MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 1544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021872	TATAA	2	10	1116	1125	60 %	40 %	0 %	0 %	526230726
2	NC_021872	ACCAC	2	10	1255	1264	40 %	0 %	0 %	60 %	526230726
3	NC_021872	GTTAA	2	10	2404	2413	40 %	40 %	20 %	0 %	526230727
4	NC_021872	GTTTT	2	10	2722	2731	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021872	AAGAT	2	10	3097	3106	60 %	20 %	20 %	0 %	526230728
6	NC_021872	AATCA	2	10	7666	7675	60 %	20 %	0 %	20 %	526230731
7	NC_021872	TAAAG	2	10	9287	9296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021872	ACCAA	2	10	10387	10396	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_021872	AATTG	2	10	11026	11035	40 %	40 %	20 %	0 %	526232157
10	NC_021872	AAATT	2	10	11619	11628	60 %	40 %	0 %	0 %	526232157
11	NC_021872	TGATA	2	10	11857	11866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021872	AGATG	2	10	14997	15006	40 %	20 %	40 %	0 %	526230737
13	NC_021872	CGGAC	2	10	15208	15217	20 %	0 %	40 %	40 %	526230737
14	NC_021872	GACAA	2	10	15524	15533	60 %	0 %	20 %	20 %	526230737
15	NC_021872	AAAAT	2	10	18710	18719	80 %	20 %	0 %	0 %	526232158
16	NC_021872	AAAAT	2	10	18759	18768	80 %	20 %	0 %	0 %	526232158
17	NC_021872	AAGAT	2	10	21908	21917	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021872	AGCAG	2	10	23135	23144	40 %	0 %	40 %	20 %	526230744
19	NC_021872	TTCAT	2	10	24865	24874	20 %	60 %	0 %	20 %	526230745
20	NC_021872	CACGA	2	10	24911	24920	40 %	0 %	20 %	40 %	526230745
21	NC_021872	TAATT	2	10	25044	25053	40 %	60 %	0 %	0 %	526230745
22	NC_021872	GGATC	2	10	25377	25386	20 %	20 %	40 %	20 %	526230745
23	NC_021872	ATATT	2	10	26301	26310	40 %	60 %	0 %	0 %	526230746
24	NC_021872	ATGGA	2	10	27199	27208	40 %	20 %	40 %	0 %	526230747
25	NC_021872	AATTA	2	10	29847	29856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021872	ACAAT	2	10	30734	30743	60 %	20 %	0 %	20 %	526230750
27	NC_021872	AAAAG	2	10	31551	31560	80 %	0 %	20 %	0 %	526230751
28	NC_021872	GATTT	2	10	32089	32098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021872	ACCTA	2	10	37196	37205	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_021872	AAATT	2	10	37283	37292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021872	AATTA	2	10	37315	37324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021872	AAAAG	2	10	38401	38410	80 %	0 %	20 %	0 %	526232162
33	NC_021872	GGGCT	2	10	38719	38728	0 %	20 %	60 %	20 %	526232162
34	NC_021872	AATAT	2	10	39181	39190	60 %	40 %	0 %	0 %	526232163
35	NC_021872	ATGGG	2	10	39454	39463	20 %	20 %	60 %	0 %	526232163
36	NC_021872	GTTTT	2	10	40361	40370	0 %	80 %	20 %	0 %	526230756
37	NC_021872	TTCTC	2	10	41600	41609	0 %	60 %	0 %	40 %	526232164
38	NC_021872	TCAAC	2	10	42618	42627	40 %	20 %	0 %	40 %	526232165
39	NC_021872	CAAAA	2	10	43667	43676	80 %	0 %	0 %	20 %	526230757
40	NC_021872	TCCTA	2	10	44858	44867	20 %	40 %	0 %	40 %	526232168
41	NC_021872	TATGA	2	10	46123	46132	40 %	40 %	20 %	0 %	526232169
42	NC_021872	AAAGT	2	10	47009	47018	60 %	20 %	20 %	0 %	526232170
43	NC_021872	GTTGG	2	10	49359	49368	0 %	40 %	60 %	0 %	526230760
44	NC_021872	TTTAA	2	10	50298	50307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021872	ATATT	2	10	50721	50730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021872	ATTAA	2	10	52998	53007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021872	TTTAA	2	10	53156	53165	40 %	60 %	0 %	0 %	526232171
