MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 1867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021848	AGAGT	2	10	5188	5197	40 %	20 %	40 %	0 %	525957491
2	NC_021848	TGCGA	2	10	10441	10450	20 %	20 %	40 %	20 %	525957493
3	NC_021848	TGCAT	2	10	12526	12535	20 %	40 %	20 %	20 %	525957494
4	NC_021848	AATGC	2	10	13929	13938	40 %	20 %	20 %	20 %	525957495
5	NC_021848	GCTTA	2	10	14138	14147	20 %	40 %	20 %	20 %	525957495
6	NC_021848	TGAAA	2	10	14383	14392	60 %	20 %	20 %	0 %	525957495
7	NC_021848	CAAAT	2	10	16668	16677	60 %	20 %	0 %	20 %	525957496
8	NC_021848	TTTCA	2	10	18353	18362	20 %	60 %	0 %	20 %	525957497
9	NC_021848	GCGGT	2	10	19930	19939	0 %	20 %	60 %	20 %	525957499
10	NC_021848	GTGTT	2	10	20020	20029	0 %	60 %	40 %	0 %	525957499
11	NC_021848	TAAGC	2	10	20642	20651	40 %	20 %	20 %	20 %	525957500
12	NC_021848	TGAAG	2	10	25149	25158	40 %	20 %	40 %	0 %	525957504
13	NC_021848	TCTGC	2	10	26017	26026	0 %	40 %	20 %	40 %	525957504
14	NC_021848	GCAAC	2	10	27811	27820	40 %	0 %	20 %	40 %	525959908
15	NC_021848	TGAGT	2	10	30742	30751	20 %	40 %	40 %	0 %	525957507
16	NC_021848	CTTTG	2	10	32929	32938	0 %	60 %	20 %	20 %	525957509
17	NC_021848	TTAGA	2	10	34242	34251	40 %	40 %	20 %	0 %	525957511
18	NC_021848	CCAAA	2	10	36532	36541	60 %	0 %	0 %	40 %	525959910
19	NC_021848	TTTCT	2	10	38351	38360	0 %	80 %	0 %	20 %	525959910
20	NC_021848	AAGGC	2	10	38444	38453	40 %	0 %	40 %	20 %	525959910
21	NC_021848	TGAAG	2	10	38961	38970	40 %	20 %	40 %	0 %	525959910
22	NC_021848	GGAAC	2	10	43833	43842	40 %	0 %	40 %	20 %	525957518
23	NC_021848	GTAAA	2	10	46245	46254	60 %	20 %	20 %	0 %	525957519
24	NC_021848	TGGAA	2	10	47769	47778	40 %	20 %	40 %	0 %	525957519
25	NC_021848	GAAGT	2	10	48281	48290	40 %	20 %	40 %	0 %	525957519
26	NC_021848	ATCAA	2	10	49632	49641	60 %	20 %	0 %	20 %	525957521
27	NC_021848	TCGGT	2	10	51811	51820	0 %	40 %	40 %	20 %	525957522
28	NC_021848	CAGAG	2	10	56384	56393	40 %	0 %	40 %	20 %	525957524
29	NC_021848	TATTT	2	10	57277	57286	20 %	80 %	0 %	0 %	525957525
30	NC_021848	CGCAA	2	10	63952	63961	40 %	0 %	20 %	40 %	525957532
31	NC_021848	TTCAA	2	10	65018	65027	40 %	40 %	0 %	20 %	525957535
32	NC_021848	AGCAT	2	10	68394	68403	40 %	20 %	20 %	20 %	525957538
33	NC_021848	GTTGA	2	10	71061	71070	20 %	40 %	40 %	0 %	525959912
34	NC_021848	CGTTT	2	10	71269	71278	0 %	60 %	20 %	20 %	525959912
35	NC_021848	TATTT	2	10	73905	73914	20 %	80 %	0 %	0 %	525957545
36	NC_021848	GTGCG	2	10	76809	76818	0 %	20 %	60 %	20 %	525957548
37	NC_021848	TTGAT	2	10	78503	78512	20 %	60 %	20 %	0 %	525957550
38	NC_021848	ACGCT	2	10	83793	83802	20 %	20 %	20 %	40 %	525957553
39	NC_021848	TCATC	2	10	88399	88408	20 %	40 %	0 %	40 %	525957556
