MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 340

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021845	TTAA	2	8	664	671	50 %	50 %	0 %	0 %	525937633
2	NC_021845	CAAT	2	8	1618	1625	50 %	25 %	0 %	25 %	525937634
3	NC_021845	TGCT	2	8	1835	1842	0 %	50 %	25 %	25 %	525937634
4	NC_021845	TATC	2	8	2038	2045	25 %	50 %	0 %	25 %	525937634
5	NC_021845	ATCC	2	8	2456	2463	25 %	25 %	0 %	50 %	525937635
6	NC_021845	GCTG	2	8	2748	2755	0 %	25 %	50 %	25 %	525937635
7	NC_021845	GATA	2	8	3014	3021	50 %	25 %	25 %	0 %	525937635
8	NC_021845	ATCC	2	8	3294	3301	25 %	25 %	0 %	50 %	525937635
9	NC_021845	CCAG	2	8	3549	3556	25 %	0 %	25 %	50 %	525937635
10	NC_021845	TGTA	2	8	3798	3805	25 %	50 %	25 %	0 %	525937636
11	NC_021845	CCTG	2	8	5469	5476	0 %	25 %	25 %	50 %	525937637
12	NC_021845	AATA	2	8	5519	5526	75 %	25 %	0 %	0 %	525937637
13	NC_021845	CATT	2	8	5740	5747	25 %	50 %	0 %	25 %	525937637
14	NC_021845	TTTA	2	8	5918	5925	25 %	75 %	0 %	0 %	525937637
15	NC_021845	TTAT	2	8	6239	6246	25 %	75 %	0 %	0 %	525937638
16	NC_021845	CAGT	2	8	6377	6384	25 %	25 %	25 %	25 %	525937638
17	NC_021845	ATCA	2	8	6799	6806	50 %	25 %	0 %	25 %	525937638
18	NC_021845	CCTG	2	8	6881	6888	0 %	25 %	25 %	50 %	525937638
19	NC_021845	ATTT	2	8	7444	7451	25 %	75 %	0 %	0 %	525937639
20	NC_021845	ATTT	2	8	8874	8881	25 %	75 %	0 %	0 %	525937641
21	NC_021845	AATT	2	8	9464	9471	50 %	50 %	0 %	0 %	525937641
22	NC_021845	ACTT	2	8	9842	9849	25 %	50 %	0 %	25 %	525937642
23	NC_021845	GTCA	2	8	10083	10090	25 %	25 %	25 %	25 %	525937642
24	NC_021845	TAAA	2	8	10219	10226	75 %	25 %	0 %	0 %	525937643
25	NC_021845	TACA	2	8	10236	10243	50 %	25 %	0 %	25 %	525937643
26	NC_021845	TGTT	2	8	11005	11012	0 %	75 %	25 %	0 %	525937643
27	NC_021845	AGAA	2	8	11559	11566	75 %	0 %	25 %	0 %	525937644
28	NC_021845	TCTT	2	8	11632	11639	0 %	75 %	0 %	25 %	525937644
29	NC_021845	TTGA	2	8	11915	11922	25 %	50 %	25 %	0 %	525937644
30	NC_021845	TCCA	2	8	11930	11937	25 %	25 %	0 %	50 %	525937644
31	NC_021845	CCAT	2	8	12310	12317	25 %	25 %	0 %	50 %	525937644
32	NC_021845	CTTT	2	8	13681	13688	0 %	75 %	0 %	25 %	525937645
33	NC_021845	TCAA	2	8	13800	13807	50 %	25 %	0 %	25 %	525937645
34	NC_021845	ACCT	2	8	14397	14404	25 %	25 %	0 %	50 %	525937646
35	NC_021845	ACCG	2	8	15306	15313	25 %	0 %	25 %	50 %	525937646
36	NC_021845	AACC	2	8	15787	15794	50 %	0 %	0 %	50 %	525937646
37	NC_021845	TGTT	2	8	15804	15811	0 %	75 %	25 %	0 %	525937646
38	NC_021845	CCTT	2	8	17101	17108	0 %	50 %	0 %	50 %	525937646
39	NC_021845	ATTG	2	8	17121	17128	25 %	50 %	25 %	0 %	525937646
40	NC_021845	CTGA	2	8	18494	18501	25 %	25 %	25 %	25 %	525937647
41	NC_021845	CCAT	2	8	18948	18955	25 %	25 %	0 %	50 %	525937649
42	NC_021845	CCAT	2	8	19220	19227	25 %	25 %	0 %	50 %	525937649
43	NC_021845	ACTG	2	8	19478	19485	25 %	25 %	25 %	25 %	525937649
44	NC_021845	CTTT	2	8	19583	19590	0 %	75 %	0 %	25 %	525937649
45	NC_021845	CGTA	2	8	19629	19636	25 %	25 %	25 %	25 %	525937649
46	NC_021845	TTTC	2	8	19732	19739	0 %	75 %	0 %	25 %	525937649
