MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 13123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021890	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320615
2	NC_021890	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320615
3	NC_021890	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320615
4	NC_021890	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320615
5	NC_021890	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320615
6	NC_021890	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320615
7	NC_021890	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320615
8	NC_021890	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320615
9	NC_021890	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320615
10	NC_021890	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320615
11	NC_021890	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320616
12	NC_021890	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320616
13	NC_021890	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320616
14	NC_021890	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320616
15	NC_021890	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320616
16	NC_021890	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320616
17	NC_021890	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320616
18	NC_021890	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320617
19	NC_021890	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320617
20	NC_021890	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320617
21	NC_021890	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320617
22	NC_021890	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320617
23	NC_021890	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320617
24	NC_021890	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320617
25	NC_021890	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320617
26	NC_021890	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320617
27	NC_021890	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320617
28	NC_021890	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320617
29	NC_021890	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320617
30	NC_021890	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320617
31	NC_021890	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320617
32	NC_021890	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320617
33	NC_021890	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320617
34	NC_021890	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320617
35	NC_021890	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320617
36	NC_021890	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320617
37	NC_021890	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320617
38	NC_021890	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320617
39	NC_021890	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320617
40	NC_021890	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320618
41	NC_021890	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320618
42	NC_021890	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320618
43	NC_021890	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320618
44	NC_021890	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320618
45	NC_021890	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320618
46	NC_021890	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320618
47	NC_021890	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320618
48	NC_021890	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320618
49	NC_021890	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320618
50	NC_021890	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320618
51	NC_021890	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320618
52	NC_021890	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320618
53	NC_021890	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320618
54	NC_021890	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320618
55	NC_021890	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320618
56	NC_021890	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320619
57	NC_021890	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320619
58	NC_021890	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320619
59	NC_021890	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320619
60	NC_021890	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320619
61	NC_021890	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320619
62	NC_021890	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320619
63	NC_021890	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320619
64	NC_021890	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320619
65	NC_021890	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320619
66	NC_021890	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320619
67	NC_021890	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320619
68	NC_021890	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320619
69	NC_021890	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320619
70	NC_021890	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320619
71	NC_021890	CTG	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320619
72	NC_021890	CAG	2	6	5911	5916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320619
73	NC_021890	AGG	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320620
74	NC_021890	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320620
75	NC_021890	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320620
76	NC_021890	AAG	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320620
77	NC_021890	TGC	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320620
78	NC_021890	TTA	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320621
79	NC_021890	GAA	2	6	7203	7208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320621
80	NC_021890	TCG	2	6	7316	7321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320622
81	NC_021890	TCC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320622
82	NC_021890	GTT	2	6	7467	7472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320622
83	NC_021890	TTA	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320622
84	NC_021890	TTC	2	6	8160	8165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320622
85	NC_021890	GAA	2	6	8304	8309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320623
86	NC_021890	ACC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527320623
87	NC_021890	CTT	2	6	8485	8490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320623
88	NC_021890	GAG	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320623
89	NC_021890	ATA	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320623
90	NC_021890	AGG	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320623
91	NC_021890	GAA	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320623
92	NC_021890	CAG	2	6	8802	8807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320623
93	NC_021890	TGT	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320623
94	NC_021890	GAG	2	6	8888	8893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320623
95	NC_021890	TAC	2	6	8956	8961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320623
96	NC_021890	GTT	2	6	9060	9065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320623
97	NC_021890	AAG	2	6	9084	9089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320623
98	NC_021890	GAG	2	6	9110	9115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320623
99	NC_021890	TTA	2	6	9400	9405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320624
100	NC_021890	AGA	2	6	9435	9440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320624
101	NC_021890	TGC	2	6	9665	9670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320624
102	NC_021890	GAA	2	6	9692	9697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320624
103	NC_021890	TCG	2	6	9752	9757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320624
104	NC_021890	TGG	2	6	9775	9780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320624
105	NC_021890	GTA	2	6	9826	9831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320625
106	NC_021890	AGC	2	6	9986	9991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320625
107	NC_021890	CTT	2	6	10000	10005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320625
108	NC_021890	ATG	2	6	10161	10166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320625
109	NC_021890	CGT	2	6	10188	10193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320625
110	NC_021890	GAC	2	6	10358	10363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320625
111	NC_021890	GGT	2	6	10445	10450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527320625
112	NC_021890	GAA	2	6	10491	10496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320625
113	NC_021890	CAA	2	6	10513	10518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320625
114	NC_021890	GGA	2	6	10575	10580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320625
115	NC_021890	CGA	2	6	10632	10637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320625
116	NC_021890	CTT	2	6	10738	10743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320625
117	NC_021890	TTG	2	6	10778	10783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320625
118	NC_021890	CTT	2	6	10792	10797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320625
119	NC_021890	ATC	2	6	10902	10907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320625
120	NC_021890	TGT	2	6	10908	10913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320625
121	NC_021890	AGA	2	6	11014	11019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320625
122	NC_021890	AGG	2	6	11053	11058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320625
123	NC_021890	GAT	2	6	11113	11118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320625
124	NC_021890	CGA	2	6	11119	11124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320625
125	NC_021890	AAT	2	6	11332	11337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320626
126	NC_021890	AGG	2	6	11575	11580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320626
127	NC_021890	ATA	3	9	11585	11593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320626
128	NC_021890	TAT	2	6	11604	11609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320626
129	NC_021890	ACA	2	6	11615	11620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320626
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