MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021847	ATTTCA	2	12	3616	3627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021847	ATTTCA	2	12	9289	9300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021847	GTATCA	2	12	28608	28619	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021847	GAAGCC	2	12	64642	64653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021847	GCATAG	2	12	68240	68251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021847	GATCGA	2	12	99064	99075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021847	ATTATC	2	12	166296	166307	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021847	ATTTCA	2	12	189489	189500	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021847	AGAGAT	10	60	198214	198273	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021847	ATTTCA	2	12	235104	235115	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021847	TAAAAA	2	12	266284	266295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021847	ATTTCA	2	12	295928	295939	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021847	ATTCTC	2	12	335903	335914	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021847	ATTTCA	2	12	337216	337227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_021847	AGAATA	2	12	344735	344746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021847	AAAGCA	2	12	361114	361125	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021847	TTTATC	2	12	370853	370864	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021847	TTTTTG	2	12	372730	372741	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021847	TGAAAT	2	12	428098	428109	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021847	GGATCC	2	12	444239	444250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021847	TGCAGA	2	12	469333	469344	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021847	TGAGTG	2	12	501069	501080	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021847	CAGCGT	2	12	579099	579110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021847	CACTTA	2	12	635876	635887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021847	CAAAAA	2	12	645178	645189	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021847	GTTTGG	2	12	688369	688380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021847	TTACAT	2	12	697744	697755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021847	TTTTTG	2	12	715788	715799	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021847	TTTCGA	2	12	732766	732777	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021847	AATAAG	2	12	814945	814956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021847	TGACGT	2	12	827140	827151	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021847	GTGGGA	2	12	874321	874332	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021847	ACAAAA	2	12	891869	891880	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021847	ATTTTG	2	12	906166	906177	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021847	ATTGAG	2	12	934509	934520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021847	TGAAAT	2	12	960800	960811	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021847	ATACAA	2	12	982281	982292	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021847	TATTAG	2	12	983202	983213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021847	TATTTT	2	12	1057317	1057328	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021847	ATTGAA	2	12	1063046	1063057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021847	AGATTA	2	12	1071439	1071450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021847	TCTAGC	2	12	1172581	1172592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021847	AATCGG	2	12	1173902	1173913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021847	ATTTAT	2	12	1185345	1185356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021847	GAGATG	2	12	1192213	1192224	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021847	CGAAGT	2	12	1242981	1242992	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021847	CGACAT	2	12	1397226	1397237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021847	AAGGCT	2	12	1411501	1411512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021847	ACGTCG	2	12	1439664	1439675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021847	ATTCTT	2	12	1450103	1450114	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021847	TTATTT	2	12	1452524	1452535	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021847	ATATTT	2	12	1452540	1452551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021847	CTTTTT	2	12	1509615	1509626	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021847	AGAGCA	2	12	1509784	1509795	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021847	TTCAAT	2	12	1514224	1514235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021847	CAAATG	2	12	1602426	1602437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021847	TAAGTA	2	12	1645651	1645662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021847	TTGTTA	2	12	1648571	1648582	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021847	TTTTTG	2	12	1674278	1674289	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021847	GATGTT	2	12	1689564	1689575	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021847	CGATTA	2	12	1694288	1694299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021847	TGCGAA	2	12	1708257	1708268	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021847	TGAAAA	2	12	1762975	1762986	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021847	GAAAGT	2	12	1778204	1778215	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021847	TAACAT	2	12	1786270	1786281	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_021847	CAGTTG	2	12	1787086	1787097	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021847	TTATTT	2	12	1787505	1787516	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021847	AAAAAT	2	12	1811017	1811028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021847	TTTGGA	2	12	1820205	1820216	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021847	ATAAAA	2	12	1833744	1833755	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021847	ATTTTA	2	12	1858826	1858837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021847	GTATTT	2	12	1870986	1870997	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021847	AAGATC	2	12	1892758	1892769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021847	AAAGGA	2	12	1917445	1917456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021847	CTTGAT	2	12	1972560	1972571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021847	TAGCAA	2	12	1976564	1976575	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021847	TCTAGC	2	12	1979511	1979522	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021847	TTCATT	2	12	2002616	2002627	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021847	TCCTTT	2	12	2004488	2004499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021847	ATAACT	2	12	2013801	2013812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021847	CCTTTT	2	12	2051408	2051419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021847	CTATAT	2	12	2051537	2051548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021847	AAAAAC	2	12	2061924	2061935	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_021847	AAAGGA	2	12	2163046	2163057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021847	TTTTTA	2	12	2172347	2172358	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021847	CAAAAA	2	12	2195360	2195371	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021847	CTTATT	2	12	2219218	2219229	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021847	ATTGAA	2	12	2288496	2288507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021847	CATTTA	2	12	2293267	2293278	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021847	TGCCTT	2	12	2298046	2298057	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021847	TAGAAA	2	12	2320411	2320422	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021847	TATGTC	2	12	2401897	2401908	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021847	CTTTTT	2	12	2419322	2419333	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021847	TTCTAT	2	12	2457990	2458001	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_021847	TATTTT	2	12	2466545	2466556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021847	TTAACC	2	12	2488317	2488328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021847	TTCAAG	2	12	2500299	2500310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021847	TTATCA	2	12	2554594	2554605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_021847	AAGTTA	2	12	2557169	2557180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021847	CTTTCA	2	12	2598272	2598283	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021847	CGATAC	2	12	2626355	2626366	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021847	TAAGAA	2	12	2779509	2779520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021847	TATCTA	2	12	2779546	2779557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021847	AAAGAG	2	12	2807870	2807881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021847	TTGTTC	2	12	2819332	2819343	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021847	CAAAAA	2	12	2852783	2852794	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021847	TATCAA	2	12	2898263	2898274	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021847	CCACGC	2	12	2938828	2938839	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021847	TCACAA	2	12	2946171	2946182	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021847	CGCTGC	2	12	2979034	2979045	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021847	AGTTAT	2	12	3030580	3030591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021847	TTCTCT	2	12	3134066	3134077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021847	ATTTCA	2	12	3241785	3241796	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021847	ATATTT	2	12	3252716	3252727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021847	ATTTAC	2	12	3253246	3253257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021847	TGGTTT	2	12	3256551	3256562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021847	ATTTCA	2	12	3352731	3352742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021847	ATTTCA	2	12	3358220	3358231	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.