MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 11043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021844	TGCG	2	8	533	540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021844	GCCT	2	8	1944	1951	0 %	25 %	25 %	50 %	525945527
3	NC_021844	ACTT	2	8	2148	2155	25 %	50 %	0 %	25 %	525945527
4	NC_021844	TGGC	2	8	2334	2341	0 %	25 %	50 %	25 %	525949035
5	NC_021844	CGCC	2	8	3043	3050	0 %	0 %	25 %	75 %	525949035
6	NC_021844	GGTT	2	8	3178	3185	0 %	50 %	50 %	0 %	525949035
7	NC_021844	ATTC	2	8	3391	3398	25 %	50 %	0 %	25 %	525949035
8	NC_021844	AGCC	2	8	4068	4075	25 %	0 %	25 %	50 %	525945528
9	NC_021844	TCAC	2	8	4612	4619	25 %	25 %	0 %	50 %	525945528
10	NC_021844	TAAT	2	8	4967	4974	50 %	50 %	0 %	0 %	525945529
11	NC_021844	CACG	2	8	5039	5046	25 %	0 %	25 %	50 %	525945529
12	NC_021844	CAAC	2	8	5258	5265	50 %	0 %	0 %	50 %	525945529
13	NC_021844	GCTG	2	8	6101	6108	0 %	25 %	50 %	25 %	525949036
14	NC_021844	AGTC	2	8	6380	6387	25 %	25 %	25 %	25 %	525949036
15	NC_021844	CAGA	2	8	7010	7017	50 %	0 %	25 %	25 %	525945530
16	NC_021844	GATC	2	8	7427	7434	25 %	25 %	25 %	25 %	525945530
17	NC_021844	CATG	2	8	7750	7757	25 %	25 %	25 %	25 %	525945531
18	NC_021844	TCTT	2	8	7860	7867	0 %	75 %	0 %	25 %	525945531
19	NC_021844	TCGG	2	8	8649	8656	0 %	25 %	50 %	25 %	525945531
20	NC_021844	GTGA	2	8	9324	9331	25 %	25 %	50 %	0 %	525945532
21	NC_021844	TAGC	2	8	10051	10058	25 %	25 %	25 %	25 %	525945533
22	NC_021844	AGAA	2	8	10524	10531	75 %	0 %	25 %	0 %	525945533
23	NC_021844	TAAC	2	8	11360	11367	50 %	25 %	0 %	25 %	525945533
24	NC_021844	TGAA	2	8	11795	11802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021844	GCCC	2	8	12153	12160	0 %	0 %	25 %	75 %	525945534
26	NC_021844	AACG	2	8	12410	12417	50 %	0 %	25 %	25 %	525945534
27	NC_021844	ACGC	2	8	13694	13701	25 %	0 %	25 %	50 %	525945535
28	NC_021844	AATC	2	8	16446	16453	50 %	25 %	0 %	25 %	525945537
29	NC_021844	GAGC	2	8	16641	16648	25 %	0 %	50 %	25 %	525945538
30	NC_021844	TAAA	2	8	17352	17359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021844	CGAT	2	8	17693	17700	25 %	25 %	25 %	25 %	525945539
32	NC_021844	CAGG	2	8	17701	17708	25 %	0 %	50 %	25 %	525945539
33	NC_021844	CCAT	2	8	18010	18017	25 %	25 %	0 %	50 %	525945539
34	NC_021844	TCGA	2	8	18310	18317	25 %	25 %	25 %	25 %	525945539
35	NC_021844	TCGT	2	8	18482	18489	0 %	50 %	25 %	25 %	525945539
36	NC_021844	TCGC	2	8	19130	19137	0 %	25 %	25 %	50 %	525945539
37	NC_021844	CGAA	2	8	19223	19230	50 %	0 %	25 %	25 %	525945539
38	NC_021844	GCCC	2	8	19396	19403	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_021844	CAAA	2	8	20078	20085	75 %	0 %	0 %	25 %	525945540
40	NC_021844	TTCA	2	8	20752	20759	25 %	50 %	0 %	25 %	525949037
41	NC_021844	AAGC	2	8	21386	21393	50 %	0 %	25 %	25 %	525945541
42	NC_021844	AAAC	2	8	21939	21946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021844	TAGA	2	8	22238	22245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021844	AGAA	2	8	22366	22373	75 %	0 %	25 %	0 %	525945542
45	NC_021844	CGAC	2	8	22438	22445	25 %	0 %	25 %	50 %	525945542
46	NC_021844	CAAA	2	8	22492	22499	75 %	0 %	0 %	25 %	525945542
