MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori UM298

Total Repeats: 1296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021882	CAAAA	2	10	264	273	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021882	TTTAG	2	10	811	820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021882	CGCAT	2	10	2637	2646	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_021882	TCCAA	2	10	4773	4782	40 %	20 %	0 %	40 %	526465358
5	NC_021882	GGCGT	2	10	6528	6537	0 %	20 %	60 %	20 %	526465360
6	NC_021882	TTTTC	2	10	6814	6823	0 %	80 %	0 %	20 %	526465360
7	NC_021882	TTTTC	2	10	9918	9927	0 %	80 %	0 %	20 %	526465363
8	NC_021882	ATTTT	2	10	10409	10418	20 %	80 %	0 %	0 %	526465363
9	NC_021882	AAACT	2	10	10515	10524	60 %	20 %	0 %	20 %	526465363
10	NC_021882	AATCA	2	10	14472	14481	60 %	20 %	0 %	20 %	526465370
11	NC_021882	ATTTT	2	10	15052	15061	20 %	80 %	0 %	0 %	526465370
12	NC_021882	AAATA	2	10	15912	15921	80 %	20 %	0 %	0 %	526465371
13	NC_021882	TAGGG	2	10	15956	15965	20 %	20 %	60 %	0 %	526465371
14	NC_021882	TGAGT	2	10	18760	18769	20 %	40 %	40 %	0 %	526465373
15	NC_021882	ATAAA	2	10	19521	19530	80 %	20 %	0 %	0 %	526465374
16	NC_021882	TGGTT	2	10	20259	20268	0 %	60 %	40 %	0 %	526466584
17	NC_021882	ATTTA	2	10	20692	20701	40 %	60 %	0 %	0 %	526466584
18	NC_021882	TTATT	2	10	22665	22674	20 %	80 %	0 %	0 %	526465377
19	NC_021882	CTTTT	2	10	23942	23951	0 %	80 %	0 %	20 %	526465379
20	NC_021882	AATCA	2	10	25469	25478	60 %	20 %	0 %	20 %	526465379
21	NC_021882	AATCA	2	10	25742	25751	60 %	20 %	0 %	20 %	526465379
22	NC_021882	TGATG	2	10	27739	27748	20 %	40 %	40 %	0 %	526465382
23	NC_021882	ATTGA	2	10	28430	28439	40 %	40 %	20 %	0 %	526465382
24	NC_021882	ATTTT	2	10	28912	28921	20 %	80 %	0 %	0 %	526465383
25	NC_021882	TAAGG	2	10	33770	33779	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021882	CGCTT	2	10	33882	33891	0 %	40 %	20 %	40 %	526466586
27	NC_021882	ATTTT	2	10	33997	34006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021882	GGCTT	2	10	37383	37392	0 %	40 %	40 %	20 %	526465389
29	NC_021882	AAAAT	2	10	39339	39348	80 %	20 %	0 %	0 %	526466587
30	NC_021882	ATTTG	2	10	39887	39896	20 %	60 %	20 %	0 %	526466588
31	NC_021882	TCAAT	2	10	43381	43390	40 %	40 %	0 %	20 %	526465393
32	NC_021882	TCTAT	2	10	43533	43542	20 %	60 %	0 %	20 %	526465393
33	NC_021882	AGAAA	2	10	43680	43689	80 %	0 %	20 %	0 %	526465394
34	NC_021882	AACTA	2	10	43993	44002	60 %	20 %	0 %	20 %	526465394
35	NC_021882	CAACT	2	10	45612	45621	40 %	20 %	0 %	40 %	526465395
36	NC_021882	AGCCA	2	10	47239	47248	40 %	0 %	20 %	40 %	526465397
37	NC_021882	TTTAA	2	10	52122	52131	40 %	60 %	0 %	0 %	526465399
38	NC_021882	GTGTG	2	10	56758	56767	0 %	40 %	60 %	0 %	526465399
39	NC_021882	AGAAA	2	10	57345	57354	80 %	0 %	20 %	0 %	526465399
40	NC_021882	AATCA	2	10	58755	58764	60 %	20 %	0 %	20 %	526465399
41	NC_021882	AATCT	2	10	59212	59221	40 %	40 %	0 %	20 %	526465399
