MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella bongori N268-08

Total Repeats: 2723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021870	TCCGG	2	10	1322	1331	0 %	20 %	40 %	40 %	526225955
2	NC_021870	AGGTA	2	10	2578	2587	40 %	20 %	40 %	0 %	526225955
3	NC_021870	ATTGC	2	10	3421	3430	20 %	40 %	20 %	20 %	526225956
4	NC_021870	CGGCG	2	10	4169	4178	0 %	0 %	60 %	40 %	526225957
5	NC_021870	TGAGA	2	10	5892	5901	40 %	20 %	40 %	0 %	526225958
6	NC_021870	GGCCG	2	10	7029	7038	0 %	0 %	60 %	40 %	526225959
7	NC_021870	CCGCG	2	10	7206	7215	0 %	0 %	40 %	60 %	526225959
8	NC_021870	ATGAG	2	10	9320	9329	40 %	20 %	40 %	0 %	526225962
9	NC_021870	CGTGA	2	10	9373	9382	20 %	20 %	40 %	20 %	526225962
10	NC_021870	GTTGC	2	10	13016	13025	0 %	40 %	40 %	20 %	526225967
11	NC_021870	GCGTG	2	10	14450	14459	0 %	20 %	60 %	20 %	526225968
12	NC_021870	AGGCG	2	10	14756	14765	20 %	0 %	60 %	20 %	526225968
13	NC_021870	AGAGC	2	10	19869	19878	40 %	0 %	40 %	20 %	526225973
14	NC_021870	TCTTA	2	10	24326	24335	20 %	60 %	0 %	20 %	526225975
15	NC_021870	CTGAA	2	10	24459	24468	40 %	20 %	20 %	20 %	526225975
16	NC_021870	TATTT	2	10	25934	25943	20 %	80 %	0 %	0 %	526225977
17	NC_021870	CGCAG	2	10	26888	26897	20 %	0 %	40 %	40 %	526225978
18	NC_021870	AGGCC	2	10	27822	27831	20 %	0 %	40 %	40 %	526225978
19	NC_021870	CAATG	2	10	28579	28588	40 %	20 %	20 %	20 %	526225978
20	NC_021870	CAGAA	2	10	29055	29064	60 %	0 %	20 %	20 %	526225979
21	NC_021870	TTACG	2	10	31519	31528	20 %	40 %	20 %	20 %	526225982
22	NC_021870	TGAAA	2	10	36235	36244	60 %	20 %	20 %	0 %	526225989
23	NC_021870	CTGGA	2	10	37337	37346	20 %	20 %	40 %	20 %	526225989
24	NC_021870	ACGGT	2	10	40974	40983	20 %	20 %	40 %	20 %	526225992
25	NC_021870	TTTAT	2	10	41477	41486	20 %	80 %	0 %	0 %	526225992
26	NC_021870	GGGCT	2	10	42676	42685	0 %	20 %	60 %	20 %	526225993
27	NC_021870	TGTGC	2	10	45503	45512	0 %	40 %	40 %	20 %	526225997
28	NC_021870	TTCGC	2	10	46092	46101	0 %	40 %	20 %	40 %	526225997
29	NC_021870	TCACG	2	10	47173	47182	20 %	20 %	20 %	40 %	526225998
30	NC_021870	CGGCG	2	10	49482	49491	0 %	0 %	60 %	40 %	526225999
31	NC_021870	TTCAC	2	10	49738	49747	20 %	40 %	0 %	40 %	526226000
32	NC_021870	GTGAT	2	10	54803	54812	20 %	40 %	40 %	0 %	526226006
33	NC_021870	GCGAA	2	10	58183	58192	40 %	0 %	40 %	20 %	526226008
34	NC_021870	TTGCC	2	10	60709	60718	0 %	40 %	20 %	40 %	526226010
35	NC_021870	CGTCC	2	10	60819	60828	0 %	20 %	20 %	60 %	526226010
36	NC_021870	TCAGC	2	10	63927	63936	20 %	20 %	20 %	40 %	526226013
37	NC_021870	GGCCA	2	10	64075	64084	20 %	0 %	40 %	40 %	526226013
38	NC_021870	GTACG	2	10	66646	66655	20 %	20 %	40 %	20 %	526226015
39	NC_021870	CAGAA	2	10	67359	67368	60 %	0 %	20 %	20 %	526226015
40	NC_021870	TGATG	2	10	69148	69157	20 %	40 %	40 %	0 %	526226018
41	NC_021870	CCGCA	2	10	69478	69487	20 %	0 %	20 %	60 %	526226018
