MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021890	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527320617
2	NC_021890	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527320618
3	NC_021890	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527320618
4	NC_021890	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527320618
5	NC_021890	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527320618
6	NC_021890	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527320619
7	NC_021890	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021890	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527320622
9	NC_021890	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527320623
10	NC_021890	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527320624
11	NC_021890	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527320625
12	NC_021890	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527320625
13	NC_021890	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527320626
14	NC_021890	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527320627
15	NC_021890	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527320627
16	NC_021890	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527320629
17	NC_021890	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527320630
18	NC_021890	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527320630
19	NC_021890	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527320630
20	NC_021890	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527320633
21	NC_021890	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527320634
22	NC_021890	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527320634
23	NC_021890	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527320634
24	NC_021890	AGAGG	2	10	25536	25545	40 %	0 %	60 %	0 %	527320635
25	NC_021890	GGAGA	2	10	27315	27324	40 %	0 %	60 %	0 %	527320636
26	NC_021890	ATCCG	2	10	28066	28075	20 %	20 %	20 %	40 %	527320638
27	NC_021890	AGGGT	2	10	28584	28593	20 %	20 %	60 %	0 %	527320638
28	NC_021890	CCTAT	2	10	29624	29633	20 %	40 %	0 %	40 %	527320639
29	NC_021890	GAAGG	2	10	30423	30432	40 %	0 %	60 %	0 %	527320640
30	NC_021890	GAGCT	2	10	31463	31472	20 %	20 %	40 %	20 %	527320641
31	NC_021890	AAAGA	2	10	33096	33105	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021890	TCAGT	2	10	35702	35711	20 %	40 %	20 %	20 %	527320647
33	NC_021890	CTATT	2	10	36136	36145	20 %	60 %	0 %	20 %	527320647
34	NC_021890	TCCTA	2	10	36183	36192	20 %	40 %	0 %	40 %	527320647
35	NC_021890	ACGAT	2	10	38099	38108	40 %	20 %	20 %	20 %	527320648
36	NC_021890	TTTGA	2	10	38464	38473	20 %	60 %	20 %	0 %	527320648
37	NC_021890	AGCAA	2	10	42115	42124	60 %	0 %	20 %	20 %	527320651
38	NC_021890	CGATG	2	10	42172	42181	20 %	20 %	40 %	20 %	527320651
39	NC_021890	TGCAA	2	10	42330	42339	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021890	CAAAA	2	10	42648	42657	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021890	TTTAT	2	10	44245	44254	20 %	80 %	0 %	0 %	527320656
42	NC_021890	CTTTC	2	10	46342	46351	0 %	60 %	0 %	40 %	527320658
43	NC_021890	AGTTT	2	10	46881	46890	20 %	60 %	20 %	0 %	527320658
44	NC_021890	GAAGA	2	10	48014	48023	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021890	CTATT	2	10	49593	49602	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021890	CTTTT	2	10	50044	50053	0 %	80 %	0 %	20 %	527320661
47	NC_021890	ATTAA	2	10	51384	51393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021890	CCGTA	2	10	53927	53936	20 %	20 %	20 %	40 %	527320664
49	NC_021890	AATTT	2	10	54167	54176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021890	TTATC	2	10	55330	55339	20 %	60 %	0 %	20 %	527320665
51	NC_021890	GTTGT	2	10	56398	56407	0 %	60 %	40 %	0 %	527320666
52	NC_021890	GAGCA	2	10	59843	59852	40 %	0 %	40 %	20 %	527320668
53	NC_021890	TGTGA	2	10	62292	62301	20 %	40 %	40 %	0 %	527320670
54	NC_021890	AGTGA	2	10	63813	63822	40 %	20 %	40 %	0 %	527320671
