MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021845	TA	3	6	136	141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021845	TA	3	6	292	297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021845	AT	3	6	873	878	50 %	50 %	0 %	0 %	525937633
4	NC_021845	TA	3	6	1769	1774	50 %	50 %	0 %	0 %	525937634
5	NC_021845	AT	3	6	1889	1894	50 %	50 %	0 %	0 %	525937634
6	NC_021845	GA	3	6	3313	3318	50 %	0 %	50 %	0 %	525937635
7	NC_021845	AT	3	6	3539	3544	50 %	50 %	0 %	0 %	525937635
8	NC_021845	TC	3	6	3653	3658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021845	AT	3	6	4512	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	525937637
10	NC_021845	TC	3	6	5312	5317	0 %	50 %	0 %	50 %	525937637
11	NC_021845	AT	3	6	5551	5556	50 %	50 %	0 %	0 %	525937637
12	NC_021845	AC	4	8	8388	8395	50 %	0 %	0 %	50 %	525937640
13	NC_021845	TA	3	6	9437	9442	50 %	50 %	0 %	0 %	525937641
14	NC_021845	TC	3	6	9883	9888	0 %	50 %	0 %	50 %	525937642
15	NC_021845	TC	4	8	10009	10016	0 %	50 %	0 %	50 %	525937642
16	NC_021845	AT	3	6	10141	10146	50 %	50 %	0 %	0 %	525937642
17	NC_021845	TA	4	8	11102	11109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021845	GA	3	6	11747	11752	50 %	0 %	50 %	0 %	525937644
19	NC_021845	GA	3	6	12031	12036	50 %	0 %	50 %	0 %	525937644
20	NC_021845	CT	3	6	12141	12146	0 %	50 %	0 %	50 %	525937644
21	NC_021845	CA	3	6	16563	16568	50 %	0 %	0 %	50 %	525937646
22	NC_021845	AT	3	6	16609	16614	50 %	50 %	0 %	0 %	525937646
23	NC_021845	GT	3	6	16704	16709	0 %	50 %	50 %	0 %	525937646
24	NC_021845	TC	3	6	17009	17014	0 %	50 %	0 %	50 %	525937646
25	NC_021845	GA	3	6	17084	17089	50 %	0 %	50 %	0 %	525937646
26	NC_021845	GA	4	8	17454	17461	50 %	0 %	50 %	0 %	525937646
27	NC_021845	TA	3	6	17568	17573	50 %	50 %	0 %	0 %	525937647
28	NC_021845	CA	3	6	17777	17782	50 %	0 %	0 %	50 %	525937647
29	NC_021845	TA	3	6	18084	18089	50 %	50 %	0 %	0 %	525937647
30	NC_021845	TA	3	6	18105	18110	50 %	50 %	0 %	0 %	525937647
31	NC_021845	AG	3	6	18724	18729	50 %	0 %	50 %	0 %	525937648
32	NC_021845	GT	3	6	18857	18862	0 %	50 %	50 %	0 %	525937649
33	NC_021845	AC	3	6	20675	20680	50 %	0 %	0 %	50 %	525937650
34	NC_021845	CT	3	6	20739	20744	0 %	50 %	0 %	50 %	525937650
35	NC_021845	CT	3	6	21379	21384	0 %	50 %	0 %	50 %	525937651
36	NC_021845	AT	3	6	21576	21581	50 %	50 %	0 %	0 %	525937651
37	NC_021845	TG	3	6	22049	22054	0 %	50 %	50 %	0 %	525937651
38	NC_021845	TA	3	6	23176	23181	50 %	50 %	0 %	0 %	525937651
39	NC_021845	GA	3	6	23359	23364	50 %	0 %	50 %	0 %	525937651
40	NC_021845	TG	3	6	23508	23513	0 %	50 %	50 %	0 %	525937651
41	NC_021845	AG	3	6	26714	26719	50 %	0 %	50 %	0 %	525937654
42	NC_021845	TC	3	6	27295	27300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021845	CT	3	6	28101	28106	0 %	50 %	0 %	50 %	525937656
44	NC_021845	TG	3	6	28842	28847	0 %	50 %	50 %	0 %	525937656
45	NC_021845	CT	3	6	28996	29001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021845	GA	3	6	29684	29689	50 %	0 %	50 %	0 %	525937658
47	NC_021845	GT	3	6	29692	29697	0 %	50 %	50 %	0 %	525937658
48	NC_021845	TC	3	6	31509	31514	0 %	50 %	0 %	50 %	525937660
49	NC_021845	TG	3	6	32300	32305	0 %	50 %	50 %	0 %	525937661
