MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 2954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021888	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021888	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021888	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021888	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	527318739
5	NC_021888	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	527318740
6	NC_021888	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	527318740
7	NC_021888	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	527318741
8	NC_021888	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	527318741
9	NC_021888	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	527318741
10	NC_021888	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	527318742
11	NC_021888	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	527318742
12	NC_021888	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	527318742
13	NC_021888	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	527318742
14	NC_021888	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	527318743
15	NC_021888	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	527318743
16	NC_021888	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	527318743
17	NC_021888	GGAG	2	8	6306	6313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021888	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	527318744
19	NC_021888	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	527318744
20	NC_021888	TATG	2	8	6955	6962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021888	ATTT	2	8	7096	7103	25 %	75 %	0 %	0 %	527318745
22	NC_021888	TTTG	2	8	7188	7195	0 %	75 %	25 %	0 %	527318745
23	NC_021888	AAGC	2	8	7822	7829	50 %	0 %	25 %	25 %	527318746
24	NC_021888	ATTG	2	8	8220	8227	25 %	50 %	25 %	0 %	527318747
25	NC_021888	AGCG	2	8	8687	8694	25 %	0 %	50 %	25 %	527318747
26	NC_021888	AAAG	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	527318747
27	NC_021888	CTTT	2	8	9048	9055	0 %	75 %	0 %	25 %	527318747
28	NC_021888	TATT	2	8	9311	9318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021888	TTCG	2	8	9422	9429	0 %	50 %	25 %	25 %	527318748
30	NC_021888	AATT	2	8	9527	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	527318748
31	NC_021888	ATGG	2	8	9586	9593	25 %	25 %	50 %	0 %	527318748
32	NC_021888	CTTT	2	8	10211	10218	0 %	75 %	0 %	25 %	527318749
33	NC_021888	GCAA	2	8	10428	10435	50 %	0 %	25 %	25 %	527318749
34	NC_021888	AGCC	2	8	10658	10665	25 %	0 %	25 %	50 %	527318749
35	NC_021888	GAAA	2	8	10801	10808	75 %	0 %	25 %	0 %	527318749
36	NC_021888	AGAA	2	8	11205	11212	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021888	AATG	2	8	11544	11551	50 %	25 %	25 %	0 %	527318750
38	NC_021888	GTTT	2	8	12576	12583	0 %	75 %	25 %	0 %	527318751
39	NC_021888	ATGC	2	8	13006	13013	25 %	25 %	25 %	25 %	527318751
40	NC_021888	AAGG	2	8	13441	13448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021888	TTGT	2	8	14042	14049	0 %	75 %	25 %	0 %	527318752
42	NC_021888	TTCT	2	8	14213	14220	0 %	75 %	0 %	25 %	527318752
43	NC_021888	ATTT	2	8	14419	14426	25 %	75 %	0 %	0 %	527318752
44	NC_021888	TTTC	2	8	15081	15088	0 %	75 %	0 %	25 %	527318753
45	NC_021888	AAAT	2	8	15563	15570	75 %	25 %	0 %	0 %	527318753