40	NC_021848	CTCAG	2	10	94228	94237	20 %	20 %	20 %	40 %	525957561
41	NC_021848	CGACA	2	10	97040	97049	40 %	0 %	20 %	40 %	525959916
42	NC_021848	GCTGT	2	10	98004	98013	0 %	40 %	40 %	20 %	525959917
43	NC_021848	TGATT	2	10	98268	98277	20 %	60 %	20 %	0 %	525959917
44	NC_021848	TACCG	2	10	99389	99398	20 %	20 %	20 %	40 %	525957562
45	NC_021848	GAAAC	2	10	102374	102383	60 %	0 %	20 %	20 %	525957564
46	NC_021848	GTCTC	2	10	103253	103262	0 %	40 %	20 %	40 %	525957566
47	NC_021848	ATGTA	2	10	103305	103314	40 %	40 %	20 %	0 %	525957566
48	NC_021848	TGCAG	2	10	103852	103861	20 %	20 %	40 %	20 %	525957566
49	NC_021848	CAGAA	2	10	107046	107055	60 %	0 %	20 %	20 %	525957569
50	NC_021848	AGATA	2	10	107341	107350	60 %	20 %	20 %	0 %	525957569
51	NC_021848	CAACC	2	10	117522	117531	40 %	0 %	0 %	60 %	525957571
52	NC_021848	ACTTC	2	10	120109	120118	20 %	40 %	0 %	40 %	525959919
53	NC_021848	GTTTT	2	10	121709	121718	0 %	80 %	20 %	0 %	525957573
54	NC_021848	GCTAC	2	10	122394	122403	20 %	20 %	20 %	40 %	525957574
55	NC_021848	TCAGG	2	10	124117	124126	20 %	20 %	40 %	20 %	525957576
56	NC_021848	CCAGA	2	10	126409	126418	40 %	0 %	20 %	40 %	525957578
57	NC_021848	GTGAG	2	10	127435	127444	20 %	20 %	60 %	0 %	525957580
58	NC_021848	CAGAA	2	10	127812	127821	60 %	0 %	20 %	20 %	525957581
59	NC_021848	TGAGA	2	10	128123	128132	40 %	20 %	40 %	0 %	525957581
60	NC_021848	ATTCG	2	10	129616	129625	20 %	40 %	20 %	20 %	525957583
61	NC_021848	GGTTT	2	10	130251	130260	0 %	60 %	40 %	0 %	525957584
62	NC_021848	TCACC	2	10	135410	135419	20 %	20 %	0 %	60 %	525957590
63	NC_021848	ATGGA	2	10	136917	136926	40 %	20 %	40 %	0 %	525957592
64	NC_021848	AACGA	2	10	138073	138082	60 %	0 %	20 %	20 %	525957593
65	NC_021848	GGTTG	2	10	138085	138094	0 %	40 %	60 %	0 %	525957593
66	NC_021848	CACTT	2	10	139523	139532	20 %	40 %	0 %	40 %	525957594
67	NC_021848	CTAAC	2	10	140235	140244	40 %	20 %	0 %	40 %	525957594
68	NC_021848	ATCAA	2	10	142893	142902	60 %	20 %	0 %	20 %	525957596
69	NC_021848	AAGAT	2	10	143622	143631	60 %	20 %	20 %	0 %	525957596
70	NC_021848	TTCTC	2	10	147193	147202	0 %	60 %	0 %	40 %	525957599
71	NC_021848	GAAAA	2	10	148495	148504	80 %	0 %	20 %	0 %	525957600
72	NC_021848	ATTCC	2	10	149128	149137	20 %	40 %	0 %	40 %	525957600
73	NC_021848	GGAAT	2	10	149639	149648	40 %	20 %	40 %	0 %	525957601
74	NC_021848	GACTC	2	10	152257	152266	20 %	20 %	20 %	40 %	525957604
75	NC_021848	CTGCG	2	10	152498	152507	0 %	20 %	40 %	40 %	525957605
76	NC_021848	TGCGT	2	10	153030	153039	0 %	40 %	40 %	20 %	525957605
77	NC_021848	TCTTT	2	10	153577	153586	0 %	80 %	0 %	20 %	525957605
78	NC_021848	GCGTT	2	10	155136	155145	0 %	40 %	40 %	20 %	525957607
79	NC_021848	GGTTG	2	10	157832	157841	0 %	40 %	60 %	0 %	525957610
