540	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	527320777
74	NC_021890	TATGAA	2	12	198123	198134	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021890	TCTGGA	2	12	202799	202810	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527320784
76	NC_021890	CTGGAT	2	12	218392	218403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527320797
77	NC_021890	GAAATA	2	12	218715	218726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	527320797
78	NC_021890	TTTTAC	2	12	224408	224419	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021890	ACTCCA	2	12	226461	226472	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	527320805
80	NC_021890	CTGCTT	2	12	226693	226704	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	527320805
81	NC_021890	ATTGCT	2	12	230002	230013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527320808
82	NC_021890	TCCTAG	2	12	230292	230303	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527320808
83	NC_021890	GCAACG	2	12	230780	230791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320809
84	NC_021890	CTTAGC	2	12	233409	233420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527320811
85	NC_021890	TTCCTT	2	12	240241	240252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320816
86	NC_021890	TCTCCT	2	12	243123	243134	0 %	50 %	0 %	50 %	527320817
87	NC_021890	AAACCA	2	12	243698	243709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320818
88	NC_021890	AACCCT	2	12	258128	258139	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021890	CCTGCA	2	12	259093	259104	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	527320837
90	NC_021890	ACCTTT	2	12	264288	264299	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	527320842
91	NC_021890	TCATAA	2	12	272132	272143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527320850
92	NC_021890	AAGTGT	2	12	272858	272869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320850
93	NC_021890	AGGAGA	2	12	274031	274042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021890	ATCTAA	2	12	276136	276147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527320853
95	NC_021890	TGGAAT	2	12	278334	278345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320855
96	NC_021890	GGAACA	2	12	282221	282232	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	527320857
97	NC_021890	ATATTA	2	12	282929	282940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021890	CACGCG	2	12	284594	284605	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	527320859
99	NC_021890	TTTCTT	2	12	284773	284784	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527320859
100	NC_021890	CTCCTA	2	12	288935	288946	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527320862
101	NC_021890	GCAATG	2	12	295054	295065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	527320868
102	NC_021890	CGACAT	2	12	295727	295738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527320870
103	NC_021890	CCCTTA	2	12	297181	297192	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527320872
104	NC_021890	AAAATA	2	12	299279	299290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	527320874
105	NC_021890	ACCACT	2	12	301634	301645	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	527320876
106	NC_021890	CATTGC	2	12	304880	304891	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527320879
107	NC_021890	CCAAAA	2	12	306059	306070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320880
108	NC_021890	TCTTTT	2	12	307944	307955	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527320882
109	NC_021890	CAAGAC	2	12	309035	309046	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	527320883
110	NC_021890	AGCTTA	2	12	310316	310327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527320885
111	NC_021890	CAAAGA	2	12	315701	315712	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	527320890
112	NC_021890	ATGGCT	2	12	316317	316328	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527320891
113	NC_021890	TACAAA	2	12	320508	320519	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527320894
114	NC_021890	TTAATT	2	12	322187	322198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320896
115	NC_021890	AAAACA	2	12	325676	325687	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	527320899
116	NC_021890	AAAAAG	2	12	327102	327113	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021890	CAGAAC	2	12	347660	347671	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	527320917
118	NC_021890	ATTCAA	2	12	352637	352648	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527320922
119	NC_021890	AGAATA	2	12	364594	364605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021890	TTCTTA	2	12	364614	364625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527320930
121	NC_021890	CAGCCT	2	12	376671	376682	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	527320945
122	NC_021890	AGCTGA	2	12	376721	376732	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	527320945
123	NC_021890	ATGCTA	2	12	380588	380599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527320947
124	NC_021890	CAATAG	2	12	387194	387205	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527320950
