MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 43897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021848	GTA	2	6	69	74	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021848	GTA	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021848	AGG	2	6	182	187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021848	GCG	2	6	254	259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021848	CGA	2	6	318	323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021848	GAC	2	6	347	352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021848	TCC	2	6	416	421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021848	TAC	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021848	GGA	2	6	725	730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021848	TAC	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021848	AAC	2	6	979	984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021848	TAC	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021848	AGC	2	6	1068	1073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021848	CAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021848	AGT	2	6	1141	1146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021848	CCT	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_021848	CTT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021848	ACG	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021848	GGT	2	6	1617	1622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021848	TTA	2	6	1774	1779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021848	CGG	2	6	1900	1905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021848	ATG	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021848	TAC	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021848	ACC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021848	TGG	2	6	2231	2236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021848	TCC	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_021848	GGA	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021848	GGT	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021848	CGG	2	6	2481	2486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021848	TCA	2	6	2509	2514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021848	CGT	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021848	GCT	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021848	ACG	2	6	2824	2829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021848	ACA	2	6	2903	2908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021848	ACA	2	6	3280	3285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021848	AGC	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021848	TTA	2	6	3437	3442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021848	GAT	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021848	TGA	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021848	TCT	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021848	CTC	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021848	ATG	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021848	TTA	2	6	3786	3791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021848	TGG	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021848	TTC	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021848	CAG	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021848	GAG	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021848	ATA	2	6	4380	4385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021848	TTG	2	6	4386	4391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021848	GCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021848	GAT	2	6	4622	4627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957491
52	NC_021848	ACC	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957491
53	NC_021848	GCC	2	6	4703	4708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957491
54	NC_021848	CAT	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957491
55	NC_021848	TCT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957491
56	NC_021848	AGC	2	6	4869	4874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957491
57	NC_021848	CTA	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957491
58	NC_021848	GGT	2	6	4945	4950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957491
59	NC_021848	CTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957491
60	NC_021848	CTT	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957491
61	NC_021848	CAT	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957491
62	NC_021848	GAA	2	6	5456	5461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957491
63	NC_021848	GCC	2	6	5543	5548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957491
64	NC_021848	CAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957491
65	NC_021848	GTT	2	6	5645	5650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957491
66	NC_021848	TGG	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957491
67	NC_021848	GCG	2	6	5760	5765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957491
68	NC_021848	AAG	2	6	5888	5893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021848	AAT	2	6	5901	5906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021848	ACA	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957492
71	NC_021848	TGG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
72	NC_021848	GAG	2	6	6104	6109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957492
73	NC_021848	CAA	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957492
74	NC_021848	TTG	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
75	NC_021848	ACC	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957492
76	NC_021848	CGC	2	6	6306	6311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957492
77	NC_021848	AGA	2	6	6855	6860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
78	NC_021848	AGC	2	6	6889	6894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957492
79	NC_021848	TGG	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
80	NC_021848	TGT	2	6	6919	6924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
81	NC_021848	GTC	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957492
82	NC_021848	TCA	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
83	NC_021848	AGA	2	6	7119	7124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
84	NC_021848	ATC	2	6	7180	7185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
85	NC_021848	TTG	2	6	7388	7393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
86	NC_021848	CGT	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957492
87	NC_021848	AGA	2	6	7539	7544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
88	NC_021848	ATT	2	6	7546	7551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957492
89	NC_021848	TGA	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
90	NC_021848	CAA	2	6	7596	7601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957492
91	NC_021848	GAT	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
92	NC_021848	TAA	2	6	7704	7709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957492
93	NC_021848	AGA	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
94	NC_021848	TTG	2	6	7882	7887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
95	NC_021848	AGA	3	9	7926	7934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
96	NC_021848	GAA	2	6	8029	8034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
97	NC_021848	GTG	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
98	NC_021848	TGA	2	6	8162	8167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
99	NC_021848	TTA	2	6	8195	8200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957492