42	NC_021870	CGGTT	2	10	69983	69992	0 %	40 %	40 %	20 %	526226019
43	NC_021870	TGGCG	2	10	71764	71773	0 %	20 %	60 %	20 %	526226021
44	NC_021870	TTCCC	2	10	75522	75531	0 %	40 %	0 %	60 %	526226025
45	NC_021870	GTGGC	2	10	76090	76099	0 %	20 %	60 %	20 %	526226025
46	NC_021870	TGCAC	2	10	78487	78496	20 %	20 %	20 %	40 %	526226028
47	NC_021870	ACGTT	2	10	79173	79182	20 %	40 %	20 %	20 %	526226029
48	NC_021870	AACGT	2	10	82417	82426	40 %	20 %	20 %	20 %	526226032
49	NC_021870	ATCTG	2	10	85858	85867	20 %	40 %	20 %	20 %	526226036
50	NC_021870	CGGTA	2	10	86446	86455	20 %	20 %	40 %	20 %	526226036
51	NC_021870	GCTTC	2	10	86654	86663	0 %	40 %	20 %	40 %	526226036
52	NC_021870	TGATC	2	10	88641	88650	20 %	40 %	20 %	20 %	526226038
53	NC_021870	GGGCG	2	10	88791	88800	0 %	0 %	80 %	20 %	526226038
54	NC_021870	AAAGT	2	10	92642	92651	60 %	20 %	20 %	0 %	526226040
55	NC_021870	CGTGT	2	10	94802	94811	0 %	40 %	40 %	20 %	526226042
56	NC_021870	CAGAT	2	10	96064	96073	40 %	20 %	20 %	20 %	526226044
57	NC_021870	GCGTG	2	10	96764	96773	0 %	20 %	60 %	20 %	526226045
58	NC_021870	CAGCG	2	10	97194	97203	20 %	0 %	40 %	40 %	526226046
59	NC_021870	TTGCC	2	10	102566	102575	0 %	40 %	20 %	40 %	526226050
60	NC_021870	GCGCA	2	10	102709	102718	20 %	0 %	40 %	40 %	526226050
61	NC_021870	CACCG	2	10	103271	103280	20 %	0 %	20 %	60 %	526226051
62	NC_021870	CCCAG	2	10	105260	105269	20 %	0 %	20 %	60 %	526226052
63	NC_021870	TAGTG	2	10	105892	105901	20 %	40 %	40 %	0 %	526226053
64	NC_021870	TTGGG	2	10	108060	108069	0 %	40 %	60 %	0 %	526226056
65	NC_021870	GGTAA	2	10	110843	110852	40 %	20 %	40 %	0 %	526226058
66	NC_021870	TGGTC	2	10	113866	113875	0 %	40 %	40 %	20 %	526226060
67	NC_021870	ATTCC	2	10	116238	116247	20 %	40 %	0 %	40 %	526226064
68	NC_021870	CCCGG	2	10	116423	116432	0 %	0 %	40 %	60 %	526226064
69	NC_021870	AAAGC	2	10	118539	118548	60 %	0 %	20 %	20 %	526226066
70	NC_021870	GACCC	2	10	120924	120933	20 %	0 %	20 %	60 %	526226068
71	NC_021870	AGTTC	2	10	121443	121452	20 %	40 %	20 %	20 %	526226068
72	NC_021870	GTTTG	2	10	128099	128108	0 %	60 %	40 %	0 %	526226074
73	NC_021870	CCTGG	2	10	128902	128911	0 %	20 %	40 %	40 %	526226075
74	NC_021870	CGTAT	2	10	129570	129579	20 %	40 %	20 %	20 %	526226075
75	NC_021870	CGGGG	2	10	130782	130791	0 %	0 %	80 %	20 %	526226076
76	NC_021870	ATCAG	2	10	131406	131415	40 %	20 %	20 %	20 %	526226077
77	NC_021870	TGCGT	2	10	135164	135173	0 %	40 %	40 %	20 %	526226080
78	NC_021870	CCTTG	2	10	138446	138455	0 %	40 %	20 %	40 %	526226083
79	NC_021870	CCGGC	2	10	139507	139516	0 %	0 %	40 %	60 %	526226084
80	NC_021870	ACTCT	2	10	139721	139730	20 %	40 %	0 %	40 %	526226084
81	NC_021870	CGATG	2	10	142640	142649	20 %	20 %	40 %	20 %	526226086
82	NC_021870	TAGCG	2	10	147617	147626	20 %	20 %	40 %	20 %	526226092
83	NC_021870	AGTGT	2	10	147950	147959	20 %	40 %	40 %	0 %	526226092
84	NC_021870	GCCCG	2	10	148675	148684	0 %	0 %	40 %	60 %	526226093
