MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021889	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	527319696
2	NC_021889	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	527319697
3	NC_021889	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	527319697
4	NC_021889	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	527319697
5	NC_021889	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	527319697
6	NC_021889	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	527319698
7	NC_021889	TATTT	2	10	7034	7043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021889	TGGTA	2	10	7692	7701	20 %	40 %	40 %	0 %	527319700
9	NC_021889	CGAAA	2	10	9100	9109	60 %	0 %	20 %	20 %	527319701
10	NC_021889	GGCTG	2	10	9736	9745	0 %	20 %	60 %	20 %	527319702
11	NC_021889	CCTCT	2	10	10528	10537	0 %	40 %	0 %	60 %	527319703
12	NC_021889	AAAGG	2	10	10687	10696	60 %	0 %	40 %	0 %	527319703
13	NC_021889	AAGAA	2	10	11807	11816	80 %	0 %	20 %	0 %	527319704
14	NC_021889	AAAGA	2	10	13205	13214	80 %	0 %	20 %	0 %	527319705
15	NC_021889	GGTGT	2	10	13309	13318	0 %	40 %	60 %	0 %	527319705
16	NC_021889	GATTT	2	10	15052	15061	20 %	60 %	20 %	0 %	527319707
17	NC_021889	CGTTC	2	10	16163	16172	0 %	40 %	20 %	40 %	527319708
18	NC_021889	GCTTC	2	10	16536	16545	0 %	40 %	20 %	40 %	527319708
19	NC_021889	GAAGG	2	10	16907	16916	40 %	0 %	60 %	0 %	527319708
20	NC_021889	GTTGT	2	10	20333	20342	0 %	60 %	40 %	0 %	527319711
21	NC_021889	AAGAT	2	10	21445	21454	60 %	20 %	20 %	0 %	527319713
22	NC_021889	TTTGC	2	10	22056	22065	0 %	60 %	20 %	20 %	527319713
23	NC_021889	GGAAA	2	10	23810	23819	60 %	0 %	40 %	0 %	527319713
24	NC_021889	AGAGG	2	10	25534	25543	40 %	0 %	60 %	0 %	527319714
25	NC_021889	GGAGA	2	10	27313	27322	40 %	0 %	60 %	0 %	527319715
26	NC_021889	GGATA	2	10	27339	27348	40 %	20 %	40 %	0 %	527319715
27	NC_021889	ATCCG	2	10	28064	28073	20 %	20 %	20 %	40 %	527319717
28	NC_021889	AGGGT	2	10	28582	28591	20 %	20 %	60 %	0 %	527319717
29	NC_021889	CCTAT	2	10	29622	29631	20 %	40 %	0 %	40 %	527319718
30	NC_021889	GAAGG	2	10	30421	30430	40 %	0 %	60 %	0 %	527319719
31	NC_021889	GAGCT	2	10	31461	31470	20 %	20 %	40 %	20 %	527319720
32	NC_021889	AAAGA	2	10	33094	33103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021889	CTATT	2	10	36135	36144	20 %	60 %	0 %	20 %	527319726
34	NC_021889	TCCTA	2	10	36182	36191	20 %	40 %	0 %	40 %	527319726
35	NC_021889	ACGAT	2	10	38097	38106	40 %	20 %	20 %	20 %	527319727
36	NC_021889	AATTT	2	10	38988	38997	40 %	60 %	0 %	0 %	527319728
37	NC_021889	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	527319730
38	NC_021889	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	527319730
39	NC_021889	TGCAA	2	10	42327	42336	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021889	TTTAT	2	10	44172	44181	20 %	80 %	0 %	0 %	527319734
41	NC_021889	CTTTC	2	10	46267	46276	0 %	60 %	0 %	40 %	527319736
42	NC_021889	AGTTT	2	10	46806	46815	20 %	60 %	20 %	0 %	527319736
43	NC_021889	GAAGA	2	10	47939	47948	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021889	CTATT	2	10	49523	49532	20 %	60 %	0 %	20 %	527319739
45	NC_021889	CTTTT	2	10	49974	49983	0 %	80 %	0 %	20 %	527319740
46	NC_021889	CCGTA	2	10	53808	53817	20 %	20 %	20 %	40 %	527319743
47	NC_021889	AATTT	2	10	54048	54057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021889	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527319744
