MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 2456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021890	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021890	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021890	CT	3	6	1229	1234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021890	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021890	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	527320617
6	NC_021890	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	527320617
7	NC_021890	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	527320618
8	NC_021890	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	527320619
9	NC_021890	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	527320619
10	NC_021890	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	527320619
11	NC_021890	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	527320619
12	NC_021890	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	527320619
13	NC_021890	AG	3	6	6414	6419	50 %	0 %	50 %	0 %	527320620
14	NC_021890	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021890	AC	3	6	7649	7654	50 %	0 %	0 %	50 %	527320622
16	NC_021890	AG	3	6	8392	8397	50 %	0 %	50 %	0 %	527320623
17	NC_021890	CT	4	8	8511	8518	0 %	50 %	0 %	50 %	527320623
18	NC_021890	GT	3	6	8593	8598	0 %	50 %	50 %	0 %	527320623
19	NC_021890	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021890	GA	3	6	9869	9874	50 %	0 %	50 %	0 %	527320625
21	NC_021890	AG	3	6	10086	10091	50 %	0 %	50 %	0 %	527320625
22	NC_021890	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021890	AG	3	6	11312	11317	50 %	0 %	50 %	0 %	527320626
24	NC_021890	TA	3	6	11872	11877	50 %	50 %	0 %	0 %	527320626
25	NC_021890	TG	3	6	12775	12780	0 %	50 %	50 %	0 %	527320627
26	NC_021890	AG	3	6	12924	12929	50 %	0 %	50 %	0 %	527320627
27	NC_021890	TC	3	6	13058	13063	0 %	50 %	0 %	50 %	527320627
28	NC_021890	AG	4	8	13080	13087	50 %	0 %	50 %	0 %	527320627
29	NC_021890	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021890	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021890	AC	3	6	14409	14414	50 %	0 %	0 %	50 %	527320628
32	NC_021890	AG	3	6	15748	15753	50 %	0 %	50 %	0 %	527320629
33	NC_021890	TC	3	6	15788	15793	0 %	50 %	0 %	50 %	527320629
34	NC_021890	GA	3	6	16317	16322	50 %	0 %	50 %	0 %	527320630
35	NC_021890	AG	3	6	16388	16393	50 %	0 %	50 %	0 %	527320630
36	NC_021890	GA	3	6	17172	17177	50 %	0 %	50 %	0 %	527320630
37	NC_021890	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021890	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021890	GA	3	6	17775	17780	50 %	0 %	50 %	0 %	527320631
40	NC_021890	TC	3	6	18225	18230	0 %	50 %	0 %	50 %	527320631
41	NC_021890	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021890	TC	3	6	18653	18658	0 %	50 %	0 %	50 %	527320632
43	NC_021890	GA	3	6	18668	18673	50 %	0 %	50 %	0 %	527320632
44	NC_021890	GA	3	6	18767	18772	50 %	0 %	50 %	0 %	527320632
45	NC_021890	AG	3	6	19233	19238	50 %	0 %	50 %	0 %	527320632
46	NC_021890	AG	4	8	19519	19526	50 %	0 %	50 %	0 %	527320632
47	NC_021890	GT	3	6	19782	19787	0 %	50 %	50 %	0 %	527320632
48	NC_021890	TG	3	6	20123	20128	0 %	50 %	50 %	0 %	527320633
49	NC_021890	AG	3	6	20519	20524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021890	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021890	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021890	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021890	CT	4	8	21920	21927	0 %	50 %	0 %	50 %	527320634
54	NC_021890	AT	3	6	22190	22195	50 %	50 %	0 %	0 %	527320634
55	NC_021890	AT	3	6	22514	22519	50 %	50 %	0 %	0 %	527320634
56	NC_021890	GA	3	6	23833	23838	50 %	0 %	50 %	0 %	527320634
57	NC_021890	GA	3	6	23925	23930	50 %	0 %	50 %	0 %	527320634
58	NC_021890	AG	3	6	24306	24311	50 %	0 %	50 %	0 %	527320634
59	NC_021890	GA	3	6	25724	25729	50 %	0 %	50 %	0 %	527320635
60	NC_021890	GT	3	6	25744	25749	0 %	50 %	50 %	0 %	527320635
61	NC_021890	GA	3	6	26392	26397	50 %	0 %	50 %	0 %	527320635
62	NC_021890	GA	3	6	26516	26521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021890	CT	3	6	26523	26528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021890	AT	3	6	26809	26814	50 %	50 %	0 %	0 %	527320636
65	NC_021890	GA	3	6	27023	27028	50 %	0 %	50 %	0 %	527320636
66	NC_021890	TC	3	6	27891	27896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021890	AG	3	6	27974	27979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021890	TG	3	6	28397	28402	0 %	50 %	50 %	0 %	527320638
69	NC_021890	TC	3	6	28450	28455	0 %	50 %	0 %	50 %	527320638
70	NC_021890	GC	4	8	28864	28871	0 %	0 %	50 %	50 %	527320638
71	NC_021890	TA	3	6	28986	28991	50 %	50 %	0 %	0 %	527320638
72	NC_021890	GA	3	6	29937	29942	50 %	0 %	50 %	0 %	527320639
