MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 6068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021872	TTTA	2	8	462	469	25 %	75 %	0 %	0 %	526230726
2	NC_021872	CATT	2	8	1562	1569	25 %	50 %	0 %	25 %	526230727
3	NC_021872	TTGA	2	8	2946	2953	25 %	50 %	25 %	0 %	526230728
4	NC_021872	AGTA	2	8	3141	3148	50 %	25 %	25 %	0 %	526230728
5	NC_021872	GATT	2	8	4054	4061	25 %	50 %	25 %	0 %	526230729
6	NC_021872	TTAA	2	8	4217	4224	50 %	50 %	0 %	0 %	526230729
7	NC_021872	GAAT	3	12	6428	6439	50 %	25 %	25 %	0 %	526230731
8	NC_021872	AAAG	2	8	7383	7390	75 %	0 %	25 %	0 %	526230731
9	NC_021872	TAAT	2	8	7451	7458	50 %	50 %	0 %	0 %	526230731
10	NC_021872	ATTG	2	8	8223	8230	25 %	50 %	25 %	0 %	526230731
11	NC_021872	TTGG	2	8	8527	8534	0 %	50 %	50 %	0 %	526230731
12	NC_021872	GACC	2	8	8574	8581	25 %	0 %	25 %	50 %	526230731
13	NC_021872	TTAA	2	8	8650	8657	50 %	50 %	0 %	0 %	526230731
14	NC_021872	CAAC	2	8	8758	8765	50 %	0 %	0 %	50 %	526230731
15	NC_021872	TTAC	2	8	9000	9007	25 %	50 %	0 %	25 %	526230732
16	NC_021872	TTAA	2	8	9271	9278	50 %	50 %	0 %	0 %	526230732
17	NC_021872	TAAA	2	8	9873	9880	75 %	25 %	0 %	0 %	526230733
18	NC_021872	AATT	2	8	10513	10520	50 %	50 %	0 %	0 %	526232157
19	NC_021872	AACG	2	8	10968	10975	50 %	0 %	25 %	25 %	526232157
20	NC_021872	ATGA	2	8	11012	11019	50 %	25 %	25 %	0 %	526232157
21	NC_021872	ACTT	2	8	11432	11439	25 %	50 %	0 %	25 %	526232157
22	NC_021872	TTAC	2	8	11713	11720	25 %	50 %	0 %	25 %	526232157
23	NC_021872	TTTA	2	8	12411	12418	25 %	75 %	0 %	0 %	526230735
24	NC_021872	TGAT	2	8	13065	13072	25 %	50 %	25 %	0 %	526230735
25	NC_021872	GAAA	2	8	13549	13556	75 %	0 %	25 %	0 %	526230735
26	NC_021872	AAAT	2	8	13602	13609	75 %	25 %	0 %	0 %	526230735
27	NC_021872	CAAG	2	8	13867	13874	50 %	0 %	25 %	25 %	526230735
28	NC_021872	AGTT	2	8	13875	13882	25 %	50 %	25 %	0 %	526230735
29	NC_021872	CTAA	2	8	13889	13896	50 %	25 %	0 %	25 %	526230735
30	NC_021872	GTTT	2	8	15242	15249	0 %	75 %	25 %	0 %	526230737
31	NC_021872	TTGA	2	8	15391	15398	25 %	50 %	25 %	0 %	526230737
32	NC_021872	TGGC	2	8	16213	16220	0 %	25 %	50 %	25 %	526230738
33	NC_021872	TATT	2	8	16782	16789	25 %	75 %	0 %	0 %	526230738
34	NC_021872	TGCC	2	8	16905	16912	0 %	25 %	25 %	50 %	526230738
35	NC_021872	AGAA	2	8	17287	17294	75 %	0 %	25 %	0 %	526230739
36	NC_021872	TGGA	2	8	17297	17304	25 %	25 %	50 %	0 %	526230739
37	NC_021872	CAAC	2	8	17856	17863	50 %	0 %	0 %	50 %	526230740
38	NC_021872	AATC	2	8	17897	17904	50 %	25 %	0 %	25 %	526230740
39	NC_021872	TAAA	2	8	18456	18463	75 %	25 %	0 %	0 %	526230740
40	NC_021872	TTTA	2	8	18488	18495	25 %	75 %	0 %	0 %	526232158
41	NC_021872	TAAG	2	8	18860	18867	50 %	25 %	25 %	0 %	526232158
42	NC_021872	ATTC	2	8	19178	19185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021872	ATTT	2	8	19561	19568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021872	AAAT	2	8	20178	20185	75 %	25 %	0 %	0 %	526230742
45	NC_021872	TAAT	2	8	20315	20322	50 %	50 %	0 %	0 %	526230742
46	NC_021872	ATTG	2	8	21306	21313	25 %	50 %	25 %	0 %	526230742
47	NC_021872	TAAA	2	8	21885	21892	75 %	25 %	0 %	0 %	526230742
