MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 2278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021848	ATTCC	2	10	3025	3034	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021848	TCCGC	2	10	3205	3214	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_021848	AGAGT	2	10	5188	5197	40 %	20 %	40 %	0 %	525957491
4	NC_021848	TGCGA	2	10	10441	10450	20 %	20 %	40 %	20 %	525957493
5	NC_021848	AGGAA	2	10	11196	11205	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021848	TGCAT	2	10	12526	12535	20 %	40 %	20 %	20 %	525957494
7	NC_021848	AATGC	2	10	13929	13938	40 %	20 %	20 %	20 %	525957495
8	NC_021848	GCTTA	2	10	14138	14147	20 %	40 %	20 %	20 %	525957495
9	NC_021848	TGAAA	2	10	14383	14392	60 %	20 %	20 %	0 %	525957495
10	NC_021848	CAAAT	2	10	16668	16677	60 %	20 %	0 %	20 %	525957496
11	NC_021848	TTTCA	2	10	18353	18362	20 %	60 %	0 %	20 %	525957497
12	NC_021848	GCGGT	2	10	19930	19939	0 %	20 %	60 %	20 %	525957499
13	NC_021848	GTGTT	2	10	20020	20029	0 %	60 %	40 %	0 %	525957499
14	NC_021848	TAAGC	2	10	20642	20651	40 %	20 %	20 %	20 %	525957500
15	NC_021848	TGAAG	2	10	25149	25158	40 %	20 %	40 %	0 %	525957504
16	NC_021848	TCTGC	2	10	26017	26026	0 %	40 %	20 %	40 %	525957504
17	NC_021848	GCAAC	2	10	27811	27820	40 %	0 %	20 %	40 %	525959908
18	NC_021848	TGAGT	2	10	30742	30751	20 %	40 %	40 %	0 %	525957507
19	NC_021848	CTTTG	2	10	32929	32938	0 %	60 %	20 %	20 %	525957509
20	NC_021848	TCGAA	2	10	33224	33233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021848	TTAGA	2	10	34242	34251	40 %	40 %	20 %	0 %	525957511
22	NC_021848	CCAAA	2	10	36532	36541	60 %	0 %	0 %	40 %	525959910
23	NC_021848	TTTCT	2	10	38351	38360	0 %	80 %	0 %	20 %	525959910
24	NC_021848	AAGGC	2	10	38444	38453	40 %	0 %	40 %	20 %	525959910
25	NC_021848	TGAAG	2	10	38961	38970	40 %	20 %	40 %	0 %	525959910
26	NC_021848	GGAAC	2	10	43833	43842	40 %	0 %	40 %	20 %	525957518
27	NC_021848	GTAAA	2	10	46245	46254	60 %	20 %	20 %	0 %	525957519
28	NC_021848	TGGAA	2	10	47769	47778	40 %	20 %	40 %	0 %	525957519
29	NC_021848	GAAGT	2	10	48281	48290	40 %	20 %	40 %	0 %	525957519
30	NC_021848	ATCAA	2	10	49632	49641	60 %	20 %	0 %	20 %	525957521
31	NC_021848	TCGGT	2	10	51811	51820	0 %	40 %	40 %	20 %	525957522
32	NC_021848	CAGAG	2	10	56384	56393	40 %	0 %	40 %	20 %	525957524
33	NC_021848	TATTT	2	10	57277	57286	20 %	80 %	0 %	0 %	525957525
34	NC_021848	CGCAA	2	10	63952	63961	40 %	0 %	20 %	40 %	525957532
35	NC_021848	TTCAA	2	10	65018	65027	40 %	40 %	0 %	20 %	525957535
36	NC_021848	AGCAT	2	10	68394	68403	40 %	20 %	20 %	20 %	525957538
37	NC_021848	TTGAC	2	10	70467	70476	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_021848	GTTGA	2	10	71061	71070	20 %	40 %	40 %	0 %	525959912
39	NC_021848	CGTTT	2	10	71269	71278	0 %	60 %	20 %	20 %	525959912
40	NC_021848	TATTT	2	10	73905	73914	20 %	80 %	0 %	0 %	525957545
41	NC_021848	GTGCG	2	10	76809	76818	0 %	20 %	60 %	20 %	525957548
42	NC_021848	TTGAT	2	10	78503	78512	20 %	60 %	20 %	0 %	525957550
43	NC_021848	ATTGA	2	10	79298	79307	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021848	TTCTA	2	10	80895	80904	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021848	ACGCT	2	10	83793	83802	20 %	20 %	20 %	40 %	525957553
46	NC_021848	TCATC	2	10	88399	88408	20 %	40 %	0 %	40 %	525957556
47	NC_021848	CTCAG	2	10	94228	94237	20 %	20 %	20 %	40 %	525957561
48	NC_021848	TTCCT	2	10	94950	94959	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_021848	AACTT	2	10	95256	95265	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021848	GTACT	2	10	95273	95282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021848	CGACA	2	10	97040	97049	40 %	0 %	20 %	40 %	525959916
