MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 9348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021844	CA	3	6	1224	1229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021844	TG	3	6	1381	1386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021844	GA	3	6	2280	2285	50 %	0 %	50 %	0 %	525945527
4	NC_021844	GC	3	6	2324	2329	0 %	0 %	50 %	50 %	525949035
5	NC_021844	GC	3	6	2586	2591	0 %	0 %	50 %	50 %	525949035
6	NC_021844	AT	3	6	2860	2865	50 %	50 %	0 %	0 %	525949035
7	NC_021844	GC	3	6	3855	3860	0 %	0 %	50 %	50 %	525945528
8	NC_021844	GA	3	6	4643	4648	50 %	0 %	50 %	0 %	525945528
9	NC_021844	GC	3	6	4760	4765	0 %	0 %	50 %	50 %	525945529
10	NC_021844	GC	4	8	5981	5988	0 %	0 %	50 %	50 %	525949036
11	NC_021844	AG	3	6	6918	6923	50 %	0 %	50 %	0 %	525945530
12	NC_021844	GC	3	6	6924	6929	0 %	0 %	50 %	50 %	525945530
13	NC_021844	AG	3	6	8619	8624	50 %	0 %	50 %	0 %	525945531
14	NC_021844	AG	3	6	8729	8734	50 %	0 %	50 %	0 %	525945531
15	NC_021844	GA	3	6	9096	9101	50 %	0 %	50 %	0 %	525945531
16	NC_021844	GT	3	6	9267	9272	0 %	50 %	50 %	0 %	525945532
17	NC_021844	GC	4	8	9863	9870	0 %	0 %	50 %	50 %	525945533
18	NC_021844	GC	4	8	10220	10227	0 %	0 %	50 %	50 %	525945533
19	NC_021844	GC	3	6	11379	11384	0 %	0 %	50 %	50 %	525945533
20	NC_021844	GC	3	6	11446	11451	0 %	0 %	50 %	50 %	525945533
21	NC_021844	TG	3	6	11822	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021844	GC	3	6	12208	12213	0 %	0 %	50 %	50 %	525945534
23	NC_021844	CT	3	6	12272	12277	0 %	50 %	0 %	50 %	525945534
24	NC_021844	GC	3	6	13170	13175	0 %	0 %	50 %	50 %	525945534
25	NC_021844	TC	3	6	13752	13757	0 %	50 %	0 %	50 %	525945535
26	NC_021844	AC	3	6	13878	13883	50 %	0 %	0 %	50 %	525945535
27	NC_021844	CG	3	6	14459	14464	0 %	0 %	50 %	50 %	525945535
28	NC_021844	GC	3	6	15310	15315	0 %	0 %	50 %	50 %	525945536
29	NC_021844	CG	3	6	15392	15397	0 %	0 %	50 %	50 %	525945536
30	NC_021844	GA	3	6	15634	15639	50 %	0 %	50 %	0 %	525945536
31	NC_021844	GA	3	6	15895	15900	50 %	0 %	50 %	0 %	525945536
32	NC_021844	AC	3	6	17581	17586	50 %	0 %	0 %	50 %	525945539
33	NC_021844	CG	3	6	17914	17919	0 %	0 %	50 %	50 %	525945539
34	NC_021844	CG	3	6	18524	18529	0 %	0 %	50 %	50 %	525945539
35	NC_021844	CG	3	6	18648	18653	0 %	0 %	50 %	50 %	525945539
36	NC_021844	GC	3	6	18865	18870	0 %	0 %	50 %	50 %	525945539
37	NC_021844	CT	3	6	18980	18985	0 %	50 %	0 %	50 %	525945539
38	NC_021844	CT	3	6	19480	19485	0 %	50 %	0 %	50 %	525945540
39	NC_021844	GA	3	6	19934	19939	50 %	0 %	50 %	0 %	525945540
40	NC_021844	AG	3	6	20232	20237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021844	TG	3	6	20446	20451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021844	CG	3	6	21511	21516	0 %	0 %	50 %	50 %	525945541
43	NC_021844	TC	3	6	21711	21716	0 %	50 %	0 %	50 %	525945541
44	NC_021844	TC	3	6	22882	22887	0 %	50 %	0 %	50 %	525945543
45	NC_021844	GC	3	6	22890	22895	0 %	0 %	50 %	50 %	525945543
46	NC_021844	GC	3	6	23934	23939	0 %	0 %	50 %	50 %	525945544
47	NC_021844	TC	3	6	24504	24509	0 %	50 %	0 %	50 %	525945544