49	NC_021889	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527319745
50	NC_021889	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527319747
51	NC_021889	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527319750
52	NC_021889	AGTGA	2	10	63746	63755	40 %	20 %	40 %	0 %	527319751
53	NC_021889	CCTTC	2	10	64020	64029	0 %	40 %	0 %	60 %	527319751
54	NC_021889	AGGAG	2	10	66248	66257	40 %	0 %	60 %	0 %	527319753
55	NC_021889	GTTAA	2	10	66378	66387	40 %	40 %	20 %	0 %	527319753
56	NC_021889	CAAGC	2	10	68744	68753	40 %	0 %	20 %	40 %	527319755
57	NC_021889	AAAAG	2	10	68992	69001	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021889	GGAGC	2	10	69614	69623	20 %	0 %	60 %	20 %	527319756
59	NC_021889	GCGAT	2	10	69804	69813	20 %	20 %	40 %	20 %	527319756
60	NC_021889	CTCTT	2	10	70158	70167	0 %	60 %	0 %	40 %	527319756
61	NC_021889	AGGGG	2	10	70804	70813	20 %	0 %	80 %	0 %	527319756
62	NC_021889	AAGAA	2	10	70846	70855	80 %	0 %	20 %	0 %	527319756
63	NC_021889	CTTGC	2	10	71935	71944	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021889	ATTGG	2	10	72136	72145	20 %	40 %	40 %	0 %	527319758
65	NC_021889	GAAAA	2	10	73208	73217	80 %	0 %	20 %	0 %	527319758
66	NC_021889	TGGGA	2	10	73625	73634	20 %	20 %	60 %	0 %	527319759
67	NC_021889	TATTT	2	10	76152	76161	20 %	80 %	0 %	0 %	527319760
68	NC_021889	AAAAG	2	10	76685	76694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021889	ATCAA	2	10	78383	78392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021889	TGTCT	2	10	79947	79956	0 %	60 %	20 %	20 %	527319764
71	NC_021889	TTACT	2	10	80454	80463	20 %	60 %	0 %	20 %	527319764
72	NC_021889	AGAAA	2	10	81844	81853	80 %	0 %	20 %	0 %	527319766
73	NC_021889	GGAAG	2	10	82357	82366	40 %	0 %	60 %	0 %	527319766
74	NC_021889	AGCGA	2	10	84823	84832	40 %	0 %	40 %	20 %	527319768
75	NC_021889	TTTGT	2	10	85122	85131	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021889	GATCC	2	10	85908	85917	20 %	20 %	20 %	40 %	527319769
77	NC_021889	AGAGC	2	10	87243	87252	40 %	0 %	40 %	20 %	527319770
78	NC_021889	AATAA	2	10	88121	88130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021889	TTTTC	2	10	90975	90984	0 %	80 %	0 %	20 %	527319773
80	NC_021889	GGATG	2	10	91235	91244	20 %	20 %	60 %	0 %	527319774
81	NC_021889	CAACA	2	10	92774	92783	60 %	0 %	0 %	40 %	527319775
82	NC_021889	ACAGC	2	10	93819	93828	40 %	0 %	20 %	40 %	527319777
83	NC_021889	CTTTT	2	10	94193	94202	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021889	GGAAC	2	10	94531	94540	40 %	0 %	40 %	20 %	527319778
85	NC_021889	GGATT	2	10	95431	95440	20 %	40 %	40 %	0 %	527319778
86	NC_021889	CAATC	2	10	96533	96542	40 %	20 %	0 %	40 %	527319780
87	NC_021889	TTTGC	2	10	96667	96676	0 %	60 %	20 %	20 %	527319780
88	NC_021889	ATTCA	2	10	96931	96940	40 %	40 %	0 %	20 %	527319780
89	NC_021889	GATCC	2	10	97190	97199	20 %	20 %	20 %	40 %	527319780
90	NC_021889	GTTTT	2	10	97611	97620	0 %	80 %	20 %	0 %	527319780
91	NC_021889	ACAAA	2	10	97738	97747	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021889	AAGCT	2	10	98815	98824	40 %	20 %	20 %	20 %	527319781
93	NC_021889	ATAGC	2	10	99867	99876	40 %	20 %	20 %	20 %	527319782
94	NC_021889	TTCCC	2	10	100471	100480	0 %	40 %	0 %	60 %	527319783
95	NC_021889	AGCGA	2	10	102795	102804	40 %	0 %	40 %	20 %	527319785
96	NC_021889	TTTCT	2	10	103153	103162	0 %	80 %	0 %	20 %	527319785
97	NC_021889	CTTCT	2	10	103207	103216	0 %	60 %	0 %	40 %	527319785
98	NC_021889	ATCAT	2	10	104359	104368	40 %	40 %	0 %	20 %	527319786