80	NC_021848	GGTGG	2	10	159956	159965	0 %	20 %	80 %	0 %	525959923
81	NC_021848	GAAAA	2	10	165189	165198	80 %	0 %	20 %	0 %	525957615
82	NC_021848	GTGAT	2	10	165369	165378	20 %	40 %	40 %	0 %	525957616
83	NC_021848	GCGAG	2	10	165379	165388	20 %	0 %	60 %	20 %	525957616
84	NC_021848	AGCGT	2	10	165422	165431	20 %	20 %	40 %	20 %	525957616
85	NC_021848	CCGTT	2	10	165684	165693	0 %	40 %	20 %	40 %	525957616
86	NC_021848	ATGCT	2	10	165786	165795	20 %	40 %	20 %	20 %	525957616
87	NC_021848	GCGAG	2	10	165971	165980	20 %	0 %	60 %	20 %	525959924
88	NC_021848	GCGCA	2	10	166780	166789	20 %	0 %	40 %	40 %	525959924
89	NC_021848	GGTTG	2	10	168196	168205	0 %	40 %	60 %	0 %	525957617
90	NC_021848	TCAAA	2	10	169887	169896	60 %	20 %	0 %	20 %	525957618
91	NC_021848	GGTGA	2	10	170963	170972	20 %	20 %	60 %	0 %	525957620
92	NC_021848	TCACG	2	10	171075	171084	20 %	20 %	20 %	40 %	525957620
93	NC_021848	TTGGT	2	10	174410	174419	0 %	60 %	40 %	0 %	525957624
94	NC_021848	TGACG	2	10	176427	176436	20 %	20 %	40 %	20 %	525957624
95	NC_021848	AAGAG	2	10	177086	177095	60 %	0 %	40 %	0 %	525957625
96	NC_021848	AGCAA	2	10	177389	177398	60 %	0 %	20 %	20 %	525957625
97	NC_021848	AACTT	2	10	177650	177659	40 %	40 %	0 %	20 %	525957625
98	NC_021848	AGGTG	2	10	177666	177675	20 %	20 %	60 %	0 %	525957625
99	NC_021848	TTTGT	2	10	177813	177822	0 %	80 %	20 %	0 %	525957625
100	NC_021848	CGTTG	2	10	178796	178805	0 %	40 %	40 %	20 %	525959926
101	NC_021848	AAGGT	2	10	181504	181513	40 %	20 %	40 %	0 %	525957626
102	NC_021848	TCAAA	2	10	184705	184714	60 %	20 %	0 %	20 %	525957628
103	NC_021848	CTTGG	2	10	185470	185479	0 %	40 %	40 %	20 %	525957629
104	NC_021848	ATGCA	2	10	188668	188677	40 %	20 %	20 %	20 %	525957634
105	NC_021848	CAAAG	2	10	189712	189721	60 %	0 %	20 %	20 %	525957635
106	NC_021848	AGCTG	2	10	191418	191427	20 %	20 %	40 %	20 %	525957636
107	NC_021848	ATGGC	2	10	192758	192767	20 %	20 %	40 %	20 %	525957636
108	NC_021848	CGGTG	2	10	193354	193363	0 %	20 %	60 %	20 %	525957636
109	NC_021848	TGACT	2	10	197628	197637	20 %	40 %	20 %	20 %	525957640
110	NC_021848	AATGG	2	10	200189	200198	40 %	20 %	40 %	0 %	525957641
111	NC_021848	GGCTG	2	10	206300	206309	0 %	20 %	60 %	20 %	525957645
112	NC_021848	ATTCA	2	10	207099	207108	40 %	40 %	0 %	20 %	525957646
113	NC_021848	TGATT	2	10	208821	208830	20 %	60 %	20 %	0 %	525957647
114	NC_021848	CGGTT	2	10	210000	210009	0 %	40 %	40 %	20 %	525957647
115	NC_021848	GAAAT	2	10	210109	210118	60 %	20 %	20 %	0 %	525957647
116	NC_021848	CTTTG	2	10	211095	211104	0 %	60 %	20 %	20 %	525957648
117	NC_021848	AGCCA	2	10	215156	215165	40 %	0 %	20 %	40 %	525957652
118	NC_021848	ACTCT	2	10	220722	220731	20 %	40 %	0 %	40 %	525957659
119	NC_021848	ATTTC	2	10	223276	223285	20 %	60 %	0 %	20 %	525957661