50	NC_021845	CT	3	6	32916	32921	0 %	50 %	0 %	50 %	525937661
51	NC_021845	AG	3	6	34182	34187	50 %	0 %	50 %	0 %	525937662
52	NC_021845	AT	3	6	34388	34393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021845	CT	3	6	34525	34530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021845	GC	3	6	37848	37853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021845	TG	3	6	38797	38802	0 %	50 %	50 %	0 %	525937663
56	NC_021845	TG	3	6	40387	40392	0 %	50 %	50 %	0 %	525937663
57	NC_021845	AG	3	6	41460	41465	50 %	0 %	50 %	0 %	525937664
58	NC_021845	AG	3	6	42094	42099	50 %	0 %	50 %	0 %	525937665
59	NC_021845	GA	3	6	42262	42267	50 %	0 %	50 %	0 %	525937665
60	NC_021845	AC	3	6	42769	42774	50 %	0 %	0 %	50 %	525937665
61	NC_021845	CT	3	6	44167	44172	0 %	50 %	0 %	50 %	525937667
62	NC_021845	TG	3	6	44249	44254	0 %	50 %	50 %	0 %	525937667
63	NC_021845	TA	3	6	44571	44576	50 %	50 %	0 %	0 %	525937667
64	NC_021845	TA	3	6	45140	45145	50 %	50 %	0 %	0 %	525937668
65	NC_021845	AG	3	6	47635	47640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021845	TG	3	6	48779	48784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021845	AG	3	6	49414	49419	50 %	0 %	50 %	0 %	525937673
68	NC_021845	GC	3	6	49649	49654	0 %	0 %	50 %	50 %	525937673
69	NC_021845	CA	3	6	49690	49695	50 %	0 %	0 %	50 %	525937673
70	NC_021845	AT	3	6	53002	53007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021845	GA	4	8	54463	54470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021845	TC	3	6	56436	56441	0 %	50 %	0 %	50 %	525937680
73	NC_021845	TC	3	6	57244	57249	0 %	50 %	0 %	50 %	525937680
74	NC_021845	TG	3	6	58196	58201	0 %	50 %	50 %	0 %	525937682
75	NC_021845	TG	3	6	58642	58647	0 %	50 %	50 %	0 %	525937683
76	NC_021845	AG	3	6	58885	58890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021845	TC	3	6	62070	62075	0 %	50 %	0 %	50 %	525937685
78	NC_021845	AG	3	6	62655	62660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021845	AG	3	6	63519	63524	50 %	0 %	50 %	0 %	525937686
80	NC_021845	CT	3	6	63690	63695	0 %	50 %	0 %	50 %	525937686
81	NC_021845	CT	3	6	64129	64134	0 %	50 %	0 %	50 %	525937686
82	NC_021845	GC	3	6	65685	65690	0 %	0 %	50 %	50 %	525937687
83	NC_021845	GC	3	6	66956	66961	0 %	0 %	50 %	50 %	525937687
84	NC_021845	CG	3	6	68550	68555	0 %	0 %	50 %	50 %	525937688
85	NC_021845	GC	3	6	68818	68823	0 %	0 %	50 %	50 %	525937689
86	NC_021845	TC	3	6	70269	70274	0 %	50 %	0 %	50 %	525937693
87	NC_021845	GC	3	6	70512	70517	0 %	0 %	50 %	50 %	525937693
88	NC_021845	CA	3	6	70798	70803	50 %	0 %	0 %	50 %	525937694
89	NC_021845	CG	3	6	70968	70973	0 %	0 %	50 %	50 %	525937694
90	NC_021845	GC	4	8	71247	71254	0 %	0 %	50 %	50 %	525937694
91	NC_021845	CG	3	6	72191	72196	0 %	0 %	50 %	50 %	525937695
92	NC_021845	CG	3	6	72598	72603	0 %	0 %	50 %	50 %	525937695
93	NC_021845	AG	3	6	74409	74414	50 %	0 %	50 %	0 %	525937697
94	NC_021845	GC	3	6	75046	75051	0 %	0 %	50 %	50 %	525937698
95	NC_021845	GT	3	6	75913	75918	0 %	50 %	50 %	0 %	525937698
96	NC_021845	GC	4	8	76426	76433	0 %	0 %	50 %	50 %	525937698
97	NC_021845	GC	3	6	77213	77218	0 %	0 %	50 %	50 %	525937698
98	NC_021845	GC	3	6	77908	77913	0 %	0 %	50 %	50 %	525937626