125	NC_021890	ACTGAA	2	12	387335	387346	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527320950
126	NC_021890	CTGCAC	2	12	387528	387539	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	527320950
127	NC_021890	TCCATA	2	12	397887	397898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320959
128	NC_021890	TTAGGT	2	12	399245	399256	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527320961
129	NC_021890	AGGGAA	2	12	400571	400582	50 %	0 %	50 %	0 %	527320962
130	NC_021890	CTGAAG	2	12	401406	401417	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	527320963
131	NC_021890	TAATCT	2	12	406823	406834	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527320966
132	NC_021890	GAACAA	2	12	407325	407336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	527320967
133	NC_021890	CTAAAG	2	12	407708	407719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527320968
134	NC_021890	CCTTTC	2	12	408872	408883	0 %	50 %	0 %	50 %	527320969
135	NC_021890	TTTTAA	2	12	412736	412747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021890	ACATGC	2	12	418413	418424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527320980
137	NC_021890	GGCTCT	2	12	419148	419159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320981
138	NC_021890	ATCTTG	2	12	420742	420753	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527320982
139	NC_021890	CCCCCA	2	12	422075	422086	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	527320983
140	NC_021890	TTCCTC	2	12	426140	426151	0 %	50 %	0 %	50 %	527320987
141	NC_021890	CTCTAC	2	12	429388	429399	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527320989
142	NC_021890	ACATCA	2	12	430033	430044	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527320990
143	NC_021890	CGGAAT	2	12	430295	430306	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	527320991
144	NC_021890	AGCTAA	2	12	434575	434586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527320995
145	NC_021890	TTCTCC	2	12	446616	446627	0 %	50 %	0 %	50 %	527321005
146	NC_021890	ATGAAG	2	12	455663	455674	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	527321013
147	NC_021890	TAACTC	2	12	456180	456191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321013
148	NC_021890	ATCCGC	2	12	457105	457116	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	527321013
149	NC_021890	CTGTAT	2	12	458455	458466	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527321014
150	NC_021890	CTAAAG	2	12	459523	459534	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527321014
151	NC_021890	CCAATA	2	12	464508	464519	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527321018
152	NC_021890	ATCGGC	2	12	470355	470366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	527321026
153	NC_021890	TATTGG	2	12	470948	470959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527321026
154	NC_021890	AAATAC	2	12	481292	481303	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527321030
155	NC_021890	TCTTCA	2	12	483731	483742	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	527321031
156	NC_021890	CTACAA	2	12	487536	487547	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527321031
157	NC_021890	CCAATC	2	12	492004	492015	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	527321035
158	NC_021890	TTCTTT	2	12	495825	495836	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527321042
159	NC_021890	CTGAAG	2	12	498884	498895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	527321044
160	NC_021890	TGAGTA	2	12	499338	499349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321044
161	NC_021890	AAACTG	2	12	502785	502796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527321048
162	NC_021890	TAACTA	2	12	506308	506319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_021890	AAGAAA	2	12	506321	506332	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021890	GGTAAT	2	12	511122	511133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321057
165	NC_021890	AGTTTT	2	12	512130	512141	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	527321059
166	NC_021890	AGAATA	2	12	512295	512306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021890	GGTTGT	2	12	514259	514270	0 %	50 %	50 %	0 %	527321061
168	NC_021890	GCTGTT	2	12	516618	516629	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	527321064
169	NC_021890	AACTAA	2	12	517968	517979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_021890	TCTCTA	2	12	520054	520065	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	527321068
171	NC_021890	TGAACT	2	12	520562	520573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527321068
172	NC_021890	TAATTC	2	12	521892	521903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527321069
173	NC_021890	ACTCCT	2	12	522161	522172	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527321069
174	NC_021890	GATGAA	2	12	522681	522692	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	527321069
175	NC_021890	CAAAGC	2	12	527041	527052	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	527321071
176	NC_021890	CAGGAA	2	12	530030	530041	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	527321077
177	NC_021890	ACTGTA	2	12	534816	534827	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527321081