48	NC_021844	CG	3	6	26840	26845	0 %	0 %	50 %	50 %	525945546
49	NC_021844	CG	4	8	26946	26953	0 %	0 %	50 %	50 %	525945546
50	NC_021844	CT	3	6	30311	30316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021844	TG	3	6	30400	30405	0 %	50 %	50 %	0 %	525949039
52	NC_021844	CT	3	6	31508	31513	0 %	50 %	0 %	50 %	525949039
53	NC_021844	GC	3	6	31846	31851	0 %	0 %	50 %	50 %	525949039
54	NC_021844	TC	3	6	34586	34591	0 %	50 %	0 %	50 %	525945551
55	NC_021844	GC	3	6	34646	34651	0 %	0 %	50 %	50 %	525945551
56	NC_021844	CT	3	6	34825	34830	0 %	50 %	0 %	50 %	525945551
57	NC_021844	CT	3	6	35536	35541	0 %	50 %	0 %	50 %	525945552
58	NC_021844	AG	3	6	37374	37379	50 %	0 %	50 %	0 %	525945553
59	NC_021844	TG	3	6	37455	37460	0 %	50 %	50 %	0 %	525945553
60	NC_021844	GC	3	6	37871	37876	0 %	0 %	50 %	50 %	525945554
61	NC_021844	GC	3	6	38285	38290	0 %	0 %	50 %	50 %	525945554
62	NC_021844	CG	3	6	38932	38937	0 %	0 %	50 %	50 %	525945555
63	NC_021844	GC	3	6	39946	39951	0 %	0 %	50 %	50 %	525949040
64	NC_021844	GC	3	6	40015	40020	0 %	0 %	50 %	50 %	525949040
65	NC_021844	CT	4	8	40204	40211	0 %	50 %	0 %	50 %	525949040
66	NC_021844	GC	3	6	40241	40246	0 %	0 %	50 %	50 %	525949040
67	NC_021844	CG	3	6	40974	40979	0 %	0 %	50 %	50 %	525945556
68	NC_021844	CG	3	6	41377	41382	0 %	0 %	50 %	50 %	525945557
69	NC_021844	GC	3	6	41506	41511	0 %	0 %	50 %	50 %	525945557
70	NC_021844	GC	3	6	41780	41785	0 %	0 %	50 %	50 %	525945557
71	NC_021844	CG	3	6	41792	41797	0 %	0 %	50 %	50 %	525945557
72	NC_021844	GC	3	6	41949	41954	0 %	0 %	50 %	50 %	525945557
73	NC_021844	CA	3	6	42116	42121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021844	GC	3	6	43269	43274	0 %	0 %	50 %	50 %	525945558
75	NC_021844	GC	4	8	43765	43772	0 %	0 %	50 %	50 %	525945559
76	NC_021844	GC	3	6	44378	44383	0 %	0 %	50 %	50 %	525945560
77	NC_021844	AG	3	6	44850	44855	50 %	0 %	50 %	0 %	525945560
78	NC_021844	CA	3	6	45113	45118	50 %	0 %	0 %	50 %	525945561
79	NC_021844	GC	3	6	45208	45213	0 %	0 %	50 %	50 %	525945561
80	NC_021844	CG	3	6	45600	45605	0 %	0 %	50 %	50 %	525945561
81	NC_021844	GC	3	6	46209	46214	0 %	0 %	50 %	50 %	525945562
82	NC_021844	CG	3	6	47964	47969	0 %	0 %	50 %	50 %	525945563
83	NC_021844	GC	3	6	48097	48102	0 %	0 %	50 %	50 %	525945563
84	NC_021844	AG	3	6	48166	48171	50 %	0 %	50 %	0 %	525945563
85	NC_021844	GC	3	6	48546	48551	0 %	0 %	50 %	50 %	525945563
86	NC_021844	CG	3	6	48630	48635	0 %	0 %	50 %	50 %	525945563
87	NC_021844	GC	3	6	48814	48819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021844	GA	3	6	49496	49501	50 %	0 %	50 %	0 %	525945564
89	NC_021844	GA	3	6	50786	50791	50 %	0 %	50 %	0 %	525945565
90	NC_021844	GC	3	6	51571	51576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021844	GC	4	8	52351	52358	0 %	0 %	50 %	50 %	525945566
92	NC_021844	GC	3	6	52474	52479	0 %	0 %	50 %	50 %	525945566
93	NC_021844	CG	4	8	53473	53480	0 %	0 %	50 %	50 %	525945567
94	NC_021844	CG	3	6	53981	53986	0 %	0 %	50 %	50 %	525945567
95	NC_021844	CG	3	6	54116	54121	0 %	0 %	50 %	50 %	525945567
96	NC_021844	CT	3	6	54128	54133	0 %	50 %	0 %	50 %	525945567
