MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 2234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021880	CTTT	2	8	990403	990410	0 %	75 %	0 %	25 %	526463869
1502	NC_021880	GTAT	2	8	990499	990506	25 %	50 %	25 %	0 %	526463869
1503	NC_021880	ATAC	2	8	994637	994644	50 %	25 %	0 %	25 %	526463871
1504	NC_021880	CTTT	2	8	994708	994715	0 %	75 %	0 %	25 %	526463871
1505	NC_021880	AAAG	2	8	994733	994740	75 %	0 %	25 %	0 %	526463871
1506	NC_021880	CATA	2	8	995020	995027	50 %	25 %	0 %	25 %	526463871
1507	NC_021880	AACC	2	8	995461	995468	50 %	0 %	0 %	50 %	526463248
1508	NC_021880	CATA	2	8	996158	996165	50 %	25 %	0 %	25 %	526463249
1509	NC_021880	GAAG	2	8	996355	996362	50 %	0 %	50 %	0 %	526463249
1510	NC_021880	ACTA	2	8	996518	996525	50 %	25 %	0 %	25 %	526463249
1511	NC_021880	AAAG	2	8	998437	998444	75 %	0 %	25 %	0 %	526463873
1512	NC_021880	CTAT	2	8	998465	998472	25 %	50 %	0 %	25 %	526463873
1513	NC_021880	GTAA	2	8	999435	999442	50 %	25 %	25 %	0 %	526463874
1514	NC_021880	GCAC	2	8	999468	999475	25 %	0 %	25 %	50 %	526463874
1515	NC_021880	TGCT	2	8	999560	999567	0 %	50 %	25 %	25 %	526463874
1516	NC_021880	TTCA	2	8	1001117	1001124	25 %	50 %	0 %	25 %	526463874
1517	NC_021880	TACG	2	8	1001158	1001165	25 %	25 %	25 %	25 %	526463874
1518	NC_021880	TTCT	2	8	1002170	1002177	0 %	75 %	0 %	25 %	526463251
1519	NC_021880	AAGT	2	8	1002327	1002334	50 %	25 %	25 %	0 %	526463251
1520	NC_021880	TGGC	2	8	1003067	1003074	0 %	25 %	50 %	25 %	526463252
1521	NC_021880	GATT	2	8	1003401	1003408	25 %	50 %	25 %	0 %	526463252
1522	NC_021880	TGCA	2	8	1004552	1004559	25 %	25 %	25 %	25 %	526463253
1523	NC_021880	CCCG	2	8	1004690	1004697	0 %	0 %	25 %	75 %	526463253
1524	NC_021880	GTTT	2	8	1005031	1005038	0 %	75 %	25 %	0 %	526463253
1525	NC_021880	CATA	2	8	1006095	1006102	50 %	25 %	0 %	25 %	526463877
1526	NC_021880	TGGG	2	8	1008226	1008233	0 %	25 %	75 %	0 %	526463881
1527	NC_021880	GCTT	2	8	1008272	1008279	0 %	50 %	25 %	25 %	526463881
1528	NC_021880	GGTT	2	8	1008290	1008297	0 %	50 %	50 %	0 %	526463881
1529	NC_021880	TGTA	2	8	1008377	1008384	25 %	50 %	25 %	0 %	526463881
1530	NC_021880	TACG	2	8	1008686	1008693	25 %	25 %	25 %	25 %	526463254
1531	NC_021880	TCAG	2	8	1009049	1009056	25 %	25 %	25 %	25 %	526463254
1532	NC_021880	GCAT	2	8	1009275	1009282	25 %	25 %	25 %	25 %	526463254
1533	NC_021880	CACT	2	8	1010418	1010425	25 %	25 %	0 %	50 %	526463254
1534	NC_021880	TTGC	2	8	1010968	1010975	0 %	50 %	25 %	25 %	526463255
1535	NC_021880	AATA	2	8	1013464	1013471	75 %	25 %	0 %	0 %	526463883
1536	NC_021880	AATA	2	8	1013710	1013717	75 %	25 %	0 %	0 %	526463883
1537	NC_021880	AATA	2	8	1013956	1013963	75 %	25 %	0 %	0 %	526463884
1538	NC_021880	CTGC	2	8	1014438	1014445	0 %	25 %	25 %	50 %	526463256