42	NC_021882	TGGGG	2	10	60161	60170	0 %	20 %	80 %	0 %	526465399
43	NC_021882	TTGGA	2	10	60178	60187	20 %	40 %	40 %	0 %	526465399
44	NC_021882	AGTAT	2	10	60399	60408	40 %	40 %	20 %	0 %	526466590
45	NC_021882	AATTT	2	10	64746	64755	40 %	60 %	0 %	0 %	526465402
46	NC_021882	TTTAA	2	10	64760	64769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021882	CTAAA	2	10	65031	65040	60 %	20 %	0 %	20 %	526465403
48	NC_021882	TTGAT	2	10	66021	66030	20 %	60 %	20 %	0 %	526465403
49	NC_021882	TTCAA	2	10	73413	73422	40 %	40 %	0 %	20 %	526465408
50	NC_021882	TAAAA	2	10	74739	74748	80 %	20 %	0 %	0 %	526465409
51	NC_021882	AAAAC	2	10	75001	75010	80 %	0 %	0 %	20 %	526465409
52	NC_021882	GTGGC	2	10	75501	75510	0 %	20 %	60 %	20 %	526465410
53	NC_021882	TTGGC	2	10	79652	79661	0 %	40 %	40 %	20 %	526465413
54	NC_021882	TTGCG	2	10	79956	79965	0 %	40 %	40 %	20 %	526465413
55	NC_021882	AAAAT	2	10	83993	84002	80 %	20 %	0 %	0 %	526465416
56	NC_021882	TCATG	2	10	84855	84864	20 %	40 %	20 %	20 %	526465417
57	NC_021882	ACCAC	2	10	87862	87871	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_021882	TATTT	2	10	91121	91130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021882	TTTTG	2	10	91752	91761	0 %	80 %	20 %	0 %	526466593
60	NC_021882	TTGAA	2	10	91801	91810	40 %	40 %	20 %	0 %	526466593
61	NC_021882	ACTCA	2	10	92477	92486	40 %	20 %	0 %	40 %	526466594
62	NC_021882	TTTAA	2	10	94605	94614	40 %	60 %	0 %	0 %	526465424
63	NC_021882	ATTTT	2	10	95362	95371	20 %	80 %	0 %	0 %	526465426
64	NC_021882	CCAAG	2	10	97602	97611	40 %	0 %	20 %	40 %	526465427
65	NC_021882	ACGAT	2	10	97781	97790	40 %	20 %	20 %	20 %	526465427
66	NC_021882	AAATC	2	10	98390	98399	60 %	20 %	0 %	20 %	526465429
67	NC_021882	GAAAA	2	10	100330	100339	80 %	0 %	20 %	0 %	526465430
68	NC_021882	CTCAG	2	10	100483	100492	20 %	20 %	20 %	40 %	526465430
69	NC_021882	AGAAA	2	10	100911	100920	80 %	0 %	20 %	0 %	526465430
70	NC_021882	ATCGT	2	10	101928	101937	20 %	40 %	20 %	20 %	526466597
71	NC_021882	GATAA	2	10	102706	102715	60 %	20 %	20 %	0 %	526466597
72	NC_021882	GCGTG	2	10	103041	103050	0 %	20 %	60 %	20 %	526465432
73	NC_021882	AAAAT	2	10	105087	105096	80 %	20 %	0 %	0 %	526465434
74	NC_021882	CATCG	2	10	105098	105107	20 %	20 %	20 %	40 %	526465434
75	NC_021882	AAGTC	2	10	105820	105829	40 %	20 %	20 %	20 %	526465435
76	NC_021882	AAAAG	2	10	106620	106629	80 %	0 %	20 %	0 %	526465435
77	NC_021882	TTTGT	2	10	108509	108518	0 %	80 %	20 %	0 %	526465436
78	NC_021882	TTTTA	2	10	109053	109062	20 %	80 %	0 %	0 %	526465436
79	NC_021882	GGCTT	2	10	110328	110337	0 %	40 %	40 %	20 %	526465437
80	NC_021882	CAAAC	2	10	110397	110406	60 %	0 %	0 %	40 %	526465437
81	NC_021882	GACTT	2	10	110682	110691	20 %	40 %	20 %	20 %	526465437
82	NC_021882	TGCGA	2	10	111296	111305	20 %	20 %	40 %	20 %	526465438
83	NC_021882	CAATT	2	10	112552	112561	40 %	40 %	0 %	20 %	526465439