52	NC_021848	GCTGT	2	10	98004	98013	0 %	40 %	40 %	20 %	525959917
53	NC_021848	TGATT	2	10	98268	98277	20 %	60 %	20 %	0 %	525959917
54	NC_021848	GTACT	3	15	98606	98620	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021848	TACCG	2	10	99389	99398	20 %	20 %	20 %	40 %	525957562
56	NC_021848	GAAAC	2	10	102374	102383	60 %	0 %	20 %	20 %	525957564
57	NC_021848	GTCTC	2	10	103253	103262	0 %	40 %	20 %	40 %	525957566
58	NC_021848	ATGTA	2	10	103305	103314	40 %	40 %	20 %	0 %	525957566
59	NC_021848	TGCAG	2	10	103852	103861	20 %	20 %	40 %	20 %	525957566
60	NC_021848	CAGAA	2	10	107046	107055	60 %	0 %	20 %	20 %	525957569
61	NC_021848	AGATA	2	10	107341	107350	60 %	20 %	20 %	0 %	525957569
62	NC_021848	GTAGT	2	10	108358	108367	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021848	TTAAA	2	10	113263	113272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021848	TCCGC	2	10	113513	113522	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_021848	CAACC	2	10	117522	117531	40 %	0 %	0 %	60 %	525957571
66	NC_021848	ACTTC	2	10	120109	120118	20 %	40 %	0 %	40 %	525959919
67	NC_021848	GTTTT	2	10	121709	121718	0 %	80 %	20 %	0 %	525957573
68	NC_021848	GCTAC	2	10	122394	122403	20 %	20 %	20 %	40 %	525957574
69	NC_021848	TCAGG	2	10	124117	124126	20 %	20 %	40 %	20 %	525957576
70	NC_021848	CCAGA	2	10	126409	126418	40 %	0 %	20 %	40 %	525957578
71	NC_021848	GTGAG	2	10	127435	127444	20 %	20 %	60 %	0 %	525957580
72	NC_021848	CAGAA	2	10	127812	127821	60 %	0 %	20 %	20 %	525957581
73	NC_021848	TGAGA	2	10	128123	128132	40 %	20 %	40 %	0 %	525957581
74	NC_021848	ATTCG	2	10	129616	129625	20 %	40 %	20 %	20 %	525957583
75	NC_021848	GGTTT	2	10	130251	130260	0 %	60 %	40 %	0 %	525957584
76	NC_021848	TCACC	2	10	135410	135419	20 %	20 %	0 %	60 %	525957590
77	NC_021848	ATGGA	2	10	136917	136926	40 %	20 %	40 %	0 %	525957592
78	NC_021848	AACGA	2	10	138073	138082	60 %	0 %	20 %	20 %	525957593
79	NC_021848	GGTTG	2	10	138085	138094	0 %	40 %	60 %	0 %	525957593
80	NC_021848	CACTT	2	10	139523	139532	20 %	40 %	0 %	40 %	525957594
81	NC_021848	CTAAC	2	10	140235	140244	40 %	20 %	0 %	40 %	525957594
82	NC_021848	ATCAA	2	10	142893	142902	60 %	20 %	0 %	20 %	525957596
83	NC_021848	AAGAT	2	10	143622	143631	60 %	20 %	20 %	0 %	525957596
84	NC_021848	AAAGC	2	10	146630	146639	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021848	TTCTC	2	10	147193	147202	0 %	60 %	0 %	40 %	525957599
86	NC_021848	GAAAA	2	10	148495	148504	80 %	0 %	20 %	0 %	525957600
87	NC_021848	ATTCC	2	10	149128	149137	20 %	40 %	0 %	40 %	525957600
88	NC_021848	GGAAT	2	10	149639	149648	40 %	20 %	40 %	0 %	525957601
89	NC_021848	GAAGT	2	10	151480	151489	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021848	GACTC	2	10	152257	152266	20 %	20 %	20 %	40 %	525957604
91	NC_021848	AAAAG	2	10	152328	152337	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021848	CTGCG	2	10	152498	152507	0 %	20 %	40 %	40 %	525957605
93	NC_021848	TGCGT	2	10	153030	153039	0 %	40 %	40 %	20 %	525957605
94	NC_021848	TCTTT	2	10	153577	153586	0 %	80 %	0 %	20 %	525957605
95	NC_021848	GCGTT	2	10	155136	155145	0 %	40 %	40 %	20 %	525957607
96	NC_021848	GGTTG	2	10	157832	157841	0 %	40 %	60 %	0 %	525957610
97	NC_021848	GGTGG	2	10	159956	159965	0 %	20 %	80 %	0 %	525959923
98	NC_021848	GAAAA	2	10	165189	165198	80 %	0 %	20 %	0 %	525957615
99	NC_021848	GTGAT	2	10	165369	165378	20 %	40 %	40 %	0 %	525957616
100	NC_021848	GCGAG	2	10	165379	165388	20 %	0 %	60 %	20 %	525957616
101	NC_021848	AGCGT	2	10	165422	165431	20 %	20 %	40 %	20 %	525957616
102	NC_021848	CCGTT	2	10	165684	165693	0 %	40 %	20 %	40 %	525957616
