MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 2523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021889	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527319694
2	NC_021889	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527319695
3	NC_021889	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527319695
4	NC_021889	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527319696
5	NC_021889	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527319696
6	NC_021889	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527319697
7	NC_021889	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527319697
8	NC_021889	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527319697
9	NC_021889	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527319697
10	NC_021889	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527319698
11	NC_021889	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527319698
12	NC_021889	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527319698
13	NC_021889	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527319699
14	NC_021889	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527319699
15	NC_021889	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527319700
16	NC_021889	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527319701
17	NC_021889	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527319701
18	NC_021889	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527319701
19	NC_021889	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527319701
20	NC_021889	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527319702
21	NC_021889	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527319702
22	NC_021889	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527319702
23	NC_021889	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527319703
24	NC_021889	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527319703
25	NC_021889	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527319703
26	NC_021889	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527319703
27	NC_021889	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527319704
28	NC_021889	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527319705
29	NC_021889	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527319705
30	NC_021889	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527319706
31	NC_021889	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527319706
32	NC_021889	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527319706
33	NC_021889	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527319707
34	NC_021889	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527319707
35	NC_021889	CTAT	2	8	16262	16269	25 %	50 %	0 %	25 %	527319708
36	NC_021889	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527319708
37	NC_021889	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527319708
38	NC_021889	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527319708
39	NC_021889	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527319708
40	NC_021889	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527319710
41	NC_021889	GATG	2	8	21647	21654	25 %	25 %	50 %	0 %	527319713
42	NC_021889	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527319713
43	NC_021889	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527319713
44	NC_021889	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527319713
45	NC_021889	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527319713
46	NC_021889	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527319713
47	NC_021889	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527319713
48	NC_021889	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527319713
49	NC_021889	TTGA	2	8	25056	25063	25 %	50 %	25 %	0 %	527319714
50	NC_021889	TAGG	2	8	25280	25287	25 %	25 %	50 %	0 %	527319714
51	NC_021889	TTCC	2	8	25404	25411	0 %	50 %	0 %	50 %	527319714
52	NC_021889	TAGG	2	8	25518	25525	25 %	25 %	50 %	0 %	527319714
53	NC_021889	GCTT	2	8	26290	26297	0 %	50 %	25 %	25 %	527319714
54	NC_021889	GGAA	2	8	26873	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	527319715
55	NC_021889	TTAA	2	8	26946	26953	50 %	50 %	0 %	0 %	527319715
56	NC_021889	AAAG	2	8	26996	27003	75 %	0 %	25 %	0 %	527319715
57	NC_021889	GGGC	2	8	27276	27283	0 %	0 %	75 %	25 %	527319715
58	NC_021889	GTTT	2	8	27559	27566	0 %	75 %	25 %	0 %	527319716
59	NC_021889	CAGA	2	8	27581	27588	50 %	0 %	25 %	25 %	527319716
60	NC_021889	CTTT	2	8	29553	29560	0 %	75 %	0 %	25 %	527319718
61	NC_021889	TTTG	2	8	29568	29575	0 %	75 %	25 %	0 %	527319718
62	NC_021889	TTGT	2	8	29603	29610	0 %	75 %	25 %	0 %	527319718
63	NC_021889	TGGC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	527319718
