MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 2958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021890	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021890	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021890	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021890	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527320615
5	NC_021890	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527320616
6	NC_021890	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527320616
7	NC_021890	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	527320617
8	NC_021890	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527320617
9	NC_021890	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527320617
10	NC_021890	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527320618
11	NC_021890	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527320618
12	NC_021890	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527320618
13	NC_021890	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527320618
14	NC_021890	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527320619
15	NC_021890	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527320619
16	NC_021890	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527320619
17	NC_021890	GGAG	2	8	6306	6313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021890	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527320620
19	NC_021890	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527320620
20	NC_021890	TATG	2	8	6955	6962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021890	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527320621
22	NC_021890	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527320621
23	NC_021890	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527320622
24	NC_021890	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527320623
25	NC_021890	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527320623
26	NC_021890	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527320623
27	NC_021890	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527320623
28	NC_021890	TATT	2	8	9311	9318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021890	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527320624
30	NC_021890	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527320624
31	NC_021890	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527320624
32	NC_021890	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527320625
33	NC_021890	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527320625
34	NC_021890	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527320625
35	NC_021890	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527320625
36	NC_021890	AGAA	2	8	11205	11212	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021890	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527320626
38	NC_021890	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527320627
39	NC_021890	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527320627
40	NC_021890	AAGG	2	8	13441	13448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021890	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527320628
42	NC_021890	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527320628
43	NC_021890	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527320628
44	NC_021890	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527320629
45	NC_021890	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527320629
46	NC_021890	CAAA	2	8	16075	16082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021890	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527320630
48	NC_021890	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527320630
49	NC_021890	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527320630
50	NC_021890	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527320630
51	NC_021890	TGCG	2	8	18529	18536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021890	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527320632
53	NC_021890	TTTG	2	8	19539	19546	0 %	75 %	25 %	0 %	527320632
54	NC_021890	TGTA	2	8	20231	20238	25 %	50 %	25 %	0 %	527320633
55	NC_021890	GCCA	2	8	21023	21030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021890	CGCT	2	8	21271	21278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021890	TTAA	2	8	21292	21299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021890	GTTA	2	8	21329	21336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021890	GATC	2	8	21384	21391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021890	TGGG	2	8	21649	21656	0 %	25 %	75 %	0 %	527320634
61	NC_021890	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527320634
62	NC_021890	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527320634
63	NC_021890	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527320634
64	NC_021890	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527320634
65	NC_021890	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527320634
66	NC_021890	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527320634