48	NC_021872	CAAGC	2	10	55542	55551	40 %	0 %	20 %	40 %	526230763
49	NC_021872	TAACT	2	10	56665	56674	40 %	40 %	0 %	20 %	526230763
50	NC_021872	AATGA	2	10	58676	58685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021872	TTTAT	2	10	58853	58862	20 %	80 %	0 %	0 %	526230765
52	NC_021872	AAGAT	2	10	59562	59571	60 %	20 %	20 %	0 %	526230765
53	NC_021872	TTGCA	2	10	59619	59628	20 %	40 %	20 %	20 %	526230765
54	NC_021872	TTAAA	2	10	59982	59991	60 %	40 %	0 %	0 %	526230765
55	NC_021872	TATTC	2	10	61237	61246	20 %	60 %	0 %	20 %	526230766
56	NC_021872	TGAAT	2	10	61475	61484	40 %	40 %	20 %	0 %	526230766
57	NC_021872	CGGAA	2	10	62220	62229	40 %	0 %	40 %	20 %	526230766
58	NC_021872	AATTT	2	10	69159	69168	40 %	60 %	0 %	0 %	526230768
59	NC_021872	GGAAC	2	10	69795	69804	40 %	0 %	40 %	20 %	526230769
60	NC_021872	ATGCA	2	10	69813	69822	40 %	20 %	20 %	20 %	526230769
61	NC_021872	AGCAA	2	10	72621	72630	60 %	0 %	20 %	20 %	526230771
62	NC_021872	GAAAA	2	10	75331	75340	80 %	0 %	20 %	0 %	526232172
63	NC_021872	AGTCA	2	10	75441	75450	40 %	20 %	20 %	20 %	526232172
64	NC_021872	AAGAA	2	10	75739	75748	80 %	0 %	20 %	0 %	526232172
65	NC_021872	CTGGA	2	10	76696	76705	20 %	20 %	40 %	20 %	526230774
66	NC_021872	TATTT	2	10	76998	77007	20 %	80 %	0 %	0 %	526230774
67	NC_021872	AATTA	2	10	78716	78725	60 %	40 %	0 %	0 %	526232173
68	NC_021872	ATGCA	2	10	80013	80022	40 %	20 %	20 %	20 %	526230776
69	NC_021872	TAACT	2	10	81226	81235	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021872	CTTGC	2	10	81508	81517	0 %	40 %	20 %	40 %	526230777
71	NC_021872	AAACA	2	10	84286	84295	80 %	0 %	0 %	20 %	526230779
72	NC_021872	ACTAA	2	10	84539	84548	60 %	20 %	0 %	20 %	526230779
73	NC_021872	TTAAC	2	10	85537	85546	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021872	GGATG	2	10	89403	89412	20 %	20 %	60 %	0 %	526230783
75	NC_021872	TATCT	2	10	91279	91288	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021872	ATTTT	2	10	91850	91859	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021872	TAGCT	2	10	94228	94237	20 %	40 %	20 %	20 %	526232174
78	NC_021872	TGATT	2	10	94374	94383	20 %	60 %	20 %	0 %	526232174
79	NC_021872	TCTTT	2	10	95036	95045	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021872	GGAAA	2	10	95740	95749	60 %	0 %	40 %	0 %	526230788
81	NC_021872	TGAAT	2	10	97378	97387	40 %	40 %	20 %	0 %	526230789
82	NC_021872	CATAC	2	10	98502	98511	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_021872	ATTTT	2	10	100229	100238	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021872	TTTTA	2	10	100367	100376	20 %	80 %	0 %	0 %	526232175
85	NC_021872	CAATG	2	10	101661	101670	40 %	20 %	20 %	20 %	526232175
86	NC_021872	TAAAA	2	10	103495	103504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021872	ATTTC	2	10	103996	104005	20 %	60 %	0 %	20 %	526230791
88	NC_021872	ATCTT	2	10	107371	107380	20 %	60 %	0 %	20 %	526230792
89	NC_021872	TAAAA	2	10	108117	108126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021872	AACGA	2	10	112983	112992	60 %	0 %	20 %	20 %	526230796
91	NC_021872	AATTT	2	10	115267	115276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021872	TCAAG	2	10	115883	115892	40 %	20 %	20 %	20 %	526232176
93	NC_021872	CTTAA	2	10	116705	116714	40 %	40 %	0 %	20 %	526232176