64	NC_021889	AAAG	2	8	30326	30333	75 %	0 %	25 %	0 %	527319719
65	NC_021889	AAAC	2	8	30396	30403	75 %	0 %	0 %	25 %	527319719
66	NC_021889	GATG	2	8	30539	30546	25 %	25 %	50 %	0 %	527319719
67	NC_021889	GATA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	25 %	0 %	527319721
68	NC_021889	TGAT	2	8	34143	34150	25 %	50 %	25 %	0 %	527319724
69	NC_021889	AAGA	3	12	34271	34282	75 %	0 %	25 %	0 %	527319724
70	NC_021889	AAGC	2	8	34491	34498	50 %	0 %	25 %	25 %	527319725
71	NC_021889	GTTC	2	8	34524	34531	0 %	50 %	25 %	25 %	527319725
72	NC_021889	GGCA	2	8	34903	34910	25 %	0 %	50 %	25 %	527319726
73	NC_021889	TGCT	2	8	35313	35320	0 %	50 %	25 %	25 %	527319726
74	NC_021889	TTGG	2	8	35545	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	527319726
75	NC_021889	AGAT	2	8	36265	36272	50 %	25 %	25 %	0 %	527319726
76	NC_021889	CTTT	2	8	36637	36644	0 %	75 %	0 %	25 %	527319727
77	NC_021889	ATGA	2	8	37127	37134	50 %	25 %	25 %	0 %	527319727
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80	NC_021889	AATG	2	8	38257	38264	50 %	25 %	25 %	0 %	527319727
81	NC_021889	AGAA	2	8	39094	39101	75 %	0 %	25 %	0 %	527319728
82	NC_021889	AAGA	2	8	39146	39153	75 %	0 %	25 %	0 %	527319728
83	NC_021889	ATCC	2	8	39154	39161	25 %	25 %	0 %	50 %	527319728
84	NC_021889	TAAT	2	8	39365	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	527319728
85	NC_021889	GTGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	527319730
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90	NC_021889	ATTT	2	8	44123	44130	25 %	75 %	0 %	0 %	527319734
91	NC_021889	GCTC	2	8	44431	44438	0 %	25 %	25 %	50 %	527319734
92	NC_021889	TTCT	2	8	44573	44580	0 %	75 %	0 %	25 %	527319734
93	NC_021889	TTGA	2	8	45173	45180	25 %	50 %	25 %	0 %	527319735
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95	NC_021889	CTAT	2	8	45375	45382	25 %	50 %	0 %	25 %	527319735
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97	NC_021889	CTAT	2	8	45700	45707	25 %	50 %	0 %	25 %	527319735
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99	NC_021889	AAGA	2	8	46251	46258	75 %	0 %	25 %	0 %	527319736
100	NC_021889	AAAG	2	8	46291	46298	75 %	0 %	25 %	0 %	527319736
101	NC_021889	AAGA	2	8	46406	46413	75 %	0 %	25 %	0 %	527319736
102	NC_021889	ACTT	2	8	46667	46674	25 %	50 %	0 %	25 %	527319736
103	NC_021889	ATGG	2	8	47293	47300	25 %	25 %	50 %	0 %	527319736
104	NC_021889	AGGA	2	8	47324	47331	50 %	0 %	50 %	0 %	527319736
105	NC_021889	GAAC	2	8	47871	47878	50 %	0 %	25 %	25 %	527319736
106	NC_021889	AACA	2	8	48118	48125	75 %	0 %	0 %	25 %	527319737
107	NC_021889	CTTT	2	8	48314	48321	0 %	75 %	0 %	25 %	527319737
108	NC_021889	CTTT	2	8	49199	49206	0 %	75 %	0 %	25 %	527319738
109	NC_021889	GTAG	2	8	49217	49224	25 %	25 %	50 %	0 %	527319738
110	NC_021889	GAAG	2	8	50647	50654	50 %	0 %	50 %	0 %	527319740
111	NC_021889	TTCA	2	8	51069	51076	25 %	50 %	0 %	25 %	527319740
112	NC_021889	TCTA	2	8	51286	51293	25 %	50 %	0 %	25 %	527319740
113	NC_021889	GGAA	2	8	52403	52410	50 %	0 %	50 %	0 %	527319742
114	NC_021889	TTAA	2	8	53144	53151	50 %	50 %	0 %	0 %	527319742
115	NC_021889	CCTT	2	8	53351	53358	0 %	50 %	0 %	50 %	527319743
116	NC_021889	TTTA	2	8	53518	53525	25 %	75 %	0 %	0 %	527319743
117	NC_021889	AAAG	2	8	53742	53749	75 %	0 %	25 %	0 %	527319743
118	NC_021889	GATT	2	8	53879	53886	25 %	50 %	25 %	0 %	527319743
119	NC_021889	AATC	2	8	53934	53941	50 %	25 %	0 %	25 %	527319743
120	NC_021889	TATT	2	8	53995	54002	25 %	75 %	0 %	0 %	527319743
121	NC_021889	TCGA	2	8	54383	54390	25 %	25 %	25 %	25 %	527319744
122	NC_021889	CTTC	2	8	54477	54484	0 %	50 %	0 %	50 %	527319744
123	NC_021889	GAAT	2	8	54512	54519	50 %	25 %	25 %	0 %	527319744
124	NC_021889	TTGA	2	8	54582	54589	25 %	50 %	25 %	0 %	527319744
125	NC_021889	GGAA	2	8	54938	54945	50 %	0 %	50 %	0 %	527319744
126	NC_021889	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527319744
127	NC_021889	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527319745
128	NC_021889	TTGC	2	8	55983	55990	0 %	50 %	25 %	25 %	527319745
129	NC_021889	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527319745
130	NC_021889	GAAA	2	8	58105	58112	75 %	0 %	25 %	0 %	527319746
131	NC_021889	AGGT	2	8	58144	58151	25 %	25 %	50 %	0 %	527319746
132	NC_021889	CGTT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	25 %	25 %	527319747
133	NC_021889	GGAG	2	8	59311	59318	25 %	0 %	75 %	0 %	527319747
134	NC_021889	GTAA	2	8	59363	59370	50 %	25 %	25 %	0 %	527319747
135	NC_021889	ATGG	2	8	59590	59597	25 %	25 %	50 %	0 %	527319747
136	NC_021889	ATAA	2	8	59736	59743	75 %	25 %	0 %	0 %	527319747
137	NC_021889	ATGT	2	8	60186	60193	25 %	50 %	25 %	0 %	527319747
138	NC_021889	CATT	2	8	60215	60222	25 %	50 %	0 %	25 %	527319747
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