MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2(s)/46

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021887	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021887	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021887	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021887	GGAG	2	8	6306	6313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021887	TATG	2	8	6955	6962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021887	TATT	2	8	9311	9318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021887	AGAA	2	8	11205	11212	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021887	AAGG	2	8	13441	13448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021887	CAAA	2	8	16075	16082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021887	TGCG	2	8	18529	18536	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021887	GCCA	2	8	21023	21030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021887	CGCT	2	8	21271	21278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021887	TTAA	2	8	21292	21299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021887	GTTA	2	8	21329	21336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021887	GATC	2	8	21384	21391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021887	ATTG	2	8	27940	27947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021887	TGTT	2	8	43747	43754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021887	AATA	2	8	43985	43992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021887	AAGT	2	8	47906	47913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021887	TATT	2	8	52172	52179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021887	GTTT	2	8	54032	54039	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021887	TGTT	2	8	54040	54047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021887	TAAT	2	8	54084	54091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021887	AGCT	2	8	56482	56489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021887	GGTT	2	8	57176	57183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021887	TAGA	2	8	58817	58824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021887	TGAA	2	8	58922	58929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021887	ACAA	2	8	67392	67399	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021887	AAGG	2	8	67490	67497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021887	GATA	2	8	71959	71966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021887	TCTA	2	8	76618	76625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021887	GTTT	2	8	79392	79399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021887	GGTT	2	8	79747	79754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021887	GTTT	2	8	88054	88061	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021887	TTTA	2	8	88077	88084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021887	GTTT	2	8	88089	88096	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021887	GTTT	2	8	88140	88147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021887	AACA	2	8	88153	88160	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021887	GAAT	2	8	90407	90414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021887	AAGT	2	8	90439	90446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021887	AAAT	2	8	93685	93692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021887	CATT	2	8	94332	94339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021887	TATT	2	8	97715	97722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021887	GATA	2	8	99604	99611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021887	AAGA	2	8	106697	106704	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021887	CTGG	2	8	120411	120418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021887	CTTC	2	8	120984	120991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021887	AAAG	2	8	122524	122531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021887	TCTA	2	8	122593	122600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021887	GTTT	2	8	134946	134953	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021887	ATCT	2	8	151665	151672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021887	GCTG	2	8	151704	151711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021887	TGTT	2	8	157279	157286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021887	AAAG	2	8	158121	158128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021887	TTTA	2	8	158130	158137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021887	TAAT	2	8	158247	158254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021887	TAAT	2	8	159083	159090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021887	GCTT	2	8	161728	161735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021887	CTTC	2	8	165799	165806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021887	TTAG	2	8	170207	170214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021887	AAAC	2	8	171954	171961	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021887	GTAT	2	8	173136	173143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021887	GGAA	2	8	178322	178329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021887	GCTG	2	8	178489	178496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021887	TTTC	2	8	178776	178783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021887	TTCC	2	8	181155	181162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021887	TCTA	2	8	181223	181230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021887	AATT	2	8	181357	181364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021887	AAGA	2	8	182714	182721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021887	TCGC	2	8	183576	183583	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021887	AAAC	2	8	188018	188025	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021887	GGAC	2	8	188377	188384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021887	ACGA	2	8	198463	198470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021887	GAAA	2	8	198749	198756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021887	TAAA	2	8	199549	199556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021887	CCTT	2	8	211883	211890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021887	CTAT	2	8	215609	215616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021887	GCAA	2	8	215853	215860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021887	AATT	2	8	217190	217197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021887	CTTG	2	8	217539	217546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021887	AAAC	2	8	221269	221276	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021887	TCCT	2	8	223893	223900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021887	AAAT	2	8	239508	239515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021887	AAGA	2	8	239527	239534	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021887	TTTC	2	8	242128	242135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021887	TAAA	2	8	242962	242969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021887	AATA	2	8	246621	246628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021887	GCAG	2	8	248283	248290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021887	CCAA	2	8	250214	250221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021887	AAAC	2	8	250822	250829	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021887	TAAA	2	8	260230	260237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021887	CAAA	2	8	263165	263172	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021887	ATTT	2	8	269675	269682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021887	GTTT	2	8	275517	275524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021887	AAAG	2	8	275552	275559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021887	TGCC	2	8	276040	276047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021887	GGGA	2	8	279888	279895	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021887	TAAA	2	8	281030	281037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021887	GATA	2	8	282691	282698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021887	AATC	2	8	287816	287823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021887	ACAA	2	8	293583	293590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021887	GCTT	2	8	294913	294920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021887	CCCT	2	8	295480	295487	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_021887	TAAA	2	8	297952	297959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021887	TCCA	2	8	301111	301118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021887	TCCC	2	8	301313	301320	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_021887	ATTG	2	8	302498	302505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021887	AATA	2	8	313888	313895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021887	TAAA	2	8	313909	313916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021887	CAGA	2	8	313917	313924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021887	AATA	2	8	313984	313991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021887	CAAT	2	8	323617	323624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021887	GCTA	2	8	324307	324314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021887	TTAA	2	8	329650	329657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021887	CAGT	2	8	329996	330003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021887	TTGT	2	8	330136	330143	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021887	CAAG	2	8	336175	336182	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021887	GCAA	2	8	354981	354988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021887	TTTA	2	8	359682	359689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021887	CAAA	2	8	359976	359983	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021887	TAGT	2	8	360289	360296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021887	GCTT	2	8	364341	364348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021887	TAAA	2	8	364621	364628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021887	AAAT	2	8	365540	365547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021887	ATCT	2	8	365595	365602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021887	TAAA	2	8	377374	377381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021887	TTTA	2	8	387342	387349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021887	GATT	2	8	388101	388108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021887	AATT	2	8	388150	388157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021887	ATAA	2	8	388210	388217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021887	GCAA	2	8	391589	391596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021887	TCAT	2	8	400886	400893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021887	CAAA	2	8	403022	403029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021887	ATTT	2	8	412439	412446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021887	AGAA	2	8	412449	412456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021887	ATTA	2	8	414238	414245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021887	ACTG	2	8	420737	420744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021887	CTTT	2	8	420756	420763	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021887	GTAA	2	8	422633	422640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021887	GAAA	2	8	422682	422689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021887	TTCT	2	8	424301	424308	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021887	AACT	2	8	426533	426540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021887	CAAA	2	8	426880	426887	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021887	ACTC	2	8	431571	431578	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021887	AAAC	2	8	436603	436610	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021887	AAAT	2	8	436745	436752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021887	TAAC	2	8	439311	439318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021887	AATT	2	8	444175	444182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021887	AAAC	2	8	444188	444195	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021887	CTTC	2	8	444330	444337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_021887	TAAT	2	8	450008	450015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.