MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021845	TTATC	2	10	2339	2348	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021845	GATAA	2	10	2373	2382	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021845	TTATT	2	10	31664	31673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021845	ACTTG	2	10	34499	34508	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021845	CAGTC	2	10	34689	34698	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_021845	CCCAG	2	10	35262	35271	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_021845	CAAAC	2	10	35511	35520	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_021845	CCCAG	2	10	37466	37475	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_021845	TTGTC	2	10	48501	48510	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021845	AACAA	2	10	48636	48645	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021845	TGATC	2	10	63266	63275	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021845	AGCTG	2	10	65075	65084	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021845	ATTCT	2	10	68420	68429	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021845	TTGTT	2	10	74601	74610	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021845	TTTGG	2	10	82186	82195	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021845	AGAAA	2	10	92081	92090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021845	TAATT	2	10	95481	95490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021845	GTGTG	2	10	107657	107666	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021845	TCGCA	2	10	120777	120786	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_021845	TACTT	2	10	120867	120876	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021845	GGGAA	2	10	124067	124076	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021845	TCCTG	2	10	124715	124724	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_021845	AGATG	2	10	128500	128509	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021845	TTATC	2	10	164132	164141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021845	AATAT	2	10	166442	166451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.