MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella bongori N268-08 plasmid RM1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021871	TTAA	2	8	72	79	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021871	TTAT	3	12	1301	1312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021871	GTCA	2	8	2520	2527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021871	TGAT	2	8	2616	2623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021871	GCCA	2	8	2754	2761	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021871	ACTT	2	8	3152	3159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021871	ACGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021871	CTGC	2	8	27842	27849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021871	ACTA	2	8	29477	29484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021871	TAAA	2	8	33718	33725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021871	AATA	2	8	33794	33801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021871	GGAA	2	8	33899	33906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021871	GAAA	2	8	33956	33963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021871	ATGA	2	8	34158	34165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021871	ATAA	2	8	34270	34277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021871	ATTA	2	8	34703	34710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021871	TCAT	2	8	39719	39726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021871	GTTT	2	8	44429	44436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021871	CCGC	2	8	47442	47449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_021871	GTCC	2	8	49990	49997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021871	CCTG	2	8	50079	50086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021871	ATAA	2	8	52789	52796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021871	AAAT	2	8	55072	55079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021871	GCAA	2	8	55304	55311	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021871	TGTC	2	8	56609	56616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021871	TGAC	2	8	57259	57266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021871	ATAA	2	8	63917	63924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021871	ATAA	2	8	64073	64080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021871	TGAA	2	8	68620	68627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021871	GAGT	2	8	70131	70138	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021871	TACT	2	8	71315	71322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021871	TCAC	2	8	71495	71502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021871	GAAA	2	8	73349	73356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021871	TCAC	2	8	73536	73543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021871	CAAT	2	8	74231	74238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021871	ATAA	2	8	74678	74685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021871	ACAA	2	8	74762	74769	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021871	TAAA	2	8	75460	75467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021871	AAAT	2	8	76187	76194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021871	AATT	2	8	76270	76277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021871	ATCT	2	8	76707	76714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021871	ATTA	2	8	77715	77722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021871	TAAT	2	8	78289	78296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021871	TTTA	2	8	78299	78306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021871	TTGT	2	8	78468	78475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021871	GATT	2	8	78590	78597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021871	ATGT	2	8	78753	78760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021871	ATTT	2	8	81046	81053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021871	TAAT	2	8	81132	81139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021871	AAAT	2	8	81156	81163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021871	TAAT	2	8	81199	81206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021871	GTAT	2	8	81209	81216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021871	TAGA	2	8	87261	87268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021871	ATTA	2	8	89711	89718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.