55	NC_021890	CCTTC	2	10	64087	64096	0 %	40 %	0 %	60 %	527320671
56	NC_021890	AGGAG	2	10	66315	66324	40 %	0 %	60 %	0 %	527320673
57	NC_021890	GTTAA	2	10	66445	66454	40 %	40 %	20 %	0 %	527320673
58	NC_021890	AAAAG	2	10	69071	69080	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021890	GCGAT	2	10	69883	69892	20 %	20 %	40 %	20 %	527320676
60	NC_021890	CTCTT	2	10	70237	70246	0 %	60 %	0 %	40 %	527320676
61	NC_021890	AGGGG	2	10	70883	70892	20 %	0 %	80 %	0 %	527320676
62	NC_021890	AAGAA	2	10	70925	70934	80 %	0 %	20 %	0 %	527320676
63	NC_021890	CTTGC	2	10	72014	72023	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021890	ATTGG	2	10	72215	72224	20 %	40 %	40 %	0 %	527320678
65	NC_021890	GAAAA	2	10	73287	73296	80 %	0 %	20 %	0 %	527320678
66	NC_021890	TGGGA	2	10	73704	73713	20 %	20 %	60 %	0 %	527320679
67	NC_021890	TATTT	2	10	76231	76240	20 %	80 %	0 %	0 %	527320680
68	NC_021890	AAAAG	2	10	76764	76773	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021890	ATCAA	2	10	78462	78471	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021890	TGTCT	2	10	80023	80032	0 %	60 %	20 %	20 %	527320684
71	NC_021890	TTACT	2	10	80530	80539	20 %	60 %	0 %	20 %	527320684
72	NC_021890	AGAAA	2	10	81920	81929	80 %	0 %	20 %	0 %	527320686
73	NC_021890	GGAAG	2	10	82433	82442	40 %	0 %	60 %	0 %	527320686
74	NC_021890	TTTGT	2	10	85198	85207	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021890	GATCC	2	10	85984	85993	20 %	20 %	20 %	40 %	527320689
76	NC_021890	AGAGC	2	10	87319	87328	40 %	0 %	40 %	20 %	527320690
77	NC_021890	AATAA	2	10	88197	88206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021890	TTTTC	2	10	91051	91060	0 %	80 %	0 %	20 %	527320693
79	NC_021890	GGATG	2	10	91311	91320	20 %	20 %	60 %	0 %	527320694
80	NC_021890	CAACA	2	10	92850	92859	60 %	0 %	0 %	40 %	527320695
81	NC_021890	TTTAA	2	10	93733	93742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021890	ACAGC	2	10	93894	93903	40 %	0 %	20 %	40 %	527320697
83	NC_021890	CTTTT	2	10	94268	94277	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021890	GGAAC	2	10	94607	94616	40 %	0 %	40 %	20 %	527320698
85	NC_021890	GGATT	2	10	95507	95516	20 %	40 %	40 %	0 %	527320698
86	NC_021890	CAATC	2	10	96609	96618	40 %	20 %	0 %	40 %	527320700
87	NC_021890	TTTGC	2	10	96743	96752	0 %	60 %	20 %	20 %	527320700
88	NC_021890	ATTCA	2	10	97007	97016	40 %	40 %	0 %	20 %	527320700
89	NC_021890	GATCC	2	10	97266	97275	20 %	20 %	20 %	40 %	527320700
90	NC_021890	GTTTT	2	10	97687	97696	0 %	80 %	20 %	0 %	527320700
91	NC_021890	ACAAA	2	10	97814	97823	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021890	AAGCT	2	10	98891	98900	40 %	20 %	20 %	20 %	527320701
93	NC_021890	AGGGG	2	10	99250	99259	20 %	0 %	80 %	0 %	527320701
94	NC_021890	ATAGC	2	10	99949	99958	40 %	20 %	20 %	20 %	527320702
95	NC_021890	TTCCC	2	10	100553	100562	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_021890	AGCGA	2	10	102876	102885	40 %	0 %	40 %	20 %	527320704
97	NC_021890	TTTCT	2	10	103234	103243	0 %	80 %	0 %	20 %	527320704
98	NC_021890	ATCAT	2	10	104440	104449	40 %	40 %	0 %	20 %	527320705
99	NC_021890	GGCAT	2	10	105148	105157	20 %	20 %	40 %	20 %	527320705
100	NC_021890	AAAGC	2	10	108874	108883	60 %	0 %	20 %	20 %	527320708
101	NC_021890	GCATT	2	10	110034	110043	20 %	40 %	20 %	20 %	527320710
102	NC_021890	GCTCT	2	10	114099	114108	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_021890	TGTTT	2	10	114723	114732	0 %	80 %	20 %	0 %	527320713
104	NC_021890	CATGT	2	10	115101	115110	20 %	40 %	20 %	20 %	527320713
105	NC_021890	TATCG	2	10	115805	115814	20 %	40 %	20 %	20 %	527320713
106	NC_021890	TTTCT	2	10	116321	116330	0 %	80 %	0 %	20 %	527320714
107	NC_021890	AAAGA	2	10	118566	118575	80 %	0 %	20 %	0 %	527320716
108	NC_021890	GCTTC	2	10	122557	122566	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_021890	TACAA	2	10	126304	126313	60 %	20 %	0 %	20 %	527320722
110	NC_021890	ATCCA	2	10	128712	128721	40 %	20 %	0 %	40 %	527320725
