MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Spiroplasma taiwanense CT-1

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021846	ATTAAA	2	12	37547	37558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021846	TGGAGA	2	12	39470	39481	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021846	AATTAC	2	12	40886	40897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021846	TATTTT	2	12	52123	52134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021846	TAAAAA	2	12	52230	52241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021846	TATTTA	2	12	60608	60619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021846	TTTAAA	2	12	63631	63642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021846	TTTTTA	2	12	71284	71295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021846	AAAAGA	2	12	73623	73634	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021846	TTAATA	2	12	83952	83963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021846	TAATTA	2	12	89234	89245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021846	TACAAT	2	12	95745	95756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021846	ATGCCA	2	12	103049	103060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021846	ATTGAA	2	12	111745	111756	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021846	TAACAG	2	12	113196	113207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021846	AGAATT	2	12	113964	113975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021846	TGAAAT	2	12	114030	114041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021846	TAGTTT	2	12	114341	114352	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021846	TTATTT	2	12	116026	116037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021846	ATTGAT	2	12	131261	131272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021846	TTAATT	2	12	142132	142143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021846	ACATTT	2	12	152872	152883	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021846	TAATGT	2	12	154007	154018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021846	ACAGAA	2	12	154928	154939	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021846	TTCAAA	2	12	160770	160781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021846	TATTTT	2	12	161607	161618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021846	TGCAAA	2	12	192411	192422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021846	TTAATT	2	12	192648	192659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021846	ACTTTT	2	12	222638	222649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021846	AGAATT	2	12	222705	222716	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021846	TAAAAT	2	12	223366	223377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021846	TTTAGC	2	12	223441	223452	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021846	ATTCAA	2	12	225285	225296	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021846	GAAATT	2	12	225557	225568	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021846	TTTAGT	2	12	233061	233072	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021846	AACAAT	2	12	233165	233176	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021846	GCTTTT	2	12	234529	234540	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021846	TTGTTT	2	12	240529	240540	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021846	TTTAGA	2	12	242621	242632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021846	AGATTA	2	12	244275	244286	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021846	TGAAAA	2	12	244896	244907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021846	AATTTA	2	12	245628	245639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021846	ATTTTT	2	12	256562	256573	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021846	CTGAAA	2	12	284148	284159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021846	GAAATT	2	12	289543	289554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021846	TTGCAA	2	12	294150	294161	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021846	ATGAAT	2	12	309686	309697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021846	AAGATT	2	12	364883	364894	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021846	AACAAA	2	12	367461	367472	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021846	TTGGTA	2	12	368129	368140	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021846	TATTTT	2	12	371168	371179	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021846	TTAAAA	2	12	372099	372110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021846	ATTTAA	2	12	411743	411754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021846	TTTACA	2	12	415268	415279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021846	TAGTGG	2	12	415909	415920	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021846	AAATAT	2	12	416023	416034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021846	CAATTG	2	12	416585	416596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021846	TAGTGG	2	12	420708	420719	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021846	ATTGCA	2	12	421387	421398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021846	TTATAA	2	12	425885	425896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021846	AGAAAT	2	12	426129	426140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021846	TTGAAG	2	12	453475	453486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021846	CTTTTT	2	12	457020	457031	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021846	TATTTT	2	12	462820	462831	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021846	AAAATG	2	12	485006	485017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021846	ATTAAA	2	12	486055	486066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021846	ATATTA	2	12	486186	486197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021846	TAAATA	2	12	488948	488959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021846	ATTTAA	2	12	493011	493022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021846	TAAATG	2	12	493905	493916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021846	ATTTAA	2	12	500846	500857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021846	AAATTT	2	12	502686	502697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021846	TTTAAA	2	12	503558	503569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021846	TATTTA	2	12	511236	511247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021846	TATATT	2	12	512263	512274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021846	TTTTAT	2	12	512294	512305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021846	AATTAA	2	12	517389	517400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021846	TAAAAA	2	12	520469	520480	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021846	TAGAAA	2	12	522364	522375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021846	ATTTAT	2	12	536031	536042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021846	AGTGGA	2	12	536219	536230	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021846	TTAAAT	2	12	538129	538140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021846	AATTAA	2	12	549949	549960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021846	TAAATT	2	12	556788	556799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021846	ATATTT	2	12	559114	559125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021846	TAAAAA	2	12	559782	559793	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021846	GGTTTA	2	12	560230	560241	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021846	AATAAC	2	12	560461	560472	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021846	ATTTTA	2	12	567210	567221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021846	TAAAAG	2	12	592914	592925	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021846	CCAGTT	2	12	596953	596964	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021846	TATGAT	2	12	601972	601983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021846	TTATAA	2	12	606557	606568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021846	ATCAAC	2	12	611171	611182	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021846	TATATT	3	18	622692	622709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021846	TTCAAT	2	12	639985	639996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021846	ATTTTA	2	12	650950	650961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021846	ATTTAA	2	12	659177	659188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021846	TTTATA	2	12	660994	661005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021846	TTCTAA	2	12	667611	667622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021846	ATATTA	2	12	669839	669850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021846	TAAATT	2	12	670733	670744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021846	CATTAT	2	12	671242	671253	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021846	CATTAT	2	12	671741	671752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021846	TTCATT	2	12	671958	671969	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021846	AAATAA	2	12	672020	672031	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021846	TAAAAT	2	12	672040	672051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021846	TAAAAA	2	12	672140	672151	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021846	TTTTAA	2	12	674707	674718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021846	ATTTTA	2	12	674797	674808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021846	TTAATT	2	12	675076	675087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021846	TATAAA	2	12	675314	675325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021846	TATAAT	2	12	675525	675536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021846	ACATTA	2	12	695011	695022	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021846	AAAAAT	2	12	695730	695741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021846	ATTTAA	2	12	699583	699594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021846	CTGTAA	2	12	703593	703604	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021846	TTTCAT	2	12	709036	709047	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021846	ATTAAT	2	12	711128	711139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021846	AATTTA	2	12	718294	718305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021846	TTTTAT	2	12	732529	732540	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021846	TCAAAT	2	12	735497	735508	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021846	TAAAAC	2	12	736732	736743	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021846	GAATTG	2	12	737154	737165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021846	CTTTTT	2	12	737628	737639	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021846	ATTAAA	2	12	740637	740648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021846	TAAAAA	2	12	745265	745276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021846	ATTTTT	2	12	745292	745303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021846	TTATCA	2	12	783097	783108	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_021846	TAAATA	2	12	783132	783143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021846	AAATAT	2	12	785233	785244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021846	TTATCA	2	12	785295	785306	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_021846	ATTTTT	2	12	785693	785704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.