84	NC_021882	CAAGC	2	10	113272	113281	40 %	0 %	20 %	40 %	526465439
85	NC_021882	TTTTA	2	10	114130	114139	20 %	80 %	0 %	0 %	526465440
86	NC_021882	ATGAA	2	10	115678	115687	60 %	20 %	20 %	0 %	526465442
87	NC_021882	GTGTG	2	10	116551	116560	0 %	40 %	60 %	0 %	526465442
88	NC_021882	TTATT	2	10	116847	116856	20 %	80 %	0 %	0 %	526465443
89	NC_021882	TGATT	2	10	117836	117845	20 %	60 %	20 %	0 %	526465444
90	NC_021882	AAGAA	2	10	118319	118328	80 %	0 %	20 %	0 %	526465444
91	NC_021882	TGCCA	2	10	119546	119555	20 %	20 %	20 %	40 %	526465445
92	NC_021882	ATGAA	2	10	119607	119616	60 %	20 %	20 %	0 %	526465445
93	NC_021882	TGCAA	2	10	120176	120185	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021882	GCTTT	2	10	120631	120640	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021882	TCTAT	2	10	121119	121128	20 %	60 %	0 %	20 %	526466598
96	NC_021882	CAAAA	2	10	121424	121433	80 %	0 %	0 %	20 %	526466598
97	NC_021882	AAAGC	2	10	122569	122578	60 %	0 %	20 %	20 %	526466598
98	NC_021882	AAAAC	2	10	123007	123016	80 %	0 %	0 %	20 %	526466598
99	NC_021882	AATCC	2	10	126027	126036	40 %	20 %	0 %	40 %	526465447
100	NC_021882	CAAAA	2	10	126495	126504	80 %	0 %	0 %	20 %	526465447
101	NC_021882	GGCGT	2	10	127054	127063	0 %	20 %	60 %	20 %	526465447
102	NC_021882	TTGGA	2	10	127082	127091	20 %	40 %	40 %	0 %	526465447
103	NC_021882	TCAAA	2	10	127166	127175	60 %	20 %	0 %	20 %	526465447
104	NC_021882	CATTT	2	10	127824	127833	20 %	60 %	0 %	20 %	526466599
105	NC_021882	GTGCA	2	10	128199	128208	20 %	20 %	40 %	20 %	526465448
106	NC_021882	TAAAA	2	10	128685	128694	80 %	20 %	0 %	0 %	526465448
107	NC_021882	TGATT	2	10	128997	129006	20 %	60 %	20 %	0 %	526465448
108	NC_021882	CCAAA	2	10	130676	130685	60 %	0 %	0 %	40 %	526465451
109	NC_021882	CGCAA	2	10	131114	131123	40 %	0 %	20 %	40 %	526465451
110	NC_021882	CATCA	2	10	133027	133036	40 %	20 %	0 %	40 %	526465452
111	NC_021882	AATTG	2	10	133527	133536	40 %	40 %	20 %	0 %	526465452
112	NC_021882	CGTTT	2	10	133917	133926	0 %	60 %	20 %	20 %	526465452
113	NC_021882	GTTCT	2	10	134027	134036	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021882	GATCG	2	10	135597	135606	20 %	20 %	40 %	20 %	526465454
115	NC_021882	AAGAT	2	10	137519	137528	60 %	20 %	20 %	0 %	526465455
116	NC_021882	CTTAT	2	10	137706	137715	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021882	TCGCT	2	10	139931	139940	0 %	40 %	20 %	40 %	526465457
118	NC_021882	TTGAT	2	10	140073	140082	20 %	60 %	20 %	0 %	526465457
119	NC_021882	TAAAT	2	10	140939	140948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021882	AAAAC	2	10	144127	144136	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021882	GTTTG	2	10	145046	145055	0 %	60 %	40 %	0 %	526465460
122	NC_021882	ATGAA	2	10	145303	145312	60 %	20 %	20 %	0 %	526465460
123	NC_021882	CAAGG	2	10	145789	145798	40 %	0 %	40 %	20 %	526465461