73	NC_021890	AG	3	6	30035	30040	50 %	0 %	50 %	0 %	527320640
74	NC_021890	TC	3	6	30144	30149	0 %	50 %	0 %	50 %	527320640
75	NC_021890	GA	3	6	30765	30770	50 %	0 %	50 %	0 %	527320640
76	NC_021890	GA	3	6	31233	31238	50 %	0 %	50 %	0 %	527320640
77	NC_021890	AT	3	6	31374	31379	50 %	50 %	0 %	0 %	527320641
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79	NC_021890	CT	3	6	32139	32144	0 %	50 %	0 %	50 %	527320642
80	NC_021890	AG	3	6	32271	32276	50 %	0 %	50 %	0 %	527320642
81	NC_021890	TC	3	6	33767	33772	0 %	50 %	0 %	50 %	527320644
82	NC_021890	AG	3	6	33780	33785	50 %	0 %	50 %	0 %	527320644
83	NC_021890	AG	3	6	33918	33923	50 %	0 %	50 %	0 %	527320645
84	NC_021890	AG	3	6	34611	34616	50 %	0 %	50 %	0 %	527320646
85	NC_021890	GA	4	8	34634	34641	50 %	0 %	50 %	0 %	527320646
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87	NC_021890	GA	3	6	36387	36392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021890	AT	3	6	36489	36494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021890	GA	3	6	36537	36542	50 %	0 %	50 %	0 %	527320648
90	NC_021890	CT	3	6	37021	37026	0 %	50 %	0 %	50 %	527320648
91	NC_021890	AG	3	6	37532	37537	50 %	0 %	50 %	0 %	527320648
92	NC_021890	AG	3	6	38078	38083	50 %	0 %	50 %	0 %	527320648
93	NC_021890	AG	3	6	38605	38610	50 %	0 %	50 %	0 %	527320648
94	NC_021890	CT	3	6	38756	38761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021890	GA	3	6	39389	39394	50 %	0 %	50 %	0 %	527320649
96	NC_021890	AG	3	6	39526	39531	50 %	0 %	50 %	0 %	527320649
97	NC_021890	AG	3	6	39626	39631	50 %	0 %	50 %	0 %	527320649
98	NC_021890	CT	3	6	40127	40132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021890	AG	3	6	40603	40608	50 %	0 %	50 %	0 %	527320650
100	NC_021890	GC	3	6	40652	40657	0 %	0 %	50 %	50 %	527320650
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102	NC_021890	TC	3	6	40826	40831	0 %	50 %	0 %	50 %	527320650
103	NC_021890	GC	3	6	40891	40896	0 %	0 %	50 %	50 %	527320650
104	NC_021890	GA	3	6	41031	41036	50 %	0 %	50 %	0 %	527320650
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106	NC_021890	GA	3	6	42007	42012	50 %	0 %	50 %	0 %	527320651
107	NC_021890	GA	4	8	42017	42024	50 %	0 %	50 %	0 %	527320651
108	NC_021890	AG	3	6	42253	42258	50 %	0 %	50 %	0 %	527320651
109	NC_021890	CT	3	6	42319	42324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021890	GA	5	10	42594	42603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021890	AG	3	6	42718	42723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021890	TG	3	6	43081	43086	0 %	50 %	50 %	0 %	527320653
113	NC_021890	AC	3	6	43476	43481	50 %	0 %	0 %	50 %	527320654
114	NC_021890	TC	3	6	43645	43650	0 %	50 %	0 %	50 %	527320654
115	NC_021890	TC	3	6	43810	43815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021890	TA	3	6	43963	43968	50 %	50 %	0 %	0 %	527320655
117	NC_021890	TC	3	6	44875	44880	0 %	50 %	0 %	50 %	527320656
118	NC_021890	GA	3	6	45358	45363	50 %	0 %	50 %	0 %	527320657
119	NC_021890	TG	3	6	45576	45581	0 %	50 %	50 %	0 %	527320657
120	NC_021890	AG	3	6	45587	45592	50 %	0 %	50 %	0 %	527320657
121	NC_021890	AG	4	8	46029	46036	50 %	0 %	50 %	0 %	527320658
122	NC_021890	CT	3	6	46220	46225	0 %	50 %	0 %	50 %	527320658
123	NC_021890	TG	3	6	46421	46426	0 %	50 %	50 %	0 %	527320658
124	NC_021890	AG	3	6	46474	46479	50 %	0 %	50 %	0 %	527320658
125	NC_021890	AG	3	6	48046	48051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021890	AG	3	6	49398	49403	50 %	0 %	50 %	0 %	527320660
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128	NC_021890	TG	4	8	51394	51401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_021890	CA	3	6	53066	53071	50 %	0 %	0 %	50 %	527320663
131	NC_021890	GA	3	6	53487	53492	50 %	0 %	50 %	0 %	527320664
132	NC_021890	CT	3	6	53804	53809	0 %	50 %	0 %	50 %	527320664
133	NC_021890	CT	3	6	54467	54472	0 %	50 %	0 %	50 %	527320665
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135	NC_021890	GA	3	6	55712	55717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021890	AG	3	6	56311	56316	50 %	0 %	50 %	0 %	527320666
137	NC_021890	CT	3	6	56610	56615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021890	GT	3	6	56660	56665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021890	TG	3	6	57298	57303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021890	CT	3	6	58182	58187	0 %	50 %	0 %	50 %	527320667
141	NC_021890	GA	3	6	59743	59748	50 %	0 %	50 %	0 %	527320668
142	NC_021890	GT	3	6	59881	59886	0 %	50 %	50 %	0 %	527320668
143	NC_021890	TC	3	6	60629	60634	0 %	50 %	0 %	50 %	527320669
144	NC_021890	GA	3	6	60857	60862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021890	CA	3	6	61255	61260	50 %	0 %	0 %	50 %	527320670
146	NC_021890	AT	3	6	61505	61510	50 %	50 %	0 %	0 %	527320670
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