MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021881	GCAGGA	2	12	73975	73986	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021881	GCTTTA	2	12	80610	80621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021881	TAACTC	2	12	82868	82879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021881	TGCGTG	2	12	92650	92661	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021881	TACGTT	2	12	122762	122773	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021881	CAGTAT	2	12	127204	127215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021881	TATGGT	2	12	149421	149432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021881	TTACCA	2	12	207051	207062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021881	TCACTG	2	12	207551	207562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021881	ACAGAA	2	12	221229	221240	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021881	CGAGGA	2	12	246331	246342	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021881	CTATTA	2	12	290565	290576	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021881	TACATA	2	12	319309	319320	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021881	TAATAG	2	12	319934	319945	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021881	TGAGGT	2	12	383493	383504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021881	GATACT	2	12	383719	383730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021881	GCCCGT	2	12	386775	386786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021881	TTATGG	2	12	389846	389857	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021881	CTATAG	2	12	420642	420653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021881	TGTACT	2	12	421060	421071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021881	TAACGG	2	12	423121	423132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021881	TAAATG	2	12	423175	423186	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021881	TGGTAG	2	12	435813	435824	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021881	AGGGAG	2	12	440999	441010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021881	AATTTT	2	12	450439	450450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021881	AAATAG	2	12	512027	512038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021881	AGATCA	2	12	525109	525120	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021881	TTATAC	2	12	553271	553282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021881	TACGTG	2	12	586023	586034	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021881	CGATAT	2	12	596135	596146	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021881	TAAAGC	2	12	599469	599480	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021881	TTTTTA	2	12	611084	611095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021881	TAGGTA	2	12	614999	615010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021881	GTTTTT	2	12	653700	653711	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021881	AGGTTG	2	12	657092	657103	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021881	TAGCAG	2	12	673455	673466	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021881	ATTTCA	2	12	679228	679239	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021881	CTTTTT	2	12	684064	684075	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021881	AATCTG	2	12	684683	684694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021881	ATCTTT	2	12	687194	687205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021881	ATACTT	2	12	707278	707289	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021881	ATGGCT	2	12	707307	707318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021881	AGAGAA	2	12	723121	723132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021881	AGGTTT	2	12	723480	723491	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021881	ACAGCC	2	12	727746	727757	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021881	AGCATG	2	12	728384	728395	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021881	TAAAGT	2	12	731003	731014	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021881	AAAATG	2	12	741880	741891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021881	ATTAAA	2	12	763517	763528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021881	ATATTA	2	12	764492	764503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021881	AAAAGC	2	12	777792	777803	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021881	ATACTT	2	12	809472	809483	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021881	GCGGTT	2	12	826049	826060	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021881	TTCTGA	2	12	880038	880049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021881	GTTATG	2	12	886803	886814	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021881	TTTGTA	2	12	895308	895319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021881	ATGGAA	2	12	943656	943667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021881	CCGAAA	2	12	952351	952362	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021881	CAAAAA	2	12	960207	960218	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021881	AGAGGA	2	12	962450	962461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021881	ATAATT	2	12	978552	978563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021881	CATATG	2	12	989097	989108	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021881	TTTATG	2	12	1010274	1010285	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021881	GCTTTT	2	12	1032709	1032720	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021881	GCCCCT	2	12	1038882	1038893	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_021881	TAGATA	2	12	1063782	1063793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021881	TAAATA	2	12	1076290	1076301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021881	GCCCCT	2	12	1077513	1077524	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021881	CTGTAT	2	12	1117248	1117259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021881	GGGCTT	2	12	1117689	1117700	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021881	AAGTAT	2	12	1125725	1125736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021881	CAAAGG	2	12	1135910	1135921	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021881	CTGTAT	2	12	1155559	1155570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021881	GGGCTT	2	12	1156000	1156011	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021881	TGCATA	2	12	1172503	1172514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021881	TACCCA	2	12	1175120	1175131	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021881	TAAACA	2	12	1198687	1198698	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021881	TAAACA	2	12	1199908	1199919	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021881	AACACA	2	12	1202338	1202349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021881	GTTTGC	2	12	1209975	1209986	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021881	GGCGTT	2	12	1243170	1243181	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021881	ACAGCA	2	12	1254658	1254669	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021881	AGAGCT	2	12	1275197	1275208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021881	GCTTCT	2	12	1275221	1275232	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021881	AAAAAC	2	12	1276623	1276634	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021881	CGATTC	2	12	1312285	1312296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021881	AACGTA	2	12	1353328	1353339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021881	TCTGCA	2	12	1383680	1383691	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021881	ACATGT	2	12	1386750	1386761	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021881	GAATCG	2	12	1398427	1398438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021881	AACGTA	2	12	1407617	1407628	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021881	CCACCC	2	12	1411735	1411746	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
93	NC_021881	TATGTA	2	12	1440571	1440582	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021881	TAGTAT	2	12	1442098	1442109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021881	TGCGAA	2	12	1450423	1450434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.