MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021890	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527320617
2	NC_021890	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527320618
3	NC_021890	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527320618
4	NC_021890	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527320618
5	NC_021890	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527320618
6	NC_021890	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527320619
7	NC_021890	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527320622
8	NC_021890	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527320623
9	NC_021890	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527320624
10	NC_021890	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527320625
11	NC_021890	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527320625
12	NC_021890	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527320626
13	NC_021890	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527320627
14	NC_021890	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527320627
15	NC_021890	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527320629
16	NC_021890	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527320630
17	NC_021890	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527320630
18	NC_021890	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527320630
19	NC_021890	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527320633
20	NC_021890	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527320634
21	NC_021890	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527320634
22	NC_021890	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527320634
23	NC_021890	AGAGG	2	10	25536	25545	40 %	0 %	60 %	0 %	527320635
24	NC_021890	GGAGA	2	10	27315	27324	40 %	0 %	60 %	0 %	527320636
25	NC_021890	ATCCG	2	10	28066	28075	20 %	20 %	20 %	40 %	527320638
26	NC_021890	AGGGT	2	10	28584	28593	20 %	20 %	60 %	0 %	527320638
27	NC_021890	CCTAT	2	10	29624	29633	20 %	40 %	0 %	40 %	527320639
28	NC_021890	GAAGG	2	10	30423	30432	40 %	0 %	60 %	0 %	527320640
29	NC_021890	GAGCT	2	10	31463	31472	20 %	20 %	40 %	20 %	527320641
30	NC_021890	TCAGT	2	10	35702	35711	20 %	40 %	20 %	20 %	527320647
31	NC_021890	CTATT	2	10	36136	36145	20 %	60 %	0 %	20 %	527320647
32	NC_021890	TCCTA	2	10	36183	36192	20 %	40 %	0 %	40 %	527320647
33	NC_021890	ACGAT	2	10	38099	38108	40 %	20 %	20 %	20 %	527320648
34	NC_021890	TTTGA	2	10	38464	38473	20 %	60 %	20 %	0 %	527320648
35	NC_021890	AGCAA	2	10	42115	42124	60 %	0 %	20 %	20 %	527320651
36	NC_021890	CGATG	2	10	42172	42181	20 %	20 %	40 %	20 %	527320651
37	NC_021890	TTTAT	2	10	44245	44254	20 %	80 %	0 %	0 %	527320656
38	NC_021890	CTTTC	2	10	46342	46351	0 %	60 %	0 %	40 %	527320658
39	NC_021890	AGTTT	2	10	46881	46890	20 %	60 %	20 %	0 %	527320658
40	NC_021890	CTTTT	2	10	50044	50053	0 %	80 %	0 %	20 %	527320661
41	NC_021890	CCGTA	2	10	53927	53936	20 %	20 %	20 %	40 %	527320664
42	NC_021890	TTATC	2	10	55330	55339	20 %	60 %	0 %	20 %	527320665
43	NC_021890	GTTGT	2	10	56398	56407	0 %	60 %	40 %	0 %	527320666
44	NC_021890	GAGCA	2	10	59843	59852	40 %	0 %	40 %	20 %	527320668