120	NC_021848	CAATT	2	10	224926	224935	40 %	40 %	0 %	20 %	525957662
121	NC_021848	TTGCG	2	10	226492	226501	0 %	40 %	40 %	20 %	525957663
122	NC_021848	GTTTG	2	10	226548	226557	0 %	60 %	40 %	0 %	525957663
123	NC_021848	GCATG	2	10	227227	227236	20 %	20 %	40 %	20 %	525957664
124	NC_021848	TAGCT	2	10	228411	228420	20 %	40 %	20 %	20 %	525957665
125	NC_021848	GTCAG	2	10	230397	230406	20 %	20 %	40 %	20 %	525957666
126	NC_021848	CGTAA	2	10	233874	233883	40 %	20 %	20 %	20 %	525957668
127	NC_021848	GATTG	2	10	236461	236470	20 %	40 %	40 %	0 %	525957670
128	NC_021848	GATTT	2	10	237256	237265	20 %	60 %	20 %	0 %	525957671
129	NC_021848	TCTAA	2	10	238093	238102	40 %	40 %	0 %	20 %	525957672
130	NC_021848	TGGTG	2	10	238548	238557	0 %	40 %	60 %	0 %	525957672
131	NC_021848	GTTGC	2	10	241480	241489	0 %	40 %	40 %	20 %	525957675
132	NC_021848	CGTTA	2	10	243407	243416	20 %	40 %	20 %	20 %	525957677
133	NC_021848	ATACC	2	10	243880	243889	40 %	20 %	0 %	40 %	525957677
134	NC_021848	GCGTT	2	10	245664	245673	0 %	40 %	40 %	20 %	525959930
135	NC_021848	TGGAA	2	10	250772	250781	40 %	20 %	40 %	0 %	525957680
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138	NC_021848	TCTGG	2	10	257467	257476	0 %	40 %	40 %	20 %	525957683
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141	NC_021848	TGGTG	2	10	262911	262920	0 %	40 %	60 %	0 %	525957686
142	NC_021848	ACGGC	2	10	264323	264332	20 %	0 %	40 %	40 %	525957687
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150	NC_021848	GTCCA	2	10	278644	278653	20 %	20 %	20 %	40 %	525957697
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152	NC_021848	CCATG	2	10	282250	282259	20 %	20 %	20 %	40 %	525957698
153	NC_021848	CATAG	2	10	282932	282941	40 %	20 %	20 %	20 %	525957698
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155	NC_021848	CTTGA	2	10	284213	284222	20 %	40 %	20 %	20 %	525957699
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157	NC_021848	TGGAT	2	10	290151	290160	20 %	40 %	40 %	0 %	525957704
158	NC_021848	GCATG	2	10	290852	290861	20 %	20 %	40 %	20 %	525957704
159	NC_021848	CGACG	2	10	291709	291718	20 %	0 %	40 %	40 %	525957704
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247	NC_021848	TTTGA	2	10	435266	435275	20 %	60 %	20 %	0 %	525957818
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251	NC_021848	GGTTA	2	10	439809	439818	20 %	40 %	40 %	0 %	525957820
252	NC_021848	GAGAA	2	10	440132	440141	60 %	0 %	40 %	0 %	525957820
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259	NC_021848	CAGTC	2	10	456899	456908	20 %	20 %	20 %	40 %	525957835
260	NC_021848	GGCAA	2	10	462485	462494	40 %	0 %	40 %	20 %	525957841
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