47	NC_021844	GAAC	2	8	22861	22868	50 %	0 %	25 %	25 %	525945543
48	NC_021844	CGCT	2	8	22908	22915	0 %	25 %	25 %	50 %	525945543
49	NC_021844	CGGG	2	8	23201	23208	0 %	0 %	75 %	25 %	525945543
50	NC_021844	ATCG	2	8	23696	23703	25 %	25 %	25 %	25 %	525945544
51	NC_021844	ACTG	2	8	24256	24263	25 %	25 %	25 %	25 %	525945544
52	NC_021844	GCAG	2	8	24283	24290	25 %	0 %	50 %	25 %	525945544
53	NC_021844	CGTT	2	8	24303	24310	0 %	50 %	25 %	25 %	525945544
54	NC_021844	CGAC	2	8	25124	25131	25 %	0 %	25 %	50 %	525945545
55	NC_021844	GGTA	2	8	26006	26013	25 %	25 %	50 %	0 %	525945546
56	NC_021844	TATC	2	8	27358	27365	25 %	50 %	0 %	25 %	525945547
57	NC_021844	TGGT	2	8	28011	28018	0 %	50 %	50 %	0 %	525945548
58	NC_021844	TTAT	2	8	28609	28616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021844	GTTG	2	8	29384	29391	0 %	50 %	50 %	0 %	525945549
60	NC_021844	AGGA	2	8	29459	29466	50 %	0 %	50 %	0 %	525945549
61	NC_021844	ACGG	2	8	29506	29513	25 %	0 %	50 %	25 %	525945549
62	NC_021844	ACCT	2	8	29932	29939	25 %	25 %	0 %	50 %	525945549
63	NC_021844	CTGG	2	8	31467	31474	0 %	25 %	50 %	25 %	525949039
64	NC_021844	AGTA	2	8	32224	32231	50 %	25 %	25 %	0 %	525949039
65	NC_021844	TTCT	2	8	32298	32305	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021844	GCCT	2	8	32340	32347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021844	AGCC	2	8	32497	32504	25 %	0 %	25 %	50 %	525945550
68	NC_021844	CCAG	2	8	32681	32688	25 %	0 %	25 %	50 %	525945550
69	NC_021844	CTCA	2	8	32946	32953	25 %	25 %	0 %	50 %	525945550
70	NC_021844	CAGC	2	8	32991	32998	25 %	0 %	25 %	50 %	525945550
71	NC_021844	TGTC	2	8	33200	33207	0 %	50 %	25 %	25 %	525945550
72	NC_021844	CCGA	2	8	34363	34370	25 %	0 %	25 %	50 %	525945551
73	NC_021844	TTAA	2	8	34774	34781	50 %	50 %	0 %	0 %	525945551
74	NC_021844	TGGC	2	8	34799	34806	0 %	25 %	50 %	25 %	525945551
75	NC_021844	CTGG	2	8	35641	35648	0 %	25 %	50 %	25 %	525945552
76	NC_021844	GGGA	2	8	35739	35746	25 %	0 %	75 %	0 %	525945552
77	NC_021844	TACC	2	8	36774	36781	25 %	25 %	0 %	50 %	525945553
78	NC_021844	AGAA	2	8	36782	36789	75 %	0 %	25 %	0 %	525945553
79	NC_021844	ACCA	2	8	37435	37442	50 %	0 %	0 %	50 %	525945553
80	NC_021844	ATTA	2	8	37673	37680	50 %	50 %	0 %	0 %	525945553
81	NC_021844	GGCT	2	8	38128	38135	0 %	25 %	50 %	25 %	525945554
82	NC_021844	CGAA	2	8	38627	38634	50 %	0 %	25 %	25 %	525945554
83	NC_021844	TGTT	2	8	39184	39191	0 %	75 %	25 %	0 %	525945555
84	NC_021844	GGGC	2	8	39577	39584	0 %	0 %	75 %	25 %	525945555
85	NC_021844	GCGT	2	8	40089	40096	0 %	25 %	50 %	25 %	525949040
86	NC_021844	TTGA	2	8	40436	40443	25 %	50 %	25 %	0 %	525949040
87	NC_021844	TGCG	2	8	40750	40757	0 %	25 %	50 %	25 %	525945556
88	NC_021844	GCGA	2	8	40783	40790	25 %	0 %	50 %	25 %	525945556
89	NC_021844	TATC	2	8	41004	41011	25 %	50 %	0 %	25 %	525945556
90	NC_021844	GATC	2	8	41437	41444	25 %	25 %	25 %	25 %	525945557
91	NC_021844	GTTC	2	8	42930	42937	0 %	50 %	25 %	25 %	525945558
92	NC_021844	TGTT	2	8	43074	43081	0 %	75 %	25 %	0 %	525945558
93	NC_021844	CAGC	2	8	43938	43945	25 %	0 %	25 %	50 %	525945559
94	NC_021844	GCTG	2	8	43954	43961	0 %	25 %	50 %	25 %	525945559
95	NC_021844	TCAT	2	8	44431	44438	25 %	50 %	0 %	25 %	525945560
