MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 5223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021881	AAG	2	6	1142261	1142266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021881	TAC	2	6	1142324	1142329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_021881	CCT	2	6	1142330	1142335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_021881	CTT	2	6	1144006	1144011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_021881	CTG	2	6	1144138	1144143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_021881	TTG	2	6	1144166	1144171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021881	ATC	2	6	1144310	1144315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_021881	TGC	2	6	1144501	1144506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_021881	TAA	2	6	1144688	1144693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_021881	TAA	2	6	1144799	1144804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_021881	AGT	2	6	1144828	1144833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_021881	TAA	2	6	1144840	1144845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_021881	AGA	2	6	1144857	1144862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_021881	CAT	2	6	1144901	1144906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_021881	TAA	2	6	1145747	1145752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021881	TTA	3	9	1145771	1145779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021881	AGA	3	9	1145806	1145814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021881	TAT	2	6	1145816	1145821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021881	CTA	2	6	1145850	1145855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_021881	ATG	2	6	1145872	1145877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021881	CTG	2	6	1145905	1145910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_021881	GAA	2	6	1146048	1146053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021881	ATA	3	9	1146058	1146066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021881	GTT	2	6	1146824	1146829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021881	ATG	2	6	1146843	1146848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021881	TAA	2	6	1146899	1146904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_021881	ATT	2	6	1146910	1146915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021881	CTA	2	6	1146948	1146953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_021881	ATG	2	6	1146970	1146975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021881	TGC	3	9	1147001	1147009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_021881	ATT	2	6	1147636	1147641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021881	TAT	2	6	1147680	1147685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021881	CTA	2	6	1147713	1147718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_021881	ATG	2	6	1147735	1147740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021881	TGC	3	9	1147766	1147774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_021881	CTT	2	6	1148288	1148293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_021881	CTA	2	6	1148320	1148325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_021881	TTC	2	6	1148450	1148455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_021881	TAA	2	6	1148531	1148536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021881	TAG	2	6	1152882	1152887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021881	TAG	3	9	1153028	1153036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021881	GGA	2	6	1154315	1154320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021881	AGG	2	6	1154323	1154328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021881	GTT	3	9	1154361	1154369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_021881	AGT	2	6	1154499	1154504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021881	ATA	2	6	1154532	1154537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_021881	GTG	2	6	1154539	1154544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_021881	CGT	2	6	1155052	1155057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_021881	CGG	2	6	1155071	1155076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_021881	TGC	2	6	1155334	1155339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_021881	GAG	2	6	1155351	1155356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_021881	TAA	2	6	1155362	1155367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_021881	GCT	2	6	1155490	1155495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_021881	CAT	2	6	1155517	1155522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_021881	TTC	2	6	1155738	1155743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_021881	CAT	2	6	1155840	1155845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_021881	TAA	2	6	1156919	1156924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021881	TGA	2	6	1157082	1157087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_021881	TCA	2	6	1157805	1157810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_021881	GAA	2	6	1157899	1157904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021881	ACT	2	6	1159078	1159083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_021881	AAT	2	6	1159116	1159121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021881	ACC	2	6	1159166	1159171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_021881	ACA	2	6	1160846	1160851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_021881	AAC	2	6	1160900	1160905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_021881	TAA	2	6	1160968	1160973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021881	TAT	2	6	1160974	1160979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021881	TAG	2	6	1161706	1161711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_021881	TAA	2	6	1161744	1161749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_021881	TAC	2	6	1161783	1161788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_021881	AAC	2	6	1161790	1161795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_021881	AGA	3	9	1161833	1161841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_021881	TAC	2	6	1161852	1161857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_021881	TCA	2	6	1162019	1162024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_021881	TAC	2	6	1162844	1162849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_021881	TAC	2	6	1162916	1162921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_021881	TCA	2	6	1163380	1163385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_021881	TGC	2	6	1163512	1163517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_021881	CCA	2	6	1163535	1163540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_021881	AGT	2	6	1164109	1164114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021881	TTA	2	6	1164135	1164140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021881	TTG	2	6	1164403	1164408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_021881	AGC	2	6	1164450	1164455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_021881	CTG	2	6	1164491	1164496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_021881	CAC	2	6	1164549	1164554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_021881	AAT	2	6	1164556	1164561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021881	CAA	2	6	1164572	1164577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_021881	ATT	2	6	1164666	1164671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_021881	AGA	2	6	1164805	1164810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_021881	ATC	2	6	1164963	1164968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_021881	GCA	2	6	1165179	1165184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_021881	ACT	2	6	1165486	1165491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_021881	TAG	2	6	1165526	1165531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021881	CAA	2	6	1168132	1168137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_021881	GTG	2	6	1168240	1168245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021881	CAC	2	6	1168302	1168307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_021881	CAA	2	6	1168983	1168988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_021881	AAT	2	6	1169017	1169022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021881	TGC	2	6	1169072	1169077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_021881	AGA	2	6	1169215	1169220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_021881	GAT	2	6	1169339	1169344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_021881	TTG	2	6	1169564	1169569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021881	TTG	2	6	1169619	1169624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021881	GGA	2	6	1169662	1169667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_021881	AGT	2	6	1169752	1169757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021881	TAC	2	6	1169908	1169913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_021881	TGC	2	6	1172399	1172404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_021881	TCA	2	6	1172418	1172423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_021881	GGC	2	6	1172515	1172520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_021881	CTG	2	6	1172998	1173003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_021881	TCT	2	6	1173014	1173019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_021881	TAT	2	6	1173172	1173177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021881	TGA	2	6	1173181	1173186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_021881	TAT	2	6	1173289	1173294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_021881	AAC	2	6	1173353	1173358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_021881	TAA	2	6	1173410	1173415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021881	GTT	2	6	1173446	1173451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_021881	ATT	2	6	1173545	1173550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021881	TAT	2	6	1173561	1173566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_021881	ATG	2	6	1173578	1173583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021881	GAA	2	6	1175041	1175046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021881	GTA	2	6	1175049	1175054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_021881	GCA	2	6	1175238	1175243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_021881	CTG	2	6	1175258	1175263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4126	NC_021881	TCC	2	6	1175342	1175347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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