MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021845	TA	3	6	136	141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021845	TA	3	6	292	297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021845	TC	3	6	3653	3658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021845	TA	4	8	11102	11109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021845	TC	3	6	27295	27300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021845	CT	3	6	28996	29001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021845	AT	3	6	34388	34393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021845	CT	3	6	34525	34530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021845	GC	3	6	37848	37853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021845	AG	3	6	47635	47640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021845	TG	3	6	48779	48784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021845	AT	3	6	53002	53007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021845	GA	4	8	54463	54470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021845	AG	3	6	58885	58890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021845	AG	3	6	62655	62660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021845	AC	3	6	83222	83227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021845	AT	3	6	86951	86956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021845	AG	3	6	91502	91507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021845	CT	3	6	94900	94905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021845	TA	4	8	104652	104659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021845	AC	3	6	107180	107185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021845	CA	3	6	113049	113054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021845	TA	3	6	115183	115188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021845	TA	4	8	116527	116534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021845	CT	3	6	124314	124319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021845	CT	3	6	124728	124733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021845	TC	3	6	124768	124773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021845	AG	3	6	124972	124977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021845	TA	3	6	127637	127642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021845	TC	3	6	129134	129139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021845	TC	3	6	129684	129689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021845	CA	3	6	129720	129725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021845	AG	3	6	129899	129904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021845	TC	3	6	130051	130056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021845	GA	3	6	130649	130654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021845	CT	3	6	131470	131475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021845	AT	3	6	142125	142130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021845	AT	3	6	144198	144203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021845	AG	3	6	153284	153289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021845	AT	3	6	153322	153327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021845	AT	3	6	153985	153990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021845	GT	3	6	154860	154865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021845	TC	3	6	159090	159095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021845	GA	3	6	164368	164373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021845	CT	3	6	166500	166505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.