MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021845	T	6	6	580	585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021845	A	6	6	2360	2365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021845	C	7	7	2383	2389	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_021845	A	6	6	2707	2712	100 %	0 %	0 %	0 %	525937635
5	NC_021845	A	6	6	3304	3309	100 %	0 %	0 %	0 %	525937635
6	NC_021845	A	6	6	5441	5446	100 %	0 %	0 %	0 %	525937637
7	NC_021845	A	6	6	6071	6076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021845	T	6	6	6633	6638	0 %	100 %	0 %	0 %	525937638
9	NC_021845	T	7	7	6830	6836	0 %	100 %	0 %	0 %	525937638
10	NC_021845	T	6	6	7071	7076	0 %	100 %	0 %	0 %	525937638
11	NC_021845	A	8	8	7271	7278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021845	T	6	6	7520	7525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021845	T	6	6	7639	7644	0 %	100 %	0 %	0 %	525937640
14	NC_021845	T	8	8	9012	9019	0 %	100 %	0 %	0 %	525937641
15	NC_021845	T	7	7	9638	9644	0 %	100 %	0 %	0 %	525937641
16	NC_021845	A	8	8	9668	9675	100 %	0 %	0 %	0 %	525937641
17	NC_021845	T	7	7	10091	10097	0 %	100 %	0 %	0 %	525937642
18	NC_021845	T	6	6	10506	10511	0 %	100 %	0 %	0 %	525937643
19	NC_021845	T	6	6	10538	10543	0 %	100 %	0 %	0 %	525937643
20	NC_021845	T	6	6	11128	11133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021845	A	6	6	12176	12181	100 %	0 %	0 %	0 %	525937644
22	NC_021845	T	6	6	12404	12409	0 %	100 %	0 %	0 %	525937644
23	NC_021845	T	6	6	13354	13359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021845	T	6	6	13362	13367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021845	T	6	6	13494	13499	0 %	100 %	0 %	0 %	525937645
26	NC_021845	A	7	7	13831	13837	100 %	0 %	0 %	0 %	525937645
27	NC_021845	A	6	6	14282	14287	100 %	0 %	0 %	0 %	525937645
28	NC_021845	A	6	6	14298	14303	100 %	0 %	0 %	0 %	525937645
29	NC_021845	A	6	6	14323	14328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021845	T	6	6	14796	14801	0 %	100 %	0 %	0 %	525937646
31	NC_021845	T	7	7	16329	16335	0 %	100 %	0 %	0 %	525937646
32	NC_021845	T	7	7	16718	16724	0 %	100 %	0 %	0 %	525937646
33	NC_021845	T	7	7	17630	17636	0 %	100 %	0 %	0 %	525937647
34	NC_021845	T	6	6	18603	18608	0 %	100 %	0 %	0 %	525937647
35	NC_021845	T	7	7	19256	19262	0 %	100 %	0 %	0 %	525937649
36	NC_021845	T	6	6	19371	19376	0 %	100 %	0 %	0 %	525937649
37	NC_021845	A	6	6	19392	19397	100 %	0 %	0 %	0 %	525937649
38	NC_021845	T	8	8	20017	20024	0 %	100 %	0 %	0 %	525937649
39	NC_021845	T	6	6	20241	20246	0 %	100 %	0 %	0 %	525937649
40	NC_021845	A	6	6	20437	20442	100 %	0 %	0 %	0 %	525937650
41	NC_021845	A	6	6	21000	21005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021845	T	6	6	23002	23007	0 %	100 %	0 %	0 %	525937651
43	NC_021845	T	7	7	23125	23131	0 %	100 %	0 %	0 %	525937651
44	NC_021845	C	7	7	23416	23422	0 %	0 %	0 %	100 %	525937651
45	NC_021845	T	7	7	23829	23835	0 %	100 %	0 %	0 %	525937651
46	NC_021845	T	6	6	23895	23900	0 %	100 %	0 %	0 %	525937651
47	NC_021845	T	6	6	24968	24973	0 %	100 %	0 %	0 %	525937651
48	NC_021845	A	7	7	25094	25100	100 %	0 %	0 %	0 %	525937651
49	NC_021845	A	7	7	25426	25432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021845	T	6	6	25536	25541	0 %	100 %	0 %	0 %	525937652
51	NC_021845	T	7	7	25846	25852	0 %	100 %	0 %	0 %	525937652
52	NC_021845	A	6	6	27020	27025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021845	T	6	6	27107	27112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021845	A	9	9	27224	27232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021845	C	6	6	27812	27817	0 %	0 %	0 %	100 %	525937655
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61	NC_021845	A	7	7	29752	29758	100 %	0 %	0 %	0 %	525937658
62	NC_021845	A	7	7	30864	30870	100 %	0 %	0 %	0 %	525937659
63	NC_021845	A	7	7	31648	31654	100 %	0 %	0 %	0 %	525937660
64	NC_021845	A	6	6	31740	31745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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66	NC_021845	T	7	7	32408	32414	0 %	100 %	0 %	0 %	525937661
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69	NC_021845	T	6	6	33274	33279	0 %	100 %	0 %	0 %	525937662
70	NC_021845	T	6	6	33771	33776	0 %	100 %	0 %	0 %	525937662
71	NC_021845	T	6	6	34055	34060	0 %	100 %	0 %	0 %	525937662
72	NC_021845	A	7	7	34173	34179	100 %	0 %	0 %	0 %	525937662
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75	NC_021845	T	6	6	34489	34494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021845	A	6	6	34911	34916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_021845	A	6	6	48269	48274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_021845	T	7	7	52925	52931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_021845	T	7	7	56107	56113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.