MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_03

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021869	GCG	2	6	45	50	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021869	ACA	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021869	TGT	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222928
4	NC_021869	ACG	2	6	569	574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222928
5	NC_021869	TGA	2	6	594	599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222928
6	NC_021869	AAC	2	6	713	718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222928
7	NC_021869	TGA	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222928
8	NC_021869	AAC	2	6	907	912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021869	AGC	2	6	918	923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021869	TGC	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
11	NC_021869	GCC	2	6	1059	1064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
12	NC_021869	GCT	2	6	1119	1124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
13	NC_021869	AGT	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222929
14	NC_021869	CTG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
15	NC_021869	GCT	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
16	NC_021869	ATC	2	6	1331	1336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222929
17	NC_021869	GCG	2	6	1387	1392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222929
18	NC_021869	CGC	2	6	1422	1427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
19	NC_021869	GAT	2	6	1471	1476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222929
20	NC_021869	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
21	NC_021869	CCA	2	6	1507	1512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222929
22	NC_021869	CAG	2	6	1537	1542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222929
23	NC_021869	GGC	2	6	1648	1653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222929
24	NC_021869	CTG	3	9	1741	1749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
25	NC_021869	CAC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222929
26	NC_021869	CCG	2	6	2024	2029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
27	NC_021869	CAG	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222929
28	NC_021869	GCC	2	6	2182	2187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
29	NC_021869	CTT	2	6	2371	2376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222929
30	NC_021869	CAG	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222929
31	NC_021869	CCG	2	6	2454	2459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
32	NC_021869	ATC	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222929
33	NC_021869	GCG	2	6	2554	2559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222931
34	NC_021869	GCC	2	6	2586	2591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222931
35	NC_021869	AGC	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222931
36	NC_021869	CAG	2	6	2757	2762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222931
37	NC_021869	CGG	2	6	2764	2769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222931
38	NC_021869	CGG	2	6	2982	2987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021869	CCT	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021869	GCG	2	6	3120	3125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021869	GCG	2	6	3190	3195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021869	GTG	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021869	TGG	2	6	3305	3310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021869	GGC	2	6	3587	3592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021869	ACG	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021869	TGA	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021869	CAG	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021869	ATT	2	6	3930	3935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021869	TGC	2	6	4064	4069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021869	CGA	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021869	ACG	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222932
52	NC_021869	AAT	2	6	4314	4319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222932
53	NC_021869	CAT	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222932
54	NC_021869	AAG	2	6	4447	4452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222932
55	NC_021869	CAG	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222932
56	NC_021869	ATT	2	6	4685	4690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021869	AGC	2	6	4757	4762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.