111	NC_021890	GAAGA	2	10	130262	130271	60 %	0 %	40 %	0 %	527320725
112	NC_021890	AAAAG	2	10	132175	132184	80 %	0 %	20 %	0 %	527320727
113	NC_021890	GATTC	2	10	132506	132515	20 %	40 %	20 %	20 %	527320727
114	NC_021890	ATTGG	2	10	135791	135800	20 %	40 %	40 %	0 %	527320730
115	NC_021890	TGTTT	2	10	136250	136259	0 %	80 %	20 %	0 %	527320731
116	NC_021890	TTGCA	2	10	137040	137049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021890	TCCAG	2	10	139995	140004	20 %	20 %	20 %	40 %	527320736
118	NC_021890	GTACA	2	10	140726	140735	40 %	20 %	20 %	20 %	527320737
119	NC_021890	TAGAT	2	10	141099	141108	40 %	40 %	20 %	0 %	527320737
120	NC_021890	AAAAG	2	10	141511	141520	80 %	0 %	20 %	0 %	527320738
121	NC_021890	AAAAC	2	10	141991	142000	80 %	0 %	0 %	20 %	527320739
122	NC_021890	TGCTA	2	10	143077	143086	20 %	40 %	20 %	20 %	527320741
123	NC_021890	GGAGC	2	10	143124	143133	20 %	0 %	60 %	20 %	527320741
124	NC_021890	CTGGG	2	10	144538	144547	0 %	20 %	60 %	20 %	527320743
125	NC_021890	GTTTT	2	10	145285	145294	0 %	80 %	20 %	0 %	527320744
126	NC_021890	GAACC	2	10	149019	149028	40 %	0 %	20 %	40 %	527320745
127	NC_021890	ATTCT	2	10	152515	152524	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021890	CTGTG	2	10	152718	152727	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021890	TTCTT	2	10	155191	155200	0 %	80 %	0 %	20 %	527320751
130	NC_021890	TTCTA	2	10	157296	157305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021890	AGGAA	2	10	159749	159758	60 %	0 %	40 %	0 %	527320755
132	NC_021890	CAAAA	2	10	161752	161761	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021890	AGAGA	2	10	162980	162989	60 %	0 %	40 %	0 %	527320758
134	NC_021890	AGCAA	2	10	163415	163424	60 %	0 %	20 %	20 %	527320758
135	NC_021890	CAAAA	2	10	166918	166927	80 %	0 %	0 %	20 %	527320760
136	NC_021890	AAGAG	2	10	167751	167760	60 %	0 %	40 %	0 %	527320760
137	NC_021890	GATTG	2	10	168096	168105	20 %	40 %	40 %	0 %	527320760
138	NC_021890	GTTTT	2	10	174578	174587	0 %	80 %	20 %	0 %	527320764
139	NC_021890	TATTG	2	10	174601	174610	20 %	60 %	20 %	0 %	527320764
140	NC_021890	CAGCA	2	10	174960	174969	40 %	0 %	20 %	40 %	527320764
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149	NC_021890	AGAAA	2	10	182549	182558	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_021890	AAAGT	2	10	188892	188901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021890	AGCTT	2	10	191638	191647	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_021890	ACGAT	2	10	193930	193939	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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163	NC_021890	AAGAA	2	10	195486	195495	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021890	AAAAG	2	10	195614	195623	80 %	0 %	20 %	0 %	527320775
165	NC_021890	TATCA	2	10	195687	195696	40 %	40 %	0 %	20 %	527320775
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232	NC_021890	TGTTT	2	10	305214	305223	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
233	NC_021890	ATTCC	2	10	305362	305371	20 %	40 %	0 %	40 %	527320880
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256	NC_021890	CTTGT	2	10	337323	337332	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
257	NC_021890	CCTTT	2	10	337781	337790	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
258	NC_021890	CTAAA	2	10	340875	340884	60 %	20 %	0 %	20 %	527320912
259	NC_021890	TCCAA	2	10	341510	341519	40 %	20 %	0 %	40 %	527320912
260	NC_021890	TCCAT	2	10	341593	341602	20 %	40 %	0 %	40 %	527320912
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263	NC_021890	CATTG	2	10	345789	345798	20 %	40 %	20 %	20 %	527320915
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266	NC_021890	GTTAC	2	10	353495	353504	20 %	40 %	20 %	20 %	527320923
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400	NC_021890	TTGGA	2	10	527277	527286	20 %	40 %	40 %	0 %	527321072
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