99	NC_021889	GGCAT	2	10	105067	105076	20 %	20 %	40 %	20 %	527319786
100	NC_021889	AAAGC	2	10	108793	108802	60 %	0 %	20 %	20 %	527319789
101	NC_021889	GCATT	2	10	109953	109962	20 %	40 %	20 %	20 %	527319791
102	NC_021889	GCTCT	2	10	114018	114027	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_021889	TGTTT	2	10	114642	114651	0 %	80 %	20 %	0 %	527319794
104	NC_021889	CATGT	2	10	115020	115029	20 %	40 %	20 %	20 %	527319794
105	NC_021889	TATCG	2	10	115724	115733	20 %	40 %	20 %	20 %	527319794
106	NC_021889	TTTCT	2	10	116240	116249	0 %	80 %	0 %	20 %	527319795
107	NC_021889	GGAGA	2	10	116436	116445	40 %	0 %	60 %	0 %	527319795
108	NC_021889	AAAGA	2	10	118487	118496	80 %	0 %	20 %	0 %	527319798
109	NC_021889	CCAAT	2	10	121450	121459	40 %	20 %	0 %	40 %	527319801
110	NC_021889	GCTTC	2	10	122551	122560	0 %	40 %	20 %	40 %	527319801
111	NC_021889	TACAA	2	10	126340	126349	60 %	20 %	0 %	20 %	527319805
112	NC_021889	ATCCA	2	10	128747	128756	40 %	20 %	0 %	40 %	527319808
113	NC_021889	GAAGA	2	10	130297	130306	60 %	0 %	40 %	0 %	527319808
114	NC_021889	AAAAG	2	10	132209	132218	80 %	0 %	20 %	0 %	527319810
115	NC_021889	GATTC	2	10	132540	132549	20 %	40 %	20 %	20 %	527319810
116	NC_021889	GGATA	2	10	135158	135167	40 %	20 %	40 %	0 %	527319812
117	NC_021889	ATTGT	2	10	135855	135864	20 %	60 %	20 %	0 %	527319813
118	NC_021889	TGTTT	2	10	136281	136290	0 %	80 %	20 %	0 %	527319814
119	NC_021889	TTGCA	2	10	137071	137080	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021889	AAGAG	2	10	138323	138332	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021889	TCCAG	2	10	140028	140037	20 %	20 %	20 %	40 %	527319820
122	NC_021889	GTACA	2	10	140759	140768	40 %	20 %	20 %	20 %	527319821
123	NC_021889	TAGAT	2	10	141132	141141	40 %	40 %	20 %	0 %	527319821
124	NC_021889	AAAAG	2	10	141544	141553	80 %	0 %	20 %	0 %	527319822
125	NC_021889	AAAAC	2	10	142024	142033	80 %	0 %	0 %	20 %	527319823
126	NC_021889	TGCTA	2	10	143110	143119	20 %	40 %	20 %	20 %	527319825
127	NC_021889	GGAGC	2	10	143157	143166	20 %	0 %	60 %	20 %	527319825
128	NC_021889	CTGGG	2	10	144572	144581	0 %	20 %	60 %	20 %	527319827
129	NC_021889	GTTTT	2	10	145319	145328	0 %	80 %	20 %	0 %	527319828
130	NC_021889	GAACC	2	10	149053	149062	40 %	0 %	20 %	40 %	527319829
131	NC_021889	ATTCT	2	10	152550	152559	20 %	60 %	0 %	20 %	527319833
132	NC_021889	CTGTG	2	10	152754	152763	0 %	40 %	40 %	20 %	527319833
133	NC_021889	TTCTT	2	10	155227	155236	0 %	80 %	0 %	20 %	527319836
134	NC_021889	AGGAA	2	10	159786	159795	60 %	0 %	40 %	0 %	527319840
135	NC_021889	CAAAA	2	10	161798	161807	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021889	AGAGA	2	10	163026	163035	60 %	0 %	40 %	0 %	527319843
137	NC_021889	AGCAA	2	10	163461	163470	60 %	0 %	20 %	20 %	527319843
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252	NC_021889	CTTGT	2	10	329920	329929	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_021889	CCTTT	2	10	330376	330385	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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264	NC_021889	CCTTC	2	10	349523	349532	0 %	40 %	0 %	60 %	527320008
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402	NC_021889	TTTTC	2	10	532713	532722	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
403	NC_021889	TCTCT	2	10	533672	533681	0 %	60 %	0 %	40 %	527320168
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