94	NC_021872	AAGGT	2	10	123753	123762	40 %	20 %	40 %	0 %	526232176
95	NC_021872	AATAC	2	10	127870	127879	60 %	20 %	0 %	20 %	526232177
96	NC_021872	TTCAC	2	10	132109	132118	20 %	40 %	0 %	40 %	526232177
97	NC_021872	TGACT	2	10	137309	137318	20 %	40 %	20 %	20 %	526232177
98	NC_021872	ATCAA	2	10	137356	137365	60 %	20 %	0 %	20 %	526232177
99	NC_021872	CATTT	2	10	138537	138546	20 %	60 %	0 %	20 %	526232178
100	NC_021872	ACTTA	2	10	138955	138964	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021872	AGTTT	2	10	139382	139391	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021872	ATAGT	2	10	139470	139479	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021872	GAAAA	2	10	141860	141869	80 %	0 %	20 %	0 %	526230800
104	NC_021872	TACTA	2	10	141889	141898	40 %	40 %	0 %	20 %	526230800
105	NC_021872	TTATT	2	10	144434	144443	20 %	80 %	0 %	0 %	526230802
106	NC_021872	ATTAT	2	10	145088	145097	40 %	60 %	0 %	0 %	526230802
107	NC_021872	TCTTT	2	10	145418	145427	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021872	TTGGA	2	10	148182	148191	20 %	40 %	40 %	0 %	526230804
109	NC_021872	ATAAG	2	10	150424	150433	60 %	20 %	20 %	0 %	526230806
110	NC_021872	ATTTT	2	10	151784	151793	20 %	80 %	0 %	0 %	526230808
111	NC_021872	AACGG	2	10	152858	152867	40 %	0 %	40 %	20 %	526230809
112	NC_021872	ACGCA	2	10	152891	152900	40 %	0 %	20 %	40 %	526230809
113	NC_021872	TGCAA	2	10	154905	154914	40 %	20 %	20 %	20 %	526230812
114	NC_021872	CTTTT	2	10	155350	155359	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_021872	AAAGG	2	10	158204	158213	60 %	0 %	40 %	0 %	526230815
116	NC_021872	TGGGA	2	10	158929	158938	20 %	20 %	60 %	0 %	526230816
117	NC_021872	ATGAT	2	10	159408	159417	40 %	40 %	20 %	0 %	526230816
118	NC_021872	CTGAA	2	10	159649	159658	40 %	20 %	20 %	20 %	526230817
119	NC_021872	TTACT	2	10	160223	160232	20 %	60 %	0 %	20 %	526230817
120	NC_021872	ATGGA	2	10	162077	162086	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021872	GCGGT	2	10	163028	163037	0 %	20 %	60 %	20 %	526230819
122	NC_021872	GATTG	2	10	163990	163999	20 %	40 %	40 %	0 %	526230820
123	NC_021872	AATTA	2	10	165175	165184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021872	TTTTA	2	10	165232	165241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021872	ATCCC	2	10	171610	171619	20 %	20 %	0 %	60 %	526230828
126	NC_021872	AATAC	2	10	171774	171783	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021872	TTTAA	2	10	172527	172536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021872	TAAAG	2	10	173124	173133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021872	TTTTC	2	10	173141	173150	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021872	TGTAA	2	10	173176	173185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021872	AGTAA	2	10	173467	173476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021872	TAAAA	2	10	173931	173940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021872	AATTT	2	10	174156	174165	40 %	60 %	0 %	0 %	526230829
134	NC_021872	TATTG	2	10	174953	174962	20 %	60 %	20 %	0 %	526230829
135	NC_021872	ATTTT	2	10	175103	175112	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021872	ACTTT	2	10	176762	176771	20 %	60 %	0 %	20 %	526230830