97	NC_021844	GC	3	6	54499	54504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021844	AC	4	8	54528	54535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021844	AT	3	6	54556	54561	50 %	50 %	0 %	0 %	525945568
100	NC_021844	GC	3	6	55344	55349	0 %	0 %	50 %	50 %	525945568
101	NC_021844	CG	3	6	55368	55373	0 %	0 %	50 %	50 %	525945568
102	NC_021844	GC	3	6	56848	56853	0 %	0 %	50 %	50 %	525945569
103	NC_021844	GC	3	6	57027	57032	0 %	0 %	50 %	50 %	525945569
104	NC_021844	AT	3	6	58132	58137	50 %	50 %	0 %	0 %	525945570
105	NC_021844	GC	3	6	58180	58185	0 %	0 %	50 %	50 %	525945570
106	NC_021844	CG	3	6	58962	58967	0 %	0 %	50 %	50 %	525945570
107	NC_021844	TA	3	6	59479	59484	50 %	50 %	0 %	0 %	525945571
108	NC_021844	AG	3	6	60445	60450	50 %	0 %	50 %	0 %	525945572
109	NC_021844	AT	3	6	60587	60592	50 %	50 %	0 %	0 %	525945572
110	NC_021844	TC	3	6	61805	61810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021844	AG	3	6	62955	62960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021844	CT	3	6	62980	62985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021844	GC	3	6	63716	63721	0 %	0 %	50 %	50 %	525945575
114	NC_021844	AC	3	6	63825	63830	50 %	0 %	0 %	50 %	525945575
115	NC_021844	TG	3	6	63985	63990	0 %	50 %	50 %	0 %	525945575
116	NC_021844	GT	3	6	64843	64848	0 %	50 %	50 %	0 %	525949041
117	NC_021844	GC	3	6	64949	64954	0 %	0 %	50 %	50 %	525949041
118	NC_021844	TG	3	6	65041	65046	0 %	50 %	50 %	0 %	525949041
119	NC_021844	GC	3	6	65713	65718	0 %	0 %	50 %	50 %	525945576
120	NC_021844	GC	3	6	66235	66240	0 %	0 %	50 %	50 %	525945576
121	NC_021844	AC	3	6	66356	66361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021844	GC	3	6	66755	66760	0 %	0 %	50 %	50 %	525945577
123	NC_021844	GC	3	6	66836	66841	0 %	0 %	50 %	50 %	525945577
124	NC_021844	GC	3	6	67362	67367	0 %	0 %	50 %	50 %	525945577
125	NC_021844	GC	3	6	67669	67674	0 %	0 %	50 %	50 %	525945577
126	NC_021844	GC	4	8	67940	67947	0 %	0 %	50 %	50 %	525945578
127	NC_021844	GC	3	6	67974	67979	0 %	0 %	50 %	50 %	525945578
128	NC_021844	CG	3	6	68069	68074	0 %	0 %	50 %	50 %	525945578
129	NC_021844	GC	3	6	68199	68204	0 %	0 %	50 %	50 %	525945578
130	NC_021844	GC	3	6	68892	68897	0 %	0 %	50 %	50 %	525945578
131	NC_021844	GC	4	8	69173	69180	0 %	0 %	50 %	50 %	525945578
132	NC_021844	GT	3	6	69505	69510	0 %	50 %	50 %	0 %	525945578
133	NC_021844	GC	3	6	69912	69917	0 %	0 %	50 %	50 %	525945578
134	NC_021844	GC	3	6	70073	70078	0 %	0 %	50 %	50 %	525945578
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136	NC_021844	CG	3	6	70647	70652	0 %	0 %	50 %	50 %	525949042
137	NC_021844	GC	4	8	71517	71524	0 %	0 %	50 %	50 %	525949042
138	NC_021844	TG	3	6	71612	71617	0 %	50 %	50 %	0 %	525945579
139	NC_021844	CG	4	8	71782	71789	0 %	0 %	50 %	50 %	525945579
140	NC_021844	GC	3	6	72268	72273	0 %	0 %	50 %	50 %	525945579
141	NC_021844	AT	3	6	72299	72304	50 %	50 %	0 %	0 %	525945579
142	NC_021844	CG	3	6	72613	72618	0 %	0 %	50 %	50 %	525945580
143	NC_021844	GC	3	6	72775	72780	0 %	0 %	50 %	50 %	525945580
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