MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021881	CATTT	2	10	740767	740776	20 %	60 %	0 %	20 %	526465001
502	NC_021881	AGAAC	2	10	742264	742273	60 %	0 %	20 %	20 %	526464455
503	NC_021881	TACCA	2	10	745022	745031	40 %	20 %	0 %	40 %	526464456
504	NC_021881	AAACC	2	10	745521	745530	60 %	0 %	0 %	40 %	526465002
505	NC_021881	AAAAC	2	10	745554	745563	80 %	0 %	0 %	20 %	526465002
506	NC_021881	CCCTA	2	10	745956	745965	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
507	NC_021881	CCGCT	2	10	746660	746669	0 %	20 %	20 %	60 %	526464457
508	NC_021881	TTAAT	2	10	751508	751517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021881	ACTGC	2	10	751743	751752	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
510	NC_021881	TTATA	2	10	751770	751779	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021881	ACCTT	2	10	752167	752176	20 %	40 %	0 %	40 %	526465007
512	NC_021881	CGCAT	2	10	753141	753150	20 %	20 %	20 %	40 %	526465007
513	NC_021881	ATCTT	2	10	754040	754049	20 %	60 %	0 %	20 %	526465007
514	NC_021881	TGCTT	2	10	756070	756079	0 %	60 %	20 %	20 %	526465007
515	NC_021881	TTTTC	2	10	757849	757858	0 %	80 %	0 %	20 %	526465007
516	NC_021881	CAATA	2	10	758141	758150	60 %	20 %	0 %	20 %	526465007
517	NC_021881	AGAGT	2	10	758388	758397	40 %	20 %	40 %	0 %	526465007
518	NC_021881	GATAA	2	10	758836	758845	60 %	20 %	20 %	0 %	526465007
519	NC_021881	ATTAA	2	10	761823	761832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021881	ATCAT	2	10	764718	764727	40 %	40 %	0 %	20 %	526465010
521	NC_021881	GAGAA	2	10	765025	765034	60 %	0 %	40 %	0 %	526465010
522	NC_021881	TGTGC	2	10	767787	767796	0 %	40 %	40 %	20 %	526465010
523	NC_021881	CTTAT	2	10	769751	769760	20 %	60 %	0 %	20 %	526465012
524	NC_021881	TTGCT	2	10	770240	770249	0 %	60 %	20 %	20 %	526465012
525	NC_021881	AGTAA	2	10	771366	771375	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
526	NC_021881	CTTTA	2	10	771430	771439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
527	NC_021881	GAAAG	2	10	771513	771522	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021881	ATAAG	2	10	772722	772731	60 %	20 %	20 %	0 %	526465013
529	NC_021881	CCGGG	2	10	773412	773421	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
530	NC_021881	CAATG	2	10	774216	774225	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
531	NC_021881	ATCTT	2	10	774248	774257	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
532	NC_021881	CTCTT	2	10	774742	774751	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
533	NC_021881	CTCTT	2	10	774921	774930	0 %	60 %	0 %	40 %	526464458
534	NC_021881	CATAA	2	10	775451	775460	60 %	20 %	0 %	20 %	526464458
535	NC_021881	TAGTC	2	10	776912	776921	20 %	40 %	20 %	20 %	526464460
536	NC_021881	AATAT	2	10	777397	777406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021881	TATTT	2	10	777740	777749	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021881	CGTGC	2	10	778750	778759	0 %	20 %	40 %	40 %	526464461
539	NC_021881	TACGC	2	10	779065	779074	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
540	NC_021881	CTATA	2	10	781238	781247	40 %	40 %	0 %	20 %	526464463
541	NC_021881	GCAAA	2	10	783147	783156	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
542	NC_021881	CAGCT	2	10	784574	784583	20 %	20 %	20 %	40 %	526465016
543	NC_021881	TGGCT	2	10	786678	786687	0 %	40 %	40 %	20 %	526465016
544	NC_021881	TACTG	2	10	787080	787089	20 %	40 %	20 %	20 %	526465016
545	NC_021881	CTCAC	2	10	788703	788712	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
546	NC_021881	GCAAT	2	10	788765	788774	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
547	NC_021881	TCCCC	2	10	789020	789029	0 %	20 %	0 %	80 %	526465018
548	NC_021881	CGACA	2	10	790055	790064	40 %	0 %	20 %	40 %	526464464
