MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM298

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021882	CAAAA	2	10	264	273	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021882	TTTAG	2	10	811	820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021882	CGCAT	2	10	2637	2646	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_021882	TAAGG	2	10	33770	33779	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021882	ATTTT	2	10	33997	34006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021882	TTTAA	2	10	64760	64769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021882	ACCAC	2	10	87862	87871	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_021882	TATTT	2	10	91121	91130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021882	TGCAA	2	10	120176	120185	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021882	GCTTT	2	10	120631	120640	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021882	GTTCT	2	10	134027	134036	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021882	CTTAT	2	10	137706	137715	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021882	TAAAT	2	10	140939	140948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021882	AAAAC	2	10	144127	144136	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021882	TTTAA	2	10	174787	174796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021882	TTTCT	2	10	180958	180967	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021882	ATTTA	2	10	190296	190305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021882	TATAG	2	10	192137	192146	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021882	TTGAT	2	10	194002	194011	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021882	TGCTT	2	10	195334	195343	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021882	AAAAT	2	10	203353	203362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021882	ACTTT	2	10	203548	203557	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021882	TCTTT	2	10	227000	227009	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021882	TTTTA	2	10	244092	244101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021882	TTTTA	2	10	253338	253347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021882	TCCTC	2	10	271305	271314	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_021882	ATTTA	2	10	274713	274722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021882	CAAGC	2	10	303734	303743	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_021882	TTAAA	2	10	304679	304688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021882	TTTAA	2	10	335497	335506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021882	ATTTT	2	10	340168	340177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021882	TAGTA	2	10	347942	347951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021882	TAAAA	2	10	349483	349492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021882	GGATA	2	10	351278	351287	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021882	TATTT	2	10	361543	361552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021882	ATTTT	2	10	363487	363496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021882	TCAAA	2	10	363764	363773	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021882	TTATT	2	10	366249	366258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021882	TCATT	2	10	380478	380487	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021882	ATTTT	2	10	387964	387973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021882	ATTTT	3	15	387996	388010	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021882	ACAAG	2	10	393370	393379	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021882	ATTAA	2	10	398183	398192	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021882	CTTTA	2	10	399802	399811	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021882	TGGTT	2	10	413505	413514	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021882	TTATT	2	10	433960	433969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021882	TTGAT	2	10	449361	449370	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021882	ATTTT	2	10	452139	452148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021882	TGATT	2	10	463747	463756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021882	AACTT	2	10	489944	489953	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021882	AATAT	2	10	496684	496693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021882	AAAAC	2	10	538044	538053	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021882	AAATG	2	10	555781	555790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021882	TACGA	2	10	565924	565933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021882	ATTTT	2	10	566235	566244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021882	TTTTA	2	10	568209	568218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021882	AATTT	2	10	571422	571431	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021882	GCATT	2	10	580764	580773	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021882	GTTAG	2	10	582109	582118	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021882	TTAAG	2	10	589855	589864	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021882	CTAAA	2	10	596107	596116	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021882	TAGCA	2	10	608479	608488	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021882	TGTTT	2	10	615386	615395	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021882	CAACA	2	10	617449	617458	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021882	ATAAA	2	10	617490	617499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021882	CTCTT	2	10	632922	632931	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_021882	ATCCG	2	10	634273	634282	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_021882	TTAAA	2	10	639369	639378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021882	TTAAA	2	10	647864	647873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021882	TTTTG	2	10	656455	656464	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021882	AATTT	2	10	657860	657869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021882	AGATT	2	10	657889	657898	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021882	ATTTG	2	10	663735	663744	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021882	TAGAT	2	10	689713	689722	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021882	CCCTA	2	10	696214	696223	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_021882	TTAAT	2	10	713768	713777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021882	CAATC	2	10	723046	723055	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_021882	CTTTT	2	10	737770	737779	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_021882	ATTTT	2	10	737870	737879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021882	AGCCA	2	10	744303	744312	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_021882	AAGAT	2	10	744844	744853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021882	TGTAA	2	10	751826	751835	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021882	TTTGT	2	10	768669	768678	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021882	TTTAA	2	10	768697	768706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021882	AAAAC	2	10	824990	824999	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021882	TATTT	2	10	832171	832180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021882	AAAAT	2	10	836950	836959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021882	TCCGC	2	10	837697	837706	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_021882	ACAAA	2	10	839456	839465	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021882	TTTTA	2	10	842953	842962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021882	TATTT	2	10	843386	843395	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021882	TAAAT	2	10	844789	844798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021882	TTTAT	2	10	848057	848066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021882	CAAAA	2	10	848152	848161	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021882	GATGT	2	10	853883	853892	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021882	ATTTA	2	10	862078	862087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021882	TGATT	2	10	894879	894888	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021882	CAAAA	2	10	896935	896944	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021882	ATATA	2	10	898502	898511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021882	CTTTT	2	10	904142	904151	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021882	TTTCT	2	10	913343	913352	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021882	CAATA	2	10	914543	914552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021882	CATTC	2	10	925017	925026	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_021882	CAAGC	2	10	926659	926668	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_021882	TTATC	2	10	928540	928549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021882	TAAAC	2	10	941802	941811	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_021882	TAAAA	2	10	961794	961803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021882	TCGTG	2	10	1019797	1019806	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021882	TAAAA	2	10	1034305	1034314	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021882	TAAAT	2	10	1046120	1046129	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021882	AGTAA	2	10	1050582	1050591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021882	AGTGA	2	10	1050880	1050889	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021882	AGATG	2	10	1052357	1052366	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021882	TTGAA	2	10	1052589	1052598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021882	TTGTT	2	10	1053996	1054005	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021882	TTTAA	2	10	1057060	1057069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021882	TCACA	2	10	1057257	1057266	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_021882	ATTTT	2	10	1079554	1079563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021882	TTTTG	2	10	1084260	1084269	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021882	TTTTG	2	10	1089465	1089474	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021882	TTTCT	2	10	1089533	1089542	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021882	TTTTA	2	10	1103815	1103824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021882	AATAT	2	10	1104818	1104827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021882	GAAAG	2	10	1111557	1111566	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021882	GTTTT	2	10	1117805	1117814	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021882	AAAAT	2	10	1117904	1117913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021882	AAGAA	2	10	1120799	1120808	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021882	GATTT	2	10	1153618	1153627	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021882	AGTTT	2	10	1153787	1153796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021882	CAATT	2	10	1154109	1154118	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021882	CAGCC	2	10	1154705	1154714	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_021882	TGAAA	2	10	1154765	1154774	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021882	AATTT	2	10	1162685	1162694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021882	TTGTT	2	10	1174689	1174698	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021882	CTCAT	2	10	1174719	1174728	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_021882	ATGAA	2	10	1179801	1179810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021882	TATAT	2	10	1201072	1201081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021882	GTCTA	2	10	1205417	1205426	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021882	TTTAA	2	10	1205950	1205959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021882	GGATT	2	10	1205971	1205980	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021882	ATTTT	2	10	1218540	1218549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021882	AAAGT	2	10	1219405	1219414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021882	TGATT	2	10	1232441	1232450	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021882	ATGTA	2	10	1235878	1235887	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021882	TTTTA	2	10	1255492	1255501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021882	TTATT	2	10	1262598	1262607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_021882	TTTAG	2	10	1595367	1595376	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.