MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella bongori N268-08 plasmid RM1

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021871	TTAA	2	8	72	79	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021871	TTCA	2	8	156	163	25 %	50 %	0 %	25 %	526230593
3	NC_021871	GGGC	2	8	1254	1261	0 %	0 %	75 %	25 %	526230596
4	NC_021871	TTAT	3	12	1301	1312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021871	GGTA	2	8	2112	2119	25 %	25 %	50 %	0 %	526230597
6	NC_021871	CGAA	3	12	2349	2360	50 %	0 %	25 %	25 %	526230599
7	NC_021871	GTCA	2	8	2520	2527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021871	TGAT	2	8	2616	2623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021871	GCCA	2	8	2754	2761	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021871	CTTT	2	8	2928	2935	0 %	75 %	0 %	25 %	526230600
11	NC_021871	ACTT	2	8	3152	3159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021871	CGCC	2	8	3987	3994	0 %	0 %	25 %	75 %	526230602
13	NC_021871	GCCA	2	8	4078	4085	25 %	0 %	25 %	50 %	526230602
14	NC_021871	TGCC	2	8	4151	4158	0 %	25 %	25 %	50 %	526230604
15	NC_021871	ACGA	2	8	4763	4770	50 %	0 %	25 %	25 %	526230606
16	NC_021871	GCCT	2	8	4859	4866	0 %	25 %	25 %	50 %	526230606
17	NC_021871	CCAG	3	12	5864	5875	25 %	0 %	25 %	50 %	526230608
18	NC_021871	CGGT	2	8	6165	6172	0 %	25 %	50 %	25 %	526230608
19	NC_021871	CTGA	2	8	6203	6210	25 %	25 %	25 %	25 %	526230608
20	NC_021871	CGTT	2	8	6348	6355	0 %	50 %	25 %	25 %	526230608
21	NC_021871	CGCA	2	8	6398	6405	25 %	0 %	25 %	50 %	526230608
22	NC_021871	TCCT	2	8	6728	6735	0 %	50 %	0 %	50 %	526230608
23	NC_021871	CGGT	2	8	7275	7282	0 %	25 %	50 %	25 %	526230608
24	NC_021871	AGGC	2	8	7342	7349	25 %	0 %	50 %	25 %	526230608
25	NC_021871	TCAG	2	8	7524	7531	25 %	25 %	25 %	25 %	526230608
26	NC_021871	GCTG	2	8	8458	8465	0 %	25 %	50 %	25 %	526230608
27	NC_021871	TTTC	2	8	8653	8660	0 %	75 %	0 %	25 %	526230608
28	NC_021871	CATT	2	8	8722	8729	25 %	50 %	0 %	25 %	526230608
29	NC_021871	GTTC	2	8	9034	9041	0 %	50 %	25 %	25 %	526230608
30	NC_021871	CAGC	2	8	10145	10152	25 %	0 %	25 %	50 %	526230608
31	NC_021871	AGCC	2	8	11339	11346	25 %	0 %	25 %	50 %	526230609
32	NC_021871	AACG	2	8	11809	11816	50 %	0 %	25 %	25 %	526230609
33	NC_021871	CTGA	2	8	12259	12266	25 %	25 %	25 %	25 %	526230609
34	NC_021871	TTAT	2	8	12407	12414	25 %	75 %	0 %	0 %	526230609
35	NC_021871	GTCT	2	8	12532	12539	0 %	50 %	25 %	25 %	526230609
36	NC_021871	CCAG	2	8	13233	13240	25 %	0 %	25 %	50 %	526230610
37	NC_021871	AAAG	2	8	13824	13831	75 %	0 %	25 %	0 %	526230611
38	NC_021871	TAGT	2	8	15542	15549	25 %	50 %	25 %	0 %	526230612
39	NC_021871	GCCA	2	8	15734	15741	25 %	0 %	25 %	50 %	526230612
40	NC_021871	CACC	2	8	16509	16516	25 %	0 %	0 %	75 %	526230612
41	NC_021871	CCGG	2	8	16641	16648	0 %	0 %	50 %	50 %	526230612
42	NC_021871	AGAT	2	8	17277	17284	50 %	25 %	25 %	0 %	526230613
43	NC_021871	GATG	2	8	18146	18153	25 %	25 %	50 %	0 %	526230613
44	NC_021871	GAAT	2	8	18290	18297	50 %	25 %	25 %	0 %	526230613
45	NC_021871	GGCG	2	8	18459	18466	0 %	0 %	75 %	25 %	526230614
46	NC_021871	CATC	2	8	18861	18868	25 %	25 %	0 %	50 %	526230614
47	NC_021871	TCAG	2	8	19378	19385	25 %	25 %	25 %	25 %	526230615
48	NC_021871	AGGT	2	8	20574	20581	25 %	25 %	50 %	0 %	526230616