47	NC_021845	TGCT	2	8	19999	20006	0 %	50 %	25 %	25 %	525937649
48	NC_021845	TGCT	2	8	20139	20146	0 %	50 %	25 %	25 %	525937649
49	NC_021845	TCAA	2	8	20381	20388	50 %	25 %	0 %	25 %	525937650
50	NC_021845	CCAT	2	8	20462	20469	25 %	25 %	0 %	50 %	525937650
51	NC_021845	ATCA	2	8	20602	20609	50 %	25 %	0 %	25 %	525937650
52	NC_021845	ATTA	2	8	21039	21046	50 %	50 %	0 %	0 %	525937651
53	NC_021845	ACTT	2	8	21079	21086	25 %	50 %	0 %	25 %	525937651
54	NC_021845	GGTT	2	8	21304	21311	0 %	50 %	50 %	0 %	525937651
55	NC_021845	TATC	2	8	21508	21515	25 %	50 %	0 %	25 %	525937651
56	NC_021845	ACAG	2	8	22026	22033	50 %	0 %	25 %	25 %	525937651
57	NC_021845	TACT	2	8	22101	22108	25 %	50 %	0 %	25 %	525937651
58	NC_021845	TTCC	2	8	22226	22233	0 %	50 %	0 %	50 %	525937651
59	NC_021845	TGTC	2	8	22444	22451	0 %	50 %	25 %	25 %	525937651
60	NC_021845	ACCA	2	8	22850	22857	50 %	0 %	0 %	50 %	525937651
61	NC_021845	TCAG	2	8	22935	22942	25 %	25 %	25 %	25 %	525937651
62	NC_021845	AATC	2	8	24355	24362	50 %	25 %	0 %	25 %	525937651
63	NC_021845	GAAA	2	8	24857	24864	75 %	0 %	25 %	0 %	525937651
64	NC_021845	TTGA	2	8	24936	24943	25 %	50 %	25 %	0 %	525937651
65	NC_021845	TGAA	2	8	26792	26799	50 %	25 %	25 %	0 %	525937654
66	NC_021845	AAAT	2	8	27753	27760	75 %	25 %	0 %	0 %	525937655
67	NC_021845	TTTC	2	8	27865	27872	0 %	75 %	0 %	25 %	525937655
68	NC_021845	TTTC	2	8	28866	28873	0 %	75 %	0 %	25 %	525937656
69	NC_021845	AGTA	2	8	29246	29253	50 %	25 %	25 %	0 %	525937657
70	NC_021845	TTTC	2	8	29407	29414	0 %	75 %	0 %	25 %	525937658
71	NC_021845	TTTG	2	8	29509	29516	0 %	75 %	25 %	0 %	525937658
72	NC_021845	TAGG	2	8	29988	29995	25 %	25 %	50 %	0 %	525937658
73	NC_021845	ACAA	2	8	30217	30224	75 %	0 %	0 %	25 %	525937658
74	NC_021845	GAAA	2	8	31053	31060	75 %	0 %	25 %	0 %	525937659
75	NC_021845	ACTG	2	8	31162	31169	25 %	25 %	25 %	25 %	525937660
76	NC_021845	GTCA	2	8	31173	31180	25 %	25 %	25 %	25 %	525937660
77	NC_021845	GTTA	2	8	31556	31563	25 %	50 %	25 %	0 %	525937660
78	NC_021845	TATT	2	8	32092	32099	25 %	75 %	0 %	0 %	525937661
79	NC_021845	CTTC	2	8	32756	32763	0 %	50 %	0 %	50 %	525937661
80	NC_021845	CGTT	2	8	33624	33631	0 %	50 %	25 %	25 %	525937662
81	NC_021845	CTTT	2	8	38707	38714	0 %	75 %	0 %	25 %	525937663
82	NC_021845	GTTT	2	8	38820	38827	0 %	75 %	25 %	0 %	525937663
83	NC_021845	AGGA	2	8	38854	38861	50 %	0 %	50 %	0 %	525937663
84	NC_021845	TGAT	2	8	38877	38884	25 %	50 %	25 %	0 %	525937663
85	NC_021845	CATA	2	8	40301	40308	50 %	25 %	0 %	25 %	525937663
86	NC_021845	ACTT	2	8	40589	40596	25 %	50 %	0 %	25 %	525937663
87	NC_021845	GACA	2	8	40880	40887	50 %	0 %	25 %	25 %	525937663
88	NC_021845	ATCA	2	8	40995	41002	50 %	25 %	0 %	25 %	525937663
89	NC_021845	TTGT	2	8	41542	41549	0 %	75 %	25 %	0 %	525937664
90	NC_021845	CAGA	2	8	41887	41894	50 %	0 %	25 %	25 %	525937664
91	NC_021845	CCTT	2	8	42801	42808	0 %	50 %	0 %	50 %	525937665
92	NC_021845	TTAG	2	8	42840	42847	25 %	50 %	25 %	0 %	525937665
93	NC_021845	ATAA	2	8	43257	43264	75 %	25 %	0 %	0 %	525937666
