MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Syncytium symbiont of Diaphorina citri plasmid

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021886	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	527317805
2	NC_021886	A	8	8	46	53	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
3	NC_021886	T	6	6	176	181	0 %	100 %	0 %	0 %	527317805
4	NC_021886	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
5	NC_021886	T	6	6	312	317	0 %	100 %	0 %	0 %	527317805
6	NC_021886	A	10	10	419	428	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
7	NC_021886	A	10	10	492	501	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
8	NC_021886	T	6	6	532	537	0 %	100 %	0 %	0 %	527317805
9	NC_021886	A	6	6	751	756	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
10	NC_021886	T	7	7	787	793	0 %	100 %	0 %	0 %	527317805
11	NC_021886	A	6	6	796	801	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
12	NC_021886	A	6	6	924	929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021886	A	6	6	1090	1095	100 %	0 %	0 %	0 %	527317806
14	NC_021886	T	7	7	1126	1132	0 %	100 %	0 %	0 %	527317806
15	NC_021886	A	6	6	1135	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	527317806
16	NC_021886	A	6	6	1263	1268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021886	T	6	6	1338	1343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021886	A	6	6	1414	1419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021886	A	6	6	1490	1495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021886	T	7	7	1552	1558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021886	T	6	6	1564	1569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021886	A	6	6	1582	1587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021886	C	8	8	1707	1714	0 %	0 %	0 %	100 %	527317807
24	NC_021886	A	6	6	1758	1763	100 %	0 %	0 %	0 %	527317807
25	NC_021886	A	9	9	1799	1807	100 %	0 %	0 %	0 %	527317807
26	NC_021886	A	7	7	1817	1823	100 %	0 %	0 %	0 %	527317807
27	NC_021886	A	6	6	1941	1946	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
28	NC_021886	T	6	6	2139	2144	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
29	NC_021886	A	7	7	2200	2206	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
30	NC_021886	A	6	6	2244	2249	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
31	NC_021886	T	7	7	2276	2282	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
32	NC_021886	A	7	7	2354	2360	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
33	NC_021886	A	6	6	2434	2439	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
34	NC_021886	T	6	6	2442	2447	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
35	NC_021886	A	7	7	2463	2469	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
36	NC_021886	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
37	NC_021886	A	6	6	2553	2558	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
38	NC_021886	A	6	6	2561	2566	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
39	NC_021886	A	7	7	2578	2584	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
40	NC_021886	A	6	6	2728	2733	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
41	NC_021886	A	8	8	2750	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
42	NC_021886	T	8	8	2763	2770	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
43	NC_021886	T	8	8	2788	2795	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
44	NC_021886	T	6	6	2887	2892	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
45	NC_021886	T	6	6	2906	2911	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
46	NC_021886	A	6	6	3179	3184	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
47	NC_021886	T	7	7	3337	3343	0 %	100 %	0 %	0 %	527317809
48	NC_021886	A	7	7	3353	3359	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
49	NC_021886	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
50	NC_021886	A	9	9	3839	3847	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
51	NC_021886	T	8	8	3943	3950	0 %	100 %	0 %	0 %	527317809
52	NC_021886	A	6	6	3963	3968	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
53	NC_021886	A	6	6	3989	3994	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
54	NC_021886	A	6	6	4148	4153	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
55	NC_021886	A	6	6	4200	4205	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
56	NC_021886	A	9	9	4633	4641	100 %	0 %	0 %	0 %	527317810
57	NC_021886	T	6	6	4723	4728	0 %	100 %	0 %	0 %	527317810
58	NC_021886	A	6	6	4737	4742	100 %	0 %	0 %	0 %	527317810
59	NC_021886	A	7	7	5077	5083	100 %	0 %	0 %	0 %	527317810
60	NC_021886	T	7	7	5272	5278	0 %	100 %	0 %	0 %	527317810
61	NC_021886	T	8	8	5304	5311	0 %	100 %	0 %	0 %	527317810
62	NC_021886	A	8	8	5354	5361	100 %	0 %	0 %	0 %	527317810
63	NC_021886	T	7	7	5362	5368	0 %	100 %	0 %	0 %	527317810
64	NC_021886	A	6	6	5369	5374	100 %	0 %	0 %	0 %	527317810
65	NC_021886	A	7	7	5378	5384	100 %	0 %	0 %	0 %	527317810
66	NC_021886	A	6	6	5390	5395	100 %	0 %	0 %	0 %	527317810
67	NC_021886	A	7	7	5420	5426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021886	T	6	6	5430	5435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021886	T	6	6	5445	5450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.