MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella bongori N268-08 plasmid RM1

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021871	GT	3	6	854	859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021871	AG	3	6	1314	1319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021871	GA	3	6	1522	1527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021871	GT	3	6	2154	2159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021871	AG	3	6	2674	2679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021871	GA	3	6	3356	3361	50 %	0 %	50 %	0 %	526230601
7	NC_021871	GC	3	6	3401	3406	0 %	0 %	50 %	50 %	526230601
8	NC_021871	GC	3	6	5684	5689	0 %	0 %	50 %	50 %	526230608
9	NC_021871	GA	3	6	6265	6270	50 %	0 %	50 %	0 %	526230608
10	NC_021871	CG	4	8	7598	7605	0 %	0 %	50 %	50 %	526230608
11	NC_021871	AC	3	6	7732	7737	50 %	0 %	0 %	50 %	526230608
12	NC_021871	CG	3	6	7837	7842	0 %	0 %	50 %	50 %	526230608
13	NC_021871	GC	3	6	8875	8880	0 %	0 %	50 %	50 %	526230608
14	NC_021871	GA	3	6	10047	10052	50 %	0 %	50 %	0 %	526230608
15	NC_021871	AG	3	6	10229	10234	50 %	0 %	50 %	0 %	526230608
16	NC_021871	GC	3	6	11638	11643	0 %	0 %	50 %	50 %	526230609
17	NC_021871	AG	3	6	13312	13317	50 %	0 %	50 %	0 %	526230610
18	NC_021871	AT	3	6	13393	13398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021871	CA	3	6	13445	13450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021871	TG	3	6	13456	13461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021871	AT	3	6	13614	13619	50 %	50 %	0 %	0 %	526230611
22	NC_021871	TC	3	6	13775	13780	0 %	50 %	0 %	50 %	526230611
23	NC_021871	TG	3	6	15629	15634	0 %	50 %	50 %	0 %	526230612
24	NC_021871	GC	3	6	16599	16604	0 %	0 %	50 %	50 %	526230612
25	NC_021871	CG	3	6	17172	17177	0 %	0 %	50 %	50 %	526230613
26	NC_021871	GA	3	6	17326	17331	50 %	0 %	50 %	0 %	526230613
27	NC_021871	GA	3	6	17361	17366	50 %	0 %	50 %	0 %	526230613
28	NC_021871	GC	3	6	18194	18199	0 %	0 %	50 %	50 %	526230613
29	NC_021871	AC	3	6	20075	20080	50 %	0 %	0 %	50 %	526230616
30	NC_021871	TC	3	6	20278	20283	0 %	50 %	0 %	50 %	526230616
31	NC_021871	GC	3	6	20377	20382	0 %	0 %	50 %	50 %	526230616
32	NC_021871	CA	3	6	20471	20476	50 %	0 %	0 %	50 %	526230616
33	NC_021871	CA	3	6	20660	20665	50 %	0 %	0 %	50 %	526230616
34	NC_021871	TG	3	6	21183	21188	0 %	50 %	50 %	0 %	526230616
35	NC_021871	CA	3	6	21218	21223	50 %	0 %	0 %	50 %	526230616
36	NC_021871	AG	3	6	21605	21610	50 %	0 %	50 %	0 %	526230616
37	NC_021871	CT	3	6	21830	21835	0 %	50 %	0 %	50 %	526230617
38	NC_021871	GT	3	6	22166	22171	0 %	50 %	50 %	0 %	526230617
39	NC_021871	GA	3	6	23670	23675	50 %	0 %	50 %	0 %	526230620
40	NC_021871	AG	3	6	26713	26718	50 %	0 %	50 %	0 %	526230622
41	NC_021871	GC	3	6	26863	26868	0 %	0 %	50 %	50 %	526230622
42	NC_021871	CG	3	6	27605	27610	0 %	0 %	50 %	50 %	526230624
43	NC_021871	TG	4	8	28060	28067	0 %	50 %	50 %	0 %	526230625
44	NC_021871	TG	3	6	29528	29533	0 %	50 %	50 %	0 %	526230630
45	NC_021871	GA	3	6	30496	30501	50 %	0 %	50 %	0 %	526230630
46	NC_021871	CA	3	6	33452	33457	50 %	0 %	0 %	50 %	526230636