67	NC_021890	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527320634
68	NC_021890	TTGA	2	8	25058	25065	25 %	50 %	25 %	0 %	527320635
69	NC_021890	TTCG	2	8	25203	25210	0 %	50 %	25 %	25 %	527320635
70	NC_021890	TAGG	2	8	25282	25289	25 %	25 %	50 %	0 %	527320635
71	NC_021890	TTCC	2	8	25406	25413	0 %	50 %	0 %	50 %	527320635
72	NC_021890	TAGG	2	8	25520	25527	25 %	25 %	50 %	0 %	527320635
73	NC_021890	TTTC	2	8	25955	25962	0 %	75 %	0 %	25 %	527320635
74	NC_021890	GCTT	2	8	26292	26299	0 %	50 %	25 %	25 %	527320635
75	NC_021890	GGAA	2	8	26875	26882	50 %	0 %	50 %	0 %	527320636
76	NC_021890	TTAA	2	8	26948	26955	50 %	50 %	0 %	0 %	527320636
77	NC_021890	AAAG	2	8	26998	27005	75 %	0 %	25 %	0 %	527320636
78	NC_021890	GGGC	2	8	27278	27285	0 %	0 %	75 %	25 %	527320636
79	NC_021890	GTTT	2	8	27561	27568	0 %	75 %	25 %	0 %	527320637
80	NC_021890	CAGA	2	8	27583	27590	50 %	0 %	25 %	25 %	527320637
81	NC_021890	ATTG	2	8	27942	27949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021890	CTTT	2	8	29555	29562	0 %	75 %	0 %	25 %	527320639
83	NC_021890	TTTG	2	8	29570	29577	0 %	75 %	25 %	0 %	527320639
84	NC_021890	TTGT	2	8	29605	29612	0 %	75 %	25 %	0 %	527320639
85	NC_021890	TGGC	2	8	29768	29775	0 %	25 %	50 %	25 %	527320639
86	NC_021890	AAAG	2	8	30328	30335	75 %	0 %	25 %	0 %	527320640
87	NC_021890	AAAC	2	8	30398	30405	75 %	0 %	0 %	25 %	527320640
88	NC_021890	GATG	2	8	30541	30548	25 %	25 %	50 %	0 %	527320640
89	NC_021890	TGAT	2	8	34144	34151	25 %	50 %	25 %	0 %	527320645
90	NC_021890	AAGA	3	12	34272	34283	75 %	0 %	25 %	0 %	527320645
91	NC_021890	AAGC	2	8	34492	34499	50 %	0 %	25 %	25 %	527320646
92	NC_021890	GTTC	2	8	34525	34532	0 %	50 %	25 %	25 %	527320646
93	NC_021890	GGCA	2	8	34904	34911	25 %	0 %	50 %	25 %	527320647
94	NC_021890	TCGA	2	8	35161	35168	25 %	25 %	25 %	25 %	527320647
95	NC_021890	TGCT	2	8	35314	35321	0 %	50 %	25 %	25 %	527320647
96	NC_021890	TTGG	2	8	35546	35553	0 %	50 %	50 %	0 %	527320647
97	NC_021890	AGAT	2	8	36266	36273	50 %	25 %	25 %	0 %	527320647
98	NC_021890	CTTT	2	8	36639	36646	0 %	75 %	0 %	25 %	527320648
99	NC_021890	ATGA	2	8	37129	37136	50 %	25 %	25 %	0 %	527320648
100	NC_021890	TAGG	2	8	37288	37295	25 %	25 %	50 %	0 %	527320648
101	NC_021890	CAAT	2	8	37472	37479	50 %	25 %	0 %	25 %	527320648
102	NC_021890	AATG	2	8	38259	38266	50 %	25 %	25 %	0 %	527320648
103	NC_021890	AGAA	2	8	39096	39103	75 %	0 %	25 %	0 %	527320649
104	NC_021890	AAGA	2	8	39148	39155	75 %	0 %	25 %	0 %	527320649
105	NC_021890	ATCC	2	8	39156	39163	25 %	25 %	0 %	50 %	527320649
106	NC_021890	TAAT	2	8	39367	39374	50 %	50 %	0 %	0 %	527320649
107	NC_021890	GTGC	2	8	41456	41463	0 %	25 %	50 %	25 %	527320651
108	NC_021890	AGAA	2	8	41875	41882	75 %	0 %	25 %	0 %	527320651
109	NC_021890	GGAT	2	8	42027	42034	25 %	25 %	50 %	0 %	527320651
110	NC_021890	AAAC	2	8	43235	43242	75 %	0 %	0 %	25 %	527320654
111	NC_021890	CAAT	2	8	43439	43446	50 %	25 %	0 %	25 %	527320654
112	NC_021890	TGTT	2	8	43819	43826	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021890	AATA	2	8	44058	44065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021890	ATTT	2	8	44196	44203	25 %	75 %	0 %	0 %	527320656
115	NC_021890	GCTC	2	8	44504	44511	0 %	25 %	25 %	50 %	527320656
116	NC_021890	TTCT	2	8	44646	44653	0 %	75 %	0 %	25 %	527320656
117	NC_021890	TTGA	2	8	45246	45253	25 %	50 %	25 %	0 %	527320657
118	NC_021890	TGTT	2	8	45418	45425	0 %	75 %	25 %	0 %	527320657
119	NC_021890	CTAT	2	8	45448	45455	25 %	50 %	0 %	25 %	527320657
120	NC_021890	TGTT	2	8	45477	45484	0 %	75 %	25 %	0 %	527320657
121	NC_021890	CTAT	2	8	45773	45780	25 %	50 %	0 %	25 %	527320657
122	NC_021890	AAGA	2	8	46269	46276	75 %	0 %	25 %	0 %	527320658
123	NC_021890	AAGA	2	8	46326	46333	75 %	0 %	25 %	0 %	527320658
124	NC_021890	AAAG	2	8	46366	46373	75 %	0 %	25 %	0 %	527320658
125	NC_021890	AAGA	2	8	46481	46488	75 %	0 %	25 %	0 %	527320658
126	NC_021890	ACTT	2	8	46742	46749	25 %	50 %	0 %	25 %	527320658
127	NC_021890	ATGG	2	8	47368	47375	25 %	25 %	50 %	0 %	527320658
128	NC_021890	AGGA	2	8	47399	47406	50 %	0 %	50 %	0 %	527320658
129	NC_021890	GAAC	2	8	47946	47953	50 %	0 %	25 %	25 %	527320658
130	NC_021890	AAGT	2	8	47981	47988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021890	AACA	2	8	48190	48197	75 %	0 %	0 %	25 %	527320659
132	NC_021890	CTTT	2	8	48386	48393	0 %	75 %	0 %	25 %	527320659
133	NC_021890	CTTT	2	8	49271	49278	0 %	75 %	0 %	25 %	527320660
134	NC_021890	GTAG	2	8	49289	49296	25 %	25 %	50 %	0 %	527320660
135	NC_021890	GAAG	2	8	50717	50724	50 %	0 %	50 %	0 %	527320661
136	NC_021890	TTCA	2	8	51139	51146	25 %	50 %	0 %	25 %	527320661
137	NC_021890	TCTA	2	8	51356	51363	25 %	50 %	0 %	25 %	527320661
138	NC_021890	TATT	2	8	52291	52298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021890	GGAA	2	8	52522	52529	50 %	0 %	50 %	0 %	527320663
140	NC_021890	TTAA	2	8	53263	53270	50 %	50 %	0 %	0 %	527320663
141	NC_021890	CCTT	2	8	53470	53477	0 %	50 %	0 %	50 %	527320664
142	NC_021890	TTTA	2	8	53637	53644	25 %	75 %	0 %	0 %	527320664
143	NC_021890	AAAG	2	8	53861	53868	75 %	0 %	25 %	0 %	527320664
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