85	NC_021870	GGCGC	2	10	151164	151173	0 %	0 %	60 %	40 %	526226096
86	NC_021870	ATGAC	2	10	151690	151699	40 %	20 %	20 %	20 %	526226096
87	NC_021870	CTGGA	2	10	152280	152289	20 %	20 %	40 %	20 %	526226097
88	NC_021870	TTCGC	2	10	152358	152367	0 %	40 %	20 %	40 %	526226097
89	NC_021870	CAGAA	2	10	154398	154407	60 %	0 %	20 %	20 %	526226099
90	NC_021870	TTATT	2	10	156861	156870	20 %	80 %	0 %	0 %	526226103
91	NC_021870	GCCGC	2	10	157672	157681	0 %	0 %	40 %	60 %	526226102
92	NC_021870	AAAGT	2	10	159004	159013	60 %	20 %	20 %	0 %	526226105
93	NC_021870	GACTG	2	10	162227	162236	20 %	20 %	40 %	20 %	526226109
94	NC_021870	AGCAA	2	10	162639	162648	60 %	0 %	20 %	20 %	526226109
95	NC_021870	TGGTC	2	10	165351	165360	0 %	40 %	40 %	20 %	526226110
96	NC_021870	TGGCA	2	10	167738	167747	20 %	20 %	40 %	20 %	526226112
97	NC_021870	GGCCA	2	10	168160	168169	20 %	0 %	40 %	40 %	526226113
98	NC_021870	GCGCC	2	10	168173	168182	0 %	0 %	40 %	60 %	526226113
99	NC_021870	CCCAC	2	10	179499	179508	20 %	0 %	0 %	80 %	526226123
100	NC_021870	TGGTG	2	10	180006	180015	0 %	40 %	60 %	0 %	526226123
101	NC_021870	TTTCA	2	10	186515	186524	20 %	60 %	0 %	20 %	526226130
102	NC_021870	GCCGC	2	10	190216	190225	0 %	0 %	40 %	60 %	526226135
103	NC_021870	GCACT	2	10	190367	190376	20 %	20 %	20 %	40 %	526226135
104	NC_021870	GAACC	2	10	192450	192459	40 %	0 %	20 %	40 %	526226137
105	NC_021870	GCCCA	2	10	194016	194025	20 %	0 %	20 %	60 %	526226139
106	NC_021870	CGTTT	2	10	195578	195587	0 %	60 %	20 %	20 %	526226139
107	NC_021870	CCGCG	2	10	201101	201110	0 %	0 %	40 %	60 %	526226145
108	NC_021870	GCCAG	2	10	201404	201413	20 %	0 %	40 %	40 %	526226145
109	NC_021870	CGGGG	2	10	203788	203797	0 %	0 %	80 %	20 %	526226149
110	NC_021870	GCGCA	2	10	204458	204467	20 %	0 %	40 %	40 %	526226149
111	NC_021870	ACGCA	2	10	204626	204635	40 %	0 %	20 %	40 %	526226149
112	NC_021870	GGCGA	2	10	205907	205916	20 %	0 %	60 %	20 %	526226149
113	NC_021870	GCCGT	2	10	207001	207010	0 %	20 %	40 %	40 %	526226150
114	NC_021870	GTACA	2	10	207034	207043	40 %	20 %	20 %	20 %	526226150
115	NC_021870	AACCT	2	10	212431	212440	40 %	20 %	0 %	40 %	526226154
116	NC_021870	GGCGT	2	10	213461	213470	0 %	20 %	60 %	20 %	526226155
117	NC_021870	CGGCG	2	10	217090	217099	0 %	0 %	60 %	40 %	526226157
118	NC_021870	GGGCG	2	10	217432	217441	0 %	0 %	80 %	20 %	526226157
119	NC_021870	TGCTT	2	10	217584	217593	0 %	60 %	20 %	20 %	526226157
120	NC_021870	CCGGG	2	10	224737	224746	0 %	0 %	60 %	40 %	526226164
121	NC_021870	ACTGG	2	10	225512	225521	20 %	20 %	40 %	20 %	526226165
122	NC_021870	AGTCC	2	10	226929	226938	20 %	20 %	20 %	40 %	526226165
123	NC_021870	TCGGA	2	10	229925	229934	20 %	20 %	40 %	20 %	526226167
124	NC_021870	CGGCG	2	10	231171	231180	0 %	0 %	60 %	40 %	526226168
125	NC_021870	CTGAA	2	10	235509	235518	40 %	20 %	20 %	20 %	526226171
126	NC_021870	AAGCG	2	10	235573	235582	40 %	0 %	40 %	20 %	526226171