48	NC_021872	TAAT	2	8	22198	22205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021872	AACA	2	8	23172	23179	75 %	0 %	0 %	25 %	526230744
50	NC_021872	AAAC	2	8	23595	23602	75 %	0 %	0 %	25 %	526230744
51	NC_021872	GGAT	2	8	24274	24281	25 %	25 %	50 %	0 %	526230744
52	NC_021872	AAGA	2	8	24420	24427	75 %	0 %	25 %	0 %	526230744
53	NC_021872	GCAA	2	8	24825	24832	50 %	0 %	25 %	25 %	526230745
54	NC_021872	ACCA	2	8	24886	24893	50 %	0 %	0 %	50 %	526230745
55	NC_021872	CAAT	2	8	24958	24965	50 %	25 %	0 %	25 %	526230745
56	NC_021872	CAAA	2	8	25107	25114	75 %	0 %	0 %	25 %	526230745
57	NC_021872	TACT	2	8	25288	25295	25 %	50 %	0 %	25 %	526230745
58	NC_021872	GTGA	2	8	25735	25742	25 %	25 %	50 %	0 %	526230745
59	NC_021872	CAAC	2	8	25949	25956	50 %	0 %	0 %	50 %	526230745
60	NC_021872	GAAT	2	8	26105	26112	50 %	25 %	25 %	0 %	526230746
61	NC_021872	GAAA	2	8	26241	26248	75 %	0 %	25 %	0 %	526230746
62	NC_021872	GAAA	2	8	26315	26322	75 %	0 %	25 %	0 %	526230746
63	NC_021872	TCTT	2	8	26382	26389	0 %	75 %	0 %	25 %	526230746
64	NC_021872	ACTT	2	8	26641	26648	25 %	50 %	0 %	25 %	526230746
65	NC_021872	GATC	2	8	27111	27118	25 %	25 %	25 %	25 %	526230747
66	NC_021872	GGCA	2	8	27232	27239	25 %	0 %	50 %	25 %	526230747
67	NC_021872	CAAG	2	8	27751	27758	50 %	0 %	25 %	25 %	526230747
68	NC_021872	ATTA	2	8	28645	28652	50 %	50 %	0 %	0 %	526230748
69	NC_021872	AATT	2	8	28675	28682	50 %	50 %	0 %	0 %	526230748
70	NC_021872	TTAA	2	8	28775	28782	50 %	50 %	0 %	0 %	526230748
71	NC_021872	AATG	2	8	29148	29155	50 %	25 %	25 %	0 %	526230748
72	NC_021872	TTAA	2	8	29205	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021872	TAAG	2	8	31044	31051	50 %	25 %	25 %	0 %	526230750
74	NC_021872	TAAC	2	8	31203	31210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021872	ATGC	2	8	31467	31474	25 %	25 %	25 %	25 %	526230751
76	NC_021872	AAGG	2	8	31690	31697	50 %	0 %	50 %	0 %	526230751
77	NC_021872	ATAA	2	8	31991	31998	75 %	25 %	0 %	0 %	526230751
78	NC_021872	TGAA	2	8	32192	32199	50 %	25 %	25 %	0 %	526230752
79	NC_021872	ATTG	2	8	32314	32321	25 %	50 %	25 %	0 %	526230752
80	NC_021872	CGTT	2	8	32461	32468	0 %	50 %	25 %	25 %	526230753
81	NC_021872	GAGT	2	8	32635	32642	25 %	25 %	50 %	0 %	526230753
82	NC_021872	TGTT	2	8	32667	32674	0 %	75 %	25 %	0 %	526230753
83	NC_021872	AGTT	2	8	32755	32762	25 %	50 %	25 %	0 %	526230753
84	NC_021872	AGCT	2	8	32963	32970	25 %	25 %	25 %	25 %	526230753
85	NC_021872	ATTG	2	8	33291	33298	25 %	50 %	25 %	0 %	526230754
86	NC_021872	AATT	2	8	33857	33864	50 %	50 %	0 %	0 %	526230754
87	NC_021872	TAAA	2	8	34364	34371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021872	GCCA	2	8	34425	34432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021872	TTGG	2	8	34634	34641	0 %	50 %	50 %	0 %	526230755
90	NC_021872	ATTA	2	8	34653	34660	50 %	50 %	0 %	0 %	526230755
91	NC_021872	AACC	2	8	34751	34758	50 %	0 %	0 %	50 %	526230755
92	NC_021872	GTTA	2	8	34887	34894	25 %	50 %	25 %	0 %	526230755
93	NC_021872	CGGA	2	8	35009	35016	25 %	0 %	50 %	25 %	526230755
94	NC_021872	TAAT	2	8	35460	35467	50 %	50 %	0 %	0 %	526230755