549	NC_021881	AAAAG	2	10	793861	793870	80 %	0 %	20 %	0 %	526464467
550	NC_021881	GTTAT	2	10	795369	795378	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021881	GGATA	2	10	795420	795429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021881	ATATT	2	10	800000	800009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021881	TATGT	2	10	800048	800057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
554	NC_021881	AAAAG	2	10	800457	800466	80 %	0 %	20 %	0 %	526465025
555	NC_021881	ACTTA	2	10	800916	800925	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
556	NC_021881	TGCGC	2	10	802733	802742	0 %	20 %	40 %	40 %	526465026
557	NC_021881	GAATG	2	10	803549	803558	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021881	CTTCT	2	10	804456	804465	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
559	NC_021881	TCTAA	2	10	804921	804930	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
560	NC_021881	TAGAA	2	10	805085	805094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021881	TAATC	2	10	805221	805230	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
562	NC_021881	ACCTT	2	10	805290	805299	20 %	40 %	0 %	40 %	526464470
563	NC_021881	CTTCT	2	10	806023	806032	0 %	60 %	0 %	40 %	526464470
564	NC_021881	GGTAT	2	10	806173	806182	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021881	TACCC	2	10	806429	806438	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
566	NC_021881	TCTCT	2	10	809578	809587	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
567	NC_021881	TACCC	2	10	810217	810226	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
568	NC_021881	AGAAT	2	10	812931	812940	60 %	20 %	20 %	0 %	526465029
569	NC_021881	GTATT	2	10	819409	819418	20 %	60 %	20 %	0 %	526465030
570	NC_021881	ATATC	2	10	820538	820547	40 %	40 %	0 %	20 %	526464477
571	NC_021881	AGAGC	2	10	820912	820921	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
572	NC_021881	TAAAA	2	10	820953	820962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021881	ACGGA	2	10	822210	822219	40 %	0 %	40 %	20 %	526465033
574	NC_021881	ACAAG	2	10	825013	825022	60 %	0 %	20 %	20 %	526464479
575	NC_021881	TACTC	2	10	828508	828517	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
576	NC_021881	TGCGC	2	10	829372	829381	0 %	20 %	40 %	40 %	526464481
577	NC_021881	ATGCC	2	10	829516	829525	20 %	20 %	20 %	40 %	526464481
578	NC_021881	CAACT	2	10	829809	829818	40 %	20 %	0 %	40 %	526464481
579	NC_021881	TCTTA	2	10	830130	830139	20 %	60 %	0 %	20 %	526465037
580	NC_021881	TCTCT	2	10	830493	830502	0 %	60 %	0 %	40 %	526465037
581	NC_021881	TTTGT	2	10	831906	831915	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021881	CATAG	2	10	832542	832551	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
583	NC_021881	TGAAA	2	10	836941	836950	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021881	ACTTT	2	10	839131	839140	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
585	NC_021881	GAAGT	2	10	839345	839354	40 %	20 %	40 %	0 %	526464484
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587	NC_021881	GTACT	2	10	841724	841733	20 %	40 %	20 %	20 %	526464484
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589	NC_021881	AAATG	2	10	843445	843454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021881	TTTAT	2	10	845906	845915	20 %	80 %	0 %	0 %	526464487
591	NC_021881	ACACT	2	10	849079	849088	40 %	20 %	0 %	40 %	526465043
592	NC_021881	TCTAT	2	10	850966	850975	20 %	60 %	0 %	20 %	526465044
593	NC_021881	GTACT	2	10	851697	851706	20 %	40 %	20 %	20 %	526465044
594	NC_021881	AGCTT	2	10	852868	852877	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
595	NC_021881	GAATA	2	10	854309	854318	60 %	20 %	20 %	0 %	526465045
596	NC_021881	ACAGC	2	10	856219	856228	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