127	NC_021870	TGGTG	2	10	237476	237485	0 %	40 %	60 %	0 %	526226173
128	NC_021870	TGCGC	2	10	237995	238004	0 %	20 %	40 %	40 %	526226173
129	NC_021870	AGCAG	2	10	238555	238564	40 %	0 %	40 %	20 %	526226174
130	NC_021870	ATGGC	2	10	239744	239753	20 %	20 %	40 %	20 %	526226176
131	NC_021870	ACTTT	2	10	241039	241048	20 %	60 %	0 %	20 %	526226178
132	NC_021870	CGGTA	2	10	242203	242212	20 %	20 %	40 %	20 %	526226180
133	NC_021870	TACGG	2	10	244952	244961	20 %	20 %	40 %	20 %	526226182
134	NC_021870	ATGTC	2	10	246239	246248	20 %	40 %	20 %	20 %	526226183
135	NC_021870	GGGTC	2	10	247065	247074	0 %	20 %	60 %	20 %	526226184
136	NC_021870	GTGAA	2	10	248267	248276	40 %	20 %	40 %	0 %	526226186
137	NC_021870	GAAGC	2	10	248752	248761	40 %	0 %	40 %	20 %	526226186
138	NC_021870	ATGCC	2	10	249358	249367	20 %	20 %	20 %	40 %	526226187
139	NC_021870	ACCGC	2	10	253290	253299	20 %	0 %	20 %	60 %	526226189
140	NC_021870	AAAGA	2	10	254482	254491	80 %	0 %	20 %	0 %	526226190
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142	NC_021870	TACGC	2	10	259866	259875	20 %	20 %	20 %	40 %	526226194
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144	NC_021870	ATTTT	2	10	263321	263330	20 %	80 %	0 %	0 %	526226199
145	NC_021870	GACCG	2	10	264222	264231	20 %	0 %	40 %	40 %	526226200
146	NC_021870	ACCAG	2	10	265976	265985	40 %	0 %	20 %	40 %	526226201
147	NC_021870	ACCGC	2	10	266594	266603	20 %	0 %	20 %	60 %	526226203
148	NC_021870	TGGCG	2	10	267699	267708	0 %	20 %	60 %	20 %	526226204
149	NC_021870	ATGCG	2	10	277151	277160	20 %	20 %	40 %	20 %	526226209
150	NC_021870	ATGTC	2	10	278452	278461	20 %	40 %	20 %	20 %	526226210
151	NC_021870	CTTGT	2	10	280785	280794	0 %	60 %	20 %	20 %	526226212
152	NC_021870	ACTGG	2	10	281544	281553	20 %	20 %	40 %	20 %	526226213
153	NC_021870	TTTCA	2	10	284422	284431	20 %	60 %	0 %	20 %	526226216
154	NC_021870	ACAAT	2	10	284577	284586	60 %	20 %	0 %	20 %	526226216
155	NC_021870	AAAAT	2	10	287337	287346	80 %	20 %	0 %	0 %	526226218
156	NC_021870	ACCTT	2	10	288592	288601	20 %	40 %	0 %	40 %	526226220
157	NC_021870	CTGCG	2	10	289864	289873	0 %	20 %	40 %	40 %	526226221
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159	NC_021870	TGCGA	2	10	291856	291865	20 %	20 %	40 %	20 %	526226222
160	NC_021870	TGGCG	2	10	297775	297784	0 %	20 %	60 %	20 %	526226229
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163	NC_021870	GTGAT	2	10	300472	300481	20 %	40 %	40 %	0 %	526226231
164	NC_021870	GAACG	2	10	303767	303776	40 %	0 %	40 %	20 %	526226234
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166	NC_021870	GGGAA	2	10	304707	304716	40 %	0 %	60 %	0 %	526226237
167	NC_021870	AGAAA	2	10	305386	305395	80 %	0 %	20 %	0 %	526226238
168	NC_021870	AAACA	2	10	305733	305742	80 %	0 %	0 %	20 %	526226238
169	NC_021870	TGCAT	2	10	306226	306235	20 %	40 %	20 %	20 %	526226238
