MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 39227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021847	ACC	2	6	206	211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525952308
2	NC_021847	TCA	2	6	318	323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952308
3	NC_021847	CAT	2	6	1539	1544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952310
4	NC_021847	ATG	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525952310
5	NC_021847	GAA	2	6	1717	1722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525952311
6	NC_021847	AGG	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525952311
7	NC_021847	CAA	2	6	1847	1852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952311
8	NC_021847	ACA	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952311
9	NC_021847	CAT	2	6	13915	13920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949894
10	NC_021847	AAG	2	6	13953	13958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949894
11	NC_021847	TTC	2	6	13964	13969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949894
12	NC_021847	CTT	2	6	14029	14034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949894
13	NC_021847	GAT	2	6	14044	14049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949894
14	NC_021847	GTA	2	6	14072	14077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949894
15	NC_021847	TTA	2	6	14088	14093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949894
16	NC_021847	ACG	2	6	14225	14230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949894
17	NC_021847	TGT	2	6	14254	14259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949894
18	NC_021847	CTT	2	6	14308	14313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949894
19	NC_021847	TCA	2	6	14376	14381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949894
20	NC_021847	AAT	2	6	14426	14431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949894
21	NC_021847	CTT	2	6	14690	14695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949895
22	NC_021847	ATG	2	6	14698	14703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949895
23	NC_021847	CCA	2	6	14765	14770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949895
24	NC_021847	TCT	2	6	14782	14787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949895
25	NC_021847	GCT	2	6	15092	15097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949895
26	NC_021847	CAA	2	6	15176	15181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949895
27	NC_021847	CAC	2	6	15347	15352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949895
28	NC_021847	TCA	2	6	15559	15564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949895
29	NC_021847	ACC	3	9	15609	15617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949895
30	NC_021847	CAT	2	6	15695	15700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949895
31	NC_021847	GGA	2	6	15706	15711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525949895
32	NC_021847	GTT	2	6	15721	15726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949895
33	NC_021847	TCT	2	6	15769	15774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949895
34	NC_021847	TCT	2	6	15851	15856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949895
35	NC_021847	CTT	2	6	15872	15877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949895
36	NC_021847	CTG	2	6	15935	15940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949895
37	NC_021847	CGT	2	6	16032	16037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949895
38	NC_021847	TAA	2	6	16106	16111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949895
39	NC_021847	GCC	2	6	16251	16256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949895
40	NC_021847	TAA	2	6	16438	16443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949896
41	NC_021847	CTT	2	6	16474	16479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
42	NC_021847	CAA	2	6	16486	16491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
43	NC_021847	CAC	2	6	16534	16539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949896
44	NC_021847	AAC	2	6	16737	16742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
45	NC_021847	ATG	2	6	16824	16829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949896
46	NC_021847	TAT	2	6	16837	16842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949896
47	NC_021847	TTG	2	6	16866	16871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949896
48	NC_021847	CTT	2	6	16900	16905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
49	NC_021847	AAG	2	6	16920	16925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949896
50	NC_021847	ACC	2	6	16971	16976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949896
51	NC_021847	CTT	2	6	16993	16998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
52	NC_021847	TCT	2	6	17092	17097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
53	NC_021847	CAA	2	6	17110	17115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
54	NC_021847	CCA	2	6	17158	17163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949896
55	NC_021847	AGA	2	6	17564	17569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949896
56	NC_021847	TTC	2	6	17609	17614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
57	NC_021847	AGA	2	6	17713	17718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949896
58	NC_021847	CAA	2	6	17851	17856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
59	NC_021847	TGA	2	6	17857	17862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949896
60	NC_021847	AAC	2	6	17910	17915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949896
61	NC_021847	CTT	2	6	17941	17946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949896
62	NC_021847	ATG	2	6	17997	18002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949896
63	NC_021847	GCT	2	6	18039	18044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949896
64	NC_021847	GCC	2	6	18060	18065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949896
65	NC_021847	TGC	2	6	18120	18125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949896
66	NC_021847	TTG	2	6	18146	18151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949896
67	NC_021847	TTG	2	6	18164	18169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949896
68	NC_021847	GGA	2	6	18192	18197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525949896
69	NC_021847	ATT	2	6	18212	18217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949896
70	NC_021847	TTG	2	6	18404	18409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949897
71	NC_021847	GGC	2	6	18437	18442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949897
