MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-L2(s)/46

Total Repeats: 344

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021887	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021887	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021887	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021887	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021887	AG	3	6	9353	9358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021887	TA	3	6	11251	11256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021887	TA	3	6	13342	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021887	TA	4	8	13566	13573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021887	AG	3	6	17518	17523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021887	GA	3	6	17531	17536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021887	CT	3	6	18453	18458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021887	AG	3	6	20519	20524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021887	GA	3	6	20677	20682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021887	AG	3	6	21194	21199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021887	CT	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021887	GA	3	6	26514	26519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021887	CT	3	6	26521	26526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021887	TC	3	6	27889	27894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021887	AG	3	6	27972	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021887	GA	3	6	36386	36391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021887	AT	3	6	36487	36492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021887	CT	3	6	38754	38759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021887	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021887	AG	3	6	42250	42255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021887	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021887	AG	3	6	42646	42651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021887	TC	3	6	43738	43743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021887	AG	3	6	47974	47979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021887	TG	3	6	51325	51330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021887	GA	3	6	55593	55598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021887	CT	3	6	56488	56493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021887	GT	3	6	56538	56543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021887	TG	3	6	57167	57172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021887	AG	4	8	64809	64816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021887	TA	3	6	69128	69133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021887	CT	3	6	71864	71869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021887	TA	3	6	85228	85233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021887	TC	3	6	90449	90454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021887	GA	3	6	90581	90586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021887	CT	3	6	92931	92936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021887	GA	3	6	93459	93464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021887	TA	3	6	94076	94081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021887	TC	3	6	99952	99957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021887	AT	3	6	100003	100008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021887	GC	3	6	102109	102114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021887	TA	3	6	106679	106684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021887	TG	3	6	115933	115938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021887	AG	4	8	118521	118528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021887	GA	3	6	120343	120348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021887	TG	3	6	120676	120681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021887	CT	3	6	121301	121306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021887	AT	3	6	122004	122009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021887	TC	3	6	122214	122219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021887	GA	3	6	122544	122549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021887	GT	3	6	123600	123605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021887	CT	3	6	128137	128142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021887	TC	3	6	130459	130464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021887	TG	3	6	133368	133373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021887	TG	3	6	136978	136983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021887	TC	3	6	137108	137113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021887	CT	3	6	137137	137142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021887	CT	3	6	137319	137324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021887	AG	3	6	138221	138226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021887	GA	3	6	138284	138289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021887	AT	3	6	142516	142521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021887	AG	3	6	157322	157327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021887	TC	3	6	171794	171799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021887	AG	3	6	171926	171931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021887	CT	3	6	171944	171949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021887	TG	3	6	178433	178438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021887	CT	3	6	178572	178577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021887	GA	3	6	179126	179131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021887	TA	3	6	183631	183636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021887	GA	3	6	183847	183852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021887	GA	3	6	184486	184491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021887	GA	3	6	184518	184523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021887	AG	3	6	188572	188577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021887	TC	3	6	188732	188737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021887	AT	3	6	189073	189078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021887	AG	3	6	192852	192857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021887	TC	3	6	195844	195849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021887	AG	3	6	197676	197681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021887	CT	3	6	197688	197693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021887	CT	3	6	199602	199607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021887	GA	4	8	202661	202668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021887	CT	4	8	202709	202716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021887	TA	3	6	204290	204295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021887	AG	3	6	213981	213986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021887	TA	3	6	215535	215540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021887	CT	3	6	217178	217183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021887	TC	3	6	220179	220184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021887	AG	3	6	220210	220215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021887	TC	3	6	234409	234414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021887	AG	3	6	234435	234440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021887	AC	3	6	239358	239363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021887	GA	3	6	246444	246449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021887	TG	3	6	246554	246559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021887	AG	3	6	247354	247359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021887	GA	3	6	248233	248238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021887	AG	3	6	248358	248363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021887	TA	3	6	250179	250184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021887	AG	3	6	252470	252475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021887	TC	3	6	252496	252501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021887	TA	3	6	260337	260342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021887	AG	3	6	260417	260422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021887	CA	3	6	262144	262149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021887	TC	3	6	264043	264048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021887	TA	3	6	269594	269599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021887	AT	4	8	280154	280161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021887	CT	3	6	281006	281011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021887	TC	4	8	281097	281104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021887	TC	3	6	282788	282793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021887	TC	3	6	282845	282850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021887	CT	3	6	283318	283323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021887	AT	3	6	295332	295337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021887	CA	3	6	297661	297666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021887	AC	3	6	297702	297707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021887	GA	3	6	302392	302397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021887	AG	3	6	311612	311617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021887	AG	3	6	311693	311698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021887	CT	3	6	343583	343588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021887	CT	3	6	346654	346659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021887	TC	3	6	350880	350885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021887	CT	3	6	354796	354801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021887	AC	3	6	358129	358134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021887	GA	3	6	360041	360046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021887	TA	3	6	360321	360326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021887	GC	3	6	361850	361855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021887	TC	3	6	362153	362158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021887	CT	4	8	377455	377462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021887	CG	3	6	387294	387299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021887	CA	3	6	388344	388349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021887	TC	3	6	390891	390896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021887	CT	3	6	391381	391386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021887	GA	3	6	391635	391640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021887	CT	3	6	406728	406733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021887	CT	3	6	425463	425468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021887	CT	3	6	426486	426491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021887	AG	3	6	426832	426837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021887	GA	3	6	428527	428532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021887	AC	3	6	432525	432530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021887	CT	3	6	436796	436801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021887	AC	3	6	436834	436839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021887	CA	3	6	439303	439308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021887	CT	3	6	440707	440712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021887	CT	3	6	449989	449994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021887	AG	3	6	456130	456135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021887	TC	3	6	462668	462673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021887	AT	3	6	462737	462742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021887	GA	4	8	464111	464118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021887	TA	3	6	464154	464159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021887	TC	3	6	475979	475984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_021887	AC	3	6	481520	481525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021887	GA	4	8	481565	481572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.