96	NC_021844	GCAG	2	8	44815	44822	25 %	0 %	50 %	25 %	525945560
97	NC_021844	AAGG	2	8	45041	45048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021844	AATC	2	8	45516	45523	50 %	25 %	0 %	25 %	525945561
99	NC_021844	AACC	2	8	46255	46262	50 %	0 %	0 %	50 %	525945562
100	NC_021844	AGCC	2	8	46625	46632	25 %	0 %	25 %	50 %	525945562
101	NC_021844	TTAC	2	8	47356	47363	25 %	50 %	0 %	25 %	525945563
102	NC_021844	AGTG	2	8	47660	47667	25 %	25 %	50 %	0 %	525945563
103	NC_021844	CGTC	2	8	47793	47800	0 %	25 %	25 %	50 %	525945563
104	NC_021844	CGCT	2	8	48376	48383	0 %	25 %	25 %	50 %	525945563
105	NC_021844	GTTC	2	8	50069	50076	0 %	50 %	25 %	25 %	525945564
106	NC_021844	GATA	2	8	50183	50190	50 %	25 %	25 %	0 %	525945564
107	NC_021844	CTGG	2	8	50344	50351	0 %	25 %	50 %	25 %	525945564
108	NC_021844	CGGG	2	8	50536	50543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021844	CAAC	2	8	50600	50607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021844	ACAT	2	8	52308	52315	50 %	25 %	0 %	25 %	525945566
111	NC_021844	CCAA	2	8	52340	52347	50 %	0 %	0 %	50 %	525945566
112	NC_021844	TTGG	2	8	52760	52767	0 %	50 %	50 %	0 %	525945566
113	NC_021844	CGTG	2	8	52899	52906	0 %	25 %	50 %	25 %	525945566
114	NC_021844	CCGG	2	8	52952	52959	0 %	0 %	50 %	50 %	525945566
115	NC_021844	ACCA	2	8	53155	53162	50 %	0 %	0 %	50 %	525945566
116	NC_021844	GGCG	2	8	53191	53198	0 %	0 %	75 %	25 %	525945566
117	NC_021844	CTGC	2	8	53642	53649	0 %	25 %	25 %	50 %	525945567
118	NC_021844	CGAC	2	8	53823	53830	25 %	0 %	25 %	50 %	525945567
119	NC_021844	GCGT	2	8	54150	54157	0 %	25 %	50 %	25 %	525945567
120	NC_021844	CTAT	2	8	54684	54691	25 %	50 %	0 %	25 %	525945568
121	NC_021844	GGCG	2	8	55131	55138	0 %	0 %	75 %	25 %	525945568
122	NC_021844	AGAC	2	8	55239	55246	50 %	0 %	25 %	25 %	525945568
123	NC_021844	GCGG	2	8	55437	55444	0 %	0 %	75 %	25 %	525945568
124	NC_021844	GTAT	2	8	55732	55739	25 %	50 %	25 %	0 %	525945569
125	NC_021844	GAAC	2	8	56720	56727	50 %	0 %	25 %	25 %	525945569
126	NC_021844	CAGT	2	8	57593	57600	25 %	25 %	25 %	25 %	525945569
127	NC_021844	GGCG	2	8	58167	58174	0 %	0 %	75 %	25 %	525945570
128	NC_021844	GTTT	2	8	58510	58517	0 %	75 %	25 %	0 %	525945570
129	NC_021844	CTGC	2	8	59078	59085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021844	GCAG	2	8	59089	59096	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021844	TGGT	2	8	59120	59127	0 %	50 %	50 %	0 %	525945571
132	NC_021844	GCAT	2	8	59635	59642	25 %	25 %	25 %	25 %	525945571
133	NC_021844	TAAT	2	8	60310	60317	50 %	50 %	0 %	0 %	525945572
134	NC_021844	AAAT	2	8	60411	60418	75 %	25 %	0 %	0 %	525945572
135	NC_021844	GCCA	2	8	60737	60744	25 %	0 %	25 %	50 %	525945572
136	NC_021844	GACT	2	8	61114	61121	25 %	25 %	25 %	25 %	525945572
137	NC_021844	AATA	2	8	61498	61505	75 %	25 %	0 %	0 %	525945572
138	NC_021844	ACAG	2	8	61515	61522	50 %	0 %	25 %	25 %	525945572
139	NC_021844	ATGG	2	8	61907	61914	25 %	25 %	50 %	0 %	525945573
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141	NC_021844	CCCG	2	8	62714	62721	0 %	0 %	25 %	75 %	525945573
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