MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcobacter butzleri 7h1h

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021878	TTAAA	2	10	13264	13273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021878	TAATT	2	10	30852	30861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021878	ATTTT	2	10	51886	51895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021878	AAAGC	2	10	54381	54390	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021878	ATTTT	2	10	54441	54450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021878	AGATA	2	10	69175	69184	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021878	AATAG	2	10	81759	81768	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021878	TAAAT	2	10	86377	86386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021878	TAATA	2	10	96801	96810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021878	TATAA	2	10	122982	122991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021878	TATAA	2	10	131814	131823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021878	TTTCT	2	10	133327	133336	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021878	TAAAA	2	10	142494	142503	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021878	TATAG	2	10	145706	145715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021878	ATTAA	2	10	157764	157773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021878	TTAAT	2	10	162123	162132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021878	ATATA	2	10	167357	167366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021878	AATAA	2	10	168223	168232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021878	GTCTC	2	10	175356	175365	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_021878	GTCTC	2	10	175585	175594	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_021878	TTCTA	2	10	189512	189521	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021878	TTTAT	2	10	225205	225214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021878	AGTAA	2	10	238546	238555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021878	AAATT	2	10	268366	268375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021878	ATTTA	2	10	274628	274637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021878	ATGTA	2	10	280502	280511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021878	TAATT	2	10	284143	284152	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021878	ATATA	2	10	285131	285140	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021878	ATAAA	2	10	324539	324548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021878	TTCTA	2	10	329985	329994	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021878	TATAA	2	10	342732	342741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021878	TGCAA	2	10	342758	342767	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021878	TATAC	2	10	342842	342851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021878	AATAA	2	10	345749	345758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021878	TAAAT	2	10	366589	366598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021878	TTAAT	2	10	366617	366626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021878	CATTT	2	10	371161	371170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021878	AATTT	2	10	375498	375507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021878	ATCTT	2	10	398322	398331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_021878	ATATT	2	10	407916	407925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021878	TGATA	2	10	417969	417978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021878	TTAAT	2	10	431157	431166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021878	TTAAA	2	10	433302	433311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021878	TTAAA	2	10	433391	433400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021878	TTTTA	2	10	444790	444799	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021878	CTTTT	2	10	454707	454716	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021878	AAGAG	2	10	454833	454842	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021878	CAGAT	2	10	461448	461457	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021878	TACCC	2	10	479460	479469	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_021878	GGGTA	2	10	479475	479484	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021878	CTTTC	2	10	483389	483398	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_021878	TTAAT	2	10	484490	484499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021878	ATTTT	2	10	497517	497526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021878	TTAGT	2	10	498880	498889	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021878	TTATA	2	10	502401	502410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021878	AGCAT	2	10	514957	514966	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021878	AACTA	2	10	517344	517353	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021878	CAAAA	2	10	517650	517659	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021878	AACTA	2	10	517728	517737	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021878	AATAA	2	10	517764	517773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021878	TATAA	2	10	535732	535741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021878	ATAAA	2	10	553671	553680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021878	AAAGG	2	10	571136	571145	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021878	CAAAT	2	10	571408	571417	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021878	TTAAA	2	10	577432	577441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021878	AATTA	2	10	582945	582954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021878	TTTAA	2	10	594195	594204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021878	TAAAT	2	10	609181	609190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021878	ATTTT	2	10	612695	612704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021878	ATAAA	2	10	615816	615825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021878	TAATA	2	10	619683	619692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021878	TTAAA	2	10	619744	619753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021878	TAAAT	2	10	638194	638203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021878	TAAAA	2	10	642127	642136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021878	ATTTT	2	10	664166	664175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021878	TAATA	2	10	667479	667488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021878	TAAAT	2	10	699624	699633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021878	TGTAA	2	10	702967	702976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021878	ATTTC	2	10	703766	703775	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021878	ATATT	2	10	732178	732187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021878	AATTA	2	10	741995	742004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021878	AAATA	2	10	745047	745056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021878	GTTTT	2	10	762347	762356	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021878	AAATA	2	10	782392	782401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021878	TATAA	2	10	789416	