100	NC_021848	TTG	2	6	8239	8244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
101	NC_021848	TAA	2	6	8307	8312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957492
102	NC_021848	ATC	2	6	8320	8325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
103	NC_021848	AGA	2	6	8373	8378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
104	NC_021848	TGG	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
105	NC_021848	CCG	2	6	8516	8521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957492
106	NC_021848	GGT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
107	NC_021848	AAG	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
108	NC_021848	CCA	2	6	8758	8763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957492
109	NC_021848	GAT	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
110	NC_021848	GAA	2	6	8893	8898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
111	NC_021848	GAG	2	6	8905	8910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957492
112	NC_021848	ATG	2	6	8927	8932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
113	NC_021848	GCT	2	6	8940	8945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957492
114	NC_021848	TGA	2	6	9018	9023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
115	NC_021848	ACT	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
116	NC_021848	GCA	2	6	9337	9342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957492
117	NC_021848	ATG	2	6	9359	9364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
118	NC_021848	GAT	2	6	9583	9588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
119	NC_021848	GTT	2	6	9724	9729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021848	TCT	2	6	9911	9916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957493
121	NC_021848	TGC	2	6	10036	10041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957493
122	NC_021848	GCC	2	6	10060	10065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957493
123	NC_021848	AAG	2	6	10169	10174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957493
124	NC_021848	GTG	2	6	10251	10256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957493
125	NC_021848	TGA	2	6	10268	10273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957493
126	NC_021848	GCC	2	6	10285	10290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957493
127	NC_021848	CAA	2	6	10314	10319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957493
128	NC_021848	ACC	2	6	10543	10548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957493
129	NC_021848	GTT	2	6	10559	10564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957493
130	NC_021848	CTT	2	6	10572	10577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957493
131	NC_021848	GAC	2	6	10606	10611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957493
132	NC_021848	GTC	2	6	10693	10698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957493
133	NC_021848	CAC	2	6	10788	10793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957493
134	NC_021848	GGT	2	6	10803	10808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957493
135	NC_021848	GGC	2	6	10837	10842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957493
136	NC_021848	GAA	2	6	10886	10891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957493
137	NC_021848	GCT	2	6	11029	11034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957493
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140	NC_021848	TCA	2	6	11263	11268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021848	TGA	2	6	11277	11282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021848	ACT	2	6	11348	11353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021848	ATC	2	6	11392	11397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959907
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148	NC_021848	AAT	2	6	11642	11647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021848	AAT	2	6	11698	11703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021848	CTT	2	6	11715	11720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_021848	TCT	2	6	14896	14901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957496
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245	NC_021848	CAG	2	6	20277	20282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957499
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247	NC_021848	GCA	2	6	20318	20323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957499
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251	NC_021848	ATG	2	6	20593	20598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_021848	TGG	2	6	20659	20664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957500
253	NC_021848	CGG	2	6	20711	20716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957500
254	NC_021848	ACT	2	6	20758	20763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957500
255	NC_021848	GTT	2	6	20781	20786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957500
256	NC_021848	CGT	2	6	20894	20899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957500
257	NC_021848	ATC	2	6	21072	21077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957500
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259	NC_021848	GAA	2	6	21148	21153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957500
260	NC_021848	GAA	2	6	21432	21437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957500
261	NC_021848	TTG	2	6	21469	21474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957500
262	NC_021848	GTG	2	6	21519	21524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957500
263	NC_021848	TTA	2	6	21533	21538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957500
264	NC_021848	TCA	2	6	21566	21571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957500
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268	NC_021848	GAA	2	6	21798	21803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957500
269	NC_021848	TGA	2	6	22145	22150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957500
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271	NC_021848	AAG	2	6	22324	22329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957500
272	NC_021848	GCG	2	6	22425	22430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957500
273	NC_021848	CAA	2	6	22470	22475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957500
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278	NC_021848	ATC	2	6	22678	22683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957501
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280	NC_021848	TCA	2	6	22736	22741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957501
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283	NC_021848	CAT	2	6	22972	22977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957501
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293	NC_021848	GCG	4	12	23480	23491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957501
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371	NC_021848	TGA	2	6	30349	30354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957506
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381	NC_021848	CAA	2	6	30787	30792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957507
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498	NC_021848	CCA	2	6	40847	40852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957514
499	NC_021848	GGT	2	6	40895	40900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957514
500	NC_021848	ACT	2	6	40906	40911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957514

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