46	NC_021888	CAAA	2	8	16075	16082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021888	GTAA	2	8	16405	16412	50 %	25 %	25 %	0 %	527318754
48	NC_021888	CTAA	2	8	16598	16605	50 %	25 %	0 %	25 %	527318754
49	NC_021888	AGAA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	527318754
50	NC_021888	ATTT	2	8	17007	17014	25 %	75 %	0 %	0 %	527318754
51	NC_021888	TGCG	2	8	18529	18536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021888	GAAG	2	8	19513	19520	50 %	0 %	50 %	0 %	527318756
53	NC_021888	TTTG	2	8	19539	19546	0 %	75 %	25 %	0 %	527318756
54	NC_021888	TGTA	2	8	20231	20238	25 %	50 %	25 %	0 %	527318757
55	NC_021888	GCCA	2	8	21023	21030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021888	CGCT	2	8	21271	21278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021888	TTAA	2	8	21292	21299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021888	GTTA	2	8	21329	21336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021888	GATC	2	8	21384	21391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021888	TGGG	2	8	21649	21656	0 %	25 %	75 %	0 %	527318758
61	NC_021888	CATT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	527318758
62	NC_021888	GCTT	2	8	23049	23056	0 %	50 %	25 %	25 %	527318758
63	NC_021888	GGTT	2	8	23097	23104	0 %	50 %	50 %	0 %	527318758
64	NC_021888	TTCT	2	8	23467	23474	0 %	75 %	0 %	25 %	527318758
65	NC_021888	TAAC	2	8	23569	23576	50 %	25 %	0 %	25 %	527318758
66	NC_021888	CATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	0 %	25 %	527318758
67	NC_021888	GGTA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	527318758
68	NC_021888	TTGA	2	8	25058	25065	25 %	50 %	25 %	0 %	527318759
69	NC_021888	TTCG	2	8	25203	25210	0 %	50 %	25 %	25 %	527318759
70	NC_021888	TAGG	2	8	25282	25289	25 %	25 %	50 %	0 %	527318759
71	NC_021888	TTCC	2	8	25406	25413	0 %	50 %	0 %	50 %	527318759
72	NC_021888	TAGG	2	8	25520	25527	25 %	25 %	50 %	0 %	527318759
73	NC_021888	TTTC	2	8	25955	25962	0 %	75 %	0 %	25 %	527318759
74	NC_021888	GCTT	2	8	26292	26299	0 %	50 %	25 %	25 %	527318759
75	NC_021888	GGAA	2	8	26875	26882	50 %	0 %	50 %	0 %	527318760
76	NC_021888	TTAA	2	8	26948	26955	50 %	50 %	0 %	0 %	527318760
77	NC_021888	AAAG	2	8	26998	27005	75 %	0 %	25 %	0 %	527318760
78	NC_021888	GGGC	2	8	27278	27285	0 %	0 %	75 %	25 %	527318760
79	NC_021888	GTTT	2	8	27561	27568	0 %	75 %	25 %	0 %	527318761
80	NC_021888	CAGA	2	8	27583	27590	50 %	0 %	25 %	25 %	527318761
81	NC_021888	ATTG	2	8	27942	27949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021888	CTTT	2	8	29555	29562	0 %	75 %	0 %	25 %	527318763
83	NC_021888	TTTG	2	8	29570	29577	0 %	75 %	25 %	0 %	527318763
84	NC_021888	TTGT	2	8	29605	29612	0 %	75 %	25 %	0 %	527318763
85	NC_021888	TGGC	2	8	29768	29775	0 %	25 %	50 %	25 %	527318763
86	NC_021888	AAAG	2	8	30328	30335	75 %	0 %	25 %	0 %	527318764
87	NC_021888	AAAC	2	8	30398	30405	75 %	0 %	0 %	25 %	527318764
88	NC_021888	GATG	2	8	30541	30548	25 %	25 %	50 %	0 %	527318764
89	NC_021888	TGAT	2	8	34144	34151	25 %	50 %	25 %	0 %	527318769
90	NC_021888	AAGA	3	12	34272	34283	75 %	0 %	25 %	0 %	527318769
91	NC_021888	AAGC	2	8	34492	34499	50 %	0 %	25 %	25 %	527318770
92	NC_021888	GTTC	2	8	34525	34532	0 %	50 %	25 %	25 %	527318770
93	NC_021888	GGCA	2	8	34904	34911	25 %	0 %	50 %	25 %	527318771
94	NC_021888	TCGA	2	8	35161	35168	25 %	25 %	25 %	25 %	527318771