178	NC_021890	AGCCAC	2	12	534851	534862	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	527321081
179	NC_021890	AATGTC	2	12	536028	536039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527321081
180	NC_021890	CAAATC	2	12	538497	538508	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527321083
181	NC_021890	AGGGAA	2	12	542938	542949	50 %	0 %	50 %	0 %	527321088
182	NC_021890	AAAGAA	2	12	544794	544805	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	527321091
183	NC_021890	CTTCCT	2	12	545443	545454	0 %	50 %	0 %	50 %	527321092
184	NC_021890	ACAAGA	2	12	546946	546957	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	527321093
185	NC_021890	TAATTG	2	12	548992	549003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	527321096
186	NC_021890	TCCCTC	2	12	551858	551869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
187	NC_021890	ATTACA	2	12	554038	554049	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527321100
188	NC_021890	CGGAAA	2	12	559524	559535	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	527321105
189	NC_021890	ATATAG	2	12	559995	560006	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527321105
190	NC_021890	GCATAG	2	12	563029	563040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	527321109
191	NC_021890	TTTCAA	2	12	564201	564212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527321112
192	NC_021890	CAAAAA	2	12	564580	564591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	527321112
193	NC_021890	AGATCC	2	12	567411	567422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527321115
194	NC_021890	AAAAAT	2	12	569830	569841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021890	TTTTGC	2	12	576698	576709	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527321123
196	NC_021890	TCATAT	2	12	580796	580807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527321128
197	NC_021890	TGGAGA	2	12	582064	582075	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	527321128
198	NC_021890	CTCCAT	2	12	582587	582598	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527321129
199	NC_021890	TTCAAA	2	12	588933	588944	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527321137
200	NC_021890	TTTGTT	2	12	589715	589726	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	527321139
201	NC_021890	TCTCCG	2	12	598426	598437	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	527321156
202	NC_021890	CAGCCG	2	12	600792	600803	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	527321159
203	NC_021890	CTGATA	2	12	604055	604066	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527321163
204	NC_021890	CTGCTC	2	12	604103	604114	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	527321163
205	NC_021890	AGTCCA	2	12	606015	606026	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527321164
206	NC_021890	TAGGGG	2	12	608983	608994	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
207	NC_021890	CAAAGA	2	12	609797	609808	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	527321169
208	NC_021890	CCAAAA	2	12	613304	613315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321173
209	NC_021890	GGATGG	2	12	615076	615087	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	527321175
210	NC_021890	CGATAT	3	18	617404	617421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527321176
211	NC_021890	TCTTTT	2	12	620968	620979	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
212	NC_021890	ACTGTA	2	12	622660	622671	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527321180
213	NC_021890	CACTCT	2	12	622976	622987	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527321180
214	NC_021890	CCTTAG	2	12	626762	626773	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527321185
215	NC_021890	AACCTC	2	12	634827	634838	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	527321189
216	NC_021890	CTCTTT	2	12	641839	641850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321199
217	NC_021890	ATATCC	2	12	641856	641867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321199
218	NC_021890	TAAACA	2	12	641967	641978	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527321199
219	NC_021890	ATAAAC	2	12	645678	645689	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	527321204
220	NC_021890	ATCTTG	2	12	646371	646382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527321204
221	NC_021890	TTAAAT	2	12	649142	649153	50 %	50 %	0 %	0 %	527321206
222	NC_021890	TTATTT	2	12	652181	652192	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_021890	GCTTCT	2	12	653531	653542	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	527321210
224	NC_021890	TAGGAG	2	12	654498	654509	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	527321210
225	NC_021890	CACAGG	2	12	656491	656502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321212
226	NC_021890	AGAAAG	2	12	672641	672652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321223
227	NC_021890	AGCTGG	2	12	690684	690695	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	527321241
228	NC_021890	GCATCA	2	12	692526	692537	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527321242
229	NC_021890	ATCAAT	2	12	696851	696862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527321246