94	NC_021845	AAAT	2	8	43290	43297	75 %	25 %	0 %	0 %	525937666
95	NC_021845	CCTT	2	8	44174	44181	0 %	50 %	0 %	50 %	525937667
96	NC_021845	TTCG	2	8	44830	44837	0 %	50 %	25 %	25 %	525937668
97	NC_021845	GATG	2	8	44898	44905	25 %	25 %	50 %	0 %	525937668
98	NC_021845	TATC	2	8	44920	44927	25 %	50 %	0 %	25 %	525937668
99	NC_021845	CATA	2	8	45485	45492	50 %	25 %	0 %	25 %	525937669
100	NC_021845	GCTG	2	8	46221	46228	0 %	25 %	50 %	25 %	525937669
101	NC_021845	GTTT	2	8	46296	46303	0 %	75 %	25 %	0 %	525937669
102	NC_021845	ACTC	2	8	46825	46832	25 %	25 %	0 %	50 %	525937670
103	NC_021845	TTCA	2	8	46988	46995	25 %	50 %	0 %	25 %	525937670
104	NC_021845	TGTA	2	8	47122	47129	25 %	50 %	25 %	0 %	525937670
105	NC_021845	TCTT	2	8	47205	47212	0 %	75 %	0 %	25 %	525937670
106	NC_021845	TCAT	2	8	47293	47300	25 %	50 %	0 %	25 %	525937670
107	NC_021845	GAAT	2	8	47514	47521	50 %	25 %	25 %	0 %	525937671
108	NC_021845	AACA	2	8	47937	47944	75 %	0 %	0 %	25 %	525937672
109	NC_021845	AAAG	2	8	48016	48023	75 %	0 %	25 %	0 %	525937672
110	NC_021845	ATCA	2	8	49544	49551	50 %	25 %	0 %	25 %	525937673
111	NC_021845	TGTT	2	8	49672	49679	0 %	75 %	25 %	0 %	525937673
112	NC_021845	ATAG	2	8	49797	49804	50 %	25 %	25 %	0 %	525937673
113	NC_021845	GGAT	2	8	50028	50035	25 %	25 %	50 %	0 %	525937673
114	NC_021845	TCAA	2	8	50665	50672	50 %	25 %	0 %	25 %	525937674
115	NC_021845	AAGG	3	12	50683	50694	50 %	0 %	50 %	0 %	525937674
116	NC_021845	TAAA	2	8	51221	51228	75 %	25 %	0 %	0 %	525937674
117	NC_021845	ATGT	2	8	51941	51948	25 %	50 %	25 %	0 %	525937676
118	NC_021845	TCAG	2	8	53266	53273	25 %	25 %	25 %	25 %	525937677
119	NC_021845	TTCA	2	8	53295	53302	25 %	50 %	0 %	25 %	525937677
120	NC_021845	TTCT	2	8	54040	54047	0 %	75 %	0 %	25 %	525937678
121	NC_021845	AGTT	2	8	54217	54224	25 %	50 %	25 %	0 %	525937678
122	NC_021845	GCAA	2	8	54276	54283	50 %	0 %	25 %	25 %	525937678
123	NC_021845	AAGT	2	8	54946	54953	50 %	25 %	25 %	0 %	525937679
124	NC_021845	GCTG	2	8	55338	55345	0 %	25 %	50 %	25 %	525937679
125	NC_021845	CGAA	2	8	55352	55359	50 %	0 %	25 %	25 %	525937679
126	NC_021845	CACT	2	8	56525	56532	25 %	25 %	0 %	50 %	525937680
127	NC_021845	CAAT	2	8	56679	56686	50 %	25 %	0 %	25 %	525937680
128	NC_021845	ACAA	2	8	56740	56747	75 %	0 %	0 %	25 %	525937680
129	NC_021845	GAGC	2	8	56856	56863	25 %	0 %	50 %	25 %	525937680
130	NC_021845	CGGA	2	8	57796	57803	25 %	0 %	50 %	25 %	525937680
131	NC_021845	ATGG	2	8	57804	57811	25 %	25 %	50 %	0 %	525937680
132	NC_021845	CAAC	2	8	57899	57906	50 %	0 %	0 %	50 %	525937681
133	NC_021845	ATTA	2	8	58066	58073	50 %	50 %	0 %	0 %	525937681
134	NC_021845	CTGG	2	8	58960	58967	0 %	25 %	50 %	25 %	525937684
135	NC_021845	CAAT	2	8	59096	59103	50 %	25 %	0 %	25 %	525937684
136	NC_021845	AATG	2	8	59371	59378	50 %	25 %	25 %	0 %	525937684
137	NC_021845	CGAG	2	8	60089	60096	25 %	0 %	50 %	25 %	525937685
138	NC_021845	AACT	2	8	60839	60846	50 %	25 %	0 %	25 %	525937685
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.