95	NC_021888	TGCT	2	8	35314	35321	0 %	50 %	25 %	25 %	527318771
96	NC_021888	TTGG	2	8	35546	35553	0 %	50 %	50 %	0 %	527318771
97	NC_021888	AGAT	2	8	36266	36273	50 %	25 %	25 %	0 %	527318771
98	NC_021888	CTTT	2	8	36639	36646	0 %	75 %	0 %	25 %	527318772
99	NC_021888	ATGA	2	8	37129	37136	50 %	25 %	25 %	0 %	527318772
100	NC_021888	TAGG	2	8	37288	37295	25 %	25 %	50 %	0 %	527318772
101	NC_021888	CAAT	2	8	37472	37479	50 %	25 %	0 %	25 %	527318772
102	NC_021888	AATG	2	8	38259	38266	50 %	25 %	25 %	0 %	527318772
103	NC_021888	AGAA	2	8	39096	39103	75 %	0 %	25 %	0 %	527318773
104	NC_021888	AAGA	2	8	39148	39155	75 %	0 %	25 %	0 %	527318773
105	NC_021888	ATCC	2	8	39156	39163	25 %	25 %	0 %	50 %	527318773
106	NC_021888	TAAT	2	8	39367	39374	50 %	50 %	0 %	0 %	527318773
107	NC_021888	GTGC	2	8	41456	41463	0 %	25 %	50 %	25 %	527318775
108	NC_021888	AGAA	2	8	41875	41882	75 %	0 %	25 %	0 %	527318775
109	NC_021888	GGAT	2	8	42027	42034	25 %	25 %	50 %	0 %	527318775
110	NC_021888	AAAC	2	8	43235	43242	75 %	0 %	0 %	25 %	527318778
111	NC_021888	CAAT	2	8	43439	43446	50 %	25 %	0 %	25 %	527318778
112	NC_021888	TGTT	2	8	43819	43826	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021888	AATA	2	8	44058	44065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021888	ATTT	2	8	44196	44203	25 %	75 %	0 %	0 %	527318780
115	NC_021888	GCTC	2	8	44504	44511	0 %	25 %	25 %	50 %	527318780
116	NC_021888	TTCT	2	8	44646	44653	0 %	75 %	0 %	25 %	527318780
117	NC_021888	TTGA	2	8	45246	45253	25 %	50 %	25 %	0 %	527318781
118	NC_021888	TGTT	2	8	45418	45425	0 %	75 %	25 %	0 %	527318781
119	NC_021888	CTAT	2	8	45448	45455	25 %	50 %	0 %	25 %	527318781
120	NC_021888	TGTT	2	8	45477	45484	0 %	75 %	25 %	0 %	527318781
121	NC_021888	CTAT	2	8	45773	45780	25 %	50 %	0 %	25 %	527318781
122	NC_021888	AAGA	2	8	46269	46276	75 %	0 %	25 %	0 %	527318782
123	NC_021888	AAGA	2	8	46326	46333	75 %	0 %	25 %	0 %	527318782
124	NC_021888	AAAG	2	8	46366	46373	75 %	0 %	25 %	0 %	527318782
125	NC_021888	AAGA	2	8	46481	46488	75 %	0 %	25 %	0 %	527318782
126	NC_021888	ACTT	2	8	46742	46749	25 %	50 %	0 %	25 %	527318782
127	NC_021888	ATGG	2	8	47368	47375	25 %	25 %	50 %	0 %	527318782
128	NC_021888	AGGA	2	8	47399	47406	50 %	0 %	50 %	0 %	527318782
129	NC_021888	GAAC	2	8	47946	47953	50 %	0 %	25 %	25 %	527318782
130	NC_021888	AAGT	2	8	47981	47988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021888	AACA	2	8	48190	48197	75 %	0 %	0 %	25 %	527318783
132	NC_021888	CTTT	2	8	48386	48393	0 %	75 %	0 %	25 %	527318783
133	NC_021888	CTTT	2	8	49271	49278	0 %	75 %	0 %	25 %	527318784
134	NC_021888	GTAG	2	8	49289	49296	25 %	25 %	50 %	0 %	527318784
135	NC_021888	GAAG	2	8	50717	50724	50 %	0 %	50 %	0 %	527318785
136	NC_021888	TTCA	2	8	51139	51146	25 %	50 %	0 %	25 %	527318785
137	NC_021888	TCTA	2	8	51356	51363	25 %	50 %	0 %	25 %	527318785
138	NC_021888	TATT	2	8	52291	52298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021888	GGAA	2	8	52522	52529	50 %	0 %	50 %	0 %	527318787
140	NC_021888	TTAA	2	8	53263	53270	50 %	50 %	0 %	0 %	527318787
141	NC_021888	CCTT	2	8	53470	53477	0 %	50 %	0 %	50 %	527318788
142	NC_021888	TTTA	2	8	53637	53644	25 %	75 %	0 %	0 %	527318788
143	NC_021888	AAAG	2	8	53861	53868	75 %	0 %	25 %	0 %	527318788
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