1539	NC_021880	TTAG	2	8	1014584	1014591	25 %	50 %	25 %	0 %	526463256
1540	NC_021880	TGAC	2	8	1014944	1014951	25 %	25 %	25 %	25 %	526463256
1541	NC_021880	ACTT	2	8	1014969	1014976	25 %	50 %	0 %	25 %	526463256
1542	NC_021880	GCAT	2	8	1015412	1015419	25 %	25 %	25 %	25 %	526463256
1543	NC_021880	CTGC	2	8	1015425	1015432	0 %	25 %	25 %	50 %	526463256
1544	NC_021880	TTCG	2	8	1015878	1015885	0 %	50 %	25 %	25 %	526463257
1545	NC_021880	GCGT	2	8	1016210	1016217	0 %	25 %	50 %	25 %	526463257
1546	NC_021880	TCCA	2	8	1016312	1016319	25 %	25 %	0 %	50 %	526463257
1547	NC_021880	GGGT	2	8	1016570	1016577	0 %	25 %	75 %	0 %	526463257
1548	NC_021880	GCAT	2	8	1016632	1016639	25 %	25 %	25 %	25 %	526463257
1549	NC_021880	TCGT	2	8	1016689	1016696	0 %	50 %	25 %	25 %	526463257
1550	NC_021880	CGTT	2	8	1016991	1016998	0 %	50 %	25 %	25 %	526463257
1551	NC_021880	TAGT	2	8	1016999	1017006	25 %	50 %	25 %	0 %	526463257
1552	NC_021880	TGCC	2	8	1018274	1018281	0 %	25 %	25 %	50 %	526463885
1553	NC_021880	CATC	2	8	1019450	1019457	25 %	25 %	0 %	50 %	526463886
1554	NC_021880	CGTT	2	8	1019696	1019703	0 %	50 %	25 %	25 %	526463886
1555	NC_021880	TAAC	2	8	1020988	1020995	50 %	25 %	0 %	25 %	526463888
1556	NC_021880	ATTC	2	8	1022409	1022416	25 %	50 %	0 %	25 %	526463890
1557	NC_021880	ACAA	2	8	1022787	1022794	75 %	0 %	0 %	25 %	526463891
1558	NC_021880	ACAA	2	8	1023408	1023415	75 %	0 %	0 %	25 %	526463892
1559	NC_021880	TAAC	2	8	1023889	1023896	50 %	25 %	0 %	25 %	526463258
1560	NC_021880	CTGC	2	8	1025941	1025948	0 %	25 %	25 %	50 %	526463258
1561	NC_021880	GTAT	2	8	1026185	1026192	25 %	50 %	25 %	0 %	526463258
1562	NC_021880	CTTT	2	8	1026970	1026977	0 %	75 %	0 %	25 %	526463260
1563	NC_021880	AGGA	2	8	1027080	1027087	50 %	0 %	50 %	0 %	526463260
1564	NC_021880	TTTG	2	8	1027547	1027554	0 %	75 %	25 %	0 %	526463260
1565	NC_021880	CTTA	2	8	1029625	1029632	25 %	50 %	0 %	25 %	526463893
1566	NC_021880	TAGC	2	8	1029752	1029759	25 %	25 %	25 %	25 %	526463893
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1568	NC_021880	CAAA	2	8	1031580	1031587	75 %	0 %	0 %	25 %	526463261
1569	NC_021880	TTAT	2	8	1032507	1032514	25 %	75 %	0 %	0 %	526463262
1570	NC_021880	TTAT	2	8	1033710	1033717	25 %	75 %	0 %	0 %	526463263
1571	NC_021880	ATCT	2	8	1036467	1036474	25 %	50 %	0 %	25 %	526463264
1572	NC_021880	AGAT	2	8	1036914	1036921	50 %	25 %	25 %	0 %	526463264
1573	NC_021880	CGTA	2	8	1036940	1036947	25 %	25 %	25 %	25 %	526463264
1574	NC_021880	CTTA	2	8	1037479	1037486	25 %	50 %	0 %	25 %	526463265
1575	NC_021880	CCTA	2	8	1037758	1037765	25 %	25 %	0 %	50 %	526463265
1576	NC_021880	CGAA	2	8	1038787	1038794	50 %	0 %	25 %	25 %	526463266
1577	NC_021880	CAAA	2	8	1038975	1038982	75 %	0 %	0 %	25 %	526463266
