MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Spiroplasma taiwanense CT-1

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021846	TAATT	2	10	40742	40751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021846	ATATT	2	10	43283	43292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021846	GTTTT	2	10	63596	63605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021846	ACTAA	2	10	71049	71058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021846	GAAAG	2	10	71197	71206	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021846	AAATT	2	10	84452	84461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021846	TAAAA	2	10	89349	89358	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021846	TAAAT	2	10	89362	89371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021846	AAACT	2	10	95533	95542	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021846	GATTT	2	10	95908	95917	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021846	AAAAC	2	10	102710	102719	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021846	GTTAT	2	10	103259	103268	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021846	TAAAA	2	10	111352	111361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021846	TTTTA	2	10	111418	111427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021846	AATTA	2	10	111433	111442	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021846	AATTT	2	10	111628	111637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021846	GAAGT	2	10	112009	112018	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021846	AAATA	2	10	113164	113173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021846	TGCAA	2	10	113553	113562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021846	ATTAT	2	10	115961	115970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021846	CTTTT	2	10	116096	116105	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021846	TGATT	2	10	116171	116180	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021846	TATAA	2	10	128872	128881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021846	TTCAA	2	10	142424	142433	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021846	ATTTT	2	10	143330	143339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021846	CATAA	2	10	154803	154812	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021846	AAAAT	2	10	155030	155039	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021846	ATTTC	2	10	155040	155049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021846	ATTCA	2	10	161189	161198	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021846	GTTGA	2	10	161258	161267	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021846	AAATA	2	10	161971	161980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021846	TTTTA	2	10	162209	162218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021846	ATTTA	2	10	162233	162242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021846	TATAA	2	10	164852	164861	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021846	TAATA	2	10	170524	170533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021846	TCAAT	2	10	174918	174927	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021846	ATTAA	2	10	192624	192633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021846	TTTTA	2	10	192662	192671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021846	ATTTA	2	10	192707	192716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021846	TATCA	2	10	203472	203481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021846	AAAAT	2	10	207908	207917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021846	TTTAT	2	10	208933	208942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021846	TTTAT	2	10	209577	209586	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021846	ATACT	2	10	224525	224534	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021846	ATTTA	2	10	225274	225283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021846	TGAAA	2	10	225533	225542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021846	GAAGT	2	10	233754	233763	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021846	AATGG	2	10	234544	234553	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021846	TTAAA	2	10	239465	239474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021846	AAAAT	2	10	242981	242990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021846	TATTC	2	10	243810	243819	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021846	AAATG	2	10	244409	244418	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021846	CATTT	2	10	244466	244475	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021846	ATAAA	2	10	245403	245412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021846	ATTTT	2	10	245792	245801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021846	TATTT	2	10	246650	246659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021846	TTATC	2	10	246797	246806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021846	AATAA	3	15	247326	247340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021846	TAAAA	2	10	250008	250017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021846	TTTAT	2	10	251574	251583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021846	ATATT	2	10	283339	283348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021846	TTAAA	2	10	283578	283587	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021846	TAATA	2	10	284464	284473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021846	ATTTA	2	10	286685	286694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021846	ATTTT	2	10	287580	287589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021846	ATTAA	2	10	295268	295277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021846	ATATA	2	10	306263	306272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021846	TTAAA	2	10	309802	309811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021846	TATAG	2	10	310193	310202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021846	CTAAA	2	10	310618	310627	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021846	ATTTT	2	10	312808	312817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021846	TAAAA	2	10	316806	316815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021846	TTAAT	2	10	316829	316838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021846	AATTA	2	10	322664	322673	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021846	TAATA	2	10	323217	323226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021846	TATAT	2	10	327000	327009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021846	ATTTA	2	10	327153	327162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021846	TTATA	2	10	337806	337815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021846	TATAA	2	10	363546	363555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021846	GAAAG	2	10	364255	364264	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021846	ACAAT	2	10	364615	364624	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021846	TTTAT	2	10	365506	365515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021846	TGACA	2	10	365711	365720	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_021846	TAATT	2	10	366376	366385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021846	TAAAA	2	10	366873	366882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021846	GAAAG	2	10	367299	367308	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021846	TAAAT	2	10	367326	367335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021846	ATTTA	2	10	367449	367458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021846	TAGAT	2	10	369608	369617	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021846	AAAAT	2	10	372899	372908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021846	ATATT	2	10	377876	377885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021846	CACTT	2	10	381678	381687	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_021846	AATTT	2	10	381722	381731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021846	TATAA	2	10	384022	384031	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021846	TAAAA	2	10	386759	386768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021846	TAAAC	2	10	396044	396053	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021846	AGAAA	2	10	396232	396241	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021846	TATAA	2	10	397868	397877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021846	TTATT	2	10	401598	401607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021846	AATTA	2	10	406257	406266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021846	ATGTT	2	10	411909	411918	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021846	AATAA	2	10	412047	412056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021846	TTTAA	2	10	412116	412125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021846	TTAAA	2	10	413430	413439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021846	TTTTA	2	10	414187	414196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021846	ATCAA	2	10	414287	414296	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_021846	TAGAT	2	10	415237	415246	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021846	AATTA	2	10	415797	415806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021846	ATTGA	2	10	416150	416159	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021846	AATTA	2	10	416609	416618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021846	AAAGT	2	10	416708	416717	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021846	TTAAT	2	10	421028	421037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021846	AAAAG	2	10	425842	425851	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021846	TAATT	2	10	433354	433363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021846	TAAAA	2	10	435283	435292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021846	AAAAT	2	10	436474	436483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021846	TTACA	2	10	439750	439759	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021846	TTTTA	2	10	454522	454531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021846	ATTTA	2	10	455833	455842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021846	TATTT	2	10	457032	457041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021846	TAGCT	2	10	460148	460157	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021846	TTTTA	2	10	462023	462032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021846	TAAAA	2	10	462100	462109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021846	ATTAA	2	10	463267	463276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021846	ATTAA	2	10	463371	463380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021846	TTGAT	2	10	463709	463718	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021846	AATAA	2	10	463854	463863	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021846	TATTT	2	10	463991	464000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021846	ATAAA	2	10	466363	466372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021846	TTAAT	2	10	470673	470682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021846	AAATC	2	10	489283	489292	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021846	AAATT	2	10	490438	490447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021846	ATTTA	2	10	491375	491384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021846	AATAA	2	10	492018	492027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021846	GAATT	2	10	493407	493416	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021846	ATATT	2	10	501137	501146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021846	GAAAA	2	10	501287	501296	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021846	AATTT	2	10	501825	501834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021846	TTTTA	2	10	502195	502204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021846	GCAAA	2	10	502213	502222	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021846	TCATT	2	10	503723	503732	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021846	TACTT	2	10	504128	504137	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021846	ATTTT	2	10	504870	504879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021846	AATTA	2	10	509576	509585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021846	ACTTT	2	10	510072	510081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021846	ATATA	2	10	511644	511653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021846	AAGTT	2	10	511907	511916	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021846	TTATT	2	10	512424	512433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_021846	ACATT	2	10	787416	787425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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332	NC_021846	AATTA	2	10	1069103	1069112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_021846	TAATT	2	10	1075109	1075118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.