49	NC_021871	TTCC	2	8	21110	21117	0 %	50 %	0 %	50 %	526230616
50	NC_021871	AAAT	2	8	21283	21290	75 %	25 %	0 %	0 %	526230616
51	NC_021871	AGCC	2	8	22183	22190	25 %	0 %	25 %	50 %	526230617
52	NC_021871	ATTC	2	8	22905	22912	25 %	50 %	0 %	25 %	526230619
53	NC_021871	CTGC	2	8	23019	23026	0 %	25 %	25 %	50 %	526230619
54	NC_021871	GAGC	2	8	23074	23081	25 %	0 %	50 %	25 %	526230619
55	NC_021871	CAGA	2	8	23106	23113	50 %	0 %	25 %	25 %	526230619
56	NC_021871	AAAT	2	8	23736	23743	75 %	25 %	0 %	0 %	526230620
57	NC_021871	CGCC	2	8	24303	24310	0 %	0 %	25 %	75 %	526230621
58	NC_021871	GACC	2	8	25148	25155	25 %	0 %	25 %	50 %	526230622
59	NC_021871	CAGC	2	8	25601	25608	25 %	0 %	25 %	50 %	526230622
60	NC_021871	CCAC	2	8	25696	25703	25 %	0 %	0 %	75 %	526230622
61	NC_021871	ATGA	2	8	26028	26035	50 %	25 %	25 %	0 %	526230622
62	NC_021871	TTCC	2	8	26229	26236	0 %	50 %	0 %	50 %	526230622
63	NC_021871	GCTT	2	8	27008	27015	0 %	50 %	25 %	25 %	526230622
64	NC_021871	ACGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021871	CCGC	2	8	27695	27702	0 %	0 %	25 %	75 %	526230624
66	NC_021871	CTGC	2	8	27842	27849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021871	CTGG	2	8	27907	27914	0 %	25 %	50 %	25 %	526230625
68	NC_021871	CATC	2	8	27998	28005	25 %	25 %	0 %	50 %	526230625
69	NC_021871	CAGG	2	8	28116	28123	25 %	0 %	50 %	25 %	526230625
70	NC_021871	CGGT	2	8	28705	28712	0 %	25 %	50 %	25 %	526230627
71	NC_021871	GCCA	2	8	28926	28933	25 %	0 %	25 %	50 %	526230627
72	NC_021871	CTGA	2	8	29115	29122	25 %	25 %	25 %	25 %	526230628
73	NC_021871	ACGC	2	8	29247	29254	25 %	0 %	25 %	50 %	526230629
74	NC_021871	ACTA	2	8	29477	29484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021871	CGCA	2	8	29677	29684	25 %	0 %	25 %	50 %	526230630
76	NC_021871	CCTG	2	8	29837	29844	0 %	25 %	25 %	50 %	526230630
77	NC_021871	ACGA	2	8	30082	30089	50 %	0 %	25 %	25 %	526230630
78	NC_021871	TCTG	2	8	30632	30639	0 %	50 %	25 %	25 %	526230630
79	NC_021871	GCGG	2	8	30755	30762	0 %	0 %	75 %	25 %	526230630
80	NC_021871	CCAT	2	8	30789	30796	25 %	25 %	0 %	50 %	526230630
81	NC_021871	GCAC	2	8	30972	30979	25 %	0 %	25 %	50 %	526230631
82	NC_021871	CGCC	2	8	31066	31073	0 %	0 %	25 %	75 %	526230631
83	NC_021871	AGGA	2	8	31933	31940	50 %	0 %	50 %	0 %	526230632
84	NC_021871	CAGC	2	8	32060	32067	25 %	0 %	25 %	50 %	526230632
85	NC_021871	ATTT	2	8	32183	32190	25 %	75 %	0 %	0 %	526230633
86	NC_021871	AATA	2	8	32351	32358	75 %	25 %	0 %	0 %	526230633
87	NC_021871	CTTT	2	8	33034	33041	0 %	75 %	0 %	25 %	526230635
88	NC_021871	TAAA	2	8	33718	33725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021871	AATA	2	8	33794	33801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021871	GGAA	2	8	33899	33906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021871	GAAA	2	8	33956	33963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021871	ATGA	2	8	34158	34165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021871	ATAA	2	8	34270	34277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021871	GAAA	2	8	34310	34317	75 %	0 %	25 %	0 %	526230637
95	NC_021871	CCTT	2	8	34498	34505	0 %	50 %	0 %	50 %	526230637