230	NC_021890	CCGCAA	2	12	701732	701743	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	527321251
231	NC_021890	TGCTTG	2	12	704006	704017	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	527321252
232	NC_021890	AAATGC	2	12	707689	707700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527321253
233	NC_021890	GAAAGA	2	12	709807	709818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321254
234	NC_021890	TCTTGA	2	12	714918	714929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527321258
235	NC_021890	TATCCA	2	12	725099	725110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321270
236	NC_021890	TATTGA	2	12	740989	741000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	527321280
237	NC_021890	TGTGAT	2	12	749287	749298	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527321288
238	NC_021890	TATTTT	2	12	758120	758131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_021890	GGGAAG	2	12	762242	762253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321302
240	NC_021890	GGAAGA	2	12	765908	765919	50 %	0 %	50 %	0 %	527321304
241	NC_021890	ATGCAA	2	12	768220	768231	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527321308
242	NC_021890	GAGAAA	2	12	768449	768460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321308
243	NC_021890	TATATT	2	12	773886	773897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321313
244	NC_021890	CAATTA	2	12	781545	781556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527321320
245	NC_021890	ATGAAG	2	12	787295	787306	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	527321323
246	NC_021890	ATTAGG	2	12	793079	793090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321330
247	NC_021890	TAAACC	2	12	793918	793929	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527321331
248	NC_021890	CCCTGA	2	12	796075	796086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	527321333
249	NC_021890	AGAATT	2	12	798997	799008	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527321336
250	NC_021890	AAGCTC	2	12	799236	799247	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527321336
251	NC_021890	TTTCTT	2	12	802102	802113	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527321338
252	NC_021890	AGAAAT	2	12	805292	805303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	527321341
253	NC_021890	GAAATT	2	12	806905	806916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527321343
254	NC_021890	GCTGAG	2	12	807587	807598	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	527321343
255	NC_021890	TTTTCT	2	12	808020	808031	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_021890	TAGCCT	2	12	810534	810545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527321344
257	NC_021890	ATTTTT	2	12	811799	811810	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_021890	AAGAGG	2	12	830975	830986	50 %	0 %	50 %	0 %	527321359
259	NC_021890	GAAAGG	2	12	835852	835863	50 %	0 %	50 %	0 %	527321365
260	NC_021890	AGCTTC	2	12	837306	837317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527321366
261	NC_021890	ATTTTT	2	12	838278	838289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_021890	ATCACA	2	12	841411	841422	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527321372
263	NC_021890	GATCCG	2	12	846020	846031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	527321376
264	NC_021890	TTATGC	2	12	852958	852969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527321382
265	NC_021890	ATGGGG	2	12	855992	856003	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	527321385
266	NC_021890	AAAGAA	2	12	856471	856482	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	527321385
267	NC_021890	GGCTAG	2	12	856854	856865	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	527321385
268	NC_021890	GAGAAA	2	12	856901	856912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321385
269	NC_021890	TAAGGA	2	12	859242	859253	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021890	CCGGAG	2	12	860160	860171	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_021890	CTTCTA	2	12	864091	864102	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	527321387
272	NC_021890	CTTTTT	2	12	864775	864786	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527321388
273	NC_021890	GACCTG	2	12	869735	869746	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	527321391
274	NC_021890	CCTCTA	2	12	873310	873321	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
275	NC_021890	TAAGGA	2	12	881291	881302	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_021890	TGTGAT	2	12	885278	885289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527321397
277	NC_021890	TTGCCA	2	12	886564	886575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527321398
278	NC_021890	GCTCCT	2	12	889074	889085	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	527321402
279	NC_021890	CGGCTC	2	12	889183	889194	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	527321402
280	NC_021890	CGGCGT	2	12	890182	890193	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	527321403
281	NC_021890	CGGGGG	3	18	890370	890387	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
