MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021890	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021890	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021890	CT	3	6	1229	1234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021890	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021890	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021890	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021890	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021890	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021890	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021890	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021890	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021890	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021890	AG	3	6	20519	20524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021890	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021890	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021890	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021890	GA	3	6	26516	26521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021890	CT	3	6	26523	26528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021890	TC	3	6	27891	27896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021890	AG	3	6	27974	27979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021890	GA	3	6	36387	36392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021890	AT	3	6	36489	36494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021890	CT	3	6	38756	38761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021890	CT	3	6	40127	40132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021890	CT	3	6	42319	42324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021890	GA	5	10	42594	42603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021890	AG	3	6	42718	42723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021890	TC	3	6	43810	43815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021890	AG	3	6	48046	48051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021890	TG	4	8	51394	51401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021890	GA	3	6	55712	55717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021890	CT	3	6	56610	56615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021890	GT	3	6	56660	56665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021890	TG	3	6	57298	57303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021890	GA	3	6	60857	60862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021890	AG	4	8	64876	64883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021890	CT	3	6	71943	71948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021890	TA	3	6	85304	85309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021890	TC	3	6	90525	90530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021890	GA	3	6	90657	90662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021890	CT	3	6	93007	93012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021890	GA	3	6	93535	93540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021890	TA	3	6	94151	94156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021890	TC	3	6	100034	100039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021890	AT	3	6	100085	100090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021890	GA	3	6	100362	100367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021890	AG	3	6	100498	100503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021890	GA	3	6	101153	101158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021890	AG	3	6	101223	101228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021890	AC	3	6	101305	101310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021890	TC	3	6	101333	101338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021890	GA	3	6	101379	101384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021890	GA	3	6	101625	101630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021890	TA	3	6	106760	106765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021890	TG	3	6	116014	116019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021890	CA	3	6	117932	117937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021890	AG	4	8	118600	118607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021890	GA	3	6	120422	120427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021890	TG	3	6	120681	120686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021890	CT	3	6	121306	121311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021890	AT	3	6	122009	122014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021890	TC	3	6	122219	122224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021890	GA	3	6	122549	122554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021890	GT	3	6	123605	123610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021890	CT	3	6	128142	128147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021890	TC	3	6	130464	130469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021890	TG	3	6	133373	133378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021890	TC	3	6	137114	137119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021890	CT	3	6	137143	137148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021890	CT	3	6	137325	137330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021890	AG	3	6	137489	137494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021890	AG	3	6	138227	138232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021890	GA	3	6	138290	138295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021890	AT	3	6	142522	142527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021890	GA	3	6	151759	151764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021890	AG	3	6	152874	152879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021890	AG	3	6	153301	153306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021890	AG	3	6	157326	157331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021890	TC	3	6	171789	171794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021890	AG	3	6	171921	171926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021890	CT	3	6	171939	171944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021890	TG	3	6	178430	178435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021890	TA	3	6	180160	180165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021890	AG	3	6	180520	180525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021890	GA	3	6	183670	183675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021890	AG	3	6	183825	183830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021890	CA	3	6	183841	183846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021890	CT	3	6	188763	188768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021890	CT	3	6	189708	189713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021890	CT	3	6	189794	189799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021890	AT	3	6	190562	190567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021890	TA	3	6	192218	192223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021890	TC	3	6	192237	192242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021890	TG	3	6	193115	193120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021890	TC	3	6	195160	195165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021890	AT	3	6	195507	195512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021890	AG	3	6	200283	200288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021890	TC	3	6	203275	203280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021890	AG	3	6	205107	205112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021890	CT	3	6	207033	207038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021890	GA	4	8	210094	210101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021890	CT	4	8	210142	210149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021890	AG	4	8	221378	221385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021890	CA	3	6	221437	221442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021890	TA	3	6	222932	222937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021890	CT	3	6	224574	224579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021890	TC	3	6	227575	227580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021890	AG	3	6	227606	227611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021890	TC	3	6	241802	241807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021890	AG	3	6	241828	241833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021890	AC	3	6	246752	246757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021890	GA	3	6	253838	253843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021890	TG	3	6	253948	253953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021890	AG	3	6	254752	254757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021890	TA	3	6	257569	257574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021890	AG	3	6	259859	259864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021890	TC	3	6	259885	259890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021890	AG	3	6	261363	261368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021890	TA	3	6	267723	267728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021890	CA	3	6	269530	269535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021890	TA	3	6	276983	276988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021890	AT	4	8	287543	287550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021890	CT	3	6	288395	288400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021890	TC	4	8	288486	288493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021890	TC	3	6	290177	290182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021890	TC	3	6	290234	290239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021890	CT	3	6	290707	290712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021890	AT	3	6	302721	302726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021890	CA	3	6	305050	305055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021890	AC	3	6	305091	305096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021890	GA	3	6	309781	309786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021890	AG	3	6	319001	319006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021890	AG	3	6	319082	319087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021890	CT	3	6	350972	350977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021890	CT	3	6	354043	354048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021890	TC	3	6	358269	358274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021890	CT	3	6	362185	362190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021890	AC	3	6	365518	365523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021890	GA	3	6	367430	367435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021890	TA	3	6	367710	367715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021890	GC	3	6	369239	369244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021890	TC	3	6	369543	369548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021890	TA	3	6	369613	369618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021890	CT	4	8	384821	384828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021890	CG	3	6	394660	394665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021890	CA	3	6	395710	395715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021890	TC	3	6	398257	398262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021890	CT	3	6	398747	398752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021890	GA	3	6	398877	398882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021890	GA	3	6	399008	399013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021890	CT	3	6	414100	414105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021890	CT	3	6	433850	433855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021890	AG	3	6	434197	434202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021890	GA	3	6	435892	435897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.