597	NC_021881	GTATG	2	10	856294	856303	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021881	TAAAA	2	10	856992	857001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021881	TACGT	2	10	858045	858054	20 %	40 %	20 %	20 %	526465046
600	NC_021881	TGGGA	2	10	862706	862715	20 %	20 %	60 %	0 %	526465047
601	NC_021881	GTTCA	2	10	863097	863106	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
602	NC_021881	CTATT	2	10	863969	863978	20 %	60 %	0 %	20 %	526465049
603	NC_021881	TGTGG	2	10	864066	864075	0 %	40 %	60 %	0 %	526465049
604	NC_021881	GCATA	2	10	865178	865187	40 %	20 %	20 %	20 %	526465050
605	NC_021881	CAAAA	2	10	866305	866314	80 %	0 %	0 %	20 %	526465050
606	NC_021881	TATGG	2	10	870023	870032	20 %	40 %	40 %	0 %	526465055
607	NC_021881	CAATA	2	10	871384	871393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
608	NC_021881	CTAAA	2	10	876144	876153	60 %	20 %	0 %	20 %	526465060
609	NC_021881	TTTAG	2	10	876804	876813	20 %	60 %	20 %	0 %	526465061
610	NC_021881	TGCTA	2	10	881487	881496	20 %	40 %	20 %	20 %	526465064
611	NC_021881	CTGCG	2	10	881903	881912	0 %	20 %	40 %	40 %	526465064
612	NC_021881	AATGC	2	10	882621	882630	40 %	20 %	20 %	20 %	526465065
613	NC_021881	GACAT	2	10	882634	882643	40 %	20 %	20 %	20 %	526465065
614	NC_021881	CAATA	2	10	883601	883610	60 %	20 %	0 %	20 %	526465067
615	NC_021881	ATGCA	2	10	884323	884332	40 %	20 %	20 %	20 %	526465068
616	NC_021881	TTGCT	2	10	884776	884785	0 %	60 %	20 %	20 %	526465068
617	NC_021881	CAATA	2	10	885302	885311	60 %	20 %	0 %	20 %	526465068
618	NC_021881	ATGCA	2	10	886024	886033	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
619	NC_021881	GGATG	2	10	890184	890193	20 %	20 %	60 %	0 %	526465070
620	NC_021881	GGATG	2	10	892361	892370	20 %	20 %	60 %	0 %	526465072
621	NC_021881	CAAAT	2	10	893877	893886	60 %	20 %	0 %	20 %	526465073
622	NC_021881	AGAGG	2	10	893935	893944	40 %	0 %	60 %	0 %	526465073
623	NC_021881	TACAA	2	10	894889	894898	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
624	NC_021881	TATTT	2	10	898238	898247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021881	ATAAA	2	10	898772	898781	80 %	20 %	0 %	0 %	526464488
626	NC_021881	TACCA	2	10	900221	900230	40 %	20 %	0 %	40 %	526465078
627	NC_021881	CATTC	2	10	902509	902518	20 %	40 %	0 %	40 %	526465078
628	NC_021881	GTCAC	2	10	903120	903129	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
629	NC_021881	GATCT	2	10	903324	903333	20 %	40 %	20 %	20 %	526464489
630	NC_021881	CGCGG	2	10	904209	904218	0 %	0 %	60 %	40 %	526464489
631	NC_021881	AGCTT	2	10	904427	904436	20 %	40 %	20 %	20 %	526465079
632	NC_021881	AAACA	2	10	906576	906585	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
633	NC_021881	TTGAG	2	10	907664	907673	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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635	NC_021881	ATTGA	2	10	908546	908555	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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769	NC_021881	CATAC	2	10	1123103	1123112	40 %	20 %	0 %	40 %	526464568
770	NC_021881	GCACC	2	10	1126735	1126744	20 %	0 %	20 %	60 %	526465185
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780	NC_021881	ATATC	2	10	1142014	1142023	40 %	40 %	0 %	20 %	526465193
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797	NC_021881	TCTCT	2	10	1167787	1167796	0 %	60 %	0 %	40 %	526464589
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802	NC_021881	TTGAG	2	10	1176591	1176600	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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887	NC_021881	AATTG	2	10	1330326	1330335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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