137	NC_021872	ATTTT	2	10	182278	182287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021872	TGACG	2	10	182940	182949	20 %	20 %	40 %	20 %	526232181
139	NC_021872	AATTA	2	10	183090	183099	60 %	40 %	0 %	0 %	526232181
140	NC_021872	TGATT	2	10	187447	187456	20 %	60 %	20 %	0 %	526230835
141	NC_021872	ATTCC	2	10	187490	187499	20 %	40 %	0 %	40 %	526230835
142	NC_021872	TCAAT	2	10	189489	189498	40 %	40 %	0 %	20 %	526230836
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155	NC_021872	TCGTG	2	10	204755	204764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_021872	CAAAA	2	10	219523	219532	80 %	0 %	0 %	20 %	526230851
163	NC_021872	AAGTT	2	10	219954	219963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_021872	TTTCT	2	10	344947	344956	0 %	80 %	0 %	20 %	526232203
239	NC_021872	GTAAA	2	10	345150	345159	60 %	20 %	20 %	0 %	526232203
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241	NC_021872	GGTAA	2	10	347162	347171	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
242	NC_021872	GTCTG	2	10	347645	347654	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
243	NC_021872	TCGTG	2	10	347979	347988	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
244	NC_021872	AACAA	2	10	348560	348569	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
245	NC_021872	GAGAT	2	10	351451	351460	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
246	NC_021872	GAAAA	2	10	353192	353201	80 %	0 %	20 %	0 %	526230946
247	NC_021872	AAAGC	2	10	353225	353234	60 %	0 %	20 %	20 %	526230946
248	NC_021872	TTCTA	2	10	356447	356456	20 %	60 %	0 %	20 %	526230948
249	NC_021872	GGGAA	2	10	358659	358668	40 %	0 %	60 %	0 %	526230949
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252	NC_021872	TTATT	2	10	360742	360751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021872	GATTT	2	10	361137	361146	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_021872	ATCGG	2	10	361557	361566	20 %	20 %	40 %	20 %	526230951
255	NC_021872	TTTTG	2	10	362224	362233	0 %	80 %	20 %	0 %	526230951
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257	NC_021872	GTTCA	2	10	366208	366217	20 %	40 %	20 %	20 %	526230955
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259	NC_021872	AAATT	2	10	367668	367677	60 %	40 %	0 %	0 %	526230956
260	NC_021872	CCTCT	2	10	369868	369877	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
261	NC_021872	TAAAC	2	10	371924	371933	60 %	20 %	0 %	20 %	526230959
262	NC_021872	CTTCT	2	10	373304	373313	0 %	60 %	0 %	40 %	526230960
263	NC_021872	TAGAT	2	10	373796	373805	40 %	40 %	20 %	0 %	526230960
264	NC_021872	TAAAC	2	10	374650	374659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_021872	TTTCC	2	10	374670	374679	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
266	NC_021872	TGAAG	2	10	375103	375112	40 %	20 %	40 %	0 %	526230961
267	NC_021872	ATCTT	2	10	378438	378447	20 %	60 %	0 %	20 %	526230964
268	NC_021872	AGTTT	2	10	380647	380656	20 %	60 %	20 %	0 %	526230967
269	NC_021872	AACCA	2	10	380678	380687	60 %	0 %	0 %	40 %	526230967
270	NC_021872	AATTC	2	10	385575	385584	40 %	40 %	0 %	20 %	526230972
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276	NC_021872	ATTTA	2	10	398120	398129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_021872	CTATC	2	10	575324	575333	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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