789425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021878	TGTAT	2	10	795044	795053	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021878	TCGTG	2	10	795858	795867	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021878	AGTGA	2	10	797192	797201	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021878	CCGTA	2	10	798650	798659	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_021878	TTTAT	2	10	816103	816112	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021878	GTTGT	2	10	829505	829514	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021878	TAAAA	2	10	829582	829591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021878	TAATA	2	10	837778	837787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021878	AGATT	2	10	866717	866726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021878	AATAA	2	10	866875	866884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021878	TTTTG	2	10	867043	867052	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021878	ATTAT	2	10	875589	875598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021878	TTTTA	2	10	888419	888428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021878	ATATT	2	10	888492	888501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021878	ATTTG	2	10	893509	893518	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021878	CATTT	2	10	905005	905014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021878	TTTAT	2	10	906721	906730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021878	AATAA	2	10	917510	917519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021878	TAAAA	3	15	947410	947424	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021878	AATAT	2	10	947481	947490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021878	TAAAT	2	10	971492	971501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021878	ATTTT	2	10	977608	977617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021878	AAATA	2	10	977656	977665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021878	AAAAT	2	10	981455	981464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021878	TGAAG	2	10	986998	987007	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021878	ATTTA	2	10	987168	987177	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021878	TAAAG	2	10	996993	997002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021878	ATTTT	2	10	1000585	1000594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021878	ATATT	2	10	1027878	1027887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021878	AATAT	2	10	1034083	1034092	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021878	TCAAT	2	10	1046595	1046604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021878	TAAAA	2	10	1048011	1048020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021878	TAAAT	2	10	1050123	1050132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021878	ATAAA	2	10	1050186	1050195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021878	AATAT	2	10	1050274	1050283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021878	AAAAT	2	10	1070714	1070723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021878	CTTTT	2	10	1084501	1084510	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021878	TAATT	2	10	1087008	1087017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021878	TAAAA	2	10	1087028	1087037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021878	AATAA	2	10	1095494	1095503	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021878	GAATT	2	10	1098931	1098940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021878	TAAAA	2	10	1134512	1134521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021878	TATTT	2	10	1152979	1152988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021878	ATTAT	2	10	1158132	1158141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021878	AAAAT	2	10	1168119	1168128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021878	TTACA	2	10	1173144	1173153	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021878	TATTT	2	10	1178438	1178447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021878	ATAAA	2	10	1178467	1178476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021878	TAAAT	2	10	1193780	1193789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021878	CTATT	2	10	1196132	1196141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021878	TATCT	2	10	1196743	1196752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021878	TAATA	2	10	1197151	1197160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021878	ATAAA	2	10	1208536	1208545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021878	TTTAT	2	10	1214697	1214706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021878	TATAA	2	10	1221691	1221700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021878	TTATA	2	10	1252648	1252657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021878	CTTAC	2	10	1255430	1255439	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_021878	CTTAT	2	10	1267431	1267440	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021878	TTCAT	2	10	1276558	1276567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_021878	TTCAT	2	10	1276574	1276583	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021878	ATTTT	2	10	1276599	1276608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021878	AAATT	2	10	1281320	1281329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_021878	TTATT	2	10	1534733	1534742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021878	TCTAC	2	10	1670851	1670860	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_021878	AAGAG	2	10	1717826	1717835	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021878	TCTTA	3	15	1720070	1720084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_021878	TATTT	2	10	1745880	1745889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_021878	TCACT	2	10	1795377	1795386	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
192	NC_021878	CACGA	2	10	1796711	1796720	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_021878	ATACA	2	10	1797525	1797534	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
194	NC_021878	TCTAC	2	10	1798039	1798048	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
195	NC_021878	AAACA	2	10	1808312	1808321	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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222	NC_021878	AAATA	2	10	2180826	2180835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_021878	TACGG	2	10	2182572	2182581	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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225	NC_021878	CACGA	2	10	2185364	2185373	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
226	NC_021878	ATACA	2	10	2186178	2186187	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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230	NC_021878	TCTTT	2	10	2218074	2218083	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
231	NC_021878	AAAAG	2	10	2233063	2233072	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
232	NC_021878	ATTTT	2	10	2235026	2235035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_021878	TTTTA	2	10	2247921	2247930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_021878	TAATA	2	10	2249851	2249860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.