MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 2369

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021889	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021889	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021889	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021889	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	527319696
5	NC_021889	TC	3	6	2234	2239	0 %	50 %	0 %	50 %	527319696
6	NC_021889	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	527319696
7	NC_021889	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	527319697
8	NC_021889	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	527319698
9	NC_021889	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	527319698
10	NC_021889	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	527319698
11	NC_021889	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	527319698
12	NC_021889	TA	3	6	5603	5608	50 %	50 %	0 %	0 %	527319698
13	NC_021889	AG	3	6	5940	5945	50 %	0 %	50 %	0 %	527319698
14	NC_021889	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021889	AC	3	6	7649	7654	50 %	0 %	0 %	50 %	527319700
16	NC_021889	AG	3	6	8392	8397	50 %	0 %	50 %	0 %	527319701
17	NC_021889	CT	4	8	8511	8518	0 %	50 %	0 %	50 %	527319701
18	NC_021889	GT	3	6	8593	8598	0 %	50 %	50 %	0 %	527319701
19	NC_021889	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021889	GA	3	6	9869	9874	50 %	0 %	50 %	0 %	527319703
21	NC_021889	AG	3	6	10086	10091	50 %	0 %	50 %	0 %	527319703
22	NC_021889	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021889	AG	3	6	11312	11317	50 %	0 %	50 %	0 %	527319704
24	NC_021889	TA	3	6	11872	11877	50 %	50 %	0 %	0 %	527319704
25	NC_021889	TG	3	6	12775	12780	0 %	50 %	50 %	0 %	527319705
26	NC_021889	AG	3	6	12924	12929	50 %	0 %	50 %	0 %	527319705
27	NC_021889	AG	4	8	13080	13087	50 %	0 %	50 %	0 %	527319705
28	NC_021889	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021889	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021889	AC	3	6	14409	14414	50 %	0 %	0 %	50 %	527319706
31	NC_021889	CT	3	6	14698	14703	0 %	50 %	0 %	50 %	527319706
32	NC_021889	AG	3	6	15748	15753	50 %	0 %	50 %	0 %	527319707
33	NC_021889	TC	3	6	15788	15793	0 %	50 %	0 %	50 %	527319707
34	NC_021889	GA	3	6	16317	16322	50 %	0 %	50 %	0 %	527319708
35	NC_021889	AG	3	6	16388	16393	50 %	0 %	50 %	0 %	527319708
36	NC_021889	GA	3	6	17172	17177	50 %	0 %	50 %	0 %	527319708
37	NC_021889	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021889	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021889	GA	3	6	17775	17780	50 %	0 %	50 %	0 %	527319709
40	NC_021889	TC	3	6	18225	18230	0 %	50 %	0 %	50 %	527319709
41	NC_021889	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021889	TC	3	6	18653	18658	0 %	50 %	0 %	50 %	527319710
43	NC_021889	GA	3	6	18668	18673	50 %	0 %	50 %	0 %	527319710
44	NC_021889	GA	3	6	18767	18772	50 %	0 %	50 %	0 %	527319710
45	NC_021889	AG	3	6	19233	19238	50 %	0 %	50 %	0 %	527319710
46	NC_021889	AG	4	8	19519	19526	50 %	0 %	50 %	0 %	527319710
47	NC_021889	GT	3	6	19782	19787	0 %	50 %	50 %	0 %	527319710
48	NC_021889	AG	3	6	20010	20015	50 %	0 %	50 %	0 %	527319711
49	NC_021889	TG	3	6	20123	20128	0 %	50 %	50 %	0 %	527319711
50	NC_021889	AG	3	6	20519	20524	50 %	0 %	50 %	0 %	527319712
51	NC_021889	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021889	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021889	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021889	CT	4	8	21920	21927	0 %	50 %	0 %	50 %	527319713
55	NC_021889	AT	3	6	22190	22195	50 %	50 %	0 %	0 %	527319713
56	NC_021889	AT	3	6	22514	22519	50 %	50 %	0 %	0 %	527319713
57	NC_021889	GA	3	6	23833	23838	50 %	0 %	50 %	0 %	527319713
58	NC_021889	GA	3	6	23925	23930	50 %	0 %	50 %	0 %	527319713
59	NC_021889	AG	3	6	24306	24311	50 %	0 %	50 %	0 %	527319713
60	NC_021889	GA	3	6	25722	25727	50 %	0 %	50 %	0 %	527319714
61	NC_021889	GT	3	6	25742	25747	0 %	50 %	50 %	0 %	527319714