124	NC_021882	GCTTT	2	10	147498	147507	0 %	60 %	20 %	20 %	526465463
125	NC_021882	GTTTT	2	10	148229	148238	0 %	80 %	20 %	0 %	526465464
126	NC_021882	GAATT	2	10	149213	149222	40 %	40 %	20 %	0 %	526465464
127	NC_021882	AAAGA	2	10	150086	150095	80 %	0 %	20 %	0 %	526465465
128	NC_021882	CGGTT	2	10	152090	152099	0 %	40 %	40 %	20 %	526465466
129	NC_021882	TTGGA	2	10	153955	153964	20 %	40 %	40 %	0 %	526465467
130	NC_021882	TCAAA	2	10	155038	155047	60 %	20 %	0 %	20 %	526465468
131	NC_021882	GTGAT	2	10	156365	156374	20 %	40 %	40 %	0 %	526465470
132	NC_021882	GGCAA	2	10	156467	156476	40 %	0 %	40 %	20 %	526465470
133	NC_021882	CATCG	2	10	158136	158145	20 %	20 %	20 %	40 %	526465470
134	NC_021882	GTGGG	2	10	159594	159603	0 %	20 %	80 %	0 %	526465472
135	NC_021882	TGAAA	2	10	162293	162302	60 %	20 %	20 %	0 %	526465473
136	NC_021882	GGAAT	2	10	163563	163572	40 %	20 %	40 %	0 %	526465474
137	NC_021882	TGGTT	2	10	163890	163899	0 %	60 %	40 %	0 %	526465474
138	NC_021882	TTCAA	2	10	165476	165485	40 %	40 %	0 %	20 %	526465475
139	NC_021882	AATCT	2	10	167965	167974	40 %	40 %	0 %	20 %	526466603
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151	NC_021882	ATTTA	2	10	190296	190305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021882	TATAG	2	10	192137	192146	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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211	NC_021882	TCCTC	2	10	271305	271314	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
212	NC_021882	TCATT	2	10	271941	271950	20 %	60 %	0 %	20 %	526465549
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239	NC_021882	AATTT	2	10	303582	303591	40 %	60 %	0 %	0 %	526465580
240	NC_021882	CAAGC	2	10	303734	303743	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
241	NC_021882	TTTTA	2	10	304354	304363	20 %	80 %	0 %	0 %	526466644
242	NC_021882	TCTTA	2	10	304366	304375	20 %	60 %	0 %	20 %	526466644
243	NC_021882	TTAAA	2	10	304679	304688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_021882	ATTGA	2	10	305070	305079	40 %	40 %	20 %	0 %	526465582
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249	NC_021882	TGAAA	2	10	310354	310363	60 %	20 %	20 %	0 %	526465587
250	NC_021882	CTCTT	2	10	313456	313465	0 %	60 %	0 %	40 %	526466645
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260	NC_021882	CCTTT	2	10	323587	323596	0 %	60 %	0 %	40 %	526465594
261	NC_021882	GCTTT	2	10	323715	323724	0 %	60 %	20 %	20 %	526465594
262	NC_021882	CTTTT	2	10	328207	328216	0 %	80 %	0 %	20 %	526465600
263	NC_021882	TCTAA	2	10	330332	330341	40 %	40 %	0 %	20 %	526465601
264	NC_021882	AGCCA	2	10	330651	330660	40 %	0 %	20 %	40 %	526465602
265	NC_021882	ATTCC	2	10	333956	333965	20 %	40 %	0 %	40 %	526465607
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267	NC_021882	ATTCA	2	10	334658	334667	40 %	40 %	0 %	20 %	526465607
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