1578	NC_021880	TTTA	2	8	1042163	1042170	25 %	75 %	0 %	0 %	526463268
1579	NC_021880	ATGT	2	8	1042581	1042588	25 %	50 %	25 %	0 %	526463268
1580	NC_021880	ATGA	2	8	1042945	1042952	50 %	25 %	25 %	0 %	526463269
1581	NC_021880	ACTT	2	8	1042970	1042977	25 %	50 %	0 %	25 %	526463269
1582	NC_021880	TGCA	2	8	1045048	1045055	25 %	25 %	25 %	25 %	526463271
1583	NC_021880	AGTA	2	8	1045063	1045070	50 %	25 %	25 %	0 %	526463271
1584	NC_021880	TTTA	2	8	1045336	1045343	25 %	75 %	0 %	0 %	526463271
1585	NC_021880	GCGT	2	8	1045660	1045667	0 %	25 %	50 %	25 %	526463271
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1588	NC_021880	TTAC	2	8	1046344	1046351	25 %	50 %	0 %	25 %	526463898
1589	NC_021880	CATT	2	8	1046369	1046376	25 %	50 %	0 %	25 %	526463898
1590	NC_021880	GCTA	2	8	1049750	1049757	25 %	25 %	25 %	25 %	526463274
1591	NC_021880	TACT	2	8	1051735	1051742	25 %	50 %	0 %	25 %	526463900
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1593	NC_021880	TGTA	2	8	1053276	1053283	25 %	50 %	25 %	0 %	526463275
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1596	NC_021880	ATGG	2	8	1054177	1054184	25 %	25 %	50 %	0 %	526463277
1597	NC_021880	CAAT	2	8	1054210	1054217	50 %	25 %	0 %	25 %	526463277
1598	NC_021880	GCTT	2	8	1055797	1055804	0 %	50 %	25 %	25 %	526463278
1599	NC_021880	AGCT	2	8	1059146	1059153	25 %	25 %	25 %	25 %	526463279
1600	NC_021880	TAAC	2	8	1060110	1060117	50 %	25 %	0 %	25 %	526463902
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1605	NC_021880	TCCC	2	8	1066858	1066865	0 %	25 %	0 %	75 %	526463907
1606	NC_021880	CCTC	2	8	1067457	1067464	0 %	25 %	0 %	75 %	526463907
1607	NC_021880	TGAT	2	8	1067972	1067979	25 %	50 %	25 %	0 %	526463281
1608	NC_021880	TGTA	2	8	1068166	1068173	25 %	50 %	25 %	0 %	526463281
1609	NC_021880	TAAA	2	8	1068300	1068307	75 %	25 %	0 %	0 %	526463281
1610	NC_021880	TTCT	2	8	1068457	1068464	0 %	75 %	0 %	25 %	526463281
1611	NC_021880	TACT	2	8	1068518	1068525	25 %	50 %	0 %	25 %	526463281
1612	NC_021880	TTAA	2	8	1068755	1068762	50 %	50 %	0 %	0 %	526463281
1613	NC_021880	TAGC	2	8	1069169	1069176	25 %	25 %	25 %	25 %	526463281
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1616	NC_021880	TGCT	2	8	1070303	1070310	0 %	50 %	25 %	25 %	526463281
1617	NC_021880	TGAA	2	8	1070546	1070553	50 %	25 %	25 %	0 %	526463281
1618	NC_021880	TACG	2	8	1070680	1070687	25 %	25 %	25 %	25 %	526463281
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1623	NC_021880	ACTT	2	8	1072883	1072890	25 %	50 %	0 %	25 %	526463911
1624	NC_021880	TCTA	2	8	1072914	1072921	25 %	50 %	0 %	25 %	526463911
1625	NC_021880	CCAT	2	8	1073438	1073445	25 %	25 %	0 %	50 %	526463282
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