MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella bongori N268-08

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021870	TTCCTT	2	12	17488	17499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021870	AATGCT	2	12	100478	100489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021870	AAGAGG	2	12	107656	107667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021870	ATCACT	2	12	156658	156669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021870	AACGGC	2	12	159191	159202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021870	TGTTAA	2	12	235072	235083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021870	GCGGCA	2	12	273576	273587	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021870	TTATTT	2	12	302975	302986	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021870	GCCAGC	2	12	319609	319620	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021870	TAAATT	2	12	371163	371174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021870	GTGATA	2	12	410456	410467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021870	AAATTG	2	12	417036	417047	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021870	CAGGCG	2	12	463394	463405	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021870	GGGGGA	2	12	616877	616888	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021870	GAAAAA	2	12	644931	644942	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021870	TCGAGG	2	12	651697	651708	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021870	ATTGAT	2	12	757142	757153	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021870	GGAACG	6	36	805886	805921	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021870	CGGGGC	2	12	805922	805933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021870	GATACT	2	12	811938	811949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021870	TGAAAA	2	12	814622	814633	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021870	AAATAA	2	12	929276	929287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021870	GCGTAT	2	12	938987	938998	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021870	AAAGAT	2	12	961864	961875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021870	CAAGAG	2	12	1009753	1009764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021870	TACAGA	2	12	1017466	1017477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021870	CTTTTT	2	12	1028683	1028694	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021870	GTTTTT	2	12	1036049	1036060	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021870	TATGTT	2	12	1042509	1042520	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021870	TTTTTG	2	12	1049710	1049721	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021870	AAATTT	2	12	1051720	1051731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021870	GATGCC	2	12	1096014	1096025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021870	CAGAAA	2	12	1098423	1098434	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021870	GACGGT	2	12	1098761	1098772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021870	TGATCA	2	12	1102804	1102815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021870	AGCAAA	2	12	1107737	1107748	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021870	AAAAAG	2	12	1174311	1174322	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021870	TGAGTT	2	12	1195964	1195975	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021870	CAGAAT	2	12	1223261	1223272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021870	TTTCCC	2	12	1223364	1223375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021870	AATATA	2	12	1223826	1223837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021870	CTGGAA	2	12	1226690	1226701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021870	AAGCGC	2	12	1253357	1253368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021870	TAAAAC	2	12	1318520	1318531	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021870	GGGCGC	2	12	1340024	1340035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021870	CGCTCG	2	12	1386457	1386468	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021870	ATAGGC	2	12	1412871	1412882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021870	TCACAT	2	12	1422308	1422319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021870	TACCAT	2	12	1688714	1688725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021870	CAAATA	2	12	1705927	1705938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021870	GACACA	2	12	1742367	1742378	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021870	TAACTA	2	12	1794793	1794804	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021870	CAGCTT	2	12	1794890	1794901	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021870	GCCTTT	2	12	1799417	1799428	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021870	TCTGCG	2	12	1815436	1815447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021870	CAACGG	2	12	1855681	1855692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021870	TTGGCT	2	12	1897480	1897491	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021870	TGTTAA	2	12	1902274	1902285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021870	TATAAA	2	12	1939075	1939086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021870	CTTATC	2	12	2019946	2019957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021870	CAGGTA	2	12	2043253	2043264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021870	AATTTA	2	12	2062958	2062969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021870	TTGATA	2	12	2080812	2080823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021870	ATTTTC	2	12	2093786	2093797	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021870	TAAAAA	2	12	2119513	2119524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021870	CAGATA	4	24	2119526	2119549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021870	GAAAGG	2	12	2123656	2123667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021870	AGGCGT	2	12	2130169	2130180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021870	CTATGT	2	12	2135156	2135167	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021870	GATTCG	2	12	2155940	2155951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021870	CATATA	2	12	2166756	2166767	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021870	TTCATA	2	12	2198837	2198848	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021870	AGGCGT	2	12	2261572	2261583	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021870	TTTATC	2	12	2276027	2276038	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021870	ATCTTT	2	12	2368842	2368853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021870	TCATTA	2	12	2430032	2430043	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021870	TTGCCT	2	12	2464014	2464025	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021870	TTTCAT	2	12	2504785	2504796	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021870	GTAAGT	2	12	2510780	2510791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021870	TTTTCA	2	12	2527418	2527429	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021870	CATTTT	2	12	2534843	2534854	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021870	CAAGTG	2	12	2540515	2540526	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021870	TGCATT	2	12	2623865	2623876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021870	GCTACA	2	12	2630912	2630923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021870	CTAAAA	2	12	2656666	2656677	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021870	TTTGTT	2	12	2699090	2699101	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021870	TGCCGC	2	12	2717491	2717502	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021870	TGCAAA	2	12	2769665	2769676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021870	TAAAAA	2	12	2819101	2819112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021870	GCAAAA	2	12	2819155	2819166	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021870	GGGATG	2	12	2844481	2844492	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021870	TTATGG	2	12	2955114	2955125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021870	TCACAT	2	12	2960604	2960615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021870	AATGAA	2	12	2991813	2991824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021870	GCTGGC	2	12	3030272	3030283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021870	AAGCCA	2	12	3104348	3104359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021870	TTCAGT	2	12	3106005	3106016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021870	AGTTGT	2	12	3227846	3227857	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021870	AAAAAG	2	12	3232991	3233002	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021870	CGAGCA	2	12	3265621	3265632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021870	AGGCGC	2	12	3296936	3296947	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021870	TGCTTC	2	12	3360015	3360026	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021870	TGTTAT	2	12	3404618	3404629	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021870	GCATGG	2	12	3439329	3439340	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021870	TGCCGC	2	12	3450474	3450485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021870	TTATTT	2	12	3629113	3629124	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021870	CTTAAT	2	12	3660595	3660606	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021870	CCTCCA	2	12	3715542	3715553	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021870	TTTGCT	2	12	3807137	3807148	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021870	ACATGA	2	12	3821502	3821513	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021870	GCAAAC	2	12	3855405	3855416	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021870	GCGGCA	2	12	3946471	3946482	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021870	TCAGAT	2	12	3948265	3948276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021870	GCGGCA	2	12	4039161	4039172	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021870	TTTTAA	2	12	4091399	4091410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021870	GCGGCA	2	12	4170599	4170610	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021870	GCGGCA	2	12	4211377	4211388	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021870	TTTTGA	2	12	4215317	4215328	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021870	ATAAAC	2	12	4239614	4239625	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021870	TTTTAT	2	12	4274033	4274044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021870	TGTTTC	2	12	4298579	4298590	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021870	TTTTCA	2	12	4304185	4304196	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021870	AGCATC	2	12	4329276	4329287	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021870	GTTCTG	3	18	4371154	4371171	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_021870	TTATAA	2	12	4374938	4374949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021870	CGCGTC	2	12	4387273	4387284	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021870	TTGATT	2	12	4407394	4407405	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021870	TTTTTA	2	12	4417563	4417574	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021870	TGGCGC	2	12	4456639	4456650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021870	GCATAT	2	12	4489476	4489487	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_021870	AATGAT	2	12	4565030	4565041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021870	TAAAAA	2	12	4600759	4600770	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021870	GGATGT	2	12	4613587	4613598	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021870	GGTGTG	2	12	4615448	4615459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021870	TTTTCC	2	12	4621021	4621032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021870	TATAGC	2	12	4633758	4633769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_021870	AATGAT	2	12	4641363	4641374	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021870	AGAATG	2	12	4678976	4678987	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.