95	NC_021872	ATTG	2	8	35713	35720	25 %	50 %	25 %	0 %	526232160
96	NC_021872	GTTT	2	8	36574	36581	0 %	75 %	25 %	0 %	526232161
97	NC_021872	CTTG	2	8	37011	37018	0 %	50 %	25 %	25 %	526232161
98	NC_021872	TCGA	3	12	37049	37060	25 %	25 %	25 %	25 %	526232161
99	NC_021872	TTTA	2	8	37451	37458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021872	AACA	2	8	37548	37555	75 %	0 %	0 %	25 %	526232162
101	NC_021872	ATTA	2	8	37699	37706	50 %	50 %	0 %	0 %	526232162
102	NC_021872	TATT	2	8	37893	37900	25 %	75 %	0 %	0 %	526232162
103	NC_021872	AACA	2	8	38813	38820	75 %	0 %	0 %	25 %	526232162
104	NC_021872	AACG	2	8	39400	39407	50 %	0 %	25 %	25 %	526232163
105	NC_021872	CAAG	2	8	39534	39541	50 %	0 %	25 %	25 %	526232163
106	NC_021872	AACC	2	8	41172	41179	50 %	0 %	0 %	50 %	526232164
107	NC_021872	TGAT	2	8	42006	42013	25 %	50 %	25 %	0 %	526232164
108	NC_021872	TGAT	2	8	42688	42695	25 %	50 %	25 %	0 %	526232165
109	NC_021872	CTAT	2	8	43022	43029	25 %	50 %	0 %	25 %	526230757
110	NC_021872	AAGC	2	8	43157	43164	50 %	0 %	25 %	25 %	526230757
111	NC_021872	CAGT	2	8	43389	43396	25 %	25 %	25 %	25 %	526230757
112	NC_021872	GGAT	2	8	44505	44512	25 %	25 %	50 %	0 %	526232166
113	NC_021872	TTGT	2	8	44848	44855	0 %	75 %	25 %	0 %	526232168
114	NC_021872	TTGG	2	8	45186	45193	0 %	50 %	50 %	0 %	526232168
115	NC_021872	GCAA	2	8	47099	47106	50 %	0 %	25 %	25 %	526232170
116	NC_021872	TTTA	2	8	47170	47177	25 %	75 %	0 %	0 %	526232170
117	NC_021872	TGGT	2	8	47358	47365	0 %	50 %	50 %	0 %	526230758
118	NC_021872	GGCA	2	8	47501	47508	25 %	0 %	50 %	25 %	526230758
119	NC_021872	GCTT	2	8	48125	48132	0 %	50 %	25 %	25 %	526230759
120	NC_021872	TTTG	2	8	48504	48511	0 %	75 %	25 %	0 %	526230759
121	NC_021872	TCAA	2	8	48611	48618	50 %	25 %	0 %	25 %	526230759
122	NC_021872	ACTG	2	8	49118	49125	25 %	25 %	25 %	25 %	526230760
123	NC_021872	GTAA	2	8	49346	49353	50 %	25 %	25 %	0 %	526230760
124	NC_021872	CCCA	2	8	49481	49488	25 %	0 %	0 %	75 %	526230760
125	NC_021872	GAGT	2	8	49846	49853	25 %	25 %	50 %	0 %	526230760
126	NC_021872	TTGA	2	8	50205	50212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021872	ATTA	2	8	50221	50228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021872	ATGA	2	8	50787	50794	50 %	25 %	25 %	0 %	526230762
129	NC_021872	GTTG	2	8	51287	51294	0 %	50 %	50 %	0 %	526230762
130	NC_021872	CAAG	2	8	51532	51539	50 %	0 %	25 %	25 %	526230762
131	NC_021872	AAGA	2	8	51795	51802	75 %	0 %	25 %	0 %	526230762
132	NC_021872	TTAA	2	8	52518	52525	50 %	50 %	0 %	0 %	526230762
133	NC_021872	TGCT	2	8	52630	52637	0 %	50 %	25 %	25 %	526230762
134	NC_021872	AAGA	2	8	52971	52978	75 %	0 %	25 %	0 %	526230762
135	NC_021872	CAAA	2	8	53449	53456	75 %	0 %	0 %	25 %	526232171
136	NC_021872	TGCC	2	8	53760	53767	0 %	25 %	25 %	50 %	526232171
137	NC_021872	TGAT	2	8	53806	53813	25 %	50 %	25 %	0 %	526232171
138	NC_021872	ATAA	2	8	54572	54579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021872	ATAA	2	8	54727	54734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_021872	TTAC	2	8	55119	55126	25 %	50 %	0 %	25 %	526230763
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