47	NC_021871	GC	3	6	34406	34411	0 %	0 %	50 %	50 %	526230637
48	NC_021871	CT	3	6	34511	34516	0 %	50 %	0 %	50 %	526230637
49	NC_021871	GT	3	6	35006	35011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021871	AG	3	6	35265	35270	50 %	0 %	50 %	0 %	526230638
51	NC_021871	CG	3	6	35618	35623	0 %	0 %	50 %	50 %	526230639
52	NC_021871	CT	3	6	35637	35642	0 %	50 %	0 %	50 %	526230639
53	NC_021871	AT	3	6	35862	35867	50 %	50 %	0 %	0 %	526230639
54	NC_021871	TG	3	6	35874	35879	0 %	50 %	50 %	0 %	526230639
55	NC_021871	TG	3	6	36131	36136	0 %	50 %	50 %	0 %	526230639
56	NC_021871	GC	3	6	36231	36236	0 %	0 %	50 %	50 %	526230640
57	NC_021871	TA	3	6	36243	36248	50 %	50 %	0 %	0 %	526230640
58	NC_021871	CA	3	6	36330	36335	50 %	0 %	0 %	50 %	526230641
59	NC_021871	GC	3	6	36703	36708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021871	CA	3	6	37244	37249	50 %	0 %	0 %	50 %	526230643
61	NC_021871	CT	4	8	37543	37550	0 %	50 %	0 %	50 %	526230643
62	NC_021871	GT	3	6	37836	37841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021871	CG	3	6	38518	38523	0 %	0 %	50 %	50 %	526230646
64	NC_021871	TG	3	6	38642	38647	0 %	50 %	50 %	0 %	526230646
65	NC_021871	TC	3	6	38685	38690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021871	AT	3	6	39710	39715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021871	GC	3	6	41088	41093	0 %	0 %	50 %	50 %	526230651
68	NC_021871	GT	3	6	41105	41110	0 %	50 %	50 %	0 %	526230651
69	NC_021871	TG	3	6	41804	41809	0 %	50 %	50 %	0 %	526230652
70	NC_021871	TC	3	6	44269	44274	0 %	50 %	0 %	50 %	526230654
71	NC_021871	CG	3	6	45444	45449	0 %	0 %	50 %	50 %	526230658
72	NC_021871	TC	3	6	45751	45756	0 %	50 %	0 %	50 %	526230659
73	NC_021871	CG	3	6	45783	45788	0 %	0 %	50 %	50 %	526230659
74	NC_021871	GA	3	6	47754	47759	50 %	0 %	50 %	0 %	526230665
75	NC_021871	TC	3	6	47901	47906	0 %	50 %	0 %	50 %	526230665
76	NC_021871	GC	3	6	49112	49117	0 %	0 %	50 %	50 %	526230669
77	NC_021871	GT	3	6	49258	49263	0 %	50 %	50 %	0 %	526230669
78	NC_021871	CG	3	6	50041	50046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021871	AG	3	6	50567	50572	50 %	0 %	50 %	0 %	526230671
80	NC_021871	AC	3	6	50703	50708	50 %	0 %	0 %	50 %	526230671
81	NC_021871	TA	3	6	51418	51423	50 %	50 %	0 %	0 %	526230673
82	NC_021871	CG	3	6	51985	51990	0 %	0 %	50 %	50 %	526230674
83	NC_021871	AC	3	6	52071	52076	50 %	0 %	0 %	50 %	526230674
84	NC_021871	TC	3	6	52853	52858	0 %	50 %	0 %	50 %	526230675
85	NC_021871	CG	3	6	52953	52958	0 %	0 %	50 %	50 %	526230675
86	NC_021871	GT	3	6	54107	54112	0 %	50 %	50 %	0 %	526230676
87	NC_021871	CA	3	6	54357	54362	50 %	0 %	0 %	50 %	526230676
88	NC_021871	TA	3	6	54876	54881	50 %	50 %	0 %	0 %	526230676
89	NC_021871	AT	3	6	55671	55676	50 %	50 %	0 %	0 %	526230677
90	NC_021871	TA	3	6	56089	56094	50 %	50 %	0 %	0 %	526230677
91	NC_021871	CT	3	6	58049	58054	0 %	50 %	0 %	50 %	526230682
92	NC_021871	GC	3	6	58425	58430	0 %	0 %	50 %	50 %	526230683
93	NC_021871	TA	3	6	58960	58965	50 %	50 %	0 %	0 %	526230683
94	NC_021871	GC	3	6	59710	59715	0 %	0 %	50 %	50 %	526230684
95	NC_021871	AG	3	6	59985	59990	50 %	0 %	50 %	0 %	526230684