170	NC_021870	ATTAT	2	10	307284	307293	40 %	60 %	0 %	0 %	526226239
171	NC_021870	AAATT	2	10	308023	308032	60 %	40 %	0 %	0 %	526226240
172	NC_021870	TAAAT	2	10	308378	308387	60 %	40 %	0 %	0 %	526226240
173	NC_021870	TATTT	2	10	308502	308511	20 %	80 %	0 %	0 %	526226240
174	NC_021870	CTTAT	2	10	309424	309433	20 %	60 %	0 %	20 %	526226241
175	NC_021870	TTTGT	2	10	311222	311231	0 %	80 %	20 %	0 %	526226244
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181	NC_021870	TAATA	2	10	321624	321633	60 %	40 %	0 %	0 %	526226252
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192	NC_021870	TGGGG	2	10	340499	340508	0 %	20 %	80 %	0 %	526226264
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198	NC_021870	TGACC	2	10	352660	352669	20 %	20 %	20 %	40 %	526226275
199	NC_021870	ACGCC	2	10	353537	353546	20 %	0 %	20 %	60 %	526226275
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211	NC_021870	GCTGC	2	10	375605	375614	0 %	20 %	40 %	40 %	526226298
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240	NC_021870	ATCTT	2	10	421176	421185	20 %	60 %	0 %	20 %	526226347
241	NC_021870	AGGCG	2	10	422598	422607	20 %	0 %	60 %	20 %	526226349
242	NC_021870	GAAGC	2	10	424001	424010	40 %	0 %	40 %	20 %	526226349
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244	NC_021870	GTTTT	2	10	425388	425397	0 %	80 %	20 %	0 %	526226352
245	NC_021870	AGTTG	2	10	426003	426012	20 %	40 %	40 %	0 %	526226353
246	NC_021870	GCACC	2	10	428122	428131	20 %	0 %	20 %	60 %	526226355
247	NC_021870	AGCGC	2	10	428481	428490	20 %	0 %	40 %	40 %	526226355
248	NC_021870	TTGAA	2	10	434061	434070	40 %	40 %	20 %	0 %	526226358
249	NC_021870	ATTAT	2	10	435541	435550	40 %	60 %	0 %	0 %	526226361
250	NC_021870	GCGAT	2	10	438738	438747	20 %	20 %	40 %	20 %	526226363
251	NC_021870	CGCTG	2	10	438817	438826	0 %	20 %	40 %	40 %	526226363
252	NC_021870	TAAGA	2	10	439366	439375	60 %	20 %	20 %	0 %	526226364
253	NC_021870	GTTCA	2	10	439605	439614	20 %	40 %	20 %	20 %	526226364
254	NC_021870	CTATT	2	10	444315	444324	20 %	60 %	0 %	20 %	526226368
255	NC_021870	CGCGG	2	10	444544	444553	0 %	0 %	60 %	40 %	526226369
256	NC_021870	CTGGT	2	10	445641	445650	0 %	40 %	40 %	20 %	526226370
257	NC_021870	GTCTG	2	10	445931	445940	0 %	40 %	40 %	20 %	526226370
258	NC_021870	TCAGA	2	10	446430	446439	40 %	20 %	20 %	20 %	526226371
259	NC_021870	CGGCG	2	10	446518	446527	0 %	0 %	60 %	40 %	526226371
260	NC_021870	TACCG	2	10	450269	450278	20 %	20 %	20 %	40 %	526226375
261	NC_021870	CAGGG	2	10	453660	453669	20 %	0 %	60 %	20 %	526226381
262	NC_021870	CGATA	2	10	454860	454869	40 %	20 %	20 %	20 %	526226381
263	NC_021870	TTAAG	2	10	456305	456314	40 %	40 %	20 %	0 %	526226382
264	NC_021870	GCCTG	2	10	459912	459921	0 %	20 %	40 %	40 %	526226384
265	NC_021870	TTCAA	2	10	462882	462891	40 %	40 %	0 %	20 %	526226388
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