MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM298

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021882	CAGAGC	2	12	312	323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021882	CATTCC	2	12	616	627	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021882	AAAATA	2	12	3967	3978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021882	ATTTTA	2	12	26971	26982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021882	AAAATC	2	12	34062	34073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021882	GGGGGC	2	12	60240	60251	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021882	AAGAAA	2	12	134004	134015	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021882	AATGAG	2	12	134040	134051	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021882	AAAAAT	2	12	141009	141020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021882	AGTGAT	2	12	160507	160518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021882	TTGGTT	2	12	175540	175551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021882	AGCTTG	2	12	194675	194686	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021882	CAAACC	2	12	202323	202334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021882	CATAAA	2	12	304559	304570	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021882	AAAACT	2	12	310799	310810	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021882	ATTTTT	2	12	340251	340262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021882	AGAATT	2	12	351180	351191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021882	AAAAAT	2	12	363025	363036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021882	CTAATA	2	12	365083	365094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021882	TATTTT	2	12	388026	388037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021882	TCAATC	2	12	414842	414853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021882	TTGCTC	2	12	472757	472768	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021882	TAAAAT	2	12	571460	571471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021882	TTTTAA	2	12	594567	594578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021882	GTTTTG	2	12	596073	596084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021882	ATTATA	2	12	608583	608594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021882	TTGAGT	2	12	615412	615423	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021882	AAGAAT	2	12	634341	634352	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021882	GAAATT	2	12	648064	648075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021882	ATTTTT	2	12	652192	652203	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021882	GTTTTT	2	12	689542	689553	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021882	GTTTTA	2	12	729012	729023	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021882	AATATT	2	12	745998	746009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021882	TTTTCT	2	12	767952	767963	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021882	GTGTTT	2	12	823301	823312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021882	TTTAAT	2	12	827937	827948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021882	TCTTTT	2	12	836724	836735	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021882	TAGCAA	2	12	891647	891658	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021882	TTTTTA	2	12	902749	902760	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021882	GTTTAG	2	12	903943	903954	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021882	GTGATG	2	12	904713	904724	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021882	ATCTTT	2	12	905020	905031	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021882	AGGCTT	2	12	909391	909402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021882	TAATTT	2	12	984524	984535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021882	TAAACA	2	12	1014456	1014467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021882	ATTTTT	2	12	1034193	1034204	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021882	CTAAAA	2	12	1035018	1035029	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021882	GAAAAA	2	12	1046146	1046157	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021882	AAAGAA	2	12	1056989	1057000	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021882	AAAACT	2	12	1057039	1057050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021882	ATATCA	2	12	1057535	1057546	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021882	TTTAGA	2	12	1058154	1058165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021882	TAGGAT	2	12	1058660	1058671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021882	TTTTTA	2	12	1120500	1120511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021882	ATAAAA	2	12	1120680	1120691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021882	TAGGCT	2	12	1130666	1130677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021882	TCTTTT	2	12	1164988	1164999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021882	CAATAA	2	12	1170351	1170362	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021882	AAGTTT	2	12	1179781	1179792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021882	ATACAA	2	12	1220568	1220579	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_021882	TCTTTA	2	12	1255722	1255733	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021882	AATGAA	2	12	1279546	1279557	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021882	GGCTTT	2	12	1376281	1376292	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021882	TTTTAG	2	12	1394945	1394956	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021882	ACCCAT	2	12	1421613	1421624	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021882	TTTGAA	2	12	1425951	1425962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021882	AGGATA	2	12	1432008	1432019	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021882	ATTTTA	2	12	1439788	1439799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021882	TTCAAT	2	12	1471323	1471334	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021882	TCTTTT	2	12	1502134	1502145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021882	TCTTTT	2	12	1502284	1502295	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021882	TTTGGA	2	12	1539786	1539797	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021882	TAAAAA	2	12	1565842	1565853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021882	TTTAAA	2	12	1588405	1588416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021882	AAAATA	2	12	1598516	1598527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021882	AGAAAT	2	12	1602186	1602197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021882	TTAGGG	2	12	1602430	1602441	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021882	CAATTC	2	12	1603266	1603277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021882	CAATGT	2	12	1603776	1603787	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.