72	NC_021847	TTC	2	6	18464	18469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949897
73	NC_021847	ACC	2	6	18497	18502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949897
74	NC_021847	CAA	2	6	18520	18525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949897
75	NC_021847	CTT	2	6	18535	18540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949897
76	NC_021847	AAT	2	6	18554	18559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949897
77	NC_021847	CAA	2	6	18565	18570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949897
78	NC_021847	AAG	2	6	18790	18795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949898
79	NC_021847	CCA	2	6	18868	18873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949898
80	NC_021847	TGT	2	6	18950	18955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949898
81	NC_021847	TCA	2	6	19039	19044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949898
82	NC_021847	GTA	2	6	19152	19157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949898
83	NC_021847	TCT	2	6	19287	19292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949898
84	NC_021847	AGA	2	6	19350	19355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949898
85	NC_021847	TGC	2	6	19661	19666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949899
86	NC_021847	TCA	2	6	19675	19680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949899
87	NC_021847	GAC	2	6	19994	19999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949900
88	NC_021847	CAA	2	6	20111	20116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949900
89	NC_021847	CTT	2	6	20127	20132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949900
90	NC_021847	ATC	2	6	20209	20214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949900
91	NC_021847	CAC	2	6	20264	20269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949900
92	NC_021847	GCG	2	6	20333	20338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949900
93	NC_021847	GCC	2	6	20412	20417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949900
94	NC_021847	ACC	2	6	20512	20517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949900
95	NC_021847	TCA	2	6	20629	20634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949900
96	NC_021847	TCT	2	6	20674	20679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949900
97	NC_021847	ACC	2	6	20688	20693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949900
98	NC_021847	CTC	2	6	20715	20720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525949900
99	NC_021847	GTC	2	6	20767	20772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949900
100	NC_021847	CAG	2	6	20787	20792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949900
101	NC_021847	CAA	2	6	21198	21203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949901
102	NC_021847	CGC	2	6	21293	21298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949901
103	NC_021847	TTG	2	6	21439	21444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949901
104	NC_021847	TCC	2	6	21617	21622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525949901
105	NC_021847	AGA	2	6	21642	21647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949901
106	NC_021847	CTT	2	6	21684	21689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949902
107	NC_021847	AAG	2	6	21749	21754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949902
108	NC_021847	TGA	2	6	21835	21840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949902
109	NC_021847	GAA	2	6	21899	21904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949902
110	NC_021847	TGG	2	6	21915	21920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949902
111	NC_021847	TGG	2	6	21943	21948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949902
112	NC_021847	ATC	3	9	22052	22060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949902
113	NC_021847	TTG	2	6	22256	22261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949903
114	NC_021847	GTT	2	6	22322	22327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949903
115	NC_021847	TTG	2	6	22460	22465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949903
116	NC_021847	CTT	2	6	22508	22513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949903
117	NC_021847	CTT	2	6	22541	22546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949903
118	NC_021847	TTC	2	6	22554	22559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949903
119	NC_021847	TGG	3	9	22615	22623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949903
120	NC_021847	CGC	2	6	22827	22832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949903
121	NC_021847	GTT	2	6	22890	22895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949903
122	NC_021847	AGC	2	6	22987	22992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949903
123	NC_021847	ACC	2	6	23061	23066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949903
124	NC_021847	GCA	2	6	23143	23148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949903
125	NC_021847	CTG	2	6	23177	23182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949903
126	NC_021847	CGT	2	6	23265	23270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949903
127	NC_021847	TTC	2	6	23284	23289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949903
128	NC_021847	GAT	2	6	23342	23347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949903
129	NC_021847	ACC	2	6	23397	23402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949903
130	NC_021847	CTG	2	6	23510	23515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949903
131	NC_021847	GAA	2	6	23576	23581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949903
132	NC_021847	TGA	2	6	23693	23698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949903
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139	NC_021847	TGA	2	6	24428	24433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949904
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152	NC_021847	CGT	2	6	25188	25193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949905
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496	NC_021847	ACT	2	6	52605	52610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949929
497	NC_021847	GCA	2	6	52630	52635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949929
498	NC_021847	TTG	3	9	52759	52767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949929
499	NC_021847	CGC	2	6	53061	53066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949930
500	NC_021847	GAA	2	6	53131	53136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949930

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