282	NC_021890	GGGCGG	2	12	893137	893148	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
283	NC_021890	ACTTTT	2	12	900151	900162	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527321415
284	NC_021890	CTTTTT	2	12	902538	902549	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527321417
285	NC_021890	GCTTTT	2	12	904362	904373	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527321420
286	NC_021890	GGAAAA	2	12	905630	905641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321421
287	NC_021890	CAATAC	2	12	911927	911938	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	527321425
288	NC_021890	TAAGGA	2	12	919064	919075	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021890	CCGGAG	2	12	919982	919993	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_021890	GAAGAG	2	12	927973	927984	50 %	0 %	50 %	0 %	527321434
291	NC_021890	TTTTCT	2	12	930363	930374	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527321435
292	NC_021890	CTGTTC	2	12	930676	930687	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	527321435
293	NC_021890	GTTTTT	2	12	931330	931341	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	527321436
294	NC_021890	GTGTAT	2	12	932242	932253	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527321437
295	NC_021890	TATTGG	2	12	936321	936332	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527321441
296	NC_021890	CCAACG	2	12	938649	938660	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	527321441
297	NC_021890	TCCAGA	2	12	941287	941298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527321445
298	NC_021890	TTTTGG	2	12	946490	946501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321449
299	NC_021890	CAATTT	2	12	947157	947168	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527321451
300	NC_021890	ATCGCC	2	12	947428	947439	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	527321451
301	NC_021890	GACGGC	2	12	962410	962421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_021890	CTTCTC	2	12	963319	963330	0 %	50 %	0 %	50 %	527321465
303	NC_021890	AAACAA	2	12	964098	964109	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
304	NC_021890	GAGCAA	2	12	965902	965913	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	527321470
305	NC_021890	ATAGGG	2	12	986662	986673	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	527321488
306	NC_021890	CGGAGG	2	12	986983	986994	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	527321489
307	NC_021890	GGATTA	2	12	996897	996908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321496
308	NC_021890	GAAAAA	2	12	997443	997454	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	527321496
309	NC_021890	TTAAAA	2	12	1001331	1001342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321500
310	NC_021890	GCTATT	2	12	1008951	1008962	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	527321508
311	NC_021890	CAAATG	2	12	1011484	1011495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527321509
312	NC_021890	GGCTGG	2	12	1022595	1022606	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	527321518
313	NC_021890	ACAGGA	2	12	1022707	1022718	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	527321518
314	NC_021890	TTAAGC	2	12	1023756	1023767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527321519
315	NC_021890	CAGGGA	2	12	1032728	1032739	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	527321527
316	NC_021890	CTCCAT	2	12	1035252	1035263	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527321528
317	NC_021890	TCAGTA	2	12	1036440	1036451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527321529
318	NC_021890	CAGAAT	2	12	1037713	1037724	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527321532
319	NC_021890	TACTAG	2	12	1038226	1038237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527321532
320	NC_021890	TAATGT	2	12	1039604	1039615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	527321536
321	NC_021890	AATTAA	2	12	1047952	1047963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321544
322	NC_021890	GCAATA	2	12	1048898	1048909	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527321544
323	NC_021890	CTTTAT	2	12	1052291	1052302	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	527321546
324	NC_021890	AGCTGG	2	12	1052719	1052730	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	527321546
325	NC_021890	TTGTAA	2	12	1055588	1055599	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	527321549
326	NC_021890	GAAAAA	2	12	1069837	1069848	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	527321558
327	NC_021890	TTTCTT	2	12	1070501	1070512	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	527321559
328	NC_021890	GTTTCC	2	12	1071788	1071799	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	527321559
329	NC_021890	CAGCAC	2	12	1076682	1076693	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	527321561
330	NC_021890	GTAATA	2	12	1076847	1076858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527321561
331	NC_021890	ACCATC	2	12	1077589	1077600	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	527321561
332	NC_021890	TAAAAT	2	12	1083198	1083209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.