96	NC_021871	ATTA	2	8	34703	34710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021871	AATG	2	8	35291	35298	50 %	25 %	25 %	0 %	526230638
98	NC_021871	ATCA	2	8	35608	35615	50 %	25 %	0 %	25 %	526230639
99	NC_021871	GCGA	2	8	35684	35691	25 %	0 %	50 %	25 %	526230639
100	NC_021871	AGGA	2	8	36214	36221	50 %	0 %	50 %	0 %	526230640
101	NC_021871	TCCT	2	8	36259	36266	0 %	50 %	0 %	50 %	526230640
102	NC_021871	ATAA	2	8	36567	36574	75 %	25 %	0 %	0 %	526230642
103	NC_021871	TATT	2	8	38275	38282	25 %	75 %	0 %	0 %	526230646
104	NC_021871	TCAT	2	8	39719	39726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021871	CATG	2	8	40298	40305	25 %	25 %	25 %	25 %	526230650
106	NC_021871	CCAT	2	8	40332	40339	25 %	25 %	0 %	50 %	526230650
107	NC_021871	CTTT	2	8	40367	40374	0 %	75 %	0 %	25 %	526230650
108	NC_021871	GCAG	2	8	41134	41141	25 %	0 %	50 %	25 %	526230651
109	NC_021871	GGAA	2	8	41172	41179	50 %	0 %	50 %	0 %	526230651
110	NC_021871	CAGG	2	8	41579	41586	25 %	0 %	50 %	25 %	526230652
111	NC_021871	TGGC	2	8	41621	41628	0 %	25 %	50 %	25 %	526230652
112	NC_021871	TTCT	2	8	42162	42169	0 %	75 %	0 %	25 %	526230652
113	NC_021871	GGAG	2	8	42237	42244	25 %	0 %	75 %	0 %	526230652
114	NC_021871	TCCT	2	8	42598	42605	0 %	50 %	0 %	50 %	526230652
115	NC_021871	CGCC	2	8	43218	43225	0 %	0 %	25 %	75 %	526230652
116	NC_021871	GTGA	2	8	43750	43757	25 %	25 %	50 %	0 %	526230653
117	NC_021871	GTTT	2	8	44429	44436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021871	GCCT	2	8	44838	44845	0 %	25 %	25 %	50 %	526230656
119	NC_021871	CAGC	2	8	45528	45535	25 %	0 %	25 %	50 %	526230658
120	NC_021871	CATC	2	8	45910	45917	25 %	25 %	0 %	50 %	526230660
121	NC_021871	GCGA	2	8	47120	47127	25 %	0 %	50 %	25 %	526230664
122	NC_021871	CAGC	2	8	47313	47320	25 %	0 %	25 %	50 %	526230664
123	NC_021871	CCGC	2	8	47442	47449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_021871	TCCC	2	8	47585	47592	0 %	25 %	0 %	75 %	526230665
125	NC_021871	CCAG	2	8	47771	47778	25 %	0 %	25 %	50 %	526230665
126	NC_021871	CGGG	2	8	47941	47948	0 %	0 %	75 %	25 %	526230665
127	NC_021871	GTCA	2	8	47952	47959	25 %	25 %	25 %	25 %	526230665
128	NC_021871	ACGG	2	8	48014	48021	25 %	0 %	50 %	25 %	526230665
129	NC_021871	GTCA	2	8	48077	48084	25 %	25 %	25 %	25 %	526230666
130	NC_021871	ATCA	2	8	48598	48605	50 %	25 %	0 %	25 %	526230667
131	NC_021871	CTCA	2	8	48790	48797	25 %	25 %	0 %	50 %	526230667
132	NC_021871	TCGG	2	8	49304	49311	0 %	25 %	50 %	25 %	526230669
133	NC_021871	GTCC	2	8	49990	49997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021871	CCTG	2	8	50079	50086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021871	ATTG	2	8	50470	50477	25 %	50 %	25 %	0 %	526230671
136	NC_021871	CAGC	2	8	50595	50602	25 %	0 %	25 %	50 %	526230671
137	NC_021871	GCCG	2	8	51536	51543	0 %	0 %	50 %	50 %	526230672
138	NC_021871	GGCA	2	8	52275	52282	25 %	0 %	50 %	25 %	526230674
139	NC_021871	AGGC	2	8	52509	52516	25 %	0 %	50 %	25 %	526230674
140	NC_021871	TTTG	2	8	52561	52568	0 %	75 %	25 %	0 %	526230674
141	NC_021871	GAGC	2	8	52591	52598	25 %	0 %	50 %	25 %	526230674
142	NC_021871	ATAA	2	8	52789	52796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021871	TTGA	2	8	53324	53331	25 %	50 %	25 %	0 %	526230675
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.