MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 5189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021847	CTT	2	6	136	141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021847	AAG	2	6	358	363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021847	TGG	2	6	479	484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021847	CAC	2	6	489	494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021847	ACC	2	6	645	650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021847	AGA	2	6	664	669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021847	AGA	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021847	TCT	2	6	845	850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021847	CCG	2	6	854	859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021847	TGA	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021847	GAG	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021847	TAA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021847	CAT	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021847	GGA	2	6	2037	2042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021847	TTA	2	6	2060	2065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021847	AGA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021847	CCA	2	6	2200	2205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021847	ATC	2	6	2228	2233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021847	CGT	2	6	2807	2812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021847	AGC	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021847	ACG	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021847	TGA	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021847	CCG	2	6	3150	3155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021847	ACC	2	6	3237	3242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021847	CTC	2	6	3356	3361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021847	GAG	2	6	3375	3380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021847	CCA	2	6	3400	3405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021847	GGT	2	6	3460	3465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021847	GTA	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021847	CAT	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021847	GCC	2	6	3730	3735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021847	TAA	2	6	3857	3862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021847	ACC	2	6	4014	4019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021847	CGT	2	6	4114	4119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021847	AAG	2	6	4231	4236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021847	GAG	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021847	TAC	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021847	ATG	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021847	GCT	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021847	TAG	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021847	GTT	2	6	4652	4657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021847	ACG	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021847	AGT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021847	GTA	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021847	GGA	2	6	5215	5220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021847	CGT	2	6	5283	5288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021847	GTT	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021847	TAC	2	6	5562	5567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021847	TGA	2	6	5649	5654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021847	ATG	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021847	TTG	2	6	5796	5801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021847	TGA	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021847	TGG	2	6	5889	5894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021847	TGG	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021847	CCT	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021847	TGG	2	6	6087	6092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021847	CCG	2	6	6197	6202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021847	CTT	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021847	ATC	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021847	AGG	2	6	6332	6337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021847	ACG	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021847	ATG	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021847	CGT	2	6	6679	6684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021847	TCC	2	6	6693	6698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_021847	GAC	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021847	GCA	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021847	TTC	2	6	6895	6900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021847	GCC	2	6	7138	7143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021847	ACC	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_021847	GCT	2	6	7348	7353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021847	CTT	2	6	7373	7378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021847	CTT	2	6	7457	7462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021847	CTG	2	6	7516	7521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021847	ATC	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021847	TCG	2	6	7591	7596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021847	CAT	2	6	7689	7694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021847	CCG	2	6	7765	7770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_021847	GCC	2	6	7840	7845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021847	ATC	2	6	8017	8022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021847	CGT	2	6	8480	8485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021847	AGC	2	6	8661	8666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021847	ACG	2	6	8715	8720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021847	TGA	2	6	8795	8800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021847	CCG	2	6	8823	8828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021847	ACC	2	6	8910	8915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_021847	CTC	2	6	9029	9034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_021847	GAG	2	6	9048	9053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021847	CCA	2	6	9073	9078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021847	GGT	2	6	9133	9138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021847	GTA	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021847	CAT	2	6	9328	9333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021847	GCC	2	6	9403	9408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021847	TAA	2	6	9530	9535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021847	ACC	2	6	9687	9692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021847	CGT	2	6	9787	9792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021847	AAG	2	6	9904	9909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021847	GAG	2	6	10018	10023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021847	TAC	2	6	10162	10167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021847	ATG	2	6	10230	10235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021847	GCT	2	6	10236	10241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021847	TAG	2	6	10291	10296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021847	GTT	2	6	10325	10330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021847	ACG	2	6	10340	10345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021847	AGT	2	6	10455	10460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021847	GTA	2	6	10872	10877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021847	GGA	2	6	10887	10892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021847	GTC	2	6	10956	10961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021847	TCG	2	6	10985	10990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021847	GTT	2	6	11201	11206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021847	TAC	2	6	11234	11239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021847	TGA	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021847	ATG	2	6	11360	11365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021847	TTG	2	6	11468	11473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021847	CCG	2	6	11595	11600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_021847	CTG	2	6	11640	11645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021847	AAT	2	6	11745	11750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021847	AGG	2	6	11760	11765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021847	ACG	2	6	12002	12007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021847	ATG	2	6	12095	12100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021847	CGT	2	6	12107	12112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021847	TCC	2	6	12121	12126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_021847	GAC	2	6	12235	12240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021847	GCA	2	6	12247	12252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021847	TTC	2	6	12323	12328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021847	GCC	2	6	12566	12571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_021847	ACC	2	6	12712	12717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021847	GCT	2	6	12776	12781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021847	CTT	2	6	12801	12806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021847	ACC	2	6	12843	12848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_021847	CTT	2	6	12885	12890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021847	CTG	2	6	12944	12949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021847	ATC	2	6	12994	12999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021847	TCG	2	6	13019	13024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021847	CAT	2	6	13117	13122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021847	CCG	2	6	13193	13198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_021847	GCC	2	6	13268	13273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021847	ATC	2	6	13445	13450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021847	CTT	2	6	13499	13504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021847	GGC	2	6	13529	13534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021847	ATT	2	6	13577	13582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021847	CGA	2	6	13641	13646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021847	AAC	2	6	13770	13775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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145	NC_021847	TAA	2	6	18647	18652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_021847	TAA	2	6	28569	28574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_021847	TGA	2	6	48173	48178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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