MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Syncytium symbiont of Diaphorina citri plasmid

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021886	TAA	2	6	15	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317805
2	NC_021886	TAG	2	6	153	158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527317805
3	NC_021886	ATT	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317805
4	NC_021886	CAA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527317805
5	NC_021886	ATA	2	6	335	340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317805
6	NC_021886	ATG	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527317805
7	NC_021886	TCT	2	6	667	672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317805
8	NC_021886	AAG	2	6	776	781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317805
9	NC_021886	TAA	3	9	836	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317805
10	NC_021886	CTT	2	6	845	850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317805
11	NC_021886	ATT	2	6	1014	1019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317806
12	NC_021886	AAG	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317806
13	NC_021886	TAA	3	9	1175	1183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317806
14	NC_021886	CTT	2	6	1184	1189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317806
15	NC_021886	ATA	2	6	1366	1371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021886	TTA	2	6	1509	1514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021886	ATC	2	6	1530	1535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021886	GAA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021886	TAA	2	6	1588	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021886	TAT	3	9	1604	1612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021886	TTA	2	6	1622	1627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021886	ATT	2	6	1640	1645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021886	TTA	2	6	1658	1663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021886	TAT	4	12	1730	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317807
25	NC_021886	TTA	2	6	1824	1829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
26	NC_021886	TAT	3	9	1913	1921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
27	NC_021886	TCA	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317808
28	NC_021886	CAT	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317808
29	NC_021886	ATT	2	6	2078	2083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
30	NC_021886	AAT	2	6	2166	2171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317808
31	NC_021886	TAA	2	6	2207	2212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317808
32	NC_021886	CAA	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527317808
33	NC_021886	TCT	2	6	2302	2307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317808
34	NC_021886	AAT	3	9	2328	2336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317808
35	NC_021886	AGA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317808
36	NC_021886	TAA	2	6	2567	2572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317808
37	NC_021886	TCT	2	6	2610	2615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317808
38	NC_021886	TAC	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317808
39	NC_021886	TAT	2	6	2736	2741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
40	NC_021886	ATC	2	6	2744	2749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317808
41	NC_021886	ATT	2	6	2784	2789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
42	NC_021886	ATT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
43	NC_021886	CCT	2	6	2920	2925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527317808
44	NC_021886	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
45	NC_021886	GAA	2	6	2972	2977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317809
46	NC_021886	CAG	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527317809
47	NC_021886	CTA	2	6	3046	3051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317809
48	NC_021886	ATT	3	9	3161	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317809
49	NC_021886	ATA	2	6	3271	3276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317809
50	NC_021886	ATT	2	6	3346	3351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317809
51	NC_021886	AAG	2	6	3367	3372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317809
52	NC_021886	TGT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527317809
53	NC_021886	TAA	2	6	3439	3444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317809
54	NC_021886	TTA	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317809
55	NC_021886	ATT	2	6	3499	3504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317809
56	NC_021886	AGG	2	6	3539	3544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527317809
57	NC_021886	CTT	2	6	3559	3564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317809
58	NC_021886	AGG	2	6	3620	3625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527317809
59	NC_021886	TGG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527317809
60	NC_021886	TAA	2	6	3716	3721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317809
61	NC_021886	TTG	2	6	3816	3821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527317809
62	NC_021886	ATT	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317809
63	NC_021886	TCA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317809
64	NC_021886	GTT	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527317809
65	NC_021886	TTC	2	6	4112	4117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317809
66	NC_021886	GAA	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317809
67	NC_021886	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317809
68	NC_021886	TTG	2	6	4354	4359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527317809
69	NC_021886	CAG	2	6	4417	4422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527317809
70	NC_021886	TGA	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527317810
71	NC_021886	TAG	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527317810
72	NC_021886	GAT	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527317810
73	NC_021886	GTT	2	6	5004	5009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527317810
74	NC_021886	TAT	2	6	5126	5131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317810
75	NC_021886	TCT	3	9	5132	5140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317810
76	NC_021886	CTT	2	6	5190	5195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317810
77	NC_021886	ACA	2	6	5260	5265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527317810
78	NC_021886	TAA	2	6	5316	5321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317810

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.