45	NC_021890	TGTGA	2	10	62292	62301	20 %	40 %	40 %	0 %	527320670
46	NC_021890	AGTGA	2	10	63813	63822	40 %	20 %	40 %	0 %	527320671
47	NC_021890	CCTTC	2	10	64087	64096	0 %	40 %	0 %	60 %	527320671
48	NC_021890	AGGAG	2	10	66315	66324	40 %	0 %	60 %	0 %	527320673
49	NC_021890	GTTAA	2	10	66445	66454	40 %	40 %	20 %	0 %	527320673
50	NC_021890	GCGAT	2	10	69883	69892	20 %	20 %	40 %	20 %	527320676
51	NC_021890	CTCTT	2	10	70237	70246	0 %	60 %	0 %	40 %	527320676
52	NC_021890	AGGGG	2	10	70883	70892	20 %	0 %	80 %	0 %	527320676
53	NC_021890	AAGAA	2	10	70925	70934	80 %	0 %	20 %	0 %	527320676
54	NC_021890	ATTGG	2	10	72215	72224	20 %	40 %	40 %	0 %	527320678
55	NC_021890	GAAAA	2	10	73287	73296	80 %	0 %	20 %	0 %	527320678
56	NC_021890	TGGGA	2	10	73704	73713	20 %	20 %	60 %	0 %	527320679
57	NC_021890	TATTT	2	10	76231	76240	20 %	80 %	0 %	0 %	527320680
58	NC_021890	TGTCT	2	10	80023	80032	0 %	60 %	20 %	20 %	527320684
59	NC_021890	TTACT	2	10	80530	80539	20 %	60 %	0 %	20 %	527320684
60	NC_021890	AGAAA	2	10	81920	81929	80 %	0 %	20 %	0 %	527320686
61	NC_021890	GGAAG	2	10	82433	82442	40 %	0 %	60 %	0 %	527320686
62	NC_021890	GATCC	2	10	85984	85993	20 %	20 %	20 %	40 %	527320689
63	NC_021890	AGAGC	2	10	87319	87328	40 %	0 %	40 %	20 %	527320690
64	NC_021890	TTTTC	2	10	91051	91060	0 %	80 %	0 %	20 %	527320693
65	NC_021890	GGATG	2	10	91311	91320	20 %	20 %	60 %	0 %	527320694
66	NC_021890	CAACA	2	10	92850	92859	60 %	0 %	0 %	40 %	527320695
67	NC_021890	ACAGC	2	10	93894	93903	40 %	0 %	20 %	40 %	527320697
68	NC_021890	GGAAC	2	10	94607	94616	40 %	0 %	40 %	20 %	527320698
69	NC_021890	GGATT	2	10	95507	95516	20 %	40 %	40 %	0 %	527320698
70	NC_021890	CAATC	2	10	96609	96618	40 %	20 %	0 %	40 %	527320700
71	NC_021890	TTTGC	2	10	96743	96752	0 %	60 %	20 %	20 %	527320700
72	NC_021890	ATTCA	2	10	97007	97016	40 %	40 %	0 %	20 %	527320700
73	NC_021890	GATCC	2	10	97266	97275	20 %	20 %	20 %	40 %	527320700
74	NC_021890	GTTTT	2	10	97687	97696	0 %	80 %	20 %	0 %	527320700
75	NC_021890	AAGCT	2	10	98891	98900	40 %	20 %	20 %	20 %	527320701
76	NC_021890	AGGGG	2	10	99250	99259	20 %	0 %	80 %	0 %	527320701
77	NC_021890	ATAGC	2	10	99949	99958	40 %	20 %	20 %	20 %	527320702
78	NC_021890	AGCGA	2	10	102876	102885	40 %	0 %	40 %	20 %	527320704
79	NC_021890	TTTCT	2	10	103234	103243	0 %	80 %	0 %	20 %	527320704
80	NC_021890	ATCAT	2	10	104440	104449	40 %	40 %	0 %	20 %	527320705
81	NC_021890	GGCAT	2	10	105148	105157	20 %	20 %	40 %	20 %	527320705
82	NC_021890	AAAGC	2	10	108874	108883	60 %	0 %	20 %	20 %	527320708
83	NC_021890	GCATT	2	10	110034	110043	20 %	40 %	20 %	20 %	527320710
84	NC_021890	TGTTT	2	10	114723	114732	0 %	80 %	20 %	0 %	527320713
85	NC_021890	CATGT	2	10	115101	115110	20 %	40 %	20 %	20 %	527320713
86	NC_021890	TATCG	2	10	115805	115814	20 %	40 %	20 %	20 %	527320713
87	NC_021890	TTTCT	2	10	116321	116330	0 %	80 %	0 %	20 %	527320714
88	NC_021890	AAAGA	2	10	118566	118575	80 %	0 %	20 %	0 %	527320716
89	NC_021890	TACAA	2	10	126304	126313	60 %	20 %	0 %	20 %	527320722
90	NC_021890	ATCCA	2	10	128712	128721	40 %	20 %	0 %	40 %	527320725
91	NC_021890	GAAGA	2	10	130262	130271	60 %	0 %	40 %	0 %	527320725