96	NC_021871	TA	3	6	60159	60164	50 %	50 %	0 %	0 %	526230684
97	NC_021871	CG	3	6	61352	61357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021871	GA	3	6	61504	61509	50 %	0 %	50 %	0 %	526230688
99	NC_021871	GC	4	8	62071	62078	0 %	0 %	50 %	50 %	526230689
100	NC_021871	GA	3	6	62234	62239	50 %	0 %	50 %	0 %	526230689
101	NC_021871	GC	3	6	62347	62352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021871	AG	4	8	63017	63024	50 %	0 %	50 %	0 %	526230692
103	NC_021871	AT	3	6	63105	63110	50 %	50 %	0 %	0 %	526230692
104	NC_021871	TA	4	8	64841	64848	50 %	50 %	0 %	0 %	526230693
105	NC_021871	AT	3	6	65732	65737	50 %	50 %	0 %	0 %	526230693
106	NC_021871	GA	3	6	66955	66960	50 %	0 %	50 %	0 %	526230694
107	NC_021871	TC	3	6	68958	68963	0 %	50 %	0 %	50 %	526230701
108	NC_021871	CT	3	6	69012	69017	0 %	50 %	0 %	50 %	526230701
109	NC_021871	CT	3	6	70259	70264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021871	AG	3	6	70934	70939	50 %	0 %	50 %	0 %	526230703
111	NC_021871	TA	3	6	71329	71334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021871	TA	3	6	71540	71545	50 %	50 %	0 %	0 %	526230705
113	NC_021871	TA	3	6	72135	72140	50 %	50 %	0 %	0 %	526230705
114	NC_021871	AT	3	6	72858	72863	50 %	50 %	0 %	0 %	526230706
115	NC_021871	GA	3	6	73152	73157	50 %	0 %	50 %	0 %	526230707
116	NC_021871	GT	3	6	74300	74305	0 %	50 %	50 %	0 %	526230710
117	NC_021871	TA	3	6	74779	74784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021871	TA	3	6	75344	75349	50 %	50 %	0 %	0 %	526230711
119	NC_021871	AT	3	6	75715	75720	50 %	50 %	0 %	0 %	526230712
120	NC_021871	TA	5	10	75843	75852	50 %	50 %	0 %	0 %	526230712
121	NC_021871	AT	5	10	76682	76691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021871	AG	3	6	76720	76725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021871	AT	3	6	76787	76792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021871	TC	3	6	77858	77863	0 %	50 %	0 %	50 %	526230716
125	NC_021871	CA	3	6	78154	78159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021871	TA	3	6	78342	78347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021871	AG	3	6	78476	78481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021871	TA	3	6	78716	78721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021871	TA	3	6	78728	78733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021871	TA	3	6	78740	78745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021871	AC	3	6	79481	79486	50 %	0 %	0 %	50 %	526230717
132	NC_021871	TA	3	6	82220	82225	50 %	50 %	0 %	0 %	526230720
133	NC_021871	TA	3	6	85382	85387	50 %	50 %	0 %	0 %	526230721
134	NC_021871	AT	3	6	85681	85686	50 %	50 %	0 %	0 %	526230721
135	NC_021871	AT	3	6	85958	85963	50 %	50 %	0 %	0 %	526230721
136	NC_021871	TC	3	6	86780	86785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021871	TC	3	6	86791	86796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021871	AG	3	6	86907	86912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021871	AT	3	6	88712	88717	50 %	50 %	0 %	0 %	526230724
140	NC_021871	TC	4	8	89676	89683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.