62	NC_021889	TA	3	6	25944	25949	50 %	50 %	0 %	0 %	527319714
63	NC_021889	GA	3	6	26390	26395	50 %	0 %	50 %	0 %	527319714
64	NC_021889	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021889	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021889	AT	3	6	26807	26812	50 %	50 %	0 %	0 %	527319715
67	NC_021889	GA	3	6	27021	27026	50 %	0 %	50 %	0 %	527319715
68	NC_021889	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021889	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021889	TG	3	6	28395	28400	0 %	50 %	50 %	0 %	527319717
71	NC_021889	TC	3	6	28448	28453	0 %	50 %	0 %	50 %	527319717
72	NC_021889	GC	4	8	28862	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	527319717
73	NC_021889	TA	3	6	28984	28989	50 %	50 %	0 %	0 %	527319717
74	NC_021889	GA	3	6	29935	29940	50 %	0 %	50 %	0 %	527319718
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76	NC_021889	TC	3	6	30142	30147	0 %	50 %	0 %	50 %	527319719
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83	NC_021889	TC	3	6	33766	33771	0 %	50 %	0 %	50 %	527319723
84	NC_021889	AG	3	6	33779	33784	50 %	0 %	50 %	0 %	527319723
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91	NC_021889	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021889	GA	3	6	36535	36540	50 %	0 %	50 %	0 %	527319727
93	NC_021889	CT	3	6	37019	37024	0 %	50 %	0 %	50 %	527319727
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95	NC_021889	AG	3	6	38076	38081	50 %	0 %	50 %	0 %	527319727
96	NC_021889	AG	3	6	38603	38608	50 %	0 %	50 %	0 %	527319727
97	NC_021889	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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99	NC_021889	AG	3	6	39524	39529	50 %	0 %	50 %	0 %	527319728
100	NC_021889	AG	3	6	39624	39629	50 %	0 %	50 %	0 %	527319728
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104	NC_021889	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	527319729
105	NC_021889	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	527319729
106	NC_021889	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	527319729
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108	NC_021889	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	527319729
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110	NC_021889	GA	3	6	42004	42009	50 %	0 %	50 %	0 %	527319730
111	NC_021889	GA	4	8	42014	42021	50 %	0 %	50 %	0 %	527319730
112	NC_021889	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021889	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021889	AG	3	6	42646	42651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021889	TG	3	6	43009	43014	0 %	50 %	50 %	0 %	527319731
116	NC_021889	AC	3	6	43404	43409	50 %	0 %	0 %	50 %	527319732
117	NC_021889	TC	3	6	43573	43578	0 %	50 %	0 %	50 %	527319732
118	NC_021889	TC	3	6	43738	43743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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124	NC_021889	AG	4	8	45954	45961	50 %	0 %	50 %	0 %	527319736
125	NC_021889	CT	3	6	46145	46150	0 %	50 %	0 %	50 %	527319736
126	NC_021889	TG	3	6	46346	46351	0 %	50 %	50 %	0 %	527319736
127	NC_021889	AG	3	6	46399	46404	50 %	0 %	50 %	0 %	527319736
128	NC_021889	AG	3	6	47974	47979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021889	AG	3	6	49326	49331	50 %	0 %	50 %	0 %	527319738
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131	NC_021889	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021889	TC	3	6	52896	52901	0 %	50 %	0 %	50 %	527319742
133	NC_021889	CA	3	6	52947	52952	50 %	0 %	0 %	50 %	527319742
134	NC_021889	GA	3	6	53368	53373	50 %	0 %	50 %	0 %	527319743
135	NC_021889	CT	3	6	53685	53690	0 %	50 %	0 %	50 %	527319743
136	NC_021889	CT	3	6	54348	54353	0 %	50 %	0 %	50 %	527319744
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140	NC_021889	GT	3	6	56538	56543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_021889	GA	3	6	60790	60795	50 %	0 %	50 %	0 %	527319749
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