92	NC_021890	AAAAG	2	10	132175	132184	80 %	0 %	20 %	0 %	527320727
93	NC_021890	GATTC	2	10	132506	132515	20 %	40 %	20 %	20 %	527320727
94	NC_021890	ATTGG	2	10	135791	135800	20 %	40 %	40 %	0 %	527320730
95	NC_021890	TGTTT	2	10	136250	136259	0 %	80 %	20 %	0 %	527320731
96	NC_021890	TCCAG	2	10	139995	140004	20 %	20 %	20 %	40 %	527320736
97	NC_021890	GTACA	2	10	140726	140735	40 %	20 %	20 %	20 %	527320737
98	NC_021890	TAGAT	2	10	141099	141108	40 %	40 %	20 %	0 %	527320737
99	NC_021890	AAAAG	2	10	141511	141520	80 %	0 %	20 %	0 %	527320738
100	NC_021890	AAAAC	2	10	141991	142000	80 %	0 %	0 %	20 %	527320739
101	NC_021890	TGCTA	2	10	143077	143086	20 %	40 %	20 %	20 %	527320741
102	NC_021890	GGAGC	2	10	143124	143133	20 %	0 %	60 %	20 %	527320741
103	NC_021890	CTGGG	2	10	144538	144547	0 %	20 %	60 %	20 %	527320743
104	NC_021890	GTTTT	2	10	145285	145294	0 %	80 %	20 %	0 %	527320744
105	NC_021890	GAACC	2	10	149019	149028	40 %	0 %	20 %	40 %	527320745
106	NC_021890	TTCTT	2	10	155191	155200	0 %	80 %	0 %	20 %	527320751
107	NC_021890	AGGAA	2	10	159749	159758	60 %	0 %	40 %	0 %	527320755
108	NC_021890	AGAGA	2	10	162980	162989	60 %	0 %	40 %	0 %	527320758
109	NC_021890	AGCAA	2	10	163415	163424	60 %	0 %	20 %	20 %	527320758
110	NC_021890	CAAAA	2	10	166918	166927	80 %	0 %	0 %	20 %	527320760
111	NC_021890	AAGAG	2	10	167751	167760	60 %	0 %	40 %	0 %	527320760
112	NC_021890	GATTG	2	10	168096	168105	20 %	40 %	40 %	0 %	527320760
113	NC_021890	GTTTT	2	10	174578	174587	0 %	80 %	20 %	0 %	527320764
114	NC_021890	TATTG	2	10	174601	174610	20 %	60 %	20 %	0 %	527320764
115	NC_021890	CAGCA	2	10	174960	174969	40 %	0 %	20 %	40 %	527320764
116	NC_021890	TAGGA	2	10	175265	175274	40 %	20 %	40 %	0 %	527320765
117	NC_021890	TGATT	2	10	177192	177201	20 %	60 %	20 %	0 %	527320766
118	NC_021890	TCAAT	2	10	177833	177842	40 %	40 %	0 %	20 %	527320766
119	NC_021890	TTTTC	2	10	177872	177881	0 %	80 %	0 %	20 %	527320766
120	NC_021890	GGAAT	2	10	179438	179447	40 %	20 %	40 %	0 %	527320767
121	NC_021890	TTGAA	2	10	181358	181367	40 %	40 %	20 %	0 %	527320768
122	NC_021890	AGGGG	2	10	182369	182378	20 %	0 %	80 %	0 %	527320768
123	NC_021890	TTGAG	2	10	182932	182941	20 %	40 %	40 %	0 %	527320769
124	NC_021890	GAATG	2	10	182957	182966	40 %	20 %	40 %	0 %	527320769
125	NC_021890	ACGAT	2	10	185122	185131	40 %	20 %	20 %	20 %	527320771
126	NC_021890	GGATC	2	10	188230	188239	20 %	20 %	40 %	20 %	527320773
127	NC_021890	CAGAT	2	10	188345	188354	40 %	20 %	20 %	20 %	527320773
128	NC_021890	TTGTA	2	10	194910	194919	20 %	60 %	20 %	0 %	527320774
129	NC_021890	AAAAG	2	10	195614	195623	80 %	0 %	20 %	0 %	527320775
130	NC_021890	TATCA	2	10	195687	195696	40 %	40 %	0 %	20 %	527320775
131	NC_021890	GATCT	2	10	195833	195842	20 %	40 %	20 %	20 %	527320775
132	NC_021890	GATTA	2	10	197086	197095	40 %	40 %	20 %	0 %	527320777
133	NC_021890	AGAAA	2	10	200097	200106	80 %	0 %	20 %	0 %	527320781
134	NC_021890	CTCTT	2	10	201977	201986	0 %	60 %	0 %	40 %	527320782
135	NC_021890	CTCTA	2	10	204469	204478	20 %	40 %	0 %	40 %	527320785
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262	NC_021890	AATTA	2	10	416674	416683	60 %	40 %	0 %	0 %	527320979
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