103	NC_021848	ATGCT	2	10	165786	165795	20 %	40 %	20 %	20 %	525957616
104	NC_021848	GCGAG	2	10	165971	165980	20 %	0 %	60 %	20 %	525959924
105	NC_021848	GCGCA	2	10	166780	166789	20 %	0 %	40 %	40 %	525959924
106	NC_021848	GGTTG	2	10	168196	168205	0 %	40 %	60 %	0 %	525957617
107	NC_021848	TCAAA	2	10	169887	169896	60 %	20 %	0 %	20 %	525957618
108	NC_021848	GGTGA	2	10	170963	170972	20 %	20 %	60 %	0 %	525957620
109	NC_021848	TCACG	2	10	171075	171084	20 %	20 %	20 %	40 %	525957620
110	NC_021848	TTGGT	2	10	174410	174419	0 %	60 %	40 %	0 %	525957624
111	NC_021848	TGACG	2	10	176427	176436	20 %	20 %	40 %	20 %	525957624
112	NC_021848	AAGAG	2	10	177086	177095	60 %	0 %	40 %	0 %	525957625
113	NC_021848	AGCAA	2	10	177389	177398	60 %	0 %	20 %	20 %	525957625
114	NC_021848	AACTT	2	10	177650	177659	40 %	40 %	0 %	20 %	525957625
115	NC_021848	AGGTG	2	10	177666	177675	20 %	20 %	60 %	0 %	525957625
116	NC_021848	TTTGT	2	10	177813	177822	0 %	80 %	20 %	0 %	525957625
117	NC_021848	CGTTG	2	10	178796	178805	0 %	40 %	40 %	20 %	525959926
118	NC_021848	AAGGT	2	10	181504	181513	40 %	20 %	40 %	0 %	525957626
119	NC_021848	CTTTG	2	10	181661	181670	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021848	TTTGA	2	10	181682	181691	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021848	TCAAA	2	10	184705	184714	60 %	20 %	0 %	20 %	525957628
122	NC_021848	TTAGT	2	10	184846	184855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021848	CTTGG	2	10	185470	185479	0 %	40 %	40 %	20 %	525957629
124	NC_021848	ATGCA	2	10	188668	188677	40 %	20 %	20 %	20 %	525957634
125	NC_021848	CAAAG	2	10	189712	189721	60 %	0 %	20 %	20 %	525957635
126	NC_021848	CAAAA	2	10	191029	191038	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021848	AGCTG	2	10	191418	191427	20 %	20 %	40 %	20 %	525957636
128	NC_021848	ATGGC	2	10	192758	192767	20 %	20 %	40 %	20 %	525957636
129	NC_021848	CGGTG	2	10	193354	193363	0 %	20 %	60 %	20 %	525957636
130	NC_021848	TTTTG	2	10	196293	196302	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021848	TGACT	2	10	197628	197637	20 %	40 %	20 %	20 %	525957640
132	NC_021848	AATGG	2	10	200189	200198	40 %	20 %	40 %	0 %	525957641
133	NC_021848	TTTTG	2	10	202455	202464	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021848	TTGTT	2	10	202514	202523	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021848	GGCTG	2	10	206300	206309	0 %	20 %	60 %	20 %	525957645
136	NC_021848	ATTCA	2	10	207099	207108	40 %	40 %	0 %	20 %	525957646
137	NC_021848	TGATT	2	10	208821	208830	20 %	60 %	20 %	0 %	525957647
138	NC_021848	CGGTT	2	10	210000	210009	0 %	40 %	40 %	20 %	525957647
139	NC_021848	GAAAT	2	10	210109	210118	60 %	20 %	20 %	0 %	525957647
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142	NC_021848	ACAAA	2	10	213362	213371	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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145	NC_021848	ACTCT	2	10	220722	220731	20 %	40 %	0 %	40 %	525957659
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152	NC_021848	TAGCT	2	10	228411	228420	20 %	40 %	20 %	20 %	525957665
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170	NC_021848	TCTGG	2	10	257467	257476	0 %	40 %	40 %	20 %	525957683
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261	NC_021848	TTTGT	2	10	389136	389145	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_021848	GCGGT	2	10	390589	390598	0 %	20 %	60 %	20 %	525957780
263	NC_021848	AAATC	2	10	391137	391146	60 %	20 %	0 %	20 %	525957781
264	NC_021848	GTTCA	2	10	391985	391994	20 %	40 %	20 %	20 %	525957782
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