99	NC_021845	GC	3	6	78844	78849	0 %	0 %	50 %	50 %	525937700
100	NC_021845	GT	3	6	79526	79531	0 %	50 %	50 %	0 %	525937702
101	NC_021845	GC	3	6	79915	79920	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
102	NC_021845	GC	3	6	80073	80078	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
103	NC_021845	CA	3	6	80550	80555	50 %	0 %	0 %	50 %	525937702
104	NC_021845	GC	3	6	80609	80614	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
105	NC_021845	GC	3	6	81400	81405	0 %	0 %	50 %	50 %	525937703
106	NC_021845	GC	3	6	82078	82083	0 %	0 %	50 %	50 %	525937705
107	NC_021845	AC	3	6	83222	83227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021845	GT	3	6	84844	84849	0 %	50 %	50 %	0 %	525937707
109	NC_021845	AT	3	6	86054	86059	50 %	50 %	0 %	0 %	525937707
110	NC_021845	AT	3	6	86546	86551	50 %	50 %	0 %	0 %	525937707
111	NC_021845	AT	3	6	86951	86956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021845	AC	3	6	87098	87103	50 %	0 %	0 %	50 %	525937708
113	NC_021845	GT	3	6	88198	88203	0 %	50 %	50 %	0 %	525937710
114	NC_021845	CT	3	6	89429	89434	0 %	50 %	0 %	50 %	525937711
115	NC_021845	GT	3	6	91238	91243	0 %	50 %	50 %	0 %	525937715
116	NC_021845	AG	3	6	91502	91507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021845	AG	3	6	92510	92515	50 %	0 %	50 %	0 %	525937718
118	NC_021845	AT	3	6	93158	93163	50 %	50 %	0 %	0 %	525937718
119	NC_021845	GT	3	6	94326	94331	0 %	50 %	50 %	0 %	525937718
120	NC_021845	CT	3	6	94900	94905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021845	TC	3	6	97585	97590	0 %	50 %	0 %	50 %	525937722
122	NC_021845	AT	3	6	98246	98251	50 %	50 %	0 %	0 %	525937723
123	NC_021845	GA	3	6	103620	103625	50 %	0 %	50 %	0 %	525937732
124	NC_021845	TG	3	6	103998	104003	0 %	50 %	50 %	0 %	525937732
125	NC_021845	TA	4	8	104652	104659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021845	AT	3	6	104775	104780	50 %	50 %	0 %	0 %	525937734
127	NC_021845	GA	3	6	106367	106372	50 %	0 %	50 %	0 %	525937734
128	NC_021845	AC	3	6	107180	107185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021845	AC	3	6	107445	107450	50 %	0 %	0 %	50 %	525937735
130	NC_021845	TC	3	6	107550	107555	0 %	50 %	0 %	50 %	525937735
131	NC_021845	AC	4	8	110787	110794	50 %	0 %	0 %	50 %	525937740
132	NC_021845	AG	3	6	111910	111915	50 %	0 %	50 %	0 %	525937741
133	NC_021845	TG	4	8	112138	112145	0 %	50 %	50 %	0 %	525937742
134	NC_021845	CA	3	6	113049	113054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021845	TA	3	6	113109	113114	50 %	50 %	0 %	0 %	525937743
136	NC_021845	CA	3	6	114837	114842	50 %	0 %	0 %	50 %	525937746
137	NC_021845	TA	3	6	115183	115188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021845	TA	4	8	116527	116534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021845	TC	3	6	119456	119461	0 %	50 %	0 %	50 %	525937628
140	NC_021845	AT	3	6	120016	120021	50 %	50 %	0 %	0 %	525937628
141	NC_021845	CA	3	6	121291	121296	50 %	0 %	0 %	50 %	525937755
142	NC_021845	CT	3	6	124314	124319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021845	CT	3	6	124728	124733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021845	TC	3	6	124768	124773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.