MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021845	CTTT	2	8	225	232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021845	CTTT	2	8	342	349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021845	ATTT	2	8	2267	2274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021845	AGCA	2	8	2280	2287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021845	AAGA	2	8	3732	3739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021845	GGGT	2	8	9769	9776	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021845	TCAT	2	8	11158	11165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021845	ACTA	2	8	31749	31756	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021845	TTTA	2	8	31830	31837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021845	TGTT	2	8	34468	34475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021845	ATCT	2	8	34636	34643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021845	CAGC	2	8	34828	34835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021845	GCAT	2	8	34943	34950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021845	CATG	2	8	47656	47663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021845	GAAT	2	8	48065	48072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021845	ATCT	2	8	48359	48366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021845	TACA	2	8	48431	48438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021845	TCAT	2	8	48456	48463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021845	CAAA	2	8	48856	48863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021845	AATG	2	8	48872	48879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021845	AATG	2	8	48992	48999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021845	ATAA	2	8	49130	49137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021845	CCTT	2	8	50166	50173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021845	ATTC	2	8	50174	50181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021845	GCAT	2	8	50193	50200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021845	ACTC	2	8	52566	52573	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021845	CTTT	2	8	52881	52888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021845	AATG	2	8	52986	52993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021845	TACT	2	8	53134	53141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021845	TACA	2	8	59617	59624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021845	GTAA	2	8	62440	62447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021845	TTTA	2	8	63023	63030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021845	ATCC	2	8	63388	63395	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021845	CACT	2	8	64817	64824	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021845	TCAA	2	8	78323	78330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021845	GGCT	2	8	78657	78664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021845	TTAA	2	8	82974	82981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021845	TTAA	2	8	83055	83062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021845	GAAG	2	8	83954	83961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021845	ACTC	2	8	84014	84021	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021845	TCTT	2	8	86769	86776	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021845	ACGG	2	8	86942	86949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021845	TCAG	2	8	87006	87013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021845	TTTC	2	8	88048	88055	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021845	GGTT	2	8	88872	88879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021845	AGGA	2	8	89803	89810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021845	TTAT	2	8	91928	91935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021845	GCTT	2	8	91982	91989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021845	TCCT	2	8	94711	94718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021845	ATTC	2	8	94950	94957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021845	TAAA	2	8	99478	99485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021845	CATT	2	8	100937	100944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021845	CACG	2	8	101606	101613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021845	TTAC	2	8	102406	102413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021845	ATTA	2	8	103295	103302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021845	GATA	2	8	104244	104251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021845	TCAC	2	8	107370	107377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021845	GCGA	2	8	113857	113864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021845	TCAT	2	8	114096	114103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021845	GCCA	2	8	115401	115408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021845	GTTC	2	8	115507	115514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021845	TCGG	2	8	116483	116490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021845	TTGT	2	8	117268	117275	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021845	AAAT	2	8	118537	118544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021845	CAGC	2	8	118630	118637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021845	ATGA	2	8	123936	123943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021845	TATT	2	8	123993	124000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021845	GTTC	2	8	124583	124590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021845	ACGG	2	8	124841	124848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021845	CAAC	2	8	124960	124967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021845	GACC	2	8	126176	126183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021845	AATA	2	8	126643	126650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021845	CTTA	2	8	129124	129131	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021845	CGTA	2	8	129158	129165	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021845	ACGA	2	8	129249	129256	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021845	CCAT	2	8	129883	129890	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021845	AGTA	2	8	130626	130633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021845	GCTG	2	8	131599	131606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021845	GATG	2	8	144386	144393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021845	CAAT	2	8	152695	152702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021845	AAGA	2	8	153276	153283	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021845	TAAA	2	8	153295	153302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021845	CTTT	2	8	153998	154005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021845	TAAC	2	8	156460	156467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021845	TGTA	2	8	159047	159054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021845	CAAG	2	8	159195	159202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021845	TAAT	2	8	160429	160436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021845	GGAA	2	8	160542	160549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021845	CAAA	2	8	